Doublet Group distance statistics: 54975

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 7, 1, 4, 0, 1, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.012, 0.026, 0.039, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.026 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.009, 0.023, 0.037, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.006, 0.022, 0.037, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.022 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.012, 0.030, 0.048, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.030 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.017, 0.037, 0.056, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.037 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.033 std_dev=0.021
O4'	A	0, 0.044, 0.216, 0.388, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.216 std_dev=0.172
C2'	A	0, 0.065, 0.302, 0.540, 0.719 max_d=0.719 avg_d=0.302 std_dev=0.238
P	B	0, 0.149, 0.395, 0.642, 0.911 max_d=0.911 avg_d=0.395 std_dev=0.247
OP1	B	0, 0.148, 0.413, 0.678, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.413 std_dev=0.265
C4'	A	0, 0.115, 0.380, 0.646, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.380 std_dev=0.265
OP2	B	0, 0.077, 0.365, 0.654, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.365 std_dev=0.289
O5'	A	0, 0.163, 0.507, 0.851, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.507 std_dev=0.344
O5'	B	0, 0.215, 0.561, 0.907, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.561 std_dev=0.346
C3'	A	0, 0.113, 0.469, 0.825, 1.060 max_d=1.060 avg_d=0.469 std_dev=0.356
O2'	A	0, 0.143, 0.519, 0.896, 1.096 max_d=1.096 avg_d=0.519 std_dev=0.377
C4	B	0, 0.210, 0.631, 1.053, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.631 std_dev=0.422
N1	B	0, 0.238, 0.682, 1.126, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.682 std_dev=0.444
N3	B	0, 0.262, 0.718, 1.174, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.718 std_dev=0.456
O4	B	0, 0.230, 0.687, 1.145, 1.535 max_d=1.535 avg_d=0.687 std_dev=0.458
C5'	A	0, 0.173, 0.633, 1.093, 1.436 max_d=1.436 avg_d=0.633 std_dev=0.460
C5	B	0, 0.133, 0.594, 1.055, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.594 std_dev=0.461
P	A	0, 0.248, 0.710, 1.173, 1.410 max_d=1.410 avg_d=0.710 std_dev=0.462
C2	B	0, 0.286, 0.751, 1.216, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.751 std_dev=0.465
C6	B	0, 0.135, 0.615, 1.094, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.615 std_dev=0.480
C1'	B	0, 0.269, 0.761, 1.254, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.761 std_dev=0.493
C3'	B	0, 0.263, 0.756, 1.250, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.756 std_dev=0.493
C2'	B	0, 0.298, 0.798, 1.299, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.798 std_dev=0.500
C5'	B	0, 0.205, 0.706, 1.208, 1.624 max_d=1.624 avg_d=0.706 std_dev=0.502
O4'	B	0, 0.219, 0.734, 1.249, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.734 std_dev=0.515
OP2	A	0, 0.310, 0.837, 1.364, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.837 std_dev=0.527
C4'	B	0, 0.200, 0.752, 1.303, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.752 std_dev=0.552
O2	B	0, 0.303, 0.870, 1.436, 1.993 max_d=1.993 avg_d=0.870 std_dev=0.567
OP1	A	0, 0.298, 0.869, 1.441, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.869 std_dev=0.572
O2'	B	0, 0.364, 0.957, 1.550, 1.977 max_d=1.977 avg_d=0.957 std_dev=0.593
O3'	A	0, 0.185, 0.784, 1.383, 1.686 max_d=1.686 avg_d=0.784 std_dev=0.599
