Doublet Group distance statistics: 54936

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 11, 6, 14, 12, 4, 5, 4, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.006, 0.010, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.006 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.005, 0.015, 0.026, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.005, 0.023, 0.040, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.007, 0.026, 0.046, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.026 std_dev=0.019
O4'	A	0, -0.074, 0.116, 0.306, 1.468 max_d=1.468 avg_d=0.116 std_dev=0.190
P	B	0, 0.284, 0.475, 0.667, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.475 std_dev=0.191
C2'	A	0, -0.075, 0.130, 0.334, 1.607 max_d=1.607 avg_d=0.130 std_dev=0.204
OP1	B	0, 0.253, 0.479, 0.705, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.479 std_dev=0.226
O2'	A	0, -0.063, 0.176, 0.416, 1.884 max_d=1.884 avg_d=0.176 std_dev=0.240
OP2	B	0, 0.315, 0.563, 0.811, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.563 std_dev=0.248
C4'	A	0, -0.106, 0.189, 0.485, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.189 std_dev=0.295
C3'	A	0, -0.128, 0.195, 0.518, 2.513 max_d=2.513 avg_d=0.195 std_dev=0.323
C5'	B	0, 0.225, 0.566, 0.907, 2.129 max_d=2.129 avg_d=0.566 std_dev=0.341
O5'	B	0, 0.183, 0.540, 0.897, 2.288 max_d=2.288 avg_d=0.540 std_dev=0.357
O3'	A	0, -0.170, 0.296, 0.762, 3.611 max_d=3.611 avg_d=0.296 std_dev=0.466
C5'	A	0, -0.196, 0.322, 0.841, 3.845 max_d=3.845 avg_d=0.322 std_dev=0.518
C4'	B	0, 0.121, 0.657, 1.193, 3.199 max_d=3.199 avg_d=0.657 std_dev=0.536
O4'	B	0, 0.145, 0.702, 1.259, 3.253 max_d=3.253 avg_d=0.702 std_dev=0.557
O5'	A	0, -0.243, 0.336, 0.915, 4.120 max_d=4.120 avg_d=0.336 std_dev=0.579
C3'	B	0, -0.051, 0.721, 1.494, 4.387 max_d=4.387 avg_d=0.721 std_dev=0.772
P	A	0, -0.290, 0.512, 1.314, 5.512 max_d=5.512 avg_d=0.512 std_dev=0.802
C1'	B	0, 0.004, 0.808, 1.613, 4.547 max_d=4.547 avg_d=0.808 std_dev=0.804
OP2	A	0, -0.182, 0.646, 1.473, 5.512 max_d=5.512 avg_d=0.646 std_dev=0.828
O3'	B	0, -0.145, 0.745, 1.635, 4.857 max_d=4.857 avg_d=0.745 std_dev=0.890
C8	B	0, -0.113, 0.778, 1.668, 4.869 max_d=4.869 avg_d=0.778 std_dev=0.891
N9	B	0, -0.079, 0.847, 1.772, 5.139 max_d=5.139 avg_d=0.847 std_dev=0.926
C2'	B	0, -0.134, 0.810, 1.755, 5.203 max_d=5.203 avg_d=0.810 std_dev=0.945
O2'	B	0, -0.164, 0.871, 1.905, 5.544 max_d=5.544 avg_d=0.871 std_dev=1.034
OP1	A	0, -0.440, 0.644, 1.727, 7.203 max_d=7.203 avg_d=0.644 std_dev=1.083
N7	B	0, -0.233, 0.886, 2.006, 6.027 max_d=6.027 avg_d=0.886 std_dev=1.119
C4	B	0, -0.147, 1.024, 2.195, 6.434 max_d=6.434 avg_d=1.024 std_dev=1.171
C5	B	0, -0.247, 1.030, 2.308, 6.919 max_d=6.919 avg_d=1.030 std_dev=1.277
N3	B	0, -0.115, 1.196, 2.507, 7.230 max_d=7.230 avg_d=1.196 std_dev=1.311
C2	B	0, -0.173, 1.365, 2.902, 8.431 max_d=8.431 avg_d=1.365 std_dev=1.538
C6	B	0, -0.324, 1.219, 2.762, 8.316 max_d=8.316 avg_d=1.219 std_dev=1.543
N1	B	0, -0.269, 1.374, 3.016, 8.923 max_d=8.923 avg_d=1.374 std_dev=1.643
O6	B	0, -0.425, 1.280, 2.985, 9.110 max_d=9.110 avg_d=1.280 std_dev=1.705
N2	B	0, -0.149, 1.558, 3.265, 9.391 max_d=9.391 avg_d=1.558 std_dev=1.707

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.27	0.23	0.07
C2	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.09	0.20	0.52	0.35	0.11
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.08	0.09	0.12	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.27	0.10	0.13
