Doublet Group distance statistics: 55003

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 5, 2, 14, 33, 19, 5, 4, 7, 14, 9, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.010, 0.017, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.010 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.018 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.004, 0.017, 0.029, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.019 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.038, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.013, 0.028, 0.043, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.028 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.010, 0.038, 0.065, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.038 std_dev=0.028
N7	A	0, 0.010, 0.039, 0.068, 0.171 max_d=0.171 avg_d=0.039 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.016, 0.046, 0.075, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.046 std_dev=0.030
OP1	B	0, 0.381, 0.639, 0.897, 1.331 max_d=1.331 avg_d=0.639 std_dev=0.258
N7	B	0, 0.195, 0.455, 0.716, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.455 std_dev=0.260
P	B	0, 0.314, 0.580, 0.846, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.580 std_dev=0.266
C2'	A	0, 0.434, 0.723, 1.011, 1.524 max_d=1.524 avg_d=0.723 std_dev=0.289
O4'	A	0, 0.419, 0.711, 1.004, 1.517 max_d=1.517 avg_d=0.711 std_dev=0.292
C8	B	0, 0.218, 0.531, 0.844, 1.979 max_d=1.979 avg_d=0.531 std_dev=0.313
C5	B	0, 0.211, 0.588, 0.964, 2.633 max_d=2.633 avg_d=0.588 std_dev=0.376
N9	B	0, 0.153, 0.559, 0.964, 2.518 max_d=2.518 avg_d=0.559 std_dev=0.406
OP2	B	0, 0.387, 0.811, 1.235, 1.889 max_d=1.889 avg_d=0.811 std_dev=0.424
O5'	B	0, 0.661, 1.085, 1.509, 2.254 max_d=2.254 avg_d=1.085 std_dev=0.424
N6	B	0, 0.402, 0.846, 1.291, 2.907 max_d=2.907 avg_d=0.846 std_dev=0.445
O4'	B	0, 0.288, 0.753, 1.218, 2.399 max_d=2.399 avg_d=0.753 std_dev=0.465
C6	B	0, 0.395, 0.861, 1.328, 3.252 max_d=3.252 avg_d=0.861 std_dev=0.466
C3'	B	0, 0.570, 1.042, 1.514, 2.446 max_d=2.446 avg_d=1.042 std_dev=0.472
C4	B	0, 0.205, 0.681, 1.157, 3.167 max_d=3.167 avg_d=0.681 std_dev=0.476
C4'	B	0, 0.413, 0.901, 1.389, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.901 std_dev=0.488
O2'	A	0, 0.931, 1.432, 1.933, 2.370 max_d=2.370 avg_d=1.432 std_dev=0.501
C1'	B	0, 0.180, 0.688, 1.195, 2.911 max_d=2.911 avg_d=0.688 std_dev=0.507
C4'	A	0, 0.931, 1.450, 1.969, 2.256 max_d=2.256 avg_d=1.450 std_dev=0.519
C5'	B	0, 0.515, 1.071, 1.627, 2.652 max_d=2.652 avg_d=1.071 std_dev=0.556
C3'	A	0, 1.138, 1.708, 2.278, 2.184 max_d=2.184 avg_d=1.708 std_dev=0.570
C2'	B	0, 0.360, 0.930, 1.500, 3.212 max_d=3.212 avg_d=0.930 std_dev=0.570
O3'	B	0, 0.803, 1.404, 2.005, 2.911 max_d=2.911 avg_d=1.404 std_dev=0.601
N1	B	0, 0.602, 1.228, 1.853, 4.288 max_d=4.288 avg_d=1.228 std_dev=0.625
N3	B	0, 0.372, 1.009, 1.646, 4.191 max_d=4.191 avg_d=1.009 std_dev=0.637
C5'	A	0, 0.984, 1.642, 2.300, 3.849 max_d=3.849 avg_d=1.642 std_dev=0.658
C2	B	0, 0.581, 1.271, 1.961, 4.668 max_d=4.668 avg_d=1.271 std_dev=0.690
O2'	B	0, 0.359, 1.105, 1.850, 3.989 max_d=3.989 avg_d=1.105 std_dev=0.746
O3'	A	0, 1.886, 2.844, 3.802, 3.492 max_d=3.492 avg_d=2.844 std_dev=0.958
O5'	A	0, 0.647, 1.813, 2.979, 5.290 max_d=5.290 avg_d=1.813 std_dev=1.166
P	A	0, 0.421, 1.911, 3.402, 6.241 max_d=6.241 avg_d=1.911 std_dev=1.490
OP2	A	0, 1.984, 3.564, 5.143, 7.471 max_d=7.471 avg_d=3.564 std_dev=1.579
OP1	A	0, 1.634, 3.343, 5.052, 8.252 max_d=8.252 avg_d=3.343 std_dev=1.709

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.25	0.01	0.27	0.89	0.28	0.40
C2	0.03	0.00	0.20	0.18	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.26	0.11	0.29	1.17	0.60	0.51
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.16	0.11	0.08	0.16	0.19	0.09	0.05	0.03	0.00	0.03	0.02	0.56	0.96	0.54	0.63
