Doublet Group distance statistics: 54937

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 11, 16, 12, 5, 4, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.012, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.004
C5	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.016 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.019, 0.028, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.028 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.017, 0.027, 0.037, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.022, 0.032, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.011, 0.023, 0.036, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N7	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.017, 0.034, 0.051, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.034 std_dev=0.017
O3'	A	0, 0.058, 0.130, 0.202, 0.499 max_d=0.499 avg_d=0.130 std_dev=0.072
C3'	A	0, -0.018, 0.112, 0.242, 1.018 max_d=1.018 avg_d=0.112 std_dev=0.130
C2'	A	0, -0.004, 0.142, 0.287, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.142 std_dev=0.145
O4'	A	0, -0.059, 0.097, 0.252, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.097 std_dev=0.155
P	B	0, 0.110, 0.285, 0.460, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.285 std_dev=0.175
C4'	A	0, -0.070, 0.108, 0.287, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.108 std_dev=0.179
O2'	A	0, -0.014, 0.221, 0.456, 1.872 max_d=1.872 avg_d=0.221 std_dev=0.235
OP2	B	0, 0.081, 0.323, 0.566, 1.640 max_d=1.640 avg_d=0.323 std_dev=0.243
OP1	B	0, 0.170, 0.434, 0.698, 1.529 max_d=1.529 avg_d=0.434 std_dev=0.264
C5'	A	0, -0.113, 0.218, 0.548, 2.590 max_d=2.590 avg_d=0.218 std_dev=0.331
O5'	B	0, -0.015, 0.332, 0.679, 2.730 max_d=2.730 avg_d=0.332 std_dev=0.347
O5'	A	0, -0.083, 0.309, 0.700, 3.094 max_d=3.094 avg_d=0.309 std_dev=0.391
P	A	0, -0.126, 0.406, 0.939, 4.165 max_d=4.165 avg_d=0.406 std_dev=0.532
C5'	B	0, -0.190, 0.360, 0.911, 4.336 max_d=4.336 avg_d=0.360 std_dev=0.551
OP2	A	0, -0.172, 0.398, 0.967, 4.391 max_d=4.391 avg_d=0.398 std_dev=0.570
OP1	A	0, -0.094, 0.506, 1.106, 4.716 max_d=4.716 avg_d=0.506 std_dev=0.600
C8	B	0, -0.374, 0.481, 1.336, 6.750 max_d=6.750 avg_d=0.481 std_dev=0.855
C4'	B	0, -0.481, 0.412, 1.304, 6.986 max_d=6.986 avg_d=0.412 std_dev=0.892
N7	B	0, -0.422, 0.496, 1.414, 7.257 max_d=7.257 avg_d=0.496 std_dev=0.918
C3'	B	0, -0.544, 0.457, 1.458, 7.831 max_d=7.831 avg_d=0.457 std_dev=1.001
O4'	B	0, -0.591, 0.436, 1.464, 8.033 max_d=8.033 avg_d=0.436 std_dev=1.027
C2'	B	0, -0.647, 0.480, 1.608, 8.809 max_d=8.809 avg_d=0.480 std_dev=1.127
N9	B	0, -0.658, 0.485, 1.627, 8.937 max_d=8.937 avg_d=0.485 std_dev=1.143
C1'	B	0, -0.694, 0.484, 1.662, 9.189 max_d=9.189 avg_d=0.484 std_dev=1.178
O3'	B	0, -0.718, 0.541, 1.800, 9.827 max_d=9.827 avg_d=0.541 std_dev=1.259
C5	B	0, -0.750, 0.515, 1.779, 9.906 max_d=9.906 avg_d=0.515 std_dev=1.264
O2'	B	0, -0.752, 0.574, 1.899, 10.331 max_d=10.331 avg_d=0.574 std_dev=1.325
C4	B	0, -0.881, 0.523, 1.928, 10.958 max_d=10.958 avg_d=0.523 std_dev=1.405
O6	B	0, -0.857, 0.568, 1.993, 11.186 max_d=11.186 avg_d=0.568 std_dev=1.425
C6	B	0, -0.931, 0.557, 2.045, 11.638 max_d=11.638 avg_d=0.557 std_dev=1.488
N3	B	0, -1.139, 0.598, 2.335, 13.521 max_d=13.521 avg_d=0.598 std_dev=1.737
N1	B	0, -1.204, 0.622, 2.448, 14.233 max_d=14.233 avg_d=0.622 std_dev=1.826
C2	B	0, -1.284, 0.652, 2.588, 15.074 max_d=15.074 avg_d=0.652 std_dev=1.936
N2	B	0, -1.502, 0.767, 3.037, 17.680 max_d=17.680 avg_d=0.767 std_dev=2.270

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.05	0.06	0.04
C2	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.06	0.07	0.07	0.07	0.09	0.07
