Doublet Group distance statistics: 54976

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 1, 3, 3, 3, 2, 5, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.017, 0.033, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.017 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.013, 0.030, 0.046, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.027 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.008, 0.029, 0.049, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.029 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.008, 0.033, 0.057, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.033 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.011, 0.161, 0.312, 0.675 max_d=0.675 avg_d=0.161 std_dev=0.150
C2'	A	0, 0.023, 0.174, 0.325, 0.681 max_d=0.681 avg_d=0.174 std_dev=0.151
O2'	A	0, 0.063, 0.253, 0.442, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.253 std_dev=0.190
C4'	A	0, 0.047, 0.241, 0.436, 0.922 max_d=0.922 avg_d=0.241 std_dev=0.194
C3'	A	0, 0.029, 0.259, 0.488, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.259 std_dev=0.229
OP1	B	0, 0.482, 0.749, 1.017, 1.274 max_d=1.274 avg_d=0.749 std_dev=0.267
OP2	B	0, 0.463, 0.731, 1.000, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.731 std_dev=0.269
P	B	0, 0.454, 0.737, 1.020, 1.257 max_d=1.257 avg_d=0.737 std_dev=0.283
O3'	A	0, 0.054, 0.380, 0.705, 1.540 max_d=1.540 avg_d=0.380 std_dev=0.326
O5'	B	0, 0.481, 0.832, 1.183, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.832 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.062, 0.417, 0.772, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.417 std_dev=0.355
C5'	B	0, 0.560, 0.945, 1.331, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.945 std_dev=0.385
O5'	A	0, 0.005, 0.411, 0.816, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.411 std_dev=0.406
OP1	A	0, 0.397, 0.804, 1.211, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.804 std_dev=0.407
P	A	0, 0.199, 0.616, 1.034, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.616 std_dev=0.418
C4'	B	0, 0.561, 0.981, 1.402, 1.670 max_d=1.670 avg_d=0.981 std_dev=0.420
O4'	B	0, 0.558, 1.012, 1.467, 1.736 max_d=1.736 avg_d=1.012 std_dev=0.454
N1	B	0, 0.514, 0.973, 1.432, 1.655 max_d=1.655 avg_d=0.973 std_dev=0.459
C1'	B	0, 0.506, 0.965, 1.425, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.965 std_dev=0.459
C3'	B	0, 0.530, 0.990, 1.450, 1.811 max_d=1.811 avg_d=0.990 std_dev=0.460
C2'	B	0, 0.471, 0.937, 1.404, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.937 std_dev=0.467
OP2	A	0, 0.381, 0.853, 1.326, 1.877 max_d=1.877 avg_d=0.853 std_dev=0.472
C2	B	0, 0.546, 1.074, 1.602, 2.208 max_d=2.208 avg_d=1.074 std_dev=0.528
C4	B	0, 0.540, 1.079, 1.618, 2.243 max_d=2.243 avg_d=1.079 std_dev=0.539
O2'	B	0, 0.479, 1.024, 1.570, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.024 std_dev=0.545
N3	B	0, 0.567, 1.118, 1.669, 2.348 max_d=2.348 avg_d=1.118 std_dev=0.551
O4	B	0, 0.553, 1.149, 1.745, 2.472 max_d=2.472 avg_d=1.149 std_dev=0.596
C6	B	0, 0.309, 0.997, 1.685, 3.525 max_d=3.525 avg_d=0.997 std_dev=0.688
O3'	B	0, 0.495, 1.213, 1.930, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.213 std_dev=0.717
C5	B	0, 0.319, 1.051, 1.783, 3.765 max_d=3.765 avg_d=1.051 std_dev=0.732
O2	B	0, 0.427, 1.215, 2.003, 4.022 max_d=4.022 avg_d=1.215 std_dev=0.788

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.36	0.07	0.12
