Doublet Group distance statistics: 54987

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.002, 0.014, 0.025, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.015, 0.027, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.001, 0.017, 0.033, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.004, 0.020, 0.036, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.020 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.005, 0.025, 0.045, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.025 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.004, 0.034, 0.064, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.034 std_dev=0.030
P	B	0, 0.162, 0.311, 0.461, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.311 std_dev=0.150
C2'	A	0, 0.029, 0.295, 0.561, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.295 std_dev=0.266
O4'	A	0, 0.021, 0.330, 0.639, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.330 std_dev=0.309
OP2	B	0, 0.095, 0.462, 0.828, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.462 std_dev=0.367
O5'	A	0, 0.179, 0.546, 0.913, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.546 std_dev=0.367
O2'	A	0, 0.074, 0.442, 0.810, 1.157 max_d=1.157 avg_d=0.442 std_dev=0.368
C4'	A	0, 0.038, 0.474, 0.910, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.474 std_dev=0.436
C3'	A	0, -0.043, 0.416, 0.876, 1.462 max_d=1.462 avg_d=0.416 std_dev=0.460
OP1	B	0, 0.124, 0.586, 1.048, 1.525 max_d=1.525 avg_d=0.586 std_dev=0.462
P	A	0, 0.187, 0.728, 1.270, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.728 std_dev=0.542
C5'	A	0, 0.130, 0.681, 1.232, 1.632 max_d=1.632 avg_d=0.681 std_dev=0.551
O3'	A	0, -0.243, 0.485, 1.213, 2.247 max_d=2.247 avg_d=0.485 std_dev=0.728
OP1	A	0, 0.600, 1.581, 2.562, 2.653 max_d=2.653 avg_d=1.581 std_dev=0.981
O5'	B	0, -0.155, 0.830, 1.815, 3.048 max_d=3.048 avg_d=0.830 std_dev=0.985
OP2	A	0, 0.605, 1.644, 2.684, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.644 std_dev=1.040
C5'	B	0, -0.442, 0.931, 2.303, 4.261 max_d=4.261 avg_d=0.931 std_dev=1.373
C4'	B	0, -1.094, 1.320, 3.734, 7.220 max_d=7.220 avg_d=1.320 std_dev=2.414
O4'	B	0, -1.123, 1.477, 4.077, 7.822 max_d=7.822 avg_d=1.477 std_dev=2.600
C5	B	0, -1.039, 1.627, 4.293, 8.104 max_d=8.104 avg_d=1.627 std_dev=2.666
C6	B	0, -1.132, 1.627, 4.387, 8.343 max_d=8.343 avg_d=1.627 std_dev=2.760
O4	B	0, -1.060, 1.819, 4.698, 8.802 max_d=8.802 avg_d=1.819 std_dev=2.879
C4	B	0, -1.115, 1.787, 4.688, 8.834 max_d=8.834 avg_d=1.787 std_dev=2.901
C3'	B	0, -1.346, 1.725, 4.797, 9.222 max_d=9.222 avg_d=1.725 std_dev=3.071
N1	B	0, -1.337, 1.816, 4.969, 9.496 max_d=9.496 avg_d=1.816 std_dev=3.153
C1'	B	0, -1.489, 1.840, 5.168, 9.960 max_d=9.960 avg_d=1.840 std_dev=3.328
N3	B	0, -1.349, 2.008, 5.366, 10.177 max_d=10.177 avg_d=2.008 std_dev=3.357
O3'	B	0, -1.384, 2.129, 5.642, 10.649 max_d=10.649 avg_d=2.129 std_dev=3.513
C2	B	0, -1.478, 2.055, 5.588, 10.659 max_d=10.659 avg_d=2.055 std_dev=3.533
C2'	B	0, -1.750, 1.985, 5.721, 11.113 max_d=11.113 avg_d=1.985 std_dev=3.736
O2	B	0, -1.728, 2.326, 6.379, 12.199 max_d=12.199 avg_d=2.326 std_dev=4.054
O2'	B	0, -2.153, 2.463, 7.079, 13.735 max_d=13.735 avg_d=2.463 std_dev=4.616

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.17	0.48	0.35	0.19
C2	0.02	0.00	0.22	0.18	0.00	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.18	0.08	0.11	0.31	0.99	0.77	0.43
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.12	0.02	0.08	0.15	0.12	0.10	0.18	0.22	0.10	0.07	0.03	0.00	0.03	0.02	0.48	0.61	0.25	0.40