C3'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.06	0.07	0.08	0.05	0.05	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.23	0.09	0.18
C4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.05	0.20	0.47	0.36	0.09
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.08	0.06	0.05	0.07	0.08	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.13	0.03	0.06
C5	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.02	0.22	0.55	0.44	0.11
C5'	0.04	0.14	0.02	0.01	0.13	0.00	0.16	0.00	0.17	0.19	0.16	0.12	0.19	0.20	0.12	0.03	0.04	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.06	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.21	0.59	0.44	0.11
C8	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00	0.08	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.08	0.06	0.26	0.50	0.44	0.19
N1	0.01	0.00	0.09	0.07	0.00	0.06	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.10	0.07	0.21	0.57	0.40	0.11
N3	0.01	0.00	0.12	0.08	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.10	0.09	0.19	0.46	0.32	0.09
N6	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.21	0.62	0.48	0.12
N7	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.03	0.25	0.58	0.50	0.18
N9	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.21	0.41	0.34	0.10
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.03	0.07	0.07	0.11	0.13	0.05	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.21	0.06	0.13
O3'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.07	0.08	0.10	0.10	0.06	0.07	0.03	0.03	0.00	0.02	0.14	0.18	0.24	0.27
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.06	0.07	0.09	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.18	0.14	0.22	0.12
O5'	0.16	0.20	0.07	0.03	0.20	0.01	0.22	0.01	0.21	0.26	0.21	0.19	0.21	0.25	0.21	0.03	0.14	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.27	0.52	0.27	0.23	0.47	0.13	0.55	0.07	0.59	0.50	0.57	0.46	0.62	0.58	0.41	0.21	0.18	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.35	0.10	0.09	0.36	0.03	0.44	0.04	0.44	0.44	0.40	0.32	0.48	0.50	0.34	0.06	0.24	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.11	0.13	0.18	0.09	0.06	0.11	0.01	0.11	0.19	0.11	0.09	0.12	0.18	0.10	0.13	0.27	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.27	0.15	0.17	0.26	0.16	0.36	0.16	0.42	0.30	0.36	0.24	0.22	0.39	0.22	0.20	0.27	0.18	0.14	0.51	0.16	0.19	0.17
C2	0.14	0.22	0.14	0.15	0.20	0.13	0.25	0.14	0.29	0.21	0.26	0.21	0.18	0.26	0.17	0.15	0.20	0.15	0.13	0.34	0.14	0.19	0.18
C2'	0.17	0.33	0.11	0.12	0.30	0.14	0.41	0.13	0.49	0.32	0.43	0.30	0.27	0.43	0.25	0.15	0.21	0.18	0.12	0.59	0.18	0.17	0.13
C3'	0.19	0.39	0.11	0.10	0.36	0.14	0.49	0.13	0.57	0.39	0.51	0.36	0.31	0.51	0.30	0.15	0.18	0.20	0.13	0.68	0.15	0.19	0.14
C4	0.15	0.24	0.14	0.15	0.24	0.15	0.32	0.15	0.37	0.27	0.32	0.22	0.20	0.35	0.21	0.18	0.24	0.17	0.13	0.45	0.16	0.18	0.17
C4'	0.19	0.35	0.13	0.14	0.34	0.16	0.47	0.15	0.54	0.39	0.47	0.31	0.29	0.50	0.29	0.18	0.23	0.20	0.16	0.65	0.13	0.21	0.18
C5	0.17	0.24	0.15	0.16	0.24	0.17	0.33	0.16	0.37	0.29	0.32	0.22	0.21	0.37	0.22	0.19	0.25	0.18	0.14	0.45	0.18	0.17	0.16
C5'	0.25	0.44	0.15	0.13	0.44	0.16	0.58	0.17	0.65	0.50	0.57	0.39	0.37	0.63	0.39	0.14	0.16	0.25	0.24	0.77	0.10	0.30	0.26
C6	0.15	0.22	0.14	0.15	0.22	0.15	0.28	0.15	0.32	0.25	0.28	0.20	0.19	0.31	0.19	0.17	0.22	0.17	0.13	0.38	0.18	0.16	0.16
C8	0.19	0.28	0.17	0.18	0.29	0.19	0.39	0.17	0.45	0.34	0.38	0.25	0.24	0.44	0.25	0.23	0.29	0.21	0.15	0.54	0.19	0.18	0.16
N1	0.14	0.21	0.13	0.14	0.19	0.13	0.24	0.14	0.28	0.21	0.25	0.19	0.18	0.26	0.17	0.14	0.19	0.15	0.13	0.33	0.15	0.17	0.17
