Doublet Group distance statistics: 54980

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 2, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.008, 0.023, 0.037, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.024 std_dev=0.016
C5	A	0, 0.001, 0.019, 0.036, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.019 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.005, 0.023, 0.040, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.023 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.025 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.005, 0.030, 0.055, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.030 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.146 max_d=0.146 avg_d=0.039 std_dev=0.039
C8	A	0, 0.004, 0.046, 0.089, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.046 std_dev=0.043
N6	A	0, 0.012, 0.059, 0.106, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.059 std_dev=0.047
O4'	A	0, 0.031, 0.131, 0.231, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.131 std_dev=0.100
C2'	A	0, 0.044, 0.216, 0.389, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.216 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.084, 0.282, 0.480, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.282 std_dev=0.198
C3'	A	0, 0.037, 0.285, 0.533, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.285 std_dev=0.248
P	A	0, 0.214, 0.493, 0.773, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.493 std_dev=0.279
O2'	A	0, 0.174, 0.505, 0.836, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.505 std_dev=0.331
O5'	A	0, 0.153, 0.503, 0.852, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.503 std_dev=0.349
C5'	B	0, 0.240, 0.592, 0.944, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.592 std_dev=0.352
OP2	A	0, 0.303, 0.677, 1.052, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.677 std_dev=0.375
C4'	B	0, 0.203, 0.583, 0.963, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.583 std_dev=0.380
O3'	B	0, 0.210, 0.607, 1.004, 1.218 max_d=1.218 avg_d=0.607 std_dev=0.397
C5'	A	0, 0.136, 0.538, 0.939, 1.395 max_d=1.395 avg_d=0.538 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.188, 0.598, 1.008, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.598 std_dev=0.410
O2	B	0, 0.144, 0.557, 0.970, 1.178 max_d=1.178 avg_d=0.557 std_dev=0.413
OP1	B	0, 0.304, 0.721, 1.138, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.721 std_dev=0.417
O5'	B	0, 0.199, 0.619, 1.039, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.619 std_dev=0.420
O4'	B	0, 0.175, 0.601, 1.026, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.601 std_dev=0.425
C2	B	0, 0.180, 0.607, 1.033, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.607 std_dev=0.426
P	B	0, 0.273, 0.701, 1.130, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.701 std_dev=0.428
N1	B	0, 0.232, 0.696, 1.160, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.696 std_dev=0.464
C1'	B	0, 0.137, 0.607, 1.077, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.607 std_dev=0.470
C2'	B	0, 0.139, 0.620, 1.102, 1.405 max_d=1.405 avg_d=0.620 std_dev=0.482
N3	B	0, 0.232, 0.723, 1.214, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.723 std_dev=0.491
OP1	A	0, 0.247, 0.746, 1.246, 1.833 max_d=1.833 avg_d=0.746 std_dev=0.500
OP2	B	0, 0.322, 0.822, 1.323, 1.719 max_d=1.719 avg_d=0.822 std_dev=0.500
O2'	B	0, 0.124, 0.658, 1.192, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.658 std_dev=0.534
C6	B	0, 0.384, 0.969, 1.554, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.969 std_dev=0.585
C4	B	0, 0.364, 0.955, 1.546, 1.898 max_d=1.898 avg_d=0.955 std_dev=0.591
O3'	A	0, 0.046, 0.642, 1.239, 1.820 max_d=1.820 avg_d=0.642 std_dev=0.597
C5	B	0, 0.442, 1.090, 1.738, 1.934 max_d=1.934 avg_d=1.090 std_dev=0.648