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.02	0.20	0.10	0.20	0.15	0.21	0.15	0.09	0.01	0.01	0.00	0.27	0.13	0.20	0.13
C4	0.01	0.00	0.12	0.15	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.08	0.05	0.27	0.89	0.74	0.39
C4'	0.00	0.05	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.14	0.04	0.00	0.01	0.13	0.17	0.02
C5	0.01	0.00	0.08	0.17	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.10	0.03	0.26	0.98	0.93	0.43
C5'	0.08	0.08	0.15	0.02	0.09	0.00	0.10	0.00	0.09	0.13	0.09	0.09	0.09	0.12	0.10	0.02	0.10	0.01	0.00	0.31	0.27	0.01
C6	0.01	0.00	0.12	0.20	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.11	0.06	0.29	1.06	0.99	0.47
C8	0.01	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.09	0.06	0.18	0.78	0.83	0.34
N1	0.02	0.00	0.18	0.20	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.10	0.09	0.31	1.06	0.91	0.47
N3	0.02	0.00	0.22	0.15	0.00	0.04	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.08	0.10	0.30	0.89	0.66	0.38
N6	0.01	0.00	0.10	0.21	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.17	0.13	0.04	0.28	1.08	1.09	0.49
N7	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.18	0.10	0.03	0.21	0.92	0.99	0.41
N9	0.00	0.00	0.03	0.09	0.00	0.02	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.09	0.00	0.22	0.73	0.64	0.32
O2'	0.02	0.18	0.00	0.01	0.13	0.14	0.16	0.02	0.16	0.17	0.17	0.17	0.17	0.18	0.11	0.00	0.02	0.07	0.36	0.58	0.33	0.35
O3'	0.18	0.08	0.03	0.01	0.08	0.04	0.10	0.10	0.11	0.09	0.10	0.08	0.13	0.10	0.09	0.02	0.00	0.16	0.18	0.16	0.31	0.09
O4'	0.00	0.11	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.09	0.10	0.04	0.03	0.00	0.07	0.16	0.00	0.19	0.18	0.38	0.20
O5'	0.17	0.31	0.48	0.27	0.27	0.01	0.26	0.00	0.29	0.18	0.31	0.30	0.28	0.21	0.22	0.36	0.18	0.19	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.48	0.99	0.61	0.13	0.89	0.13	0.98	0.31	1.06	0.78	1.06	0.89	1.08	0.92	0.73	0.58	0.16	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.77	0.25	0.20	0.74	0.17	0.93	0.27	0.99	0.83	0.91	0.66	1.09	0.99	0.64	0.33	0.31	0.38	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.19	0.43	0.40	0.13	0.39	0.02	0.43	0.01	0.47	0.34	0.47	0.38	0.49	0.41	0.32	0.35	0.09	0.20	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.21	0.78	2.00	1.79	1.00	0.86	1.36	0.67	1.44	1.15	0.75	0.56	2.15	1.88	0.95	0.66	0.66	0.33	0.34	0.15
C2	1.46	0.92	2.18	1.97	1.01	1.11	1.38	0.83	1.55	1.31	0.82	0.71	2.26	1.97	0.90	0.97	0.73	0.39	0.47	0.13
C2'	1.26	0.84	2.05	1.78	1.04	0.84	1.40	0.60	1.48	1.19	0.80	0.65	2.26	1.89	0.98	0.68	0.61	0.54	0.50	0.28
C3'	1.13	0.70	1.97	1.74	0.90	0.77	1.27	0.55	1.36	1.06	0.64	0.51	2.20	1.89	0.84	0.54	0.54	0.57	0.55	0.30
C4	1.02	0.57	1.75	1.60	0.79	0.73	1.18	0.60	1.27	0.95	0.53	0.40	1.81	1.64	0.74	0.54	0.62	0.31	0.36	0.15
C4'	1.11	0.68	1.93	1.76	0.90	0.81	1.28	0.64	1.35	1.05	0.63	0.48	2.10	1.90	0.84	0.56	0.63	0.34	0.34	0.17
C5	0.60	0.37	1.24	1.19	0.50	0.38	0.89	0.38	0.95	0.58	0.36	0.57	1.20	1.20	0.48	0.26	0.54	0.25	0.28	0.17
C5'	0.93	0.53	1.72	1.60	0.81	0.67	1.22	0.60	1.27	0.90	0.51	0.43	1.82	1.71	0.77	0.42	0.64	0.25	0.22	0.18
C6	0.55	0.40	1.12	1.09	0.44	0.35	0.80	0.35	0.87	0.52	0.39	0.64	1.05	1.08	0.41	0.26	0.54	0.25	0.29	0.17
C8	0.54	0.36	1.22	1.15	0.52	0.32	0.91	0.34	0.94	0.55	0.34	0.59	1.20	1.19	0.50	0.22	0.53	0.24	0.25	0.18
N1	1.01	0.51	1.63	1.53	0.67	0.76	1.06	0.63	1.21	0.89	0.46	0.40	1.60	1.48	0.59	0.62	0.66	0.34	0.43	0.14
N3	1.45	0.95	2.21	1.98	1.07	1.07	1.43	0.80	1.57	1.32	0.86	0.73	2.35	2.03	0.98	0.91	0.71	0.38	0.43	0.13