C2	0.04	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.13	0.15	0.05	0.09	0.33	0.10	0.11
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.09	0.12	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.28	0.13	0.09
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.10	0.08	0.10	0.05	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.09	0.20	0.18	0.10
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.02	0.11	0.33	0.09	0.10
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.08	0.02	0.04	0.06	0.08	0.03	0.04	0.03	0.00	0.02	0.21	0.07	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.05	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.16	0.30	0.13	0.12
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.11	0.15	0.08	0.04	0.14	0.16	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.09	0.08	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.07	0.03	0.16	0.29	0.14	0.13
C8	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.04	0.20	0.31	0.11	0.10
N1	0.03	0.01	0.09	0.08	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.11	0.04	0.13	0.31	0.13	0.13
N3	0.04	0.01	0.12	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.14	0.05	0.08	0.34	0.08	0.11
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.07	0.03	0.19	0.28	0.18	0.16
N7	0.01	0.02	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.21	0.28	0.14	0.13
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.34	0.08	0.10
O2'	0.01	0.13	0.00	0.02	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.03	0.11	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.03	0.04	0.04	0.27	0.13	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.07	0.10	0.11	0.14	0.07	0.09	0.03	0.03	0.00	0.02	0.12	0.16	0.27	0.14
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.37	0.14	0.18
O5'	0.06	0.09	0.06	0.09	0.11	0.02	0.16	0.01	0.16	0.20	0.13	0.08	0.19	0.21	0.11	0.04	0.12	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.36	0.33	0.28	0.20	0.33	0.21	0.30	0.09	0.29	0.31	0.31	0.34	0.28	0.28	0.34	0.27	0.16	0.37	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.10	0.13	0.18	0.09	0.07	0.13	0.08	0.14	0.11	0.13	0.08	0.18	0.14	0.08	0.13	0.27	0.14	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.11	0.09	0.10	0.10	0.06	0.12	0.01	0.13	0.10	0.13	0.11	0.16	0.13	0.10	0.07	0.14	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.38	0.26	0.27	0.21	0.15	0.67	0.17	0.65	0.21	0.34	0.82	0.34	0.51	0.21	0.26	0.14	0.16	0.18	0.15
C2	0.26	0.38	0.27	0.21	0.27	0.17	0.71	0.18	0.69	0.27	0.34	0.82	0.31	0.37	0.26	0.33	0.18	0.21	0.20	0.17
C2'	0.20	0.41	0.28	0.29	0.22	0.17	0.65	0.19	0.64	0.21	0.36	0.85	0.35	0.54	0.22	0.26	0.15	0.15	0.17	0.15
C3'	0.16	0.39	0.27	0.29	0.21	0.14	0.64	0.15	0.62	0.18	0.35	0.84	0.36	0.56	0.21	0.22	0.11	0.12	0.16	0.12
C4	0.19	0.38	0.25	0.25	0.22	0.13	0.66	0.14	0.65	0.21	0.34	0.82	0.33	0.46	0.22	0.26	0.12	0.15	0.17	0.13
C4'	0.16	0.37	0.26	0.29	0.21	0.13	0.65	0.14	0.63	0.18	0.33	0.81	0.36	0.54	0.21	0.22	0.11	0.13	0.17	0.12
C5	0.17	0.39	0.26	0.26	0.21	0.12	0.63	0.12	0.62	0.18	0.35	0.82	0.35	0.48	0.22	0.22	0.11	0.14	0.17	0.12
C5'	0.17	0.35	0.28	0.30	0.23	0.15	0.66	0.15	0.64	0.19	0.31	0.78	0.40	0.56	0.24	0.22	0.12	0.14	0.20	0.13
C6	0.17	0.39	0.25	0.24	0.21	0.11	0.64	0.11	0.63	0.19	0.35	0.83	0.33	0.43	0.22	0.23	0.10	0.14	0.17	0.11
C8	0.16	0.39	0.27	0.30	0.19	0.14	0.61	0.14	0.60	0.17	0.36	0.82	0.38	0.55	0.22	0.20	0.12	0.15	0.17	0.13
N1	0.23	0.38	0.26	0.21	0.25	0.14	0.69	0.15	0.67	0.24	0.34	0.82	0.32	0.36	0.25	0.29	0.15	0.20	0.19	0.15
