Doublet Group distance statistics: 54951

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 2, 1, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.010, 0.018, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.021, 0.036, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N3	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.021
C4	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.007, 0.035, 0.064, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.035 std_dev=0.029
N9	A	0, 0.008, 0.037, 0.066, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.037 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.011, 0.054, 0.096, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.054 std_dev=0.043
C8	A	0, 0.015, 0.068, 0.121, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.068 std_dev=0.053
O4'	A	0, 0.049, 0.152, 0.255, 0.269 max_d=0.269 avg_d=0.152 std_dev=0.103
C2'	A	0, 0.043, 0.161, 0.279, 0.378 max_d=0.378 avg_d=0.161 std_dev=0.118
OP1	B	0, 0.064, 0.190, 0.315, 0.362 max_d=0.362 avg_d=0.190 std_dev=0.126
C4'	A	0, 0.074, 0.204, 0.335, 0.334 max_d=0.334 avg_d=0.204 std_dev=0.131
P	B	0, 0.097, 0.250, 0.403, 0.454 max_d=0.454 avg_d=0.250 std_dev=0.153
C5'	B	0, 0.103, 0.266, 0.428, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.266 std_dev=0.163
C3'	A	0, 0.069, 0.238, 0.406, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.238 std_dev=0.169
O5'	B	0, 0.092, 0.272, 0.451, 0.533 max_d=0.533 avg_d=0.272 std_dev=0.180
O2'	A	0, 0.087, 0.284, 0.480, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.284 std_dev=0.197
O5'	A	0, 0.072, 0.283, 0.495, 0.606 max_d=0.606 avg_d=0.283 std_dev=0.211
O3'	B	0, 0.146, 0.363, 0.579, 0.601 max_d=0.601 avg_d=0.363 std_dev=0.217
C3'	B	0, 0.139, 0.358, 0.577, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.358 std_dev=0.219
OP2	B	0, 0.101, 0.336, 0.572, 0.680 max_d=0.680 avg_d=0.336 std_dev=0.235
C4'	B	0, 0.096, 0.332, 0.567, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.332 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.107, 0.350, 0.592, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.350 std_dev=0.243
O3'	A	0, 0.107, 0.369, 0.631, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.369 std_dev=0.262
C2'	B	0, 0.150, 0.464, 0.777, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.464 std_dev=0.314
O4'	B	0, 0.068, 0.424, 0.779, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.424 std_dev=0.355
P	A	0, 0.043, 0.414, 0.786, 1.193 max_d=1.193 avg_d=0.414 std_dev=0.372
C1'	B	0, 0.069, 0.452, 0.834, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.452 std_dev=0.382
O2'	B	0, 0.191, 0.579, 0.967, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.579 std_dev=0.388
OP2	A	0, 0.022, 0.461, 0.900, 1.391 max_d=1.391 avg_d=0.461 std_dev=0.439
N9	B	0, -0.011, 0.437, 0.884, 1.145 max_d=1.145 avg_d=0.437 std_dev=0.448
C8	B	0, 0.038, 0.490, 0.942, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.490 std_dev=0.452
C4	B	0, 0.005, 0.517, 1.028, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.517 std_dev=0.511
N7	B	0, 0.081, 0.598, 1.115, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.598 std_dev=0.517
OP1	A	0, -0.008, 0.526, 1.060, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.526 std_dev=0.534
N3	B	0, 0.034, 0.579, 1.124, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.579 std_dev=0.545
C5	B	0, 0.055, 0.605, 1.155, 1.575 max_d=1.575 avg_d=0.605 std_dev=0.550
C2	B	0, 0.056, 0.679, 1.303, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.679 std_dev=0.624
C6	B	0, 0.101, 0.739, 1.376, 1.962 max_d=1.962 avg_d=0.739 std_dev=0.638
N1	B	0, 0.078, 0.745, 1.413, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.745 std_dev=0.668
N2	B	0, 0.088, 0.767, 1.446, 2.162 max_d=2.162 avg_d=0.767 std_dev=0.679
O6	B	0, 0.160, 0.872, 1.584, 2.232 max_d=2.232 avg_d=0.872 std_dev=0.712

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.08	0.10	0.11	0.06