N6	0.37	0.77	0.55	0.62	0.42	0.24	0.51	0.07	0.53	0.41	0.71	1.16	0.44	0.68	0.42	0.48	0.46	0.16	0.17	0.20
N7	0.37	0.48	0.93	0.92	0.39	0.17	0.73	0.22	0.75	0.39	0.44	0.85	0.85	0.96	0.39	0.30	0.49	0.21	0.22	0.18
N9	0.93	0.52	1.68	1.53	0.77	0.64	1.16	0.55	1.23	0.89	0.50	0.38	1.74	1.58	0.73	0.44	0.60	0.30	0.32	0.16
O2'	1.79	1.42	2.58	2.22	1.57	1.26	1.88	0.92	1.96	1.73	1.36	1.20	2.86	2.31	1.51	1.15	0.83	0.36	0.34	0.18
O3'	1.49	1.00	2.36	2.10	1.14	1.11	1.51	0.84	1.62	1.38	0.91	0.77	2.68	2.29	1.06	0.85	0.61	0.46	0.47	0.15
O4'	1.12	0.69	1.90	1.76	0.91	0.83	1.28	0.69	1.36	1.05	0.65	0.48	2.04	1.88	0.86	0.59	0.68	0.25	0.26	0.15
O5'	0.87	0.61	1.58	1.42	0.95	0.56	1.34	0.55	1.33	0.92	0.64	0.56	1.60	1.44	0.96	0.46	0.71	0.34	0.32	0.36
OP1	1.44	1.31	1.94	1.84	1.66	1.15	2.02	1.11	1.97	1.55	1.37	1.24	1.85	1.78	1.68	1.17	1.53	1.10	1.09	1.25
OP2	0.73	0.95	0.88	0.83	0.69	0.76	0.84	0.91	0.84	0.72	0.90	1.36	0.79	0.69	0.68	0.99	0.92	1.15	1.15	1.05
P	0.71	0.67	1.27	1.16	0.85	0.48	1.21	0.53	1.17	0.78	0.67	0.89	1.21	1.12	0.86	0.58	0.77	0.55	0.54	0.58

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.18	0.02	0.01	0.14	0.26	0.13	0.11
C2	0.03	0.00	0.12	0.03	0.01	0.13	0.01	0.33	0.01	0.01	0.00	0.00	0.32	0.25	0.00	0.15	0.55	0.61	0.66	0.44
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.04	0.02	0.10	0.12	0.12	0.02	0.08	0.21	0.00	0.05	0.04	0.02	0.24	0.26	0.20	0.22
C3'	0.02	0.03	0.01	0.00	0.18	0.00	0.26	0.04	0.25	0.11	0.09	0.10	0.02	0.01	0.19	0.02	0.32	0.35	0.22	0.23
C4	0.02	0.01	0.04	0.18	0.00	0.12	0.00	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.21	0.05	0.00	0.04	0.46	0.64	0.39	0.31
C4'	0.02	0.13	0.02	0.00	0.12	0.00	0.10	0.01	0.08	0.08	0.14	0.15	0.11	0.04	0.12	0.01	0.01	0.30	0.17	0.02
C5	0.02	0.01	0.10	0.26	0.00	0.10	0.00	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	0.00	0.13	0.29	0.37	0.17	0.21
C5'	0.06	0.33	0.12	0.04	0.35	0.01	0.28	0.00	0.22	0.23	0.38	0.35	0.09	0.10	0.36	0.02	0.01	0.34	0.22	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.25	0.00	0.08	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.10	0.15	0.00	0.16	0.23	0.26	0.18	0.23
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.08	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.01	0.02	0.31	0.35	0.25	0.17
N3	0.03	0.00	0.08	0.09	0.00	0.14	0.01	0.38	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.18	0.00	0.10	0.59	0.74	0.67	0.48
O2	0.04	0.00	0.21	0.10	0.01	0.15	0.01	0.35	0.01	0.01	0.01	0.00	0.46	0.43	0.01	0.27	0.66	0.69	0.92	0.60
O2'	0.02	0.32	0.00	0.02	0.21	0.11	0.12	0.09	0.10	0.14	0.31	0.46	0.00	0.11	0.22	0.08	0.23	0.28	0.10	0.17
O3'	0.18	0.25	0.05	0.01	0.05	0.04	0.14	0.10	0.15	0.09	0.18	0.43	0.11	0.00	0.05	0.11	0.24	0.31	0.27	0.20
O4	0.02	0.00	0.04	0.19	0.00	0.12	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.22	0.05	0.00	0.04	0.47	0.69	0.42	0.33
O4'	0.01	0.15	0.02	0.02	0.04	0.01	0.13	0.02	0.16	0.02	0.10	0.27	0.08	0.11	0.04	0.00	0.09	0.31	0.21	0.10
O5'	0.14	0.55	0.24	0.32	0.46	0.01	0.29	0.01	0.23	0.31	0.59	0.66	0.23	0.24	0.47	0.09	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.26	0.61	0.26	0.35	0.64	0.30	0.37	0.34	0.26	0.35	0.74	0.69	0.28	0.31	0.69	0.31	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.66	0.20	0.22	0.39	0.17	0.17	0.22	0.18	0.25	0.67	0.92	0.10	0.27	0.42	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.44	0.22	0.23	0.31	0.02	0.21	0.02	0.23	0.17	0.48	0.60	0.17	0.20	0.33	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00