Doublet Group distance statistics: 54945

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 2, 3, 3, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.018, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.008, 0.018, 0.028, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.012 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.002, 0.017, 0.032, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C8	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.019
OP2	B	0, 0.210, 0.451, 0.693, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.451 std_dev=0.242
P	B	0, 0.284, 0.576, 0.868, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.576 std_dev=0.292
O4'	A	0, -0.128, 0.202, 0.531, 0.966 max_d=0.966 avg_d=0.202 std_dev=0.330
C2'	A	0, -0.124, 0.208, 0.540, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.208 std_dev=0.332
OP1	B	0, 0.131, 0.586, 1.042, 1.573 max_d=1.573 avg_d=0.586 std_dev=0.455
C4'	A	0, -0.178, 0.360, 0.898, 1.561 max_d=1.561 avg_d=0.360 std_dev=0.538
O2'	A	0, -0.124, 0.451, 1.026, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.451 std_dev=0.575
C3'	A	0, -0.179, 0.493, 1.165, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.493 std_dev=0.672
C5'	A	0, -0.212, 0.587, 1.386, 2.444 max_d=2.444 avg_d=0.587 std_dev=0.799
O5'	B	0, 0.089, 0.964, 1.839, 3.041 max_d=3.041 avg_d=0.964 std_dev=0.875
O3'	A	0, -0.275, 0.870, 2.016, 3.208 max_d=3.208 avg_d=0.870 std_dev=1.145
O5'	A	0, -0.283, 0.911, 2.105, 3.647 max_d=3.647 avg_d=0.911 std_dev=1.194
C5'	B	0, -0.004, 1.452, 2.907, 4.357 max_d=4.357 avg_d=1.452 std_dev=1.456
P	A	0, -0.515, 1.289, 3.094, 5.568 max_d=5.568 avg_d=1.289 std_dev=1.805
OP2	A	0, -0.612, 1.302, 3.216, 6.512 max_d=6.512 avg_d=1.302 std_dev=1.914
C4'	B	0, -0.226, 1.820, 3.866, 6.393 max_d=6.393 avg_d=1.820 std_dev=2.046
C3'	B	0, -0.478, 1.702, 3.881, 7.122 max_d=7.122 avg_d=1.702 std_dev=2.180
OP1	A	0, -0.565, 1.649, 3.863, 6.361 max_d=6.361 avg_d=1.649 std_dev=2.214
O4'	B	0, -0.292, 2.104, 4.499, 7.173 max_d=7.173 avg_d=2.104 std_dev=2.396
O3'	B	0, -0.558, 1.865, 4.289, 7.492 max_d=7.492 avg_d=1.865 std_dev=2.424
C8	B	0, -0.477, 2.010, 4.498, 7.951 max_d=7.951 avg_d=2.010 std_dev=2.488
C2'	B	0, -0.530, 2.221, 4.972, 9.057 max_d=9.057 avg_d=2.221 std_dev=2.751
N9	B	0, -0.465, 2.303, 5.071, 7.948 max_d=7.948 avg_d=2.303 std_dev=2.768
C1'	B	0, -0.408, 2.362, 5.132, 8.563 max_d=8.563 avg_d=2.362 std_dev=2.770
N7	B	0, -0.673, 2.253, 5.178, 10.016 max_d=10.016 avg_d=2.253 std_dev=2.925
O2'	B	0, -0.605, 2.666, 5.938, 10.568 max_d=10.568 avg_d=2.666 std_dev=3.272
C4	B	0, -0.573, 2.703, 5.979, 9.366 max_d=9.366 avg_d=2.703 std_dev=3.276
C5	B	0, -0.736, 2.662, 6.059, 10.985 max_d=10.985 avg_d=2.662 std_dev=3.397