O3'	B	0, 0.278, 0.905, 1.531, 2.132 max_d=2.132 avg_d=0.905 std_dev=0.627

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.00	0.10	0.11	0.10	0.08
C2	0.04	0.00	0.15	0.10	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.16	0.07	0.10	0.11	0.21	0.12
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.07	0.01	0.03	0.02	0.06	0.10	0.11	0.16	0.04	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.11	0.09	0.06
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.02	0.07	0.18	0.07	0.10	0.09	0.16	0.07	0.02	0.01	0.01	0.11	0.14	0.11	0.11
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.14	0.06	0.04	0.10	0.10	0.18	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.09	0.04	0.04	0.08	0.09	0.04	0.06	0.02	0.01	0.02	0.11	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.02	0.11	0.15	0.23	0.15
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.12	0.10	0.07	0.14	0.14	0.07	0.06	0.04	0.03	0.01	0.12	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.06	0.04	0.12	0.17	0.26	0.17
C8	0.01	0.01	0.10	0.18	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.21	0.04	0.11	0.12	0.17	0.12
N1	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.21	0.10	0.05	0.11	0.14	0.25	0.15
N3	0.03	0.00	0.16	0.10	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.17	0.07	0.10	0.10	0.18	0.10
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.12	0.11	0.04	0.13	0.21	0.30	0.20
N7	0.02	0.01	0.07	0.16	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.20	0.03	0.12	0.17	0.23	0.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.09	0.09	0.15	0.10
O2'	0.02	0.26	0.01	0.02	0.14	0.06	0.10	0.06	0.14	0.07	0.21	0.25	0.12	0.05	0.04	0.00	0.08	0.06	0.06	0.12	0.08	0.07
O3'	0.04	0.16	0.04	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.06	0.21	0.10	0.17	0.11	0.20	0.05	0.08	0.00	0.03	0.20	0.24	0.20	0.21
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.01	0.06	0.03	0.00	0.16	0.17	0.13	0.13
O5'	0.10	0.10	0.06	0.11	0.10	0.02	0.11	0.01	0.12	0.11	0.11	0.10	0.13	0.12	0.09	0.06	0.20	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.11	0.11	0.14	0.10	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.14	0.10	0.21	0.17	0.09	0.12	0.24	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.21	0.09	0.11	0.18	0.04	0.23	0.02	0.26	0.17	0.25	0.18	0.30	0.23	0.15	0.08	0.20	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.06	0.11	0.11	0.02	0.15	0.01	0.17	0.12	0.15	0.10	0.20	0.16	0.10	0.07	0.21	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.28	0.16	0.09	0.20	0.10	0.16	0.11	0.17	0.21	0.28	0.34	0.21	0.15	0.17	0.17	0.14	0.16	0.15	0.15
C2	0.18	0.23	0.14	0.14	0.20	0.15	0.26	0.16	0.21	0.19	0.21	0.29	0.15	0.21	0.27	0.19	0.19	0.22	0.22	0.20
C2'	0.16	0.21	0.13	0.14	0.17	0.12	0.18	0.12	0.18	0.17	0.22	0.25	0.18	0.20	0.15	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16
C3'	0.14	0.19	0.11	0.10	0.15	0.07	0.14	0.07	0.15	0.15	0.20	0.23	0.16	0.16	0.15	0.13	0.09	0.11	0.13	0.09
C4	0.16	0.23	0.13	0.08	0.14	0.09	0.09	0.11	0.12	0.17	0.23	0.29	0.16	0.17	0.15	0.14	0.15	0.17	0.17	0.16
C4'	0.17	0.23	0.14	0.08	0.16	0.08	0.15	0.09	0.15	0.18	0.23	0.28	0.19	0.15	0.14	0.15	0.11	0.13	0.13	0.11
C5	0.18	0.25	0.15	0.09	0.21	0.10	0.14	0.12	0.14	0.19	0.26	0.29	0.16	0.16	0.24	0.16	0.15	0.17	0.16	0.17
C5'	0.18	0.23	0.15	0.05	0.17	0.08	0.14	0.09	0.16	0.18	0.24	0.28	0.20	0.12	0.15	0.16	0.09	0.14	0.14	0.10
C6	0.16	0.21	0.15	0.10	0.16	0.10	0.10	0.12	0.10	0.16	0.20	0.25	0.14	0.17	0.20	0.14	0.16	0.18	0.18	0.18
C8	0.23	0.31	0.18	0.09	0.30	0.13	0.22	0.14	0.21	0.25	0.34	0.35	0.21	0.15	0.33	0.20	0.15	0.15	0.15	0.15
