Doublet Group distance statistics: 54958

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.032, 0.064, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.032 std_dev=0.032
C4	A	0, -0.004, 0.035, 0.073, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.035 std_dev=0.038
N9	A	0, -0.005, 0.036, 0.076, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.036 std_dev=0.040
N7	A	0, 0.006, 0.048, 0.089, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.048 std_dev=0.042
C8	A	0, 0.004, 0.046, 0.088, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.046 std_dev=0.042
N6	A	0, 0.003, 0.053, 0.104, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.053 std_dev=0.050
N3	A	0, -0.010, 0.041, 0.092, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.041 std_dev=0.051
N1	A	0, -0.010, 0.042, 0.093, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.042 std_dev=0.051
C2	A	0, -0.014, 0.044, 0.102, 0.126 max_d=0.126 avg_d=0.044 std_dev=0.058
C1'	A	0, -0.016, 0.056, 0.128, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.056 std_dev=0.072
O4'	A	0, 0.020, 0.141, 0.262, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.141 std_dev=0.121
C2'	A	0, 0.009, 0.239, 0.469, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.239 std_dev=0.230
OP2	B	0, 0.059, 0.321, 0.582, 0.641 max_d=0.641 avg_d=0.321 std_dev=0.262
C4'	A	0, 0.007, 0.271, 0.536, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.271 std_dev=0.264
O2'	A	0, 0.013, 0.305, 0.596, 0.698 max_d=0.698 avg_d=0.305 std_dev=0.292
C3'	A	0, 0.026, 0.322, 0.619, 0.715 max_d=0.715 avg_d=0.322 std_dev=0.296
C5'	A	0, 0.042, 0.448, 0.855, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.448 std_dev=0.407
O3'	A	0, 0.059, 0.491, 0.922, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.491 std_dev=0.432
OP1	B	0, 0.089, 0.532, 0.975, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.532 std_dev=0.443
P	A	0, 0.057, 0.510, 0.963, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.510 std_dev=0.453
P	B	0, -0.028, 0.449, 0.926, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.449 std_dev=0.477
O5'	A	0, -0.026, 0.665, 1.356, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.665 std_dev=0.691
O5'	B	0, -0.062, 0.844, 1.749, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.844 std_dev=0.905
N1	B	0, -0.140, 1.057, 2.254, 2.730 max_d=2.730 avg_d=1.057 std_dev=1.197
OP2	A	0, -0.181, 1.205, 2.590, 3.145 max_d=3.145 avg_d=1.205 std_dev=1.385
C5'	B	0, -0.227, 1.218, 2.663, 3.248 max_d=3.248 avg_d=1.218 std_dev=1.445
C6	B	0, -0.209, 1.284, 2.777, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.284 std_dev=1.493
OP1	A	0, -0.270, 1.253, 2.777, 3.397 max_d=3.397 avg_d=1.253 std_dev=1.523
C4	B	0, -0.240, 1.297, 2.834, 3.456 max_d=3.456 avg_d=1.297 std_dev=1.537
C2	B	0, -0.249, 1.311, 2.871, 3.503 max_d=3.503 avg_d=1.311 std_dev=1.560
N3	B	0, -0.286, 1.364, 3.014, 3.686 max_d=3.686 avg_d=1.364 std_dev=1.650
C5	B	0, -0.289, 1.458, 3.204, 3.913 max_d=3.913 avg_d=1.458 std_dev=1.746
