Doublet Group distance statistics: 54940

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 5, 1, 2, 2, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.022, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.020, 0.032, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.017 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.021 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.021, 0.039, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.021 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.010, 0.030, 0.051, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.021, 0.048, 0.074, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.048 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.015, 0.044, 0.074, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.044 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.008, 0.046, 0.083, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.046 std_dev=0.037
O4'	A	0, 0.017, 0.093, 0.170, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.093 std_dev=0.076
C2'	A	0, 0.038, 0.129, 0.220, 0.330 max_d=0.330 avg_d=0.129 std_dev=0.091
C4'	A	0, 0.124, 0.236, 0.347, 0.511 max_d=0.511 avg_d=0.236 std_dev=0.111
C3'	A	0, 0.107, 0.246, 0.385, 0.546 max_d=0.546 avg_d=0.246 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.100, 0.242, 0.384, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.242 std_dev=0.142
O3'	A	0, 0.187, 0.383, 0.579, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.383 std_dev=0.196
C5'	A	0, 0.189, 0.393, 0.597, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.393 std_dev=0.204
OP1	B	0, 0.262, 0.488, 0.714, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.488 std_dev=0.226
P	B	0, 0.194, 0.430, 0.665, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.430 std_dev=0.235
O5'	B	0, 0.173, 0.468, 0.762, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.468 std_dev=0.295
OP2	B	0, 0.108, 0.487, 0.867, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.487 std_dev=0.379
C5'	B	0, 0.061, 0.481, 0.901, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.481 std_dev=0.420
O5'	A	0, 0.090, 0.542, 0.994, 2.063 max_d=2.063 avg_d=0.542 std_dev=0.452
O4'	B	0, 0.090, 0.590, 1.091, 2.176 max_d=2.176 avg_d=0.590 std_dev=0.501
C4'	B	0, 0.004, 0.538, 1.072, 2.329 max_d=2.329 avg_d=0.538 std_dev=0.534
C8	B	0, 0.178, 0.731, 1.284, 1.881 max_d=1.881 avg_d=0.731 std_dev=0.553
N9	B	0, 0.153, 0.747, 1.342, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.747 std_dev=0.594
C1'	B	0, 0.088, 0.703, 1.318, 2.596 max_d=2.596 avg_d=0.703 std_dev=0.615
N7	B	0, 0.176, 0.822, 1.467, 2.320 max_d=2.320 avg_d=0.822 std_dev=0.646
C3'	B	0, -0.068, 0.614, 1.295, 2.964 max_d=2.964 avg_d=0.614 std_dev=0.681
C4	B	0, 0.178, 0.865, 1.552, 2.195 max_d=2.195 avg_d=0.865 std_dev=0.687
C5	B	0, 0.163, 0.887, 1.612, 2.500 max_d=2.500 avg_d=0.887 std_dev=0.725
C2'	B	0, -0.021, 0.723, 1.466, 3.251 max_d=3.251 avg_d=0.723 std_dev=0.744
N3	B	0, 0.241, 0.994, 1.747, 2.594 max_d=2.594 avg_d=0.994 std_dev=0.753
O3'	B	0, -0.168, 0.639, 1.445, 3.543 max_d=3.543 avg_d=0.639 std_dev=0.806
C2	B	0, 0.292, 1.127, 1.962, 2.742 max_d=2.742 avg_d=1.127 std_dev=0.835
P	A	0, -0.088, 0.753, 1.594, 3.907 max_d=3.907 avg_d=0.753 std_dev=0.841
C6	B	0, 0.170, 1.018, 1.865, 2.983 max_d=2.983 avg_d=1.018 std_dev=0.848
O2'	B	0, -0.064, 0.809, 1.681, 3.919 max_d=3.919 avg_d=0.809 std_dev=0.872
N1	B	0, 0.235, 1.120, 2.006, 3.057 max_d=3.057 avg_d=1.120 std_dev=0.885
N2	B	0, 0.409, 1.307, 2.205, 2.917 max_d=2.917 avg_d=1.307 std_dev=0.898
O6	B	0, 0.168, 1.087, 2.007, 3.343 max_d=3.343 avg_d=1.087 std_dev=0.919
OP1	A	0, -0.098, 0.929, 1.956, 4.749 max_d=4.749 avg_d=0.929 std_dev=1.027
OP2	A	0, -0.384, 0.987, 2.359, 6.196 max_d=6.196 avg_d=0.987 std_dev=1.372

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.25	0.38	0.15	0.09
