Doublet Group distance statistics: 54962

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C5	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.000, 0.027, 0.054, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.027 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.000, 0.032, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
N6	A	0, 0.000, 0.081, 0.161, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.081 std_dev=0.081
O2'	A	0, 0.000, 0.281, 0.561, 0.561 max_d=0.561 avg_d=0.281 std_dev=0.281
C2'	A	0, 0.000, 0.358, 0.716, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.358 std_dev=0.358
O4'	A	0, 0.000, 0.374, 0.748, 0.748 max_d=0.748 avg_d=0.374 std_dev=0.374
P	B	0, 0.000, 0.405, 0.809, 0.809 max_d=0.809 avg_d=0.405 std_dev=0.405
OP2	B	0, 0.000, 0.528, 1.057, 1.057 max_d=1.057 avg_d=0.528 std_dev=0.528
C3'	A	0, 0.000, 0.629, 1.258, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.629 std_dev=0.629
C4'	A	0, 0.000, 0.637, 1.274, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.637 std_dev=0.637
O3'	A	0, 0.000, 0.819, 1.638, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.819 std_dev=0.819
OP1	B	0, 0.000, 1.020, 2.040, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.020 std_dev=1.020
O5'	A	0, 0.000, 1.057, 2.114, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.057 std_dev=1.057
C5'	A	0, 0.000, 1.064, 2.129, 2.129 max_d=2.129 avg_d=1.064 std_dev=1.064
O5'	B	0, 0.000, 1.377, 2.753, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.377 std_dev=1.377
P	A	0, 0.000, 1.418, 2.837, 2.837 max_d=2.837 avg_d=1.418 std_dev=1.418
OP1	A	0, 0.000, 1.549, 3.098, 3.098 max_d=3.098 avg_d=1.549 std_dev=1.549
OP2	A	0, 0.000, 1.586, 3.172, 3.172 max_d=3.172 avg_d=1.586 std_dev=1.586
C5'	B	0, 0.000, 2.168, 4.337, 4.337 max_d=4.337 avg_d=2.168 std_dev=2.168
C8	B	0, 0.000, 2.577, 5.153, 5.153 max_d=5.153 avg_d=2.577 std_dev=2.577
C4'	B	0, 0.000, 2.875, 5.751, 5.751 max_d=5.751 avg_d=2.875 std_dev=2.875
O4'	B	0, 0.000, 2.917, 5.833, 5.833 max_d=5.833 avg_d=2.917 std_dev=2.917
N7	B	0, 0.000, 2.992, 5.984, 5.984 max_d=5.984 avg_d=2.992 std_dev=2.992
C3'	B	0, 0.000, 3.020, 6.040, 6.040 max_d=6.040 avg_d=3.020 std_dev=3.020
C2'	B	0, 0.000, 3.176, 6.352, 6.352 max_d=6.352 avg_d=3.176 std_dev=3.176
N9	B	0, 0.000, 3.186, 6.372, 6.372 max_d=6.372 avg_d=3.186 std_dev=3.186
C1'	B	0, 0.000, 3.290, 6.580, 6.580 max_d=6.580 avg_d=3.290 std_dev=3.290
C5	B	0, 0.000, 3.758, 7.517, 7.517 max_d=7.517 avg_d=3.758 std_dev=3.758
C4	B	0, 0.000, 3.882, 7.764, 7.764 max_d=7.764 avg_d=3.882 std_dev=3.882
O2'	B	0, 0.000, 4.052, 8.104, 8.104 max_d=8.104 avg_d=4.052 std_dev=4.052
O3'	B	0, 0.000, 4.230, 8.460, 8.460 max_d=8.460 avg_d=4.230 std_dev=4.230
C6	B	0, 0.000, 4.539, 9.078, 9.078 max_d=9.078 avg_d=4.539 std_dev=4.539
N3	B	0, 0.000, 4.670, 9.341, 9.341 max_d=9.341 avg_d=4.670 std_dev=4.670
O6	B	0, 0.000, 4.785, 9.570, 9.570 max_d=9.570 avg_d=4.785 std_dev=4.785
N1	B	0, 0.000, 5.223, 10.445, 10.445 max_d=10.445 avg_d=5.223 std_dev=5.223
C2	B	0, 0.000, 5.271, 10.542, 10.542 max_d=10.542 avg_d=5.271 std_dev=5.271
N2	B	0, 0.000, 6.127, 12.255, 12.255 max_d=12.255 avg_d=6.127 std_dev=6.127

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.20	0.28	0.15	0.24
C2	0.01	0.00	0.14	0.30	0.01	0.15	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.32	0.01	0.24	0.46	0.28	0.34
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.10	0.15	0.00	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00	0.17	0.27	0.15	0.23
C3'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.18	0.00	0.12	0.02	0.17	0.06	0.26	0.28	0.13	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.14	0.15	0.18	0.19
C4	0.01	0.01	0.05	0.18	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.02	0.29	0.48	0.32	0.38