N3	B	0, -0.570, 3.131, 6.832, 11.307 max_d=11.307 avg_d=3.131 std_dev=3.701
C6	B	0, -0.968, 3.095, 7.157, 13.389 max_d=13.389 avg_d=3.095 std_dev=4.063
C2	B	0, -0.711, 3.482, 7.674, 12.294 max_d=12.294 avg_d=3.482 std_dev=4.193
N1	B	0, -0.918, 3.464, 7.847, 13.614 max_d=13.614 avg_d=3.464 std_dev=4.383
O6	B	0, -1.195, 3.245, 7.684, 15.244 max_d=15.244 avg_d=3.245 std_dev=4.439
N2	B	0, -0.709, 3.948, 8.604, 14.329 max_d=14.329 avg_d=3.948 std_dev=4.656

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.26	0.00	0.15	0.27	0.19	0.16
C2	0.03	0.00	0.21	0.14	0.01	0.15	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.33	0.46	0.20	0.17	0.55	0.18	0.22
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.07	0.17	0.11	0.10	0.18	0.21	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.31	0.38	0.25	0.34
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.14	0.00	0.24	0.02	0.22	0.38	0.15	0.13	0.27	0.37	0.19	0.02	0.01	0.02	0.26	0.13	0.35	0.22
C4	0.02	0.01	0.12	0.14	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.22	0.10	0.10	0.45	0.31	0.12
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.04	0.19	0.09	0.15	0.06	0.16	0.06	0.26	0.04	0.00	0.02	0.26	0.11	0.07
C5	0.02	0.00	0.07	0.24	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.28	0.06	0.05	0.21	0.59	0.55	0.30
C5'	0.07	0.15	0.17	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.06	0.21	0.10	0.15	0.09	0.18	0.07	0.09	0.17	0.02	0.01	0.27	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.11	0.22	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.31	0.13	0.09	0.14	0.59	0.51	0.21
C8	0.01	0.01	0.10	0.38	0.00	0.19	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.26	0.11	0.46	0.72	0.76	0.59
N1	0.03	0.00	0.18	0.15	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.31	0.16	0.09	0.54	0.31	0.09
N3	0.03	0.00	0.21	0.13	0.00	0.15	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.47	0.19	0.17	0.51	0.14	0.22
N6	0.02	0.01	0.09	0.27	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.08	0.06	0.22	0.69	0.67	0.34
N7	0.01	0.01	0.06	0.37	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.24	0.06	0.43	0.79	0.83	0.59
N9	0.01	0.01	0.02	0.19	0.00	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.07	0.01	0.21	0.43	0.40	0.25
O2'	0.01	0.33	0.00	0.02	0.23	0.26	0.28	0.09	0.31	0.29	0.32	0.29	0.33	0.31	0.17	0.00	0.04	0.18	0.29	0.35	0.28	0.33
O3'	0.26	0.46	0.02	0.01	0.22	0.04	0.06	0.17	0.13	0.26	0.31	0.47	0.08	0.24	0.07	0.04	0.00	0.20	0.31	0.48	0.51	0.33
O4'	0.00	0.20	0.01	0.02	0.10	0.00	0.05	0.02	0.09	0.11	0.16	0.19	0.06	0.06	0.01	0.18	0.20	0.00	0.08	0.19	0.14	0.13
