Doublet Group distance statistics: 54959

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
N3	A	0, 0.000, 0.026, 0.052, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N9	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C4	A	0, 0.000, 0.029, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N7	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C8	A	0, 0.000, 0.043, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.043 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.000, 0.165, 0.329, 0.329 max_d=0.329 avg_d=0.165 std_dev=0.165
C2'	A	0, 0.000, 0.239, 0.477, 0.477 max_d=0.477 avg_d=0.239 std_dev=0.239
OP1	B	0, 0.000, 0.299, 0.598, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.299 std_dev=0.299
OP2	B	0, 0.000, 0.369, 0.737, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.369 std_dev=0.369
C4'	A	0, 0.000, 0.425, 0.849, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.425 std_dev=0.425
P	B	0, 0.000, 0.601, 1.202, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.601 std_dev=0.601
O6	B	0, 0.000, 0.755, 1.509, 1.509 max_d=1.509 avg_d=0.755 std_dev=0.755
C5'	A	0, 0.000, 0.791, 1.583, 1.583 max_d=1.583 avg_d=0.791 std_dev=0.791
N7	B	0, 0.000, 0.795, 1.589, 1.589 max_d=1.589 avg_d=0.795 std_dev=0.795
C3'	A	0, 0.000, 0.806, 1.612, 1.612 max_d=1.612 avg_d=0.806 std_dev=0.806
C6	B	0, 0.000, 0.923, 1.846, 1.846 max_d=1.846 avg_d=0.923 std_dev=0.923
C8	B	0, 0.000, 0.987, 1.973, 1.973 max_d=1.973 avg_d=0.987 std_dev=0.987
O2'	A	0, 0.000, 1.048, 2.097, 2.097 max_d=2.097 avg_d=1.048 std_dev=1.048
C5	B	0, 0.000, 1.086, 2.172, 2.172 max_d=2.172 avg_d=1.086 std_dev=1.086
O5'	A	0, 0.000, 1.361, 2.722, 2.722 max_d=2.722 avg_d=1.361 std_dev=1.361
O3'	A	0, 0.000, 1.599, 3.197, 3.197 max_d=3.197 avg_d=1.599 std_dev=1.599
O5'	B	0, 0.000, 1.845, 3.690, 3.690 max_d=3.690 avg_d=1.845 std_dev=1.845
N1	B	0, 0.000, 1.929, 3.858, 3.858 max_d=3.858 avg_d=1.929 std_dev=1.929
P	A	0, 0.000, 1.976, 3.952, 3.952 max_d=3.952 avg_d=1.976 std_dev=1.976
N9	B	0, 0.000, 2.034, 4.069, 4.069 max_d=4.069 avg_d=2.034 std_dev=2.034
OP1	A	0, 0.000, 2.086, 4.172, 4.172 max_d=4.172 avg_d=2.086 std_dev=2.086
C4	B	0, 0.000, 2.176, 4.351, 4.351 max_d=4.351 avg_d=2.176 std_dev=2.176
OP2	A	0, 0.000, 2.508, 5.015, 5.015 max_d=5.015 avg_d=2.508 std_dev=2.508
C5'	B	0, 0.000, 2.701, 5.401, 5.401 max_d=5.401 avg_d=2.701 std_dev=2.701
O4'	B	0, 0.000, 2.868, 5.736, 5.736 max_d=5.736 avg_d=2.868 std_dev=2.868
C1'	B	0, 0.000, 3.007, 6.015, 6.015 max_d=6.015 avg_d=3.007 std_dev=3.007
C2	B	0, 0.000, 3.084, 6.169, 6.169 max_d=6.169 avg_d=3.084 std_dev=3.084
N3	B	0, 0.000, 3.272, 6.544, 6.544 max_d=6.544 avg_d=3.272 std_dev=3.272
C4'	B	0, 0.000, 3.279, 6.557, 6.557 max_d=6.557 avg_d=3.279 std_dev=3.279
C3'	B	0, 0.000, 3.439, 6.877, 6.877 max_d=6.877 avg_d=3.439 std_dev=3.439