C2	0.03	0.00	0.10	0.08	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.03	0.13	0.17	0.19	0.13
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.07	0.07	0.09	0.10	0.07	0.07	0.03	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.14	0.09
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.02	0.05	0.15	0.06	0.08	0.08	0.13	0.06	0.02	0.01	0.01	0.10	0.16	0.13	0.11
C4	0.02	0.00	0.05	0.02	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.04	0.02	0.13	0.16	0.20	0.14
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.03	0.03	0.06	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.06	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.08	0.02	0.16	0.21	0.27	0.20
C5'	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.11	0.00	0.10	0.16	0.06	0.03	0.13	0.16	0.08	0.06	0.03	0.01	0.01	0.11	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.07	0.03	0.16	0.22	0.28	0.21
C8	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.10	0.01	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.17	0.01	0.18	0.22	0.28	0.22
N1	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.03	0.14	0.19	0.24	0.17
N3	0.02	0.00	0.10	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.15	0.11	0.03	0.12	0.15	0.16	0.11
N6	0.03	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.10	0.03	0.18	0.26	0.32	0.24
N7	0.02	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.16	0.01	0.19	0.26	0.33	0.25
N9	0.00	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.06	0.01	0.13	0.15	0.19	0.14
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.09	0.05	0.08	0.06	0.10	0.05	0.14	0.15	0.10	0.05	0.03	0.00	0.04	0.06	0.08	0.14	0.14	0.10
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.04	0.02	0.08	0.03	0.07	0.17	0.09	0.11	0.10	0.16	0.06	0.04	0.00	0.02	0.17	0.19	0.16	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.02	0.00	0.11	0.09	0.07	0.04
O5'	0.08	0.13	0.06	0.10	0.13	0.01	0.16	0.01	0.16	0.18	0.14	0.12	0.18	0.19	0.13	0.08	0.17	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.10	0.17	0.14	0.16	0.16	0.11	0.21	0.11	0.22	0.22	0.19	0.15	0.26	0.26	0.15	0.14	0.19	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.11	0.19	0.14	0.13	0.20	0.06	0.27	0.03	0.28	0.28	0.24	0.16	0.32	0.33	0.19	0.14	0.16	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.09	0.11	0.14	0.03	0.20	0.01	0.21	0.22	0.17	0.11	0.24	0.25	0.14	0.10	0.15	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.20	0.14	0.12	0.21	0.13	0.31	0.11	0.36	0.28	0.28	0.17	0.18	0.38	0.19	0.22	0.11	0.16	0.08	0.46	0.11	0.12	0.08
C2	0.11	0.22	0.10	0.10	0.24	0.08	0.36	0.10	0.40	0.32	0.32	0.17	0.17	0.42	0.21	0.16	0.09	0.11	0.11	0.50	0.09	0.11	0.09
C2'	0.20	0.23	0.17	0.13	0.24	0.16	0.32	0.12	0.36	0.31	0.28	0.21	0.21	0.39	0.22	0.28	0.12	0.20	0.10	0.45	0.15	0.14	0.11
C3'	0.18	0.21	0.16	0.12	0.22	0.15	0.30	0.12	0.33	0.29	0.25	0.20	0.20	0.36	0.21	0.27	0.12	0.18	0.10	0.41	0.16	0.15	0.12
C4	0.13	0.20	0.12	0.12	0.21	0.12	0.33	0.10	0.38	0.29	0.29	0.16	0.16	0.39	0.19	0.18	0.12	0.13	0.08	0.48	0.09	0.10	0.06
C4'	0.15	0.18	0.12	0.10	0.20	0.12	0.29	0.09	0.33	0.27	0.25	0.16	0.16	0.36	0.18	0.23	0.11	0.15	0.07	0.42	0.13	0.15	0.10
C5	0.09	0.18	0.10	0.12	0.20	0.10	0.32	0.09	0.37	0.28	0.29	0.14	0.14	0.38	0.16	0.14	0.13	0.10	0.07	0.48	0.08	0.10	0.06
C5'	0.11	0.14	0.11	0.12	0.16	0.11	0.26	0.09	0.29	0.24	0.21	0.12	0.12	0.32	0.15	0.18	0.13	0.11	0.09	0.38	0.16	0.20	0.14
C6	0.07	0.19	0.08	0.10	0.21	0.08	0.33	0.08	0.39	0.29	0.30	0.15	0.14	0.40	0.16	0.11	0.11	0.07	0.07	0.49	0.08	0.08	0.05
C8	0.12	0.17	0.13	0.13	0.19	0.13	0.31	0.11	0.36	0.27	0.27	0.14	0.13	0.37	0.16	0.18	0.16	0.12	0.07	0.47	0.10	0.14	0.08
N1	0.08	0.21	0.08	0.10	0.22	0.07	0.35	0.08	0.40	0.31	0.31	0.16	0.15	0.41	0.18	0.13	0.09	0.07	0.10	0.50	0.09	0.10	0.08
N3	0.14	0.22	0.12	0.11	0.24	0.11	0.35	0.10	0.39	0.32	0.31	0.18	0.18	0.41	0.21	0.19	0.10	0.13	0.10	0.49	0.08	0.10	0.07
N6	0.06	0.20	0.08	0.10	0.20	0.07	0.33	0.06	0.39	0.27	0.31	0.15	0.13	0.39	0.15	0.08	0.11	0.08	0.06	0.50	0.08	0.08	0.06