C4'	0.01	0.15	0.01	0.00	0.09	0.00	0.06	0.00	0.08	0.04	0.13	0.14	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01
C5	0.03	0.01	0.00	0.12	0.00	0.06	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.04	0.39	0.64	0.46	0.52
C5'	0.02	0.25	0.01	0.02	0.18	0.00	0.15	0.00	0.19	0.01	0.24	0.23	0.15	0.07	0.09	0.02	0.02	0.01	0.00	0.21	0.19	0.00
C6	0.02	0.00	0.04	0.17	0.00	0.08	0.01	0.19	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.19	0.04	0.38	0.67	0.49	0.53
C8	0.03	0.01	0.09	0.06	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.08	0.06	0.06	0.46	0.63	0.48	0.56
N1	0.01	0.00	0.10	0.26	0.00	0.13	0.01	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.29	0.02	0.31	0.57	0.39	0.44
N3	0.00	0.00	0.15	0.28	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.28	0.00	0.21	0.39	0.22	0.29
N6	0.04	0.02	0.00	0.13	0.01	0.05	0.01	0.15	0.00	0.04	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.07	0.15	0.07	0.46	0.79	0.62	0.65
N7	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.02	0.08	0.01	0.06	0.47	0.74	0.56	0.63
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.01	0.31	0.45	0.30	0.39
O2'	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.05	0.08	0.03	0.02	0.07	0.08	0.05	0.00	0.02	0.03	0.00	0.11	0.08	0.03
O3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.17	0.01	0.12	0.02	0.19	0.06	0.29	0.28	0.15	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.02
O4'	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.00	0.00	0.12	0.13	0.09	0.13
O5'	0.20	0.24	0.17	0.14	0.29	0.01	0.39	0.00	0.38	0.46	0.31	0.21	0.46	0.47	0.31	0.00	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.28	0.46	0.27	0.15	0.48	0.05	0.64	0.21	0.67	0.63	0.57	0.39	0.79	0.74	0.45	0.11	0.02	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.28	0.15	0.18	0.32	0.03	0.46	0.19	0.49	0.48	0.39	0.22	0.62	0.56	0.30	0.08	0.04	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.34	0.23	0.19	0.38	0.01	0.52	0.00	0.53	0.56	0.44	0.29	0.65	0.63	0.39	0.03	0.02	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.99	1.38	0.86	0.77	1.29	0.67	1.30	0.35	1.35	1.15	1.39	1.39	1.32	1.22	1.18	0.57	0.89	0.85	0.27	1.32	0.41	0.11	0.00
C2	0.00	0.55	0.43	0.36	0.58	0.23	0.90	0.29	0.97	0.76	0.78	0.44	0.41	1.04	0.45	1.00	0.50	0.04	0.17	1.12	0.40	0.18	0.10
C2'	0.80	1.20	0.63	0.60	1.14	0.54	1.22	0.30	1.28	1.07	1.27	1.19	1.13	1.18	1.03	0.24	0.65	0.72	0.24	1.30	0.34	0.16	0.04
C3'	0.90	1.15	0.76	0.81	1.13	0.72	1.17	0.48	1.19	1.10	1.19	1.13	1.12	1.16	1.07	0.38	0.94	0.84	0.41	1.19	0.19	0.25	0.16
C4	0.70	0.99	0.47	0.50	1.01	0.44	1.09	0.21	1.09	1.03	1.05	0.95	0.95	1.10	0.94	0.05	0.53	0.63	0.19	1.10	0.38	0.14	0.00
C4'	1.02	1.30	0.93	0.93	1.23	0.80	1.22	0.50	1.25	1.12	1.29	1.33	1.27	1.16	1.15	0.66	1.15	0.92	0.40	1.22	0.30	0.16	0.09
C5	0.76	0.87	0.55	0.72	0.92	0.61	0.93	0.36	0.89	0.96	0.88	0.85	0.88	0.95	0.92	0.19	0.81	0.74	0.31	0.85	0.33	0.12	0.03
C5'	1.12	1.28	1.06	1.15	1.23	0.99	1.19	0.69	1.18	1.15	1.23	1.30	1.28	1.14	1.20	0.83	1.46	1.05	0.56	1.11	0.16	0.22	0.20
C6	0.40	0.56	0.07	0.30	0.62	0.29	0.71	0.13	0.68	0.77	0.62	0.52	0.55	0.80	0.62	0.30	0.34	0.44	0.14	0.69	0.33	0.13	0.01
C8	1.15	1.21	1.10	1.21	1.20	1.01	1.10	0.66	1.06	1.09	1.13	1.24	1.25	1.03	1.19	0.86	1.50	1.07	0.49	0.96	0.32	0.08	0.08
N1	0.05	0.37	0.50	0.31	0.42	0.20	0.67	0.26	0.70	0.63	0.55	0.28	0.27	0.85	0.33	0.95	0.36	0.03	0.17	0.82	0.37	0.17	0.10
N3	0.36	0.87	0.03	0.02	0.87	0.07	1.09	0.07	1.15	0.94	1.04	0.78	0.76	1.15	0.75	0.49	0.09	0.33	0.01	1.25	0.40	0.18	0.05
N6	0.39	0.42	0.09	0.44	0.47	0.42	0.48	0.28	0.44	0.58	0.42	0.40	0.43	0.54	0.50	0.18	0.54	0.50	0.28	0.41	0.26	0.11	0.04
N7	1.06	1.02	0.97	1.21	1.05	1.00	0.94	0.68	0.88	0.99	0.94	1.04	1.08	0.90	1.08	0.72	1.47	1.03	0.52	0.77	0.29	0.07	0.09