C4'	B	0, -0.316, 1.464, 3.244, 3.969 max_d=3.969 avg_d=1.464 std_dev=1.780
O4'	B	0, -0.339, 1.464, 3.268, 4.005 max_d=4.005 avg_d=1.464 std_dev=1.803
C2'	B	0, -0.297, 1.507, 3.312, 4.044 max_d=4.044 avg_d=1.507 std_dev=1.804
C3'	B	0, -0.294, 1.529, 3.352, 4.092 max_d=4.092 avg_d=1.529 std_dev=1.823
N9	B	0, -0.324, 1.512, 3.348, 4.097 max_d=4.097 avg_d=1.512 std_dev=1.836
O6	B	0, -0.316, 1.558, 3.431, 4.193 max_d=4.193 avg_d=1.558 std_dev=1.874
C1'	B	0, -0.349, 1.548, 3.444, 4.218 max_d=4.218 avg_d=1.548 std_dev=1.896
N2	B	0, -0.413, 1.769, 3.951, 4.843 max_d=4.843 avg_d=1.769 std_dev=2.182
O3'	B	0, -0.339, 1.871, 4.081, 4.975 max_d=4.975 avg_d=1.871 std_dev=2.210
O2'	B	0, -0.424, 1.823, 4.069, 4.987 max_d=4.987 avg_d=1.823 std_dev=2.246
C8	B	0, -0.466, 1.951, 4.368, 5.357 max_d=5.357 avg_d=1.951 std_dev=2.417
N7	B	0, -0.478, 1.996, 4.470, 5.482 max_d=5.482 avg_d=1.996 std_dev=2.474

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.11	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.21	0.13	0.01
C2	0.11	0.00	0.26	0.23	0.02	0.12	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.29	0.30	0.04	0.02	0.70	0.48	0.04
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.06	0.21	0.26	0.07	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.18	0.18	0.05
C3'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.12	0.00	0.05	0.01	0.09	0.08	0.18	0.23	0.02	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.13	0.07
C4	0.05	0.02	0.13	0.12	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.13	0.15	0.01	0.06	0.63	0.41	0.03
C4'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.09	0.13	0.03	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.19	0.13	0.02
C5	0.04	0.01	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.08	0.07	0.01	0.13	0.88	0.45	0.06
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.07	0.03	0.08	0.10	0.09	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.42	0.29	0.01
C6	0.06	0.01	0.12	0.09	0.02	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.15	0.12	0.00	0.13	0.98	0.49	0.09
C8	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.08	0.01	0.17	0.70	0.34	0.05
N1	0.11	0.00	0.21	0.18	0.04	0.09	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.05	0.24	0.23	0.03	0.07	0.87	0.51	0.05
N3	0.11	0.01	0.26	0.23	0.00	0.13	0.02	0.08	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.27	0.29	0.05	0.01	0.55	0.43	0.05
N6	0.04	0.00	0.07	0.02	0.02	0.03	0.00	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.04	0.03	0.21	1.18	0.46	0.17
N7	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.06	0.02	0.20	0.96	0.42	0.10
N9	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.48	0.32	0.02
O2'	0.01	0.29	0.01	0.00	0.13	0.02	0.08	0.02	0.15	0.05	0.24	0.27	0.10	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.06
O3'	0.03	0.30	0.03	0.01	0.15	0.02	0.07	0.03	0.12	0.08	0.23	0.29	0.04	0.06	0.04	0.04	0.00	0.02	0.18	0.14	0.08	0.11
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.10	0.01	0.05	0.04
O5'	0.05	0.02	0.05	0.12	0.06	0.01	0.13	0.00	0.13	0.17	0.07	0.01	0.21	0.20	0.07	0.04	0.18	0.10	0.00	0.03	0.00	0.00
