Doublet Group distance statistics: 54952

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.024 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.013, 0.029, 0.044, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.019, 0.039, 0.059, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.039 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.023, 0.044, 0.066, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.044 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.011, 0.034, 0.058, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.034 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.013, 0.038, 0.062, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.038 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.008, 0.038, 0.067, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.038 std_dev=0.029
C1'	A	0, 0.013, 0.047, 0.080, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.047 std_dev=0.034
N6	A	0, -0.001, 0.036, 0.074, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.036 std_dev=0.037
C3'	A	0, 0.084, 0.174, 0.264, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.174 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.059, 0.163, 0.266, 0.292 max_d=0.292 avg_d=0.163 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.057, 0.167, 0.277, 0.298 max_d=0.298 avg_d=0.167 std_dev=0.110
C4'	A	0, 0.113, 0.236, 0.359, 0.370 max_d=0.370 avg_d=0.236 std_dev=0.123
O3'	A	0, 0.049, 0.183, 0.316, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.183 std_dev=0.134
O2'	A	0, 0.118, 0.320, 0.522, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.320 std_dev=0.202
O5'	A	0, 0.168, 0.381, 0.594, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.381 std_dev=0.213
C5'	A	0, 0.155, 0.370, 0.585, 0.613 max_d=0.613 avg_d=0.370 std_dev=0.215
P	B	0, 0.019, 0.237, 0.455, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.237 std_dev=0.218
OP2	B	0, 0.070, 0.308, 0.547, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.308 std_dev=0.239
O4'	B	0, 0.113, 0.363, 0.614, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.363 std_dev=0.250
C4'	B	0, 0.214, 0.467, 0.720, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.467 std_dev=0.253
O5'	B	0, 0.066, 0.372, 0.678, 1.005 max_d=1.005 avg_d=0.372 std_dev=0.306
P	A	0, 0.033, 0.362, 0.692, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.362 std_dev=0.330
O3'	B	0, 0.171, 0.551, 0.930, 1.064 max_d=1.064 avg_d=0.551 std_dev=0.379
OP2	A	0, -0.009, 0.374, 0.757, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.374 std_dev=0.383
OP1	A	0, -0.046, 0.356, 0.758, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.356 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.105, 0.520, 0.936, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.520 std_dev=0.415
O6	B	0, 0.125, 0.550, 0.975, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.550 std_dev=0.425
C6	B	0, 0.085, 0.522, 0.958, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.522 std_dev=0.437
OP1	B	0, 0.018, 0.461, 0.905, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.461 std_dev=0.444
N1	B	0, 0.027, 0.496, 0.966, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.496 std_dev=0.470
C5	B	0, 0.082, 0.554, 1.027, 1.546 max_d=1.546 avg_d=0.554 std_dev=0.473
N7	B	0, 0.148, 0.654, 1.159, 1.687 max_d=1.687 avg_d=0.654 std_dev=0.506
C4	B	0, -0.011, 0.513, 1.036, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.513 std_dev=0.524
C8	B	0, 0.116, 0.656, 1.196, 1.776 max_d=1.776 avg_d=0.656 std_dev=0.540
C2	B	0, -0.036, 0.505, 1.046, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.505 std_dev=0.541
N9	B	0, -0.004, 0.556, 1.116, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.556 std_dev=0.560
N3	B	0, -0.074, 0.497, 1.067, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.497 std_dev=0.571
N2	B	0, -0.044, 0.568, 1.180, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.568 std_dev=0.612
C1'	B	0, -0.097, 0.529, 1.155, 1.896 max_d=1.896 avg_d=0.529 std_dev=0.626
C5'	B	0, 0.020, 0.794, 1.568, 2.443 max_d=2.443 avg_d=0.794 std_dev=0.774