O5'	0.15	0.17	0.31	0.26	0.10	0.02	0.21	0.01	0.14	0.46	0.09	0.17	0.22	0.43	0.21	0.29	0.31	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.27	0.55	0.38	0.13	0.45	0.26	0.59	0.27	0.59	0.72	0.54	0.51	0.69	0.79	0.43	0.35	0.48	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.18	0.25	0.35	0.31	0.11	0.55	0.25	0.51	0.76	0.31	0.14	0.67	0.83	0.40	0.28	0.51	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.22	0.34	0.22	0.12	0.07	0.30	0.01	0.21	0.59	0.09	0.22	0.34	0.59	0.25	0.33	0.33	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.43	1.36	0.40	0.40	1.11	0.23	1.46	0.41	1.79	1.00	1.69	1.35	1.06	1.42	0.81	0.26	0.69	0.32	0.14	2.11	0.24	0.33	0.16
C2	0.53	1.16	0.73	0.75	0.96	0.35	1.14	0.28	1.33	0.82	1.31	1.18	0.97	1.07	0.76	0.65	0.99	0.29	0.30	1.47	0.27	0.33	0.17
C2'	0.45	1.33	0.44	0.44	1.06	0.38	1.40	0.48	1.75	0.91	1.66	1.34	1.03	1.34	0.75	0.38	0.67	0.44	0.21	2.08	0.26	0.42	0.17
C3'	0.58	1.25	0.47	0.49	0.98	0.70	1.34	0.79	1.70	0.84	1.60	1.25	0.96	1.27	0.70	0.64	0.75	0.69	0.40	2.08	0.25	0.46	0.30
C4	0.38	1.17	0.40	0.42	0.97	0.18	1.27	0.35	1.52	0.90	1.43	1.15	0.93	1.25	0.72	0.27	0.69	0.25	0.15	1.77	0.23	0.32	0.15
C4'	0.50	1.53	0.27	0.21	1.24	0.40	1.65	0.57	2.05	1.11	1.93	1.51	1.18	1.60	0.90	0.25	0.57	0.47	0.17	2.45	0.22	0.32	0.17
C5	0.39	1.11	0.28	0.27	0.95	0.26	1.25	0.42	1.48	0.89	1.37	1.08	0.89	1.25	0.71	0.19	0.54	0.34	0.13	1.73	0.23	0.29	0.16
C5'	0.69	1.79	0.40	0.17	1.46	0.51	1.90	0.63	2.34	1.30	2.21	1.77	1.41	1.82	1.09	0.43	0.44	0.63	0.21	2.78	0.18	0.26	0.16
C6	0.32	0.93	0.30	0.34	0.80	0.16	1.04	0.32	1.22	0.76	1.13	0.91	0.75	1.05	0.61	0.19	0.58	0.23	0.13	1.40	0.22	0.29	0.15
C8	0.55	1.39	0.36	0.26	1.16	0.45	1.53	0.57	1.85	1.06	1.72	1.36	1.11	1.50	0.87	0.38	0.50	0.54	0.20	2.19	0.25	0.29	0.17
N1	0.44	0.98	0.59	0.63	0.83	0.28	1.00	0.26	1.16	0.74	1.13	0.99	0.83	0.97	0.66	0.51	0.85	0.24	0.26	1.29	0.25	0.32	0.16
N3	0.46	1.20	0.62	0.65	0.99	0.25	1.22	0.28	1.45	0.86	1.40	1.21	0.98	1.17	0.75	0.52	0.91	0.23	0.24	1.66	0.25	0.33	0.16
N6	0.33	0.84	0.19	0.18	0.74	0.25	0.96	0.39	1.11	0.72	1.02	0.81	0.68	0.98	0.57	0.17	0.42	0.31	0.14	1.27	0.25	0.26	0.16
N7	0.57	1.32	0.37	0.26	1.12	0.48	1.46	0.59	1.75	1.03	1.62	1.28	1.06	1.45	0.85	0.42	0.47	0.56	0.22	2.05	0.26	0.28	0.18
N9	0.43	1.29	0.33	0.33	1.07	0.27	1.42	0.44	1.71	0.98	1.60	1.27	1.02	1.39	0.79	0.23	0.61	0.36	0.14	2.02	0.23	0.31	0.16
O2'	0.49	1.44	0.59	0.57	1.17	0.13	1.49	0.18	1.82	1.03	1.75	1.45	1.14	1.43	0.86	0.37	0.75	0.32	0.30	2.12	0.48	0.57	0.36
O3'	0.45	1.13	0.28	0.33	0.88	0.58	1.27	0.66	1.63	0.79	1.50	1.11	0.83	1.24	0.60	0.51	0.63	0.60	0.22	2.01	0.30	0.48	0.18
O4'	0.52	1.55	0.32	0.27	1.28	0.23	1.68	0.45	2.04	1.18	1.92	1.52	1.22	1.64	0.96	0.09	0.60	0.39	0.15	2.41	0.27	0.30	0.21
O5'	0.77	1.76	0.51	0.32	1.44	0.68	1.86	0.75	2.30	1.26	2.18	1.75	1.40	1.78	1.08	0.64	0.48	0.76	0.31	2.73	0.16	0.28	0.20
OP1	1.38	2.58	1.15	0.84	2.19	0.87	2.61	0.70	3.08	1.93	2.99	2.59	2.19	2.47	1.78	1.06	0.49	1.18	0.80	3.52	0.68	0.81	0.75