OP1	0.21	0.70	0.18	0.07	0.63	0.19	0.88	0.42	0.98	0.70	0.87	0.55	1.18	0.96	0.48	0.05	0.14	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01
OP2	0.13	0.48	0.18	0.13	0.41	0.13	0.45	0.29	0.49	0.34	0.51	0.43	0.46	0.42	0.32	0.05	0.08	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01
P	0.01	0.04	0.05	0.07	0.03	0.02	0.06	0.01	0.09	0.05	0.05	0.05	0.17	0.10	0.02	0.06	0.11	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	1.20	0.59	1.23	1.22	0.69	1.13	1.13	0.97	0.71	2.02	0.15	1.50	0.20	1.93	1.28	1.36	1.28	1.16	0.71	0.99	0.35	0.23	0.20
C2	1.46	0.58	1.51	1.51	0.81	1.44	1.17	1.26	0.66	2.15	0.18	1.53	0.12	1.95	1.47	1.54	1.54	1.46	0.99	0.85	0.57	0.07	0.45
C2'	1.20	0.56	1.23	1.21	0.71	1.10	1.13	0.92	0.71	2.00	0.13	1.46	0.15	1.91	1.28	1.40	1.30	1.14	0.67	0.98	0.32	0.24	0.16
C3'	1.17	0.60	1.21	1.17	0.70	1.06	1.16	0.90	0.74	2.05	0.15	1.53	0.20	1.99	1.28	1.37	1.25	1.11	0.68	1.05	0.37	0.18	0.19
C4	1.25	0.65	1.28	1.25	0.70	1.18	1.16	1.03	0.71	2.11	0.18	1.60	0.24	1.99	1.33	1.36	1.28	1.22	0.80	0.99	0.44	0.16	0.28
C4'	1.18	0.62	1.21	1.19	0.69	1.11	1.16	0.97	0.74	2.07	0.15	1.54	0.22	2.00	1.28	1.35	1.25	1.14	0.73	1.06	0.41	0.14	0.24
C5	1.08	0.79	1.08	1.02	0.59	0.98	1.12	0.86	0.68	2.09	0.26	1.76	0.41	2.01	1.23	1.14	1.00	1.05	0.70	1.02	0.39	0.15	0.23
C5'	1.16	0.65	1.19	1.16	0.68	1.08	1.20	0.96	0.78	2.12	0.15	1.60	0.27	2.07	1.29	1.31	1.20	1.12	0.75	1.13	0.48	0.06	0.29
C6	1.04	0.88	1.01	0.94	0.53	0.95	1.07	0.85	0.62	2.09	0.34	1.86	0.49	1.99	1.20	1.00	0.90	1.04	0.73	0.95	0.44	0.11	0.29
C8	1.05	0.73	1.07	0.98	0.60	0.91	1.15	0.79	0.74	2.07	0.19	1.69	0.37	2.03	1.21	1.17	0.98	0.99	0.63	1.11	0.31	0.17	0.16
N1	1.28	0.78	1.27	1.23	0.66	1.23	1.11	1.11	0.61	2.16	0.30	1.77	0.34	1.98	1.36	1.22	1.20	1.29	0.92	0.87	0.54	0.06	0.43
N3	1.44	0.52	1.48	1.50	0.82	1.41	1.19	1.23	0.71	2.13	0.12	1.44	0.07	1.96	1.46	1.57	1.56	1.42	0.94	0.92	0.53	0.11	0.39
N6	0.74	1.07	0.66	0.56	0.31	0.61	0.93	0.54	0.51	1.94	0.47	2.02	0.73	1.90	0.96	0.65	0.51	0.75	0.49	0.91	0.33	0.13	0.16
N7	0.95	0.82	0.96	0.86	0.53	0.81	1.11	0.70	0.70	2.05	0.26	1.79	0.47	2.02	1.14	1.03	0.83	0.91	0.58	1.09	0.31	0.15	0.15
N9	1.18	0.63	1.21	1.17	0.69	1.09	1.17	0.94	0.74	2.09	0.15	1.57	0.25	2.00	1.30	1.33	1.20	1.14	0.72	1.05	0.36	0.19	0.21
O2'	1.20	0.52	1.23	1.24	0.69	1.14	1.06	0.95	0.64	1.90	0.15	1.37	0.11	1.79	1.25	1.41	1.37	1.16	0.66	0.87	0.30	0.29	0.15
O3'	1.17	0.57	1.20	1.16	0.70	1.05	1.15	0.87	0.73	2.01	0.14	1.49	0.17	1.95	1.26	1.38	1.26	1.09	0.65	1.03	0.35	0.19	0.17
O4'	1.18	0.62	1.21	1.20	0.67	1.13	1.14	1.00	0.72	2.05	0.15	1.54	0.24	1.97	1.27	1.32	1.25	1.15	0.74	1.03	0.40	0.17	0.24
O5'	1.22	0.66	1.25	1.22	0.72	1.15	1.25	1.03	0.82	2.22	0.15	1.64	0.26	2.17	1.35	1.36	1.25	1.18	0.85	1.19	0.63	0.09	0.41
OP1	1.92	0.24	1.89	1.74	1.59	1.72	2.24	1.65	1.87	3.14	0.85	0.75	0.58	3.19	2.18	1.95	1.66	1.87	1.58	2.33	1.36	1.10	1.25
OP2	0.48	1.44	0.55	0.53	0.05	0.41	0.50	0.29	0.08	1.50	0.92	2.41	1.03	1.45	0.60	0.69	0.58	0.43	0.14	0.47	0.11	0.54	0.28