N3	0.24	0.38	0.26	0.23	0.26	0.16	0.70	0.18	0.68	0.25	0.34	0.82	0.31	0.40	0.25	0.31	0.16	0.19	0.19	0.16
N6	0.16	0.39	0.26	0.26	0.21	0.13	0.60	0.13	0.60	0.18	0.35	0.81	0.35	0.44	0.22	0.21	0.11	0.15	0.19	0.13
N7	0.16	0.40	0.28	0.31	0.19	0.15	0.59	0.13	0.58	0.17	0.36	0.82	0.39	0.55	0.22	0.19	0.12	0.15	0.18	0.14
N9	0.18	0.38	0.26	0.27	0.21	0.13	0.65	0.14	0.63	0.19	0.35	0.82	0.35	0.50	0.21	0.24	0.12	0.15	0.17	0.13
O2'	0.26	0.43	0.30	0.30	0.26	0.21	0.68	0.24	0.66	0.27	0.39	0.86	0.36	0.53	0.26	0.31	0.20	0.18	0.18	0.19
O3'	0.16	0.41	0.28	0.31	0.22	0.14	0.63	0.15	0.61	0.18	0.37	0.85	0.37	0.57	0.23	0.20	0.11	0.12	0.16	0.12
O4'	0.17	0.37	0.26	0.27	0.21	0.13	0.66	0.14	0.63	0.19	0.33	0.81	0.36	0.51	0.21	0.23	0.11	0.14	0.18	0.13
O5'	0.20	0.32	0.30	0.32	0.28	0.18	0.69	0.18	0.67	0.23	0.29	0.74	0.42	0.59	0.29	0.23	0.15	0.16	0.23	0.16
OP1	0.26	0.59	0.39	0.40	0.30	0.26	0.46	0.24	0.44	0.26	0.57	0.98	0.54	0.65	0.35	0.21	0.27	0.30	0.24	0.26
OP2	0.16	0.45	0.32	0.36	0.19	0.20	0.51	0.18	0.50	0.15	0.42	0.85	0.47	0.64	0.24	0.17	0.15	0.17	0.12	0.11
P	0.16	0.45	0.32	0.35	0.20	0.18	0.53	0.15	0.51	0.16	0.42	0.85	0.47	0.62	0.24	0.15	0.15	0.18	0.13	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.02	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.07	0.03	0.22	0.05	0.00	0.11	0.17	0.17	0.10
C2	0.04	0.00	0.13	0.18	0.02	0.20	0.01	0.37	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.31	0.02	0.15	0.35	0.40	0.52	0.44
C2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.08	0.02	0.13	0.08	0.15	0.03	0.10	0.24	0.01	0.12	0.09	0.02	0.16	0.31	0.20	0.19
C3'	0.04	0.18	0.01	0.00	0.07	0.01	0.20	0.03	0.22	0.02	0.12	0.36	0.03	0.02	0.07	0.02	0.14	0.31	0.15	0.18
C4	0.05	0.02	0.08	0.07	0.00	0.11	0.01	0.28	0.02	0.03	0.01	0.01	0.17	0.21	0.01	0.06	0.25	0.20	0.18	0.18
C4'	0.02	0.20	0.02	0.01	0.11	0.00	0.23	0.01	0.25	0.05	0.15	0.40	0.04	0.04	0.11	0.00	0.02	0.14	0.06	0.03
C5	0.04	0.01	0.13	0.20	0.01	0.23	0.00	0.42	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.19	0.03	0.14	0.51	0.50	0.48	0.49
C5'	0.04	0.37	0.08	0.03	0.28	0.01	0.42	0.00	0.42	0.15	0.34	0.67	0.05	0.11	0.31	0.02	0.01	0.13	0.04	0.02
C6	0.04	0.01	0.15	0.22	0.02	0.25	0.01	0.42	0.00	0.01	0.01	0.02	0.11	0.19	0.03	0.16	0.53	0.53	0.49	0.51
N1	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.21	0.04	0.02	0.15	0.17	0.15	0.11
N3	0.04	0.01	0.10	0.12	0.01	0.15	0.01	0.34	0.01	0.02	0.00	0.01	0.22	0.28	0.02	0.10	0.29	0.36	0.47	0.38
O2	0.07	0.01	0.24	0.36	0.01	0.40	0.02	0.67	0.02	0.02	0.01	0.00	0.36	0.42	0.02	0.27	0.73	0.80	0.95	0.88
O2'	0.03	0.23	0.01	0.03	0.17	0.04	0.13	0.05	0.11	0.09	0.22	0.36	0.00	0.21	0.19	0.03	0.17	0.37	0.27	0.23
O3'	0.22	0.31	0.12	0.02	0.21	0.04	0.19	0.11	0.19	0.21	0.28	0.42	0.21	0.00	0.22	0.16	0.19	0.49	0.24	0.28
O4	0.05	0.02	0.09	0.07	0.01	0.11	0.03	0.31	0.03	0.04	0.02	0.02	0.19	0.22	0.00	0.07	0.26	0.21	0.22	0.20
O4'	0.00	0.15	0.02	0.02	0.06	0.00	0.14	0.02	0.16	0.02	0.10	0.27	0.03	0.16	0.07	0.00	0.18	0.17	0.26	0.20
O5'	0.11	0.35	0.16	0.14	0.25	0.02	0.51	0.01	0.53	0.15	0.29	0.73	0.17	0.19	0.26	0.18	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.17	0.40	0.31	0.31	0.20	0.14	0.50	0.13	0.53	0.17	0.36	0.80	0.37	0.49	0.21	0.17	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.17	0.52	0.20	0.15	0.18	0.06	0.48	0.04	0.49	0.15	0.47	0.95	0.27	0.24	0.22	0.26	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.44	0.19	0.18	0.18	0.03	0.49	0.02	0.51	0.11	0.38	0.88	0.23	0.28	0.20	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00