OP2	1.17	2.02	1.01	0.90	1.62	1.22	2.01	1.24	2.50	1.34	2.42	2.06	1.66	1.86	1.28	1.27	1.03	1.20	0.77	2.97	0.54	0.69	0.63
P	0.97	2.01	0.74	0.52	1.63	0.85	2.06	0.85	2.53	1.39	2.43	2.03	1.63	1.93	1.25	0.90	0.58	0.93	0.43	2.99	0.21	0.36	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.02	0.40	0.12	0.08
C2	0.04	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.02	0.14	0.01	0.57	0.31	0.23
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.05	0.09	0.07	0.14	0.11	0.08	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.17	0.11	0.04
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.09	0.18	0.08	0.18	0.12	0.17	0.07	0.02	0.00	0.01	0.02	0.11	0.06	0.08	0.03
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.05	0.01	0.13	0.01	0.56	0.34	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.11	0.04	0.08	0.05	0.11	0.04	0.03	0.03	0.00	0.01	0.07	0.11	0.09	0.02
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.11	0.02	0.20	0.01	0.64	0.50	0.24
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.11	0.17	0.08	0.08	0.05	0.17	0.07	0.03	0.02	0.01	0.01	0.13	0.08	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.02	0.19	0.00	0.66	0.53	0.27
C8	0.02	0.01	0.09	0.18	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.20	0.02	0.28	0.01	0.60	0.50	0.21
N1	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.10	0.02	0.16	0.01	0.62	0.43	0.26
N2	0.04	0.01	0.14	0.18	0.01	0.08	0.01	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.22	0.03	0.15	0.02	0.55	0.26	0.24
N3	0.04	0.00	0.11	0.12	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.14	0.03	0.11	0.01	0.52	0.25	0.19
N7	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.20	0.03	0.28	0.01	0.66	0.61	0.27
N9	0.01	0.01	0.03	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.52	0.31	0.14
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.04	0.09	0.15	0.11	0.04	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.06	0.11	0.04	0.01
O3'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.05	0.03	0.11	0.02	0.11	0.20	0.10	0.22	0.14	0.20	0.07	0.03	0.00	0.02	0.04	0.15	0.27	0.09	0.09
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.05	0.02	0.41	0.03	0.08
O5'	0.06	0.14	0.03	0.02	0.13	0.01	0.20	0.01	0.19	0.28	0.16	0.15	0.11	0.28	0.14	0.03	0.04	0.05	0.00	0.23	0.02	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.15	0.02	0.23	0.00	0.70	0.61	0.30
OP1	0.40	0.57	0.17	0.06	0.56	0.11	0.64	0.08	0.66	0.60	0.62	0.55	0.52	0.66	0.52	0.11	0.27	0.41	0.02	0.70	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.31	0.11	0.08	0.34	0.09	0.50	0.20	0.53	0.50	0.43	0.26	0.25	0.61	0.31	0.04	0.09	0.03	0.01	0.61	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.23	0.04	0.03	0.19	0.02	0.24	0.01	0.27	0.21	0.26	0.24	0.19	0.27	0.14	0.01	0.09	0.08	0.00	0.30	0.00	0.01	0.00