C2	0.04	0.00	0.11	0.12	0.02	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.13	0.15	0.03	0.41	0.20	0.48	0.31
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.06	0.04	0.10	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.21	0.30	0.15	0.04
C3'	0.01	0.12	0.01	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.07	0.07	0.10	0.12	0.07	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.20	0.21	0.16	0.08
C4	0.02	0.02	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.07	0.02	0.42	0.17	0.51	0.33
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.06	0.07	0.03	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.34	0.30	0.16
C5	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.03	0.49	0.12	0.77	0.49
C5'	0.01	0.08	0.02	0.03	0.06	0.02	0.07	0.00	0.07	0.08	0.08	0.07	0.07	0.09	0.05	0.06	0.07	0.01	0.02	0.13	0.08	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.09	0.03	0.50	0.13	0.83	0.52
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.09	0.04	0.48	0.13	0.73	0.48
N1	0.04	0.00	0.10	0.10	0.02	0.06	0.02	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.13	0.03	0.46	0.12	0.67	0.43
N3	0.04	0.01	0.11	0.12	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.13	0.03	0.38	0.26	0.36	0.24
N6	0.02	0.02	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.10	0.04	0.53	0.22	1.00	0.63
N7	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.09	0.04	0.52	0.20	0.93	0.60
N9	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.39	0.20	0.43	0.28
O2'	0.02	0.13	0.01	0.02	0.07	0.05	0.06	0.06	0.08	0.03	0.12	0.12	0.08	0.04	0.03	0.00	0.04	0.05	0.08	0.47	0.45	0.24
O3'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.07	0.02	0.07	0.07	0.09	0.09	0.13	0.13	0.10	0.09	0.04	0.04	0.00	0.02	0.13	0.29	0.38	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.18	0.45	0.19	0.14
O5'	0.25	0.41	0.21	0.20	0.42	0.04	0.49	0.02	0.50	0.48	0.46	0.38	0.53	0.52	0.39	0.08	0.13	0.18	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.38	0.20	0.30	0.21	0.17	0.34	0.12	0.13	0.13	0.13	0.12	0.26	0.22	0.20	0.20	0.47	0.29	0.45	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.48	0.15	0.16	0.51	0.30	0.77	0.08	0.83	0.73	0.67	0.36	1.00	0.93	0.43	0.45	0.38	0.19	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.31	0.04	0.08	0.33	0.16	0.49	0.02	0.52	0.48	0.43	0.24	0.63	0.60	0.28	0.24	0.15	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.39	0.42	0.54	0.56	0.36	0.44	0.32	0.38	0.33	0.30	0.38	0.46	0.41	0.29	0.35	0.62	0.68	0.35	0.20	0.30	0.23	0.12	0.09
C2	0.40	0.39	0.58	0.61	0.36	0.50	0.33	0.42	0.33	0.31	0.36	0.40	0.39	0.30	0.36	0.66	0.73	0.36	0.21	0.31	0.22	0.19	0.11
C2'	0.32	0.36	0.48	0.52	0.31	0.39	0.28	0.35	0.29	0.27	0.33	0.40	0.35	0.27	0.30	0.53	0.66	0.30	0.18	0.28	0.26	0.13	0.12
C3'	0.29	0.31	0.43	0.48	0.27	0.36	0.26	0.34	0.26	0.27	0.29	0.34	0.30	0.27	0.27	0.47	0.60	0.27	0.18	0.26	0.29	0.11	0.13
C4	0.38	0.38	0.52	0.54	0.34	0.44	0.31	0.39	0.31	0.31	0.34	0.40	0.38	0.29	0.34	0.60	0.65	0.35	0.21	0.29	0.22	0.12	0.08
C4'	0.35	0.38	0.49	0.52	0.33	0.40	0.30	0.36	0.30	0.29	0.35	0.42	0.37	0.28	0.32	0.56	0.63	0.32	0.20	0.28	0.26	0.10	0.10
C5	0.35	0.33	0.45	0.47	0.32	0.40	0.30	0.36	0.30	0.31	0.31	0.35	0.34	0.30	0.33	0.52	0.54	0.34	0.22	0.29	0.23	0.10	0.08
C5'	0.32	0.34	0.45	0.47	0.29	0.37	0.27	0.34	0.27	0.27	0.31	0.39	0.34	0.26	0.29	0.51	0.58	0.29	0.18	0.25	0.31	0.10	0.13
C6	0.33	0.31	0.42	0.44	0.31	0.40	0.30	0.36	0.30	0.32	0.30	0.32	0.32	0.31	0.32	0.47	0.49	0.33	0.22	0.29	0.23	0.10	0.08
C8	0.36	0.35	0.47	0.47	0.33	0.40	0.31	0.35	0.30	0.32	0.33	0.38	0.36	0.30	0.33	0.54	0.55	0.34	0.22	0.29	0.24	0.09	0.09
N1	0.36	0.33	0.49	0.53	0.32	0.46	0.31	0.41	0.30	0.31	0.32	0.34	0.34	0.29	0.33	0.54	0.60	0.35	0.22	0.29	0.22	0.16	0.10
N3	0.41	0.41	0.58	0.61	0.37	0.48	0.33	0.41	0.34	0.31	0.38	0.44	0.42	0.30	0.36	0.67	0.74	0.36	0.21	0.32	0.22	0.16	0.10