N3	0.14	0.23	0.14	0.15	0.22	0.14	0.29	0.14	0.33	0.23	0.30	0.22	0.19	0.30	0.19	0.16	0.22	0.16	0.13	0.40	0.14	0.19	0.18
N6	0.16	0.21	0.15	0.16	0.21	0.17	0.28	0.16	0.31	0.25	0.27	0.19	0.19	0.31	0.20	0.18	0.22	0.18	0.14	0.36	0.22	0.14	0.14
N7	0.19	0.27	0.17	0.18	0.28	0.19	0.38	0.18	0.43	0.34	0.36	0.24	0.23	0.42	0.25	0.23	0.28	0.21	0.15	0.51	0.21	0.17	0.15
N9	0.17	0.27	0.15	0.16	0.26	0.17	0.36	0.16	0.42	0.31	0.36	0.23	0.22	0.40	0.23	0.20	0.27	0.19	0.14	0.50	0.17	0.19	0.16
O2'	0.17	0.32	0.14	0.16	0.29	0.15	0.39	0.15	0.46	0.30	0.41	0.29	0.25	0.40	0.23	0.17	0.25	0.18	0.13	0.55	0.20	0.17	0.14
O3'	0.20	0.42	0.12	0.09	0.38	0.15	0.51	0.13	0.60	0.40	0.54	0.39	0.34	0.53	0.31	0.15	0.17	0.20	0.12	0.72	0.18	0.18	0.12
O4'	0.18	0.27	0.19	0.20	0.27	0.20	0.37	0.18	0.43	0.32	0.36	0.23	0.22	0.41	0.24	0.25	0.31	0.20	0.16	0.53	0.18	0.21	0.19
O5'	0.22	0.19	0.31	0.35	0.19	0.35	0.32	0.32	0.40	0.24	0.31	0.16	0.15	0.37	0.16	0.43	0.50	0.25	0.18	0.54	0.37	0.12	0.15
OP1	0.68	0.94	0.54	0.50	0.94	0.51	1.11	0.54	1.20	1.03	1.10	0.87	0.85	1.18	0.87	0.41	0.32	0.65	0.70	1.34	0.45	0.77	0.70
OP2	0.38	0.12	0.53	0.58	0.12	0.58	0.18	0.55	0.27	0.10	0.17	0.17	0.20	0.24	0.18	0.68	0.76	0.42	0.37	0.43	0.64	0.30	0.37
P	0.15	0.41	0.12	0.15	0.40	0.16	0.59	0.13	0.69	0.49	0.58	0.34	0.31	0.66	0.33	0.25	0.32	0.15	0.15	0.85	0.17	0.26	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.06	0.07	0.04
C2	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.08	0.02	0.11	0.00	0.15	0.20	0.13
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.07	0.06	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.09	0.12	0.06
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.11	0.13	0.07
C4	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.10	0.01	0.12	0.16	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.04	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.05	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.12	0.01	0.15	0.19	0.14
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.08	0.08	0.07	0.04	0.04	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.14	0.00	0.17	0.22	0.16
C8	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.10	0.01	0.11	0.13	0.10
N1	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.13	0.00	0.17	0.22	0.15
N2	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.10	0.03	0.10	0.01	0.15	0.21	0.12
N3	0.01	0.00	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.09	0.00	0.12	0.17	0.10
N7	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.12	0.01	0.14	0.17	0.14
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.09	0.12	0.08
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02	0.05	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.02	0.04	0.10	0.12	0.05
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.10	0.08	0.05	0.02	0.03	0.00	0.01	0.04	0.05	0.14	0.18	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.06
O5'	0.04	0.11	0.03	0.03	0.10	0.01	0.12	0.01	0.14	0.10	0.13	0.10	0.09	0.12	0.08	0.02	0.04	0.04	0.00	0.15	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.15	0.00	0.19	0.24	0.19
OP1	0.06	0.15	0.09	0.11	0.12	0.06	0.15	0.05	0.17	0.11	0.17	0.15	0.12	0.14	0.09	0.10	0.14	0.04	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.20	0.12	0.13	0.16	0.05	0.19	0.02	0.22	0.13	0.22	0.21	0.17	0.17	0.12	0.12	0.18	0.06	0.01	0.24	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.13	0.06	0.07	0.11	0.01	0.14	0.01	0.16	0.10	0.15	0.12	0.10	0.14	0.08	0.05	0.10	0.06	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00