C2'	B	0, 0.000, 3.684, 7.368, 7.368 max_d=7.368 avg_d=3.684 std_dev=3.684
N2	B	0, 0.000, 4.078, 8.155, 8.155 max_d=8.155 avg_d=4.078 std_dev=4.078
O3'	B	0, 0.000, 4.341, 8.682, 8.682 max_d=8.682 avg_d=4.341 std_dev=4.341
O2'	B	0, 0.000, 4.667, 9.334, 9.334 max_d=9.334 avg_d=4.667 std_dev=4.667

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.00	0.03	0.06	0.08	0.03
C2	0.00	0.00	0.08	0.13	0.00	0.11	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.15	0.08	0.48	0.62	0.87	0.63
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.13	0.07	0.03	0.08	0.06	0.05	0.05	0.03	0.00	0.02	0.02	0.28	0.21	0.38	0.30
C3'	0.03	0.13	0.00	0.00	0.20	0.01	0.30	0.02	0.30	0.38	0.22	0.09	0.36	0.39	0.23	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01
C4	0.00	0.00	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.28	0.01	0.04	0.37	0.46	0.60	0.42
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.17	0.12	0.15	0.08	0.20	0.15	0.08	0.29	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.07	0.30	0.00	0.14	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.32	0.21	0.03	0.44	0.59	0.72	0.50
C5'	0.03	0.22	0.13	0.02	0.15	0.01	0.18	0.00	0.24	0.04	0.26	0.17	0.27	0.12	0.06	0.13	0.22	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01
C6	0.00	0.00	0.07	0.30	0.00	0.17	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.36	0.18	0.05	0.53	0.73	0.93	0.65
C8	0.02	0.00	0.03	0.38	0.00	0.12	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.18	0.40	0.04	0.20	0.29	0.17	0.12
N1	0.00	0.01	0.08	0.22	0.00	0.15	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.37	0.01	0.07	0.54	0.74	0.99	0.70
N3	0.00	0.00	0.06	0.09	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.29	0.19	0.07	0.39	0.48	0.69	0.49
N6	0.02	0.01	0.05	0.36	0.02	0.20	0.02	0.27	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.35	0.31	0.06	0.55	0.83	0.98	0.69
N7	0.01	0.00	0.05	0.39	0.01	0.15	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.27	0.42	0.02	0.35	0.51	0.48	0.33
N9	0.00	0.00	0.03	0.23	0.00	0.08	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.18	0.09	0.00	0.22	0.27	0.29	0.20
O2'	0.01	0.34	0.00	0.02	0.28	0.29	0.32	0.13	0.36	0.18	0.37	0.29	0.35	0.27	0.18	0.00	0.09	0.25	0.17	0.14	0.43	0.23
O3'	0.16	0.15	0.02	0.01	0.01	0.05	0.21	0.22	0.18	0.40	0.01	0.19	0.31	0.42	0.09	0.09	0.00	0.10	0.16	0.33	0.10	0.20
O4'	0.00	0.08	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.06	0.02	0.00	0.25	0.10	0.00	0.12	0.09	0.20	0.13
O5'	0.03	0.48	0.28	0.02	0.37	0.03	0.44	0.01	0.53	0.20	0.54	0.39	0.55	0.35	0.22	0.17	0.16	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.06	0.62	0.21	0.04	0.46	0.02	0.59	0.01	0.73	0.29	0.74	0.48	0.83	0.51	0.27	0.14	0.33	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.87	0.38	0.05	0.60	0.04	0.72	0.02	0.93	0.17	0.99	0.69	0.98	0.48	0.29	0.43	0.10	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.03	0.63	0.30	0.01	0.42	0.03	0.50	0.01	0.65	0.12	0.70	0.49	0.69	0.33	0.20	0.23	0.20	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.05	0.70	0.75	0.29	0.24	0.41	0.12	0.33	0.50	0.12	0.11	0.13	0.56	0.36	0.59	0.93	0.02	0.68	0.41	0.19	0.04	0.24