O4	B	0, 0.423, 1.135, 1.846, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.135 std_dev=0.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.10	0.03	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.27	0.01	0.24	0.23	0.44	0.11
C2	0.04	0.00	0.03	0.09	0.01	0.15	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.46	0.11	0.32	0.23	0.52	0.14
C2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.07	0.24	0.05	0.12	0.02	0.04	0.08	0.11	0.05	0.01	0.03	0.03	0.37	0.34	0.40	0.30
C3'	0.03	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.04	0.03	0.18	0.04	0.09	0.06	0.16	0.07	0.03	0.02	0.01	0.12	0.24	0.42	0.14
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.01	0.17	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.30	0.07	0.31	0.16	0.54	0.13
C4'	0.02	0.15	0.03	0.01	0.06	0.00	0.05	0.02	0.09	0.08	0.13	0.13	0.09	0.05	0.02	0.19	0.09	0.01	0.04	0.31	0.37	0.05
C5	0.02	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.00	0.22	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.17	0.21	0.07	0.35	0.15	0.55	0.15
C5'	0.10	0.15	0.24	0.04	0.17	0.02	0.22	0.00	0.21	0.26	0.18	0.13	0.24	0.27	0.19	0.11	0.10	0.03	0.01	0.35	0.33	0.03
C6	0.03	0.01	0.05	0.03	0.02	0.09	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.27	0.10	0.37	0.15	0.53	0.13
C8	0.02	0.02	0.12	0.18	0.01	0.08	0.01	0.26	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.34	0.11	0.05	0.34	0.19	0.56	0.22
N1	0.03	0.00	0.02	0.04	0.01	0.13	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.06	0.38	0.11	0.35	0.18	0.53	0.13
N3	0.03	0.01	0.04	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.12	0.45	0.10	0.29	0.23	0.52	0.13
N6	0.05	0.02	0.08	0.06	0.03	0.09	0.03	0.24	0.01	0.04	0.02	0.02	0.00	0.05	0.04	0.21	0.22	0.11	0.39	0.16	0.52	0.13
N7	0.02	0.02	0.11	0.16	0.01	0.05	0.01	0.27	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.00	0.01	0.31	0.10	0.05	0.37	0.21	0.56	0.21
N9	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.02	0.01	0.19	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.14	0.19	0.02	0.29	0.15	0.53	0.15
O2'	0.04	0.11	0.01	0.03	0.07	0.19	0.17	0.11	0.14	0.34	0.06	0.12	0.21	0.31	0.14	0.00	0.12	0.13	0.32	0.40	0.51	0.37
O3'	0.27	0.46	0.03	0.02	0.30	0.09	0.21	0.10	0.27	0.11	0.38	0.45	0.22	0.10	0.19	0.12	0.00	0.23	0.25	0.34	0.50	0.28
O4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.07	0.01	0.07	0.03	0.10	0.05	0.11	0.10	0.11	0.05	0.02	0.13	0.23	0.00	0.24	0.32	0.46	0.19
O5'	0.24	0.32	0.37	0.12	0.31	0.04	0.35	0.01	0.37	0.34	0.35	0.29	0.39	0.37	0.29	0.32	0.25	0.24	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.23	0.23	0.34	0.24	0.16	0.31	0.15	0.35	0.15	0.19	0.18	0.23	0.16	0.21	0.15	0.40	0.34	0.32	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.44	0.52	0.40	0.42	0.54	0.37	0.55	0.33	0.53	0.56	0.53	0.52	0.52	0.56	0.53	0.51	0.50	0.46	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.30	0.14	0.13	0.05	0.15	0.03	0.13	0.22	0.13	0.13	0.13	0.21	0.15	0.37	0.28	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.29	0.24	0.26	0.22	0.36	0.25	0.45	0.20	0.41	0.29	0.26	0.26	0.36	0.23	0.41	0.28	0.15	0.11	0.09	0.11
C2	0.33	0.28	0.31	0.26	0.37	0.28	0.45	0.24	0.44	0.33	0.29	0.30	0.40	0.24	0.40	0.32	0.21	0.16	0.18	0.17
C2'	0.31	0.27	0.30	0.26	0.41	0.28	0.50	0.25	0.45	0.32	0.30	0.30	0.37	0.27	0.46	0.31	0.20	0.19	0.18	0.18
C3'	0.29	0.24	0.27	0.25	0.37	0.26	0.45	0.23	0.41	0.29	0.27	0.25	0.36	0.27	0.42	0.28	0.18	0.18	0.15	0.16
C4	0.29	0.25	0.27	0.22	0.37	0.25	0.46	0.21	0.42	0.30	0.28	0.26	0.35	0.22	0.42	0.29	0.16	0.12	0.12	0.12
C4'	0.29	0.21	0.26	0.21	0.41	0.24	0.52	0.19	0.47	0.31	0.26	0.17	0.34	0.21	0.47	0.29	0.18	0.16	0.14	0.15
C5	0.28	0.24	0.24	0.21	0.38	0.23	0.46	0.20	0.42	0.29	0.28	0.25	0.32	0.21	0.43	0.28	0.16	0.12	0.12	0.12
C5'	0.44	0.35	0.41	0.37	0.54	0.40	0.66	0.37	0.61	0.46	0.40	0.28	0.47	0.37	0.60	0.44	0.37	0.39	0.33	0.35