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.08	0.09	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.07	0.06	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.05	0.03
C4	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.03	0.07	0.07	0.09	0.07
C4'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.08	0.08	0.11	0.08
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.04	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.04	0.03	0.08	0.09	0.11	0.09
C8	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.03	0.06	0.08	0.08	0.13	0.08
N1	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.06	0.08	0.08	0.10	0.08
N3	0.02	0.01	0.09	0.05	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.14	0.06	0.07	0.06	0.06	0.08	0.06
N6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.04	0.02	0.09	0.10	0.12	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.03	0.04	0.09	0.09	0.13	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.07	0.09	0.06
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.07	0.08	0.12	0.14	0.06	0.06	0.02	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.10	0.07
O3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.06	0.04	0.03	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03
O4'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.06	0.06	0.07	0.02	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.06	0.07	0.06
O5'	0.05	0.07	0.05	0.03	0.07	0.01	0.08	0.01	0.08	0.08	0.08	0.06	0.09	0.09	0.07	0.06	0.03	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.05	0.07	0.07	0.05	0.07	0.04	0.08	0.05	0.09	0.08	0.08	0.06	0.10	0.09	0.07	0.09	0.05	0.06	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.09	0.06	0.05	0.09	0.03	0.11	0.01	0.11	0.13	0.10	0.08	0.12	0.13	0.09	0.10	0.04	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.05	0.03	0.07	0.02	0.08	0.01	0.09	0.08	0.08	0.06	0.09	0.09	0.06	0.07	0.03	0.06	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.71	1.30	0.54	0.27	1.00	0.43	1.02	0.32	1.21	0.67	1.35	1.39	1.13	0.79	0.80	0.60	0.18	0.66	0.25	1.24	0.16	0.19	0.10
C2	0.39	0.66	0.30	0.08	0.57	0.19	0.59	0.17	0.65	0.43	0.68	0.68	0.60	0.50	0.47	0.34	0.14	0.36	0.16	0.65	0.13	0.17	0.10
C2'	0.83	1.43	0.69	0.39	1.14	0.52	1.16	0.38	1.38	0.81	1.50	1.52	1.26	0.94	0.93	0.77	0.32	0.74	0.31	1.44	0.13	0.15	0.09
C3'	0.81	1.43	0.65	0.36	1.11	0.50	1.13	0.36	1.36	0.78	1.50	1.54	1.25	0.91	0.90	0.73	0.28	0.73	0.29	1.42	0.14	0.16	0.09
C4	0.64	1.12	0.50	0.23	0.91	0.39	0.92	0.29	1.05	0.62	1.15	1.17	1.01	0.73	0.73	0.53	0.13	0.60	0.24	1.03	0.15	0.19	0.09
C4'	0.78	1.46	0.59	0.31	1.10	0.48	1.11	0.34	1.34	0.74	1.52	1.60	1.26	0.86	0.87	0.65	0.23	0.73	0.26	1.37	0.15	0.21	0.09
C5	0.72	1.20	0.58	0.32	0.99	0.46	0.96	0.35	1.07	0.66	1.19	1.25	1.10	0.75	0.81	0.59	0.21	0.68	0.28	1.00	0.16	0.21	0.09
C5'	0.90	1.67	0.69	0.41	1.25	0.57	1.24	0.40	1.49	0.83	1.71	1.84	1.44	0.96	0.99	0.76	0.34	0.83	0.30	1.51	0.14	0.20	0.08
C6	0.62	0.95	0.51	0.25	0.82	0.38	0.78	0.30	0.83	0.57	0.92	0.98	0.89	0.63	0.69	0.51	0.13	0.58	0.26	0.77	0.15	0.20	0.09
C8	0.85	1.53	0.68	0.42	1.18	0.57	1.14	0.41	1.32	0.76	1.53	1.64	1.36	0.86	0.94	0.71	0.34	0.80	0.31	1.26	0.18	0.21	0.10
N1	0.43	0.67	0.35	0.11	0.59	0.23	0.59	0.19	0.63	0.44	0.67	0.70	0.63	0.49	0.50	0.37	0.11	0.39	0.18	0.60	0.13	0.18	0.09
N3	0.49	0.86	0.37	0.11	0.71	0.26	0.74	0.21	0.85	0.51	0.90	0.90	0.77	0.61	0.58	0.42	0.08	0.45	0.18	0.86	0.14	0.18	0.10
N6	0.66	0.93	0.57	0.33	0.81	0.45	0.73	0.35	0.76	0.56	0.87	0.97	0.90	0.57	0.70	0.54	0.21	0.63	0.30	0.68	0.17	0.23	0.10
N7	0.86	1.47	0.70	0.45	1.17	0.59	1.10	0.43	1.24	0.75	1.43	1.56	1.34	0.83	0.94	0.71	0.36	0.82	0.33	1.15	0.18	0.22	0.10