N9	0.97	1.21	0.84	0.84	1.18	0.72	1.17	0.41	1.17	1.10	1.20	1.21	1.19	1.13	1.12	0.52	0.98	0.86	0.31	1.13	0.38	0.10	0.02
O2'	0.71	1.26	0.52	0.40	1.14	0.38	1.25	0.14	1.36	1.03	1.36	1.26	1.14	1.19	0.98	0.13	0.38	0.60	0.11	1.42	0.43	0.10	0.05
O3'	0.80	1.08	0.66	0.72	1.06	0.65	1.14	0.44	1.17	1.06	1.14	1.04	1.03	1.15	1.00	0.24	0.81	0.77	0.39	1.20	0.15	0.28	0.18
O4'	1.07	1.40	1.00	0.94	1.29	0.79	1.25	0.44	1.29	1.12	1.37	1.44	1.36	1.16	1.20	0.79	1.17	0.93	0.32	1.23	0.44	0.05	0.02
O5'	0.77	0.93	0.76	0.84	0.83	0.63	0.71	0.26	0.70	0.64	0.83	1.02	0.94	0.60	0.78	0.65	1.27	0.66	0.05	0.60	0.76	0.41	0.39
OP1	0.42	0.36	0.46	0.69	0.30	0.44	0.11	0.09	0.04	0.13	0.19	0.46	0.43	0.00	0.31	0.41	1.27	0.35	0.19	0.12	1.00	0.85	0.72
OP2	0.79	0.93	0.83	0.92	0.77	0.67	0.58	0.24	0.57	0.50	0.75	1.06	0.95	0.42	0.72	0.84	1.47	0.66	0.03	0.41	0.95	0.66	0.58
P	0.61	0.67	0.63	0.78	0.57	0.55	0.41	0.17	0.37	0.38	0.52	0.77	0.71	0.29	0.55	0.57	1.30	0.51	0.08	0.23	0.91	0.66	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.11	0.02	0.09	0.10	0.07
C2	0.04	0.00	0.06	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.32	0.03	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.17	0.05	0.09	0.01	0.10	0.07	0.09	0.02	0.00	0.04	0.02	0.33	0.08	0.37	0.36	0.33
C3'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.06	0.14	0.04	0.01	0.01	0.13	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.01
C4	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.22	0.01	0.08	0.02	0.06	0.08	0.04
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.02	0.02	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02
C5	0.00	0.01	0.05	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.24	0.15	0.00	0.08	0.02	0.09	0.11	0.07
C5'	0.05	0.00	0.17	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.08	0.03	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.07	0.02	0.02	0.00
C6	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.25	0.19	0.01	0.08	0.01	0.08	0.10	0.06
C8	0.02	0.01	0.09	0.14	0.00	0.02	0.01	0.08	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.00	0.01	0.11	0.04	0.14	0.16	0.14
N1	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.16	0.26	0.02	0.07	0.02	0.05	0.07	0.02
N2	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.06	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.35	0.06	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04
N3	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.33	0.02	0.06	0.01	0.02	0.05	0.00
N7	0.01	0.02	0.09	0.13	0.00	0.02	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.27	0.02	0.00	0.09	0.04	0.13	0.15	0.12
N9	0.00	0.00	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.14	0.00	0.09	0.03	0.09	0.10	0.07
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.14	0.16	0.24	0.01	0.25	0.23	0.16	0.01	0.04	0.27	0.13	0.00	0.02	0.11	0.28	0.30	0.34	0.42	0.29
O3'	0.23	0.32	0.04	0.01	0.22	0.00	0.15	0.15	0.19	0.00	0.26	0.35	0.33	0.02	0.14	0.02	0.00	0.16	0.12	0.17	0.17	0.10	0.13
O4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.00	0.00	0.11	0.16	0.00	0.02	0.01	0.07	0.05	0.07
O5'	0.11	0.06	0.33	0.01	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.11	0.07	0.03	0.06	0.09	0.09	0.28	0.12	0.02	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00
O6	0.02	0.02	0.08	0.06	0.02	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.03	0.30	0.17	0.01	0.09	0.00	0.10	0.11	0.08
OP1	0.09	0.02	0.37	0.06	0.06	0.01	0.09	0.02	0.08	0.14	0.05	0.02	0.02	0.13	0.09	0.34	0.17	0.07	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.05	0.36	0.01	0.08	0.02	0.11	0.02	0.10	0.16	0.07	0.03	0.05	0.15	0.10	0.42	0.10	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.01	0.33	0.01	0.04	0.02	0.07	0.00	0.06	0.14	0.02	0.04	0.00	0.12	0.07	0.29	0.13	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00