N7	0.10	0.17	0.12	0.13	0.18	0.12	0.31	0.10	0.36	0.26	0.28	0.13	0.12	0.37	0.15	0.15	0.16	0.11	0.07	0.47	0.09	0.14	0.09
N9	0.14	0.19	0.13	0.13	0.21	0.13	0.31	0.11	0.36	0.28	0.28	0.16	0.16	0.38	0.18	0.20	0.13	0.14	0.07	0.46	0.10	0.11	0.07
O2'	0.22	0.26	0.20	0.14	0.27	0.17	0.36	0.13	0.40	0.34	0.32	0.25	0.24	0.42	0.25	0.32	0.13	0.22	0.11	0.50	0.16	0.14	0.12
O3'	0.25	0.27	0.23	0.19	0.27	0.21	0.32	0.17	0.34	0.31	0.29	0.28	0.27	0.37	0.26	0.34	0.19	0.25	0.15	0.41	0.20	0.17	0.15
O4'	0.13	0.18	0.11	0.10	0.20	0.11	0.31	0.09	0.36	0.28	0.27	0.15	0.15	0.37	0.18	0.21	0.11	0.13	0.06	0.46	0.10	0.13	0.08
O5'	0.13	0.14	0.13	0.17	0.17	0.13	0.27	0.13	0.30	0.26	0.21	0.13	0.13	0.34	0.16	0.14	0.18	0.12	0.14	0.39	0.20	0.24	0.19
OP1	0.23	0.21	0.24	0.27	0.19	0.23	0.20	0.24	0.22	0.20	0.19	0.24	0.22	0.24	0.19	0.18	0.28	0.22	0.24	0.27	0.30	0.32	0.27
OP2	0.23	0.20	0.23	0.26	0.17	0.23	0.18	0.24	0.19	0.17	0.17	0.23	0.21	0.20	0.17	0.17	0.27	0.22	0.25	0.24	0.32	0.36	0.30
P	0.19	0.17	0.20	0.23	0.16	0.20	0.20	0.20	0.22	0.19	0.18	0.19	0.18	0.25	0.16	0.16	0.24	0.19	0.21	0.30	0.26	0.30	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.07	0.04
C2	0.04	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.10	0.02	0.21	0.01	0.25	0.37	0.26
C2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.02	0.08	0.04	0.10	0.12	0.10	0.04	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.08	0.16	0.11	0.08
C3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.12	0.16	0.09	0.08	0.08	0.17	0.10	0.02	0.01	0.00	0.06	0.13	0.17	0.12	0.09
C4	0.02	0.01	0.06	0.10	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.09	0.01	0.22	0.01	0.25	0.32	0.25
C4'	0.00	0.04	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.10	0.16	0.06	0.05	0.04	0.17	0.08	0.11	0.01	0.00	0.02	0.13	0.10	0.03	0.03
C5	0.01	0.00	0.06	0.13	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.02	0.31	0.01	0.36	0.44	0.37
C5'	0.03	0.11	0.02	0.02	0.15	0.01	0.23	0.00	0.24	0.27	0.17	0.07	0.08	0.30	0.15	0.09	0.02	0.02	0.01	0.28	0.08	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.10	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.02	0.33	0.01	0.41	0.52	0.42
C8	0.02	0.01	0.04	0.16	0.01	0.16	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.16	0.04	0.29	0.01	0.29	0.29	0.30
N1	0.03	0.01	0.10	0.09	0.01	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.23	0.09	0.01	0.27	0.01	0.34	0.47	0.35
N2	0.04	0.00	0.12	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.12	0.03	0.18	0.03	0.23	0.36	0.23
N3	0.04	0.00	0.10	0.08	0.00	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.23	0.09	0.03	0.16	0.01	0.20	0.29	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.17	0.01	0.17	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.18	0.04	0.36	0.01	0.41	0.46	0.42
N9	0.01	0.01	0.02	0.10	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.18	0.01	0.19	0.21	0.18
O2'	0.03	0.26	0.00	0.02	0.14	0.11	0.11	0.09	0.17	0.04	0.23	0.30	0.23	0.04	0.03	0.00	0.02	0.14	0.08	0.16	0.14	0.11	0.08
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.12	0.16	0.09	0.12	0.09	0.18	0.09	0.02	0.00	0.01	0.06	0.14	0.20	0.15	0.10
O4'	0.00	0.02	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.14	0.01	0.00	0.07	0.03	0.10	0.08	0.08
O5'	0.06	0.21	0.06	0.06	0.22	0.02	0.31	0.01	0.33	0.29	0.27	0.18	0.16	0.36	0.18	0.08	0.06	0.07	0.00	0.37	0.03	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.13	0.01	0.28	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.16	0.14	0.03	0.37	0.00	0.49	0.60	0.49
OP1	0.10	0.25	0.16	0.17	0.25	0.10	0.36	0.08	0.41	0.29	0.34	0.23	0.20	0.41	0.19	0.14	0.20	0.10	0.03	0.49	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.37	0.11	0.12	0.32	0.03	0.44	0.02	0.52	0.29	0.47	0.36	0.29	0.46	0.21	0.11	0.15	0.08	0.02	0.60	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.26	0.08	0.09	0.25	0.03	0.37	0.01	0.42	0.30	0.35	0.23	0.20	0.42	0.18	0.08	0.10	0.08	0.01	0.49	0.01	0.00	0.00