N6	0.29	0.29	0.32	0.33	0.30	0.32	0.32	0.31	0.31	0.33	0.30	0.28	0.28	0.34	0.31	0.36	0.34	0.30	0.22	0.32	0.24	0.11	0.11
N7	0.34	0.32	0.42	0.42	0.32	0.37	0.31	0.33	0.30	0.32	0.31	0.34	0.33	0.32	0.32	0.49	0.48	0.33	0.22	0.30	0.24	0.10	0.10
N9	0.38	0.38	0.52	0.53	0.35	0.43	0.31	0.38	0.31	0.31	0.35	0.42	0.39	0.29	0.34	0.60	0.64	0.35	0.21	0.29	0.23	0.11	0.08
O2'	0.36	0.44	0.53	0.56	0.37	0.41	0.33	0.36	0.36	0.29	0.41	0.49	0.42	0.29	0.34	0.58	0.70	0.32	0.19	0.34	0.27	0.18	0.15
O3'	0.24	0.27	0.38	0.44	0.23	0.32	0.23	0.31	0.23	0.24	0.25	0.31	0.26	0.24	0.23	0.39	0.56	0.23	0.17	0.23	0.32	0.13	0.16
O4'	0.41	0.43	0.55	0.56	0.37	0.45	0.33	0.39	0.34	0.32	0.39	0.47	0.42	0.30	0.36	0.63	0.67	0.37	0.23	0.31	0.21	0.12	0.09
O5'	0.75	0.68	0.86	0.92	0.71	0.85	0.72	0.85	0.70	0.76	0.68	0.66	0.69	0.75	0.73	0.87	1.00	0.76	0.72	0.70	0.37	0.54	0.52
OP1	0.24	0.16	0.41	0.54	0.17	0.45	0.20	0.53	0.16	0.30	0.13	0.21	0.17	0.29	0.23	0.42	0.68	0.29	0.40	0.19	0.30	0.30	0.30
OP2	0.87	0.67	0.94	1.10	0.82	1.08	0.90	1.21	0.86	1.03	0.74	0.56	0.70	1.03	0.90	0.86	1.15	0.98	1.15	0.91	0.99	1.07	1.06
P	0.67	0.53	0.78	0.89	0.61	0.84	0.65	0.91	0.62	0.74	0.55	0.48	0.55	0.73	0.67	0.76	0.98	0.73	0.80	0.64	0.56	0.67	0.66

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.10	0.31	0.16
C2	0.03	0.00	0.06	0.14	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.03	0.10	0.02	0.26	0.48	0.28
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.19	0.09
C3'	0.02	0.14	0.01	0.00	0.11	0.01	0.12	0.03	0.13	0.09	0.13	0.15	0.12	0.11	0.08	0.02	0.01	0.01	0.03	0.14	0.05	0.10	0.03
C4	0.02	0.01	0.03	0.11	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.11	0.02	0.27	0.47	0.28
C4'	0.01	0.08	0.02	0.01	0.07	0.00	0.09	0.01	0.10	0.09	0.09	0.08	0.06	0.10	0.06	0.05	0.03	0.00	0.02	0.11	0.03	0.11	0.05
C5	0.01	0.01	0.03	0.12	0.01	0.09	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.16	0.02	0.38	0.53	0.35
C5'	0.02	0.13	0.02	0.03	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.14	0.15	0.13	0.10	0.17	0.09	0.05	0.05	0.01	0.01	0.19	0.05	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.13	0.01	0.10	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.15	0.02	0.16	0.01	0.40	0.54	0.36
C8	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.09	0.01	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03	0.17	0.03	0.36	0.51	0.34
N1	0.03	0.01	0.05	0.13	0.01	0.09	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.16	0.02	0.13	0.01	0.34	0.52	0.33
N2	0.04	0.01	0.08	0.15	0.02	0.08	0.01	0.13	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.12	0.17	0.03	0.09	0.02	0.23	0.46	0.26
N3	0.03	0.01	0.06	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.08	0.02	0.21	0.44	0.25
N7	0.01	0.01	0.04	0.11	0.01	0.10	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.19	0.03	0.44	0.56	0.39
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.02	0.24	0.43	0.26
O2'	0.01	0.10	0.01	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.07	0.03	0.09	0.12	0.09	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.08	0.08	0.08	0.18	0.11
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.12	0.03	0.13	0.05	0.15	0.10	0.16	0.17	0.13	0.13	0.07	0.04	0.00	0.02	0.08	0.17	0.13	0.10	0.09
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.09	0.25	0.14
O5'	0.05	0.10	0.02	0.03	0.11	0.02	0.16	0.01	0.16	0.17	0.13	0.09	0.08	0.19	0.10	0.08	0.08	0.05	0.00	0.18	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.02	0.05	0.14	0.02	0.11	0.02	0.19	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.08	0.17	0.03	0.18	0.00	0.46	0.56	0.39
OP1	0.10	0.26	0.04	0.05	0.27	0.03	0.38	0.05	0.40	0.36	0.34	0.23	0.21	0.44	0.24	0.08	0.13	0.09	0.02	0.46	0.00	0.02	0.01
OP2	0.31	0.48	0.19	0.10	0.47	0.11	0.53	0.07	0.54	0.51	0.52	0.46	0.44	0.56	0.43	0.18	0.10	0.25	0.02	0.56	0.02	0.00	0.01
P	0.16	0.28	0.09	0.03	0.28	0.05	0.35	0.02	0.36	0.34	0.33	0.26	0.25	0.39	0.26	0.11	0.09	0.14	0.01	0.39	0.01	0.01	0.00