N9	0.74	1.33	0.58	0.31	1.04	0.46	1.04	0.34	1.22	0.69	1.36	1.41	1.18	0.80	0.83	0.62	0.21	0.69	0.27	1.21	0.16	0.20	0.10
O2'	0.77	1.26	0.66	0.37	1.04	0.48	1.08	0.35	1.26	0.77	1.33	1.32	1.13	0.89	0.86	0.76	0.30	0.67	0.29	1.33	0.12	0.13	0.10
O3'	0.69	1.23	0.54	0.26	0.96	0.41	0.98	0.31	1.18	0.68	1.29	1.33	1.07	0.79	0.77	0.63	0.18	0.63	0.25	1.24	0.14	0.16	0.10
O4'	0.71	1.37	0.52	0.26	1.03	0.44	1.03	0.32	1.24	0.67	1.42	1.50	1.19	0.78	0.80	0.57	0.16	0.68	0.24	1.26	0.17	0.23	0.11
O5'	0.97	1.78	0.77	0.48	1.34	0.62	1.33	0.42	1.60	0.90	1.84	1.96	1.55	1.03	1.07	0.85	0.42	0.88	0.33	1.61	0.17	0.21	0.11
OP1	1.10	1.97	0.89	0.61	1.47	0.72	1.43	0.48	1.70	0.99	1.98	2.22	1.72	1.11	1.19	0.97	0.57	0.99	0.37	1.68	0.16	0.21	0.10
OP2	1.15	2.05	0.95	0.66	1.54	0.75	1.49	0.49	1.75	1.03	2.06	2.27	1.79	1.15	1.24	1.04	0.64	1.01	0.39	1.70	0.17	0.20	0.12
P	1.08	1.96	0.87	0.59	1.46	0.70	1.42	0.47	1.69	0.97	1.98	2.19	1.71	1.10	1.17	0.94	0.54	0.97	0.37	1.66	0.15	0.20	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.05	0.02	0.14	0.11	0.08
C2	0.03	0.00	0.11	0.06	0.01	0.12	0.00	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.09	0.18	0.13	0.01	0.14	0.15	0.10
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.06	0.05	0.08	0.08	0.13	0.11	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.15	0.04	0.33	0.21	0.22
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.10	0.10	0.08	0.06	0.05	0.11	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.25	0.07	0.09
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.09	0.07	0.01	0.11	0.13	0.07
C4'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.09	0.09	0.16	0.12	0.07	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.03	0.04	0.06	0.01	0.10	0.12	0.09
C5'	0.03	0.18	0.06	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.09	0.09	0.14	0.23	0.17	0.07	0.04	0.06	0.09	0.01	0.01	0.08	0.04	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.07	0.07	0.00	0.10	0.13	0.10
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.19	0.04	0.09	0.11	0.01	0.12	0.11	0.13
N1	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.13	0.10	0.01	0.11	0.14	0.09
N2	0.03	0.00	0.13	0.06	0.01	0.16	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.11	0.21	0.16	0.01	0.17	0.16	0.13
N3	0.02	0.00	0.11	0.05	0.00	0.12	0.01	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.10	0.17	0.12	0.01	0.15	0.14	0.11
N7	0.01	0.00	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.05	0.05	0.11	0.01	0.14	0.13	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.05	0.01	0.10	0.11	0.07
O2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.04	0.12	0.09	0.06	0.08	0.19	0.06	0.15	0.10	0.17	0.07	0.00	0.04	0.08	0.11	0.11	0.31	0.22	0.20
O3'	0.11	0.09	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.09	0.04	0.04	0.05	0.11	0.10	0.05	0.05	0.04	0.00	0.07	0.07	0.04	0.16	0.18	0.06
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.07	0.09	0.13	0.21	0.17	0.05	0.01	0.08	0.07	0.00	0.05	0.05	0.07	0.07	0.05
O5'	0.05	0.13	0.15	0.04	0.07	0.01	0.06	0.01	0.07	0.11	0.10	0.16	0.12	0.11	0.05	0.11	0.07	0.05	0.00	0.08	0.01	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.05	0.08	0.00	0.12	0.13	0.13
OP1	0.14	0.14	0.33	0.25	0.11	0.09	0.10	0.04	0.10	0.12	0.11	0.17	0.15	0.14	0.10	0.31	0.16	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.15	0.21	0.07	0.13	0.05	0.12	0.07	0.13	0.11	0.14	0.16	0.14	0.13	0.11	0.22	0.18	0.07	0.02	0.13	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.10	0.22	0.09	0.07	0.03	0.09	0.01	0.10	0.13	0.09	0.13	0.11	0.15	0.07	0.20	0.06	0.05	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00