N1	0.16	0.19	0.14	0.13	0.11	0.13	0.15	0.15	0.14	0.15	0.16	0.25	0.14	0.20	0.18	0.17	0.19	0.22	0.22	0.20
N3	0.16	0.22	0.12	0.12	0.16	0.12	0.20	0.13	0.16	0.16	0.21	0.29	0.15	0.19	0.24	0.16	0.17	0.20	0.20	0.18
N6	0.17	0.21	0.17	0.12	0.22	0.12	0.18	0.13	0.15	0.18	0.22	0.24	0.16	0.17	0.25	0.16	0.16	0.16	0.17	0.18
N7	0.23	0.30	0.18	0.10	0.31	0.14	0.23	0.15	0.21	0.25	0.33	0.33	0.19	0.16	0.34	0.20	0.16	0.15	0.15	0.16
N9	0.19	0.27	0.16	0.08	0.21	0.10	0.14	0.11	0.16	0.21	0.28	0.32	0.19	0.15	0.20	0.17	0.14	0.16	0.16	0.15
O2'	0.27	0.29	0.27	0.30	0.28	0.27	0.30	0.25	0.29	0.27	0.29	0.31	0.29	0.35	0.29	0.26	0.28	0.26	0.23	0.27
O3'	0.16	0.21	0.17	0.17	0.17	0.11	0.16	0.09	0.16	0.16	0.22	0.25	0.20	0.23	0.18	0.13	0.12	0.12	0.15	0.10
O4'	0.21	0.28	0.17	0.09	0.19	0.11	0.15	0.12	0.16	0.21	0.28	0.35	0.23	0.14	0.16	0.17	0.15	0.17	0.17	0.16
O5'	0.20	0.25	0.17	0.06	0.21	0.09	0.17	0.08	0.19	0.21	0.26	0.29	0.20	0.11	0.21	0.19	0.07	0.11	0.11	0.07
OP1	0.24	0.27	0.20	0.10	0.24	0.15	0.22	0.17	0.23	0.24	0.28	0.29	0.23	0.11	0.24	0.24	0.13	0.21	0.20	0.16
OP2	0.31	0.32	0.30	0.23	0.31	0.24	0.28	0.25	0.30	0.31	0.33	0.34	0.31	0.23	0.32	0.30	0.22	0.29	0.27	0.24
P	0.24	0.27	0.21	0.12	0.24	0.14	0.21	0.15	0.22	0.24	0.28	0.30	0.23	0.13	0.25	0.23	0.12	0.19	0.17	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.07	0.16	0.06
C2	0.02	0.00	0.09	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.02	0.03	0.11	0.12	0.21	0.11
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.07	0.02	0.09	0.01	0.09	0.03	0.08	0.16	0.00	0.04	0.09	0.01	0.07	0.11	0.15	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.16	0.01	0.20	0.02	0.19	0.09	0.11	0.13	0.02	0.01	0.18	0.02	0.10	0.14	0.12	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.16	0.00	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.19	0.01	0.04	0.20	0.23	0.29	0.22
C4'	0.01	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.13	0.01	0.12	0.05	0.06	0.07	0.06	0.01	0.10	0.00	0.02	0.09	0.08	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.13	0.00	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.24	0.01	0.04	0.23	0.24	0.28	0.23
C5'	0.02	0.07	0.01	0.02	0.16	0.01	0.20	0.00	0.17	0.08	0.11	0.05	0.06	0.04	0.18	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.09	0.19	0.01	0.12	0.01	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.21	0.01	0.03	0.19	0.19	0.21	0.16
N1	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.08	0.02	0.02	0.11	0.13	0.19	0.11
N3	0.02	0.01	0.08	0.11	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.14	0.02	0.04	0.15	0.18	0.25	0.16
O2	0.04	0.01	0.16	0.13	0.02	0.07	0.01	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.21	0.20	0.02	0.04	0.09	0.10	0.21	0.09
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.06	0.06	0.05	0.06	0.05	0.03	0.10	0.21	0.00	0.08	0.08	0.05	0.05	0.13	0.11	0.06
O3'	0.04	0.11	0.04	0.01	0.19	0.01	0.24	0.04	0.21	0.08	0.14	0.20	0.08	0.00	0.23	0.02	0.16	0.25	0.18	0.18
O4	0.02	0.02	0.09	0.18	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.23	0.00	0.04	0.22	0.27	0.33	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.02	0.04	0.00	0.11	0.11	0.17	0.10
O5'	0.06	0.11	0.07	0.10	0.20	0.02	0.23	0.01	0.19	0.11	0.15	0.09	0.05	0.16	0.22	0.11	0.00	0.04	0.02	0.01
OP1	0.07	0.12	0.11	0.14	0.23	0.09	0.24	0.10	0.19	0.13	0.18	0.10	0.13	0.25	0.27	0.11	0.04	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.21	0.15	0.12	0.29	0.08	0.28	0.06	0.21	0.19	0.25	0.21	0.11	0.18	0.33	0.17	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.07	0.10	0.22	0.02	0.23	0.02	0.16	0.11	0.16	0.09	0.06	0.18	0.25	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00