C2	0.35	0.00	0.79	0.92	0.22	0.40	0.22	0.24	0.06	0.47	0.03	0.08	0.10	0.40	0.35	0.75	1.12	0.05	0.71	0.02	0.20	0.01	0.18
C2'	0.26	0.11	0.59	0.64	0.26	0.21	0.33	0.11	0.29	0.37	0.16	0.01	0.17	0.40	0.30	0.48	0.79	0.01	0.63	0.34	0.08	0.06	0.18
C3'	0.39	0.09	0.69	0.77	0.39	0.36	0.56	0.31	0.50	0.65	0.21	0.13	0.18	0.73	0.47	0.53	0.90	0.17	0.90	0.68	0.43	0.34	0.53
C4	0.16	0.22	0.53	0.64	0.10	0.16	0.27	0.08	0.12	0.48	0.14	0.35	0.11	0.55	0.24	0.42	0.79	0.12	0.65	0.21	0.20	0.04	0.23
C4'	0.09	0.31	0.47	0.57	0.10	0.06	0.34	0.02	0.27	0.49	0.12	0.59	0.19	0.61	0.22	0.29	0.72	0.17	0.68	0.51	0.34	0.25	0.37
C5	0.23	0.69	0.08	0.24	0.32	0.15	0.01	0.12	0.14	0.32	0.51	0.83	0.62	0.48	0.11	0.05	0.35	0.41	0.52	0.12	0.20	0.08	0.24
C5'	0.23	0.85	0.13	0.31	0.24	0.18	0.12	0.13	0.00	0.37	0.57	1.27	0.68	0.53	0.04	0.13	0.43	0.42	0.62	0.35	0.45	0.38	0.45
C6	0.34	0.69	0.05	0.14	0.43	0.23	0.15	0.18	0.22	0.20	0.51	0.81	0.68	0.32	0.24	0.14	0.25	0.52	0.46	0.02	0.19	0.07	0.21
C8	0.20	0.76	0.08	0.22	0.24	0.16	0.11	0.13	0.01	0.33	0.54	0.99	0.62	0.53	0.05	0.10	0.31	0.37	0.52	0.41	0.19	0.09	0.26
N1	0.01	0.33	0.36	0.53	0.11	0.10	0.00	0.04	0.11	0.31	0.27	0.42	0.27	0.29	0.05	0.31	0.68	0.22	0.59	0.04	0.20	0.02	0.18
N3	0.43	0.11	0.88	0.96	0.34	0.42	0.35	0.25	0.19	0.54	0.08	0.02	0.22	0.51	0.44	0.81	1.16	0.09	0.73	0.13	0.20	0.00	0.21
N6	0.84	1.01	0.60	0.39	0.81	0.67	0.38	0.49	0.37	0.07	0.72	1.13	1.09	0.14	0.66	0.68	0.30	0.95	0.23	0.07	0.16	0.12	0.19
N7	0.46	1.09	0.20	0.01	0.56	0.35	0.11	0.25	0.22	0.22	0.80	1.29	0.99	0.46	0.29	0.39	0.06	0.57	0.44	0.22	0.19	0.11	0.26
N9	0.12	0.25	0.47	0.57	0.10	0.10	0.31	0.04	0.20	0.46	0.14	0.43	0.14	0.57	0.22	0.34	0.71	0.15	0.63	0.38	0.20	0.06	0.25
O2'	0.05	0.12	0.40	0.43	0.05	0.01	0.02	0.12	0.05	0.03	0.05	0.17	0.12	0.07	0.03	0.34	0.61	0.22	0.32	0.16	0.32	0.44	0.19
O3'	0.45	0.33	0.70	0.75	0.48	0.37	0.58	0.28	0.58	0.61	0.43	0.21	0.36	0.67	0.51	0.59	0.86	0.21	0.82	0.71	0.26	0.21	0.40
O4'	0.09	0.28	0.52	0.61	0.09	0.05	0.31	0.04	0.23	0.46	0.12	0.52	0.17	0.56	0.21	0.37	0.79	0.22	0.60	0.42	0.26	0.13	0.26
O5'	0.21	1.08	0.09	0.35	0.31	0.06	0.07	0.10	0.14	0.44	0.81	1.57	0.82	0.59	0.04	0.20	0.45	0.30	0.85	0.23	0.71	0.67	0.74
OP1	0.35	1.37	0.14	0.20	0.44	0.14	0.05	0.14	0.16	0.49	0.97	2.04	1.09	0.67	0.11	0.53	0.24	0.33	0.96	0.28	1.01	1.02	1.04
OP2	0.51	1.86	0.29	0.15	0.75	0.13	0.28	0.24	0.61	0.34	1.51	2.57	1.46	0.47	0.32	0.69	0.21	0.39	1.06	0.19	1.14	1.18	1.18
P	0.51	1.60	0.24	0.11	0.63	0.25	0.16	0.02	0.40	0.33	1.22	2.25	1.29	0.50	0.28	0.61	0.18	0.49	0.84	0.04	0.89	0.89	0.89