C6	0.29	0.25	0.26	0.22	0.38	0.24	0.46	0.21	0.42	0.30	0.28	0.26	0.33	0.21	0.42	0.29	0.17	0.13	0.14	0.13
C8	0.27	0.24	0.23	0.20	0.39	0.23	0.47	0.20	0.41	0.29	0.28	0.24	0.31	0.21	0.45	0.28	0.16	0.14	0.14	0.14
N1	0.31	0.27	0.29	0.24	0.37	0.26	0.45	0.23	0.43	0.32	0.29	0.28	0.37	0.23	0.40	0.31	0.20	0.17	0.18	0.16
N3	0.32	0.27	0.30	0.25	0.37	0.27	0.46	0.23	0.43	0.32	0.29	0.29	0.39	0.24	0.40	0.31	0.19	0.13	0.15	0.14
N6	0.27	0.25	0.24	0.21	0.39	0.23	0.46	0.21	0.41	0.29	0.29	0.25	0.31	0.20	0.44	0.28	0.17	0.12	0.15	0.14
N7	0.26	0.24	0.22	0.19	0.39	0.22	0.47	0.20	0.41	0.28	0.28	0.23	0.29	0.20	0.45	0.27	0.16	0.14	0.15	0.15
N9	0.29	0.24	0.26	0.21	0.38	0.24	0.46	0.20	0.42	0.30	0.28	0.25	0.34	0.21	0.43	0.29	0.16	0.12	0.11	0.12
O2'	0.31	0.25	0.32	0.28	0.42	0.30	0.54	0.27	0.49	0.33	0.28	0.26	0.40	0.26	0.47	0.32	0.26	0.32	0.28	0.27
O3'	0.46	0.37	0.40	0.30	0.54	0.36	0.63	0.28	0.60	0.47	0.41	0.27	0.52	0.25	0.59	0.45	0.27	0.19	0.18	0.21
O4'	0.31	0.23	0.27	0.20	0.40	0.24	0.50	0.19	0.46	0.32	0.27	0.21	0.37	0.19	0.45	0.30	0.16	0.13	0.12	0.12
O5'	0.42	0.37	0.42	0.39	0.61	0.38	0.70	0.38	0.62	0.46	0.45	0.28	0.49	0.32	0.69	0.42	0.37	0.39	0.42	0.39
OP1	0.22	0.23	0.22	0.23	0.28	0.22	0.33	0.22	0.28	0.21	0.24	0.30	0.30	0.27	0.35	0.22	0.21	0.24	0.24	0.22
OP2	0.56	0.56	0.54	0.55	0.42	0.59	0.43	0.57	0.46	0.52	0.49	0.66	0.55	0.59	0.41	0.57	0.54	0.52	0.48	0.52
P	0.23	0.21	0.21	0.20	0.29	0.23	0.36	0.21	0.31	0.21	0.22	0.30	0.29	0.24	0.37	0.23	0.18	0.19	0.15	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.04	0.03	0.00	0.09	0.09	0.10	0.09
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.02	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.03	0.08	0.13	0.12	0.20	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.01	0.06	0.04	0.07	0.03	0.08	0.03	0.08	0.17	0.01	0.06	0.06	0.02	0.06	0.04	0.08	0.06
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.17	0.00	0.19	0.02	0.16	0.08	0.13	0.09	0.03	0.01	0.20	0.01	0.11	0.07	0.11	0.09
C4	0.03	0.02	0.06	0.17	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.03	0.01	0.03	0.07	0.21	0.01	0.04	0.30	0.35	0.42	0.35
C4'	0.01	0.03	0.04	0.00	0.10	0.00	0.15	0.01	0.14	0.03	0.03	0.09	0.11	0.02	0.12	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01
C5	0.03	0.03	0.07	0.19	0.01	0.15	0.00	0.26	0.01	0.03	0.02	0.03	0.07	0.22	0.02	0.11	0.36	0.42	0.46	0.42
C5'	0.02	0.04	0.03	0.02	0.18	0.01	0.26	0.00	0.23	0.08	0.08	0.11	0.12	0.03	0.21	0.02	0.01	0.08	0.03	0.01
C6	0.03	0.01	0.08	0.16	0.01	0.14	0.01	0.23	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.02	0.12	0.31	0.32	0.34	0.33
N1	0.01	0.01	0.03	0.08	0.03	0.03	0.03	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.02	0.17	0.17	0.19	0.17
N3	0.03	0.01	0.08	0.13	0.01	0.03	0.02	0.08	0.01	0.01	0.00	0.02	0.10	0.16	0.02	0.05	0.20	0.22	0.30	0.23
O2	0.06	0.01	0.17	0.09	0.03	0.09	0.03	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.21	0.10	0.03	0.15	0.08	0.06	0.13	0.06
O2'	0.02	0.12	0.01	0.03	0.07	0.11	0.07	0.12	0.08	0.04	0.10	0.21	0.00	0.10	0.08	0.07	0.10	0.08	0.11	0.11
O3'	0.04	0.11	0.06	0.01	0.21	0.02	0.22	0.03	0.18	0.09	0.16	0.10	0.10	0.00	0.24	0.03	0.15	0.12	0.12	0.12
O4	0.03	0.03	0.06	0.20	0.01	0.12	0.02	0.21	0.02	0.03	0.02	0.03	0.08	0.24	0.00	0.05	0.35	0.43	0.51	0.42
O4'	0.00	0.08	0.02	0.01	0.04	0.01	0.11	0.02	0.12	0.02	0.05	0.15	0.07	0.03	0.05	0.00	0.12	0.12	0.08	0.09
O5'	0.09	0.13	0.06	0.11	0.30	0.01	0.36	0.01	0.31	0.17	0.20	0.08	0.10	0.15	0.35	0.12	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.09	0.12	0.04	0.07	0.35	0.06	0.42	0.08	0.32	0.17	0.22	0.06	0.08	0.12	0.43	0.12	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.20	0.08	0.11	0.42	0.04	0.46	0.03	0.34	0.19	0.30	0.13	0.11	0.12	0.51	0.08	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.13	0.06	0.09	0.35	0.01	0.42	0.01	0.33	0.17	0.23	0.06	0.11	0.12	0.42	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00