P	1.04	0.70	1.06	0.96	0.64	0.88	1.23	0.76	0.85	2.15	0.14	1.67	0.35	2.16	1.23	1.19	0.95	0.96	0.65	1.28	0.42	0.04	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.14	0.10	0.03	0.00	0.03	0.02	0.01	0.11	0.03	0.10	0.21	0.17
C2	0.10	0.00	0.56	0.55	0.01	0.45	0.01	0.79	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.36	0.21	0.18	0.99	0.01	1.09	1.19	1.09
C2'	0.00	0.56	0.00	0.01	0.21	0.01	0.02	0.01	0.10	0.38	0.35	0.74	0.58	0.28	0.06	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.08	0.10	0.05
C3'	0.01	0.55	0.01	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.09	0.36	0.35	0.76	0.54	0.28	0.04	0.01	0.01	0.00	0.10	0.03	0.20	0.22	0.14
C4	0.04	0.01	0.21	0.19	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.07	0.23	0.02	0.16	0.03	0.12
C4'	0.01	0.45	0.01	0.01	0.17	0.00	0.01	0.02	0.07	0.31	0.29	0.63	0.44	0.24	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.07	0.03	0.04
C5	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.26	0.03	0.42	0.65	0.45
C5'	0.01	0.79	0.01	0.01	0.27	0.02	0.04	0.00	0.12	0.59	0.51	1.09	0.75	0.48	0.08	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.06	0.02	0.03
C6	0.01	0.01	0.10	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.03	0.02	0.09	0.01	0.17	0.33	0.18
C8	0.04	0.01	0.38	0.36	0.01	0.31	0.01	0.59	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.18	0.14	0.11	1.05	0.07	1.22	1.60	1.33
N1	0.06	0.01	0.35	0.35	0.01	0.29	0.00	0.51	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.25	0.13	0.11	0.58	0.02	0.57	0.56	0.57
N2	0.14	0.00	0.74	0.76	0.02	0.63	0.01	1.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.49	0.32	0.25	1.44	0.02	1.71	1.95	1.69
N3	0.10	0.01	0.58	0.54	0.00	0.44	0.01	0.75	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.35	0.19	0.18	0.93	0.01	0.97	1.03	0.96
N7	0.03	0.01	0.28	0.28	0.01	0.24	0.01	0.48	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.12	0.09	0.91	0.08	1.19	1.62	1.27
N9	0.00	0.03	0.06	0.04	0.01	0.03	0.02	0.08	0.02	0.00	0.01	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.29	0.04	0.35	0.55	0.43
O2'	0.03	0.36	0.00	0.01	0.13	0.01	0.03	0.02	0.09	0.18	0.25	0.49	0.35	0.13	0.02	0.00	0.07	0.02	0.05	0.04	0.12	0.18	0.10
O3'	0.02	0.21	0.04	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.14	0.13	0.32	0.19	0.12	0.03	0.07	0.00	0.00	0.10	0.05	0.29	0.25	0.17
O4'	0.01	0.18	0.01	0.00	0.07	0.00	0.02	0.04	0.02	0.11	0.11	0.25	0.18	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.05	0.16	0.31	0.27
O5'	0.11	0.99	0.04	0.10	0.23	0.03	0.26	0.02	0.09	1.05	0.58	1.44	0.93	0.91	0.29	0.05	0.10	0.19	0.00	0.29	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.01	0.07	0.02	0.02	0.01	0.08	0.04	0.04	0.05	0.05	0.29	0.00	0.54	0.77	0.53
OP1	0.10	1.09	0.08	0.20	0.16	0.07	0.42	0.06	0.17	1.22	0.57	1.71	0.97	1.19	0.35	0.12	0.29	0.16	0.02	0.54	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	1.19	0.10	0.22	0.03	0.03	0.65	0.02	0.33	1.60	0.56	1.95	1.03	1.62	0.55	0.18	0.25	0.31	0.02	0.77	0.01	0.00	0.01
P	0.17	1.09	0.05	0.14	0.12	0.04	0.45	0.03	0.18	1.33	0.57	1.69	0.96	1.27	0.43	0.10	0.17	0.27	0.01	0.53	0.01	0.01	0.00