C2'	B	0, -0.185, 0.698, 1.581, 2.627 max_d=2.627 avg_d=0.698 std_dev=0.883
O2'	B	0, -0.394, 0.989, 2.371, 4.001 max_d=4.001 avg_d=0.989 std_dev=1.382

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.09	0.07	0.06	0.07
C2	0.05	0.00	0.14	0.10	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.12	0.02	0.22	0.25	0.17	0.22
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.07	0.04	0.12	0.14	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.08	0.09	0.05	0.07
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.03	0.09	0.09	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.11	0.09	0.06	0.07
C4	0.02	0.01	0.08	0.05	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01	0.21	0.21	0.16	0.20
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.06	0.04	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.02
C5	0.02	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.08	0.01	0.23	0.25	0.20	0.23
C5'	0.03	0.08	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.00	0.10	0.13	0.10	0.08	0.09	0.13	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.02	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.09	0.02	0.23	0.27	0.21	0.24
C8	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.09	0.05	0.03	0.22	0.17	0.19	0.19
N1	0.05	0.00	0.12	0.09	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.16	0.10	0.02	0.24	0.27	0.20	0.24
N3	0.05	0.00	0.14	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.11	0.02	0.20	0.21	0.15	0.20
N6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.09	0.09	0.03	0.22	0.25	0.20	0.22
N7	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.00	0.08	0.05	0.02	0.24	0.24	0.23	0.23
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.19	0.15	0.14	0.16
O2'	0.02	0.20	0.00	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.10	0.09	0.16	0.20	0.09	0.08	0.04	0.00	0.02	0.02	0.11	0.13	0.07	0.09
O3'	0.08	0.12	0.02	0.01	0.09	0.02	0.08	0.02	0.09	0.05	0.10	0.11	0.09	0.05	0.07	0.02	0.00	0.04	0.09	0.08	0.05	0.06
O4'	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.12	0.02	0.06	0.06
O5'	0.09	0.22	0.08	0.11	0.21	0.01	0.23	0.00	0.23	0.22	0.24	0.20	0.22	0.24	0.19	0.11	0.09	0.12	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.07	0.25	0.09	0.09	0.21	0.05	0.25	0.05	0.27	0.17	0.27	0.21	0.25	0.24	0.15	0.13	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.17	0.05	0.06	0.16	0.02	0.20	0.02	0.21	0.19	0.20	0.15	0.20	0.23	0.14	0.07	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.22	0.07	0.07	0.20	0.02	0.23	0.02	0.24	0.19	0.24	0.20	0.22	0.23	0.16	0.09	0.06	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.16	0.15	0.24	0.13	0.36	0.12	0.57	0.04	0.20	0.11	0.23	0.15	0.20	0.16	0.20	0.18	0.23	0.35	0.09	0.29	0.28	0.16
C2	0.17	0.16	0.38	0.10	0.20	0.34	0.30	0.56	0.32	0.33	0.25	0.14	0.13	0.37	0.24	0.47	0.14	0.16	0.39	0.40	0.19	0.25	0.13
C2'	0.23	0.15	0.23	0.28	0.17	0.37	0.19	0.63	0.10	0.28	0.11	0.22	0.14	0.29	0.22	0.31	0.19	0.25	0.35	0.12	0.29	0.37	0.16
C3'	0.22	0.13	0.22	0.26	0.17	0.34	0.21	0.59	0.14	0.29	0.09	0.21	0.13	0.30	0.21	0.30	0.16	0.22	0.34	0.20	0.29	0.33	0.17
C4	0.14	0.08	0.17	0.18	0.06	0.35	0.12	0.55	0.18	0.17	0.15	0.12	0.03	0.19	0.12	0.23	0.17	0.21	0.35	0.27	0.28	0.25	0.16
C4'	0.21	0.17	0.16	0.22	0.16	0.30	0.18	0.50	0.15	0.23	0.12	0.26	0.17	0.25	0.18	0.20	0.13	0.19	0.30	0.21	0.30	0.27	0.15
C5	0.14	0.11	0.09	0.20	0.01	0.35	0.09	0.51	0.19	0.10	0.18	0.12	0.04	0.10	0.07	0.11	0.18	0.21	0.32	0.25	0.34	0.22	0.18
C5'	0.18	0.14	0.15	0.16	0.14	0.19	0.19	0.39	0.19	0.22	0.12	0.23	0.13	0.25	0.16	0.20	0.05	0.11	0.19	0.28	0.26	0.33	0.08
C6	0.08	0.17	0.18	0.14	0.14	0.34	0.23	0.49	0.28	0.15	0.25	0.15	0.11	0.21	0.11	0.19	0.18	0.18	0.32	0.32	0.32	0.22	0.18
C8	0.27	0.20	0.18	0.29	0.21	0.35	0.16	0.51	0.10	0.20	0.15	0.22	0.22	0.16	0.21	0.17	0.20	0.25	0.30	0.05	0.38	0.22	0.19
N1	0.16	0.20	0.36	0.08	0.22	0.33	0.31	0.52	0.33	0.30	0.27	0.16	0.17	0.36	0.24	0.41	0.15	0.15	0.38	0.39	0.23	0.23	0.16
N3	0.14	0.10	0.29	0.14	0.13	0.35	0.22	0.58	0.25	0.26	0.18	0.12	0.06	0.30	0.18	0.39	0.15	0.19	0.39	0.34	0.22	0.25	0.14
N6	0.05	0.18	0.10	0.14	0.15	0.31	0.22	0.36	0.25	0.12	0.23	0.16	0.13	0.19	0.09	0.04	0.20	0.18	0.20	0.26	0.37	0.20	0.17