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.13	0.01	0.18	0.64	0.18
C2	0.00	0.00	0.26	0.20	0.01	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.17	0.30	0.22	0.19	0.01	0.23	0.62	0.19
C2'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.15	0.02	0.06	0.00	0.11	0.12	0.20	0.31	0.27	0.07	0.02	0.00	0.06	0.02	0.04	0.08	0.33	0.66	0.30
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.17	0.01	0.17	0.01	0.20	0.09	0.21	0.21	0.18	0.13	0.11	0.01	0.01	0.00	0.12	0.20	0.25	0.54	0.28
C4	0.00	0.01	0.15	0.17	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.22	0.12	0.29	0.01	0.20	0.55	0.11
C4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.03	0.17	0.05	0.16	0.12	0.15	0.05	0.12	0.05	0.00	0.01	0.06	0.06	0.51	0.12
C5	0.00	0.01	0.06	0.17	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.04	0.20	0.04	0.44	0.01	0.17	0.37	0.01
C5'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.03	0.27	0.09	0.27	0.19	0.24	0.07	0.10	0.01	0.02	0.00	0.09	0.29	0.35	0.00
C6	0.01	0.01	0.11	0.20	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.07	0.43	0.01	0.17	0.35	0.01
C8	0.00	0.01	0.12	0.09	0.00	0.17	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.07	0.15	0.55	0.01	0.12	0.27	0.12
N1	0.01	0.01	0.20	0.21	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.29	0.16	0.31	0.01	0.20	0.49	0.10
N2	0.00	0.01	0.31	0.21	0.01	0.16	0.02	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.25	0.32	0.26	0.11	0.02	0.25	0.68	0.25
N3	0.01	0.01	0.27	0.18	0.00	0.12	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.19	0.27	0.24	0.15	0.01	0.23	0.67	0.22
N7	0.00	0.01	0.07	0.13	0.00	0.15	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.14	0.12	0.09	0.58	0.01	0.11	0.17	0.15
N9	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.13	0.00	0.33	0.01	0.17	0.52	0.07
O2'	0.03	0.17	0.00	0.01	0.05	0.12	0.04	0.10	0.00	0.16	0.09	0.25	0.19	0.14	0.03	0.00	0.07	0.12	0.02	0.04	0.18	0.58	0.20
O3'	0.05	0.30	0.06	0.01	0.22	0.05	0.20	0.01	0.24	0.07	0.29	0.32	0.27	0.12	0.13	0.07	0.00	0.04	0.29	0.23	0.27	0.47	0.32
O4'	0.00	0.22	0.02	0.00	0.12	0.00	0.04	0.02	0.07	0.15	0.16	0.26	0.24	0.09	0.00	0.12	0.04	0.00	0.15	0.03	0.02	0.63	0.12
O5'	0.13	0.19	0.04	0.12	0.29	0.01	0.44	0.00	0.43	0.55	0.31	0.11	0.15	0.58	0.33	0.02	0.29	0.15	0.00	0.50	0.00	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.08	0.20	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.23	0.03	0.50	0.00	0.14	0.22	0.09
OP1	0.18	0.23	0.33	0.25	0.20	0.06	0.17	0.29	0.17	0.12	0.20	0.25	0.23	0.11	0.17	0.18	0.27	0.02	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00
OP2	0.64	0.62	0.66	0.54	0.55	0.51	0.37	0.35	0.35	0.27	0.49	0.68	0.67	0.17	0.52	0.58	0.47	0.63	0.02	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.19	0.30	0.28	0.11	0.12	0.01	0.00	0.01	0.12	0.10	0.25	0.22	0.15	0.07	0.20	0.32	0.12	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00