N7	0.27	0.14	0.18	0.28	0.19	0.34	0.13	0.47	0.09	0.19	0.13	0.15	0.18	0.14	0.20	0.19	0.22	0.25	0.28	0.10	0.41	0.20	0.21
N9	0.19	0.12	0.12	0.24	0.11	0.36	0.08	0.55	0.03	0.16	0.09	0.18	0.13	0.15	0.14	0.15	0.18	0.23	0.34	0.13	0.32	0.25	0.17
O2'	0.25	0.18	0.26	0.34	0.17	0.46	0.17	0.76	0.10	0.29	0.17	0.24	0.15	0.28	0.23	0.37	0.24	0.30	0.43	0.06	0.32	0.40	0.22
O3'	0.25	0.16	0.22	0.32	0.18	0.44	0.19	0.71	0.12	0.28	0.11	0.24	0.16	0.28	0.22	0.30	0.23	0.28	0.47	0.14	0.36	0.25	0.25
O4'	0.23	0.22	0.13	0.24	0.17	0.33	0.14	0.50	0.10	0.18	0.14	0.29	0.21	0.19	0.17	0.15	0.18	0.23	0.32	0.13	0.33	0.23	0.17
O5'	0.23	0.12	0.22	0.21	0.19	0.20	0.23	0.31	0.21	0.26	0.14	0.14	0.14	0.27	0.22	0.24	0.16	0.19	0.15	0.26	0.24	0.47	0.14
OP1	0.12	0.07	0.14	0.09	0.11	0.07	0.15	0.14	0.18	0.15	0.13	0.10	0.07	0.17	0.11	0.20	0.18	0.11	0.08	0.22	0.15	0.48	0.09
OP2	0.14	0.09	0.15	0.08	0.12	0.05	0.18	0.15	0.21	0.18	0.14	0.14	0.08	0.22	0.13	0.23	0.13	0.07	0.02	0.28	0.20	0.42	0.04
P	0.16	0.08	0.17	0.13	0.15	0.09	0.21	0.20	0.23	0.21	0.15	0.11	0.09	0.24	0.16	0.22	0.16	0.12	0.05	0.29	0.18	0.47	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.12	0.03	0.02	0.04	0.07	0.06	0.02	0.00	0.01	0.15	0.01	0.25	0.01	0.12	0.47	0.14
C2	0.06	0.00	0.09	0.04	0.00	0.06	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.21	0.10	0.12	0.01	0.19	0.42	0.08
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.09	0.05	0.12	0.10	0.07	0.01	0.00	0.03	0.01	0.51	0.03	0.18	0.73	0.44
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.08	0.00	0.15	0.01	0.13	0.24	0.06	0.08	0.04	0.23	0.12	0.02	0.01	0.01	0.26	0.15	0.09	0.24	0.11
C4	0.03	0.00	0.04	0.08	0.00	0.11	0.00	0.36	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.04	0.13	0.01	0.17	0.46	0.10
C4'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.19	0.38	0.07	0.15	0.07	0.37	0.18	0.07	0.02	0.01	0.01	0.24	0.40	0.15	0.23
C5	0.02	0.01	0.01	0.15	0.00	0.23	0.00	0.57	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.21	0.06	0.04	0.19	0.01	0.18	0.48	0.15
C5'	0.12	0.19	0.05	0.01	0.36	0.00	0.57	0.00	0.52	0.73	0.34	0.09	0.15	0.76	0.41	0.04	0.03	0.00	0.01	0.61	0.05	0.11	0.01
C6	0.03	0.01	0.01	0.13	0.01	0.19	0.01	0.52	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.08	0.04	0.19	0.00	0.19	0.47	0.15
C8	0.02	0.01	0.09	0.24	0.01	0.38	0.01	0.73	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.09	0.12	0.20	0.02	0.14	0.52	0.16
N1	0.04	0.00	0.05	0.06	0.01	0.07	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.07	0.13	0.01	0.18	0.44	0.12
N2	0.07	0.00	0.12	0.08	0.01	0.15	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.26	0.13	0.13	0.02	0.20	0.39	0.06
N3	0.06	0.00	0.10	0.04	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.20	0.10	0.14	0.01	0.18	0.42	0.08
N7	0.02	0.01	0.07	0.23	0.01	0.37	0.00	0.76	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.36	0.08	0.10	0.25	0.02	0.17	0.52	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.41	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.15	0.07	0.03	0.16	0.00	0.13	0.50	0.14
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.09	0.07	0.21	0.04	0.18	0.37	0.08	0.22	0.14	0.36	0.15	0.00	0.05	0.12	0.45	0.24	0.11	0.74	0.37
O3'	0.15	0.21	0.03	0.01	0.12	0.02	0.06	0.03	0.08	0.09	0.16	0.26	0.20	0.08	0.07	0.05	0.00	0.09	0.06	0.06	0.50	0.17	0.25
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.04	0.12	0.07	0.13	0.10	0.10	0.03	0.12	0.09	0.00	0.14	0.04	0.33	0.24	0.11
O5'	0.25	0.12	0.51	0.26	0.13	0.01	0.19	0.01	0.19	0.20	0.13	0.13	0.14	0.25	0.16	0.45	0.06	0.14	0.00	0.25	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.24	0.01	0.61	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.24	0.06	0.04	0.25	0.00	0.20	0.48	0.19
OP1	0.12	0.19	0.18	0.09	0.17	0.40	0.18	0.05	0.19	0.14	0.18	0.20	0.18	0.17	0.13	0.11	0.50	0.33	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00
OP2	0.47	0.42	0.73	0.24	0.46	0.15	0.48	0.11	0.47	0.52	0.44	0.39	0.42	0.52	0.50	0.74	0.17	0.24	0.02	0.48	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.08	0.44	0.11	0.10	0.23	0.15	0.01	0.15	0.16	0.12	0.06	0.08	0.18	0.14	0.37	0.25	0.11	0.01	0.19	0.00	0.00	0.00