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.20	0.00	0.28	0.02	0.29	0.28	0.24	0.14	0.33	0.32	0.18	0.02	0.01	0.01	0.31	0.69	0.25	0.35
C4	0.01	0.01	0.11	0.20	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.15	0.06	0.35	1.27	0.60	0.58
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.11	0.16	0.07	0.06	0.13	0.17	0.08	0.22	0.03	0.00	0.02	0.33	0.17	0.08
C5	0.01	0.01	0.07	0.28	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.11	0.03	0.46	1.52	0.82	0.74
C5'	0.06	0.09	0.16	0.02	0.10	0.01	0.17	0.00	0.17	0.21	0.12	0.08	0.21	0.23	0.11	0.09	0.14	0.02	0.01	0.27	0.37	0.02
C6	0.02	0.01	0.11	0.29	0.01	0.11	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.13	0.05	0.46	1.52	0.88	0.74
C8	0.01	0.01	0.08	0.28	0.00	0.16	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.22	0.12	0.07	0.53	1.60	0.76	0.79
N1	0.02	0.00	0.16	0.24	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.18	0.09	0.38	1.35	0.77	0.63
N3	0.03	0.01	0.19	0.14	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.29	0.11	0.26	1.08	0.49	0.46
N6	0.02	0.01	0.09	0.33	0.01	0.13	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.15	0.04	0.52	1.66	1.03	0.84
N7	0.01	0.01	0.05	0.32	0.00	0.17	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.26	0.15	0.05	0.56	1.72	0.94	0.87
N9	0.00	0.01	0.03	0.18	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.09	0.01	0.38	1.25	0.52	0.58
O2'	0.02	0.25	0.00	0.02	0.21	0.22	0.25	0.09	0.27	0.22	0.27	0.23	0.30	0.26	0.15	0.00	0.04	0.15	0.55	0.99	0.67	0.65
O3'	0.25	0.26	0.03	0.01	0.15	0.03	0.11	0.14	0.13	0.12	0.18	0.29	0.15	0.15	0.09	0.04	0.00	0.17	0.21	0.64	0.25	0.30
O4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.00	0.03	0.02	0.05	0.07	0.09	0.11	0.04	0.05	0.01	0.15	0.17	0.00	0.07	0.69	0.17	0.24
O5'	0.27	0.29	0.56	0.31	0.35	0.02	0.46	0.01	0.46	0.53	0.38	0.26	0.52	0.56	0.38	0.55	0.21	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.89	1.17	0.96	0.69	1.27	0.33	1.52	0.27	1.52	1.60	1.35	1.08	1.66	1.72	1.25	0.99	0.64	0.69	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.60	0.54	0.25	0.60	0.17	0.82	0.37	0.88	0.76	0.77	0.49	1.03	0.94	0.52	0.67	0.25	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.40	0.51	0.63	0.35	0.58	0.08	0.74	0.02	0.74	0.79	0.63	0.46	0.84	0.87	0.58	0.65	0.30	0.24	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.18	0.20	0.26	0.14	0.15	0.15	0.17	0.19	0.15	0.20	0.15	0.22	0.15	0.13	0.17	0.34	0.15	0.22	0.15	0.28	0.12
C2	0.14	0.12	0.17	0.23	0.10	0.18	0.11	0.21	0.14	0.13	0.15	0.10	0.19	0.12	0.12	0.16	0.30	0.20	0.24	0.16	0.35	0.16
C2'	0.16	0.23	0.28	0.35	0.18	0.20	0.18	0.21	0.21	0.17	0.24	0.20	0.22	0.17	0.17	0.25	0.45	0.15	0.28	0.24	0.32	0.21
C3'	0.43	0.48	0.55	0.60	0.45	0.47	0.46	0.46	0.48	0.43	0.48	0.46	0.48	0.44	0.44	0.52	0.69	0.40	0.51	0.49	0.52	0.43
C4	0.12	0.14	0.18	0.24	0.12	0.15	0.13	0.18	0.16	0.14	0.17	0.12	0.20	0.14	0.12	0.16	0.31	0.15	0.23	0.15	0.30	0.13
C4'	0.25	0.31	0.33	0.38	0.28	0.27	0.29	0.28	0.31	0.26	0.33	0.29	0.34	0.28	0.26	0.30	0.45	0.25	0.33	0.29	0.36	0.23
C5	0.12	0.14	0.19	0.25	0.12	0.15	0.13	0.17	0.16	0.14	0.16	0.12	0.19	0.14	0.12	0.16	0.31	0.14	0.22	0.16	0.28	0.12
C5'	0.36	0.42	0.42	0.45	0.39	0.36	0.39	0.36	0.42	0.36	0.43	0.40	0.43	0.37	0.37	0.40	0.52	0.35	0.40	0.36	0.42	0.29
C6	0.12	0.12	0.18	0.24	0.10	0.16	0.11	0.18	0.14	0.12	0.14	0.10	0.18	0.11	0.11	0.16	0.29	0.15	0.23	0.15	0.30	0.13
C8	0.15	0.20	0.23	0.27	0.17	0.16	0.18	0.16	0.20	0.16	0.22	0.18	0.23	0.17	0.16	0.20	0.34	0.14	0.22	0.17	0.25	0.12
N1	0.14	0.11	0.18	0.23	0.10	0.18	0.11	0.20	0.14	0.12	0.14	0.10	0.18	0.11	0.12	0.16	0.29	0.18	0.24	0.16	0.36	0.16
N3	0.13	0.13	0.17	0.23	0.11	0.17	0.12	0.20	0.16	0.13	0.16	0.11	0.20	0.13	0.12	0.15	0.30	0.18	0.24	0.15	0.33	0.15
N6	0.12	0.12	0.19	0.24	0.11	0.16	0.11	0.16	0.14	0.12	0.13	0.11	0.16	0.10	0.11	0.17	0.29	0.13	0.22	0.16	0.27	0.12
N7	0.15	0.19	0.23	0.27	0.16	0.17	0.17	0.16	0.19	0.16	0.20	0.17	0.21	0.17	0.16	0.20	0.33	0.14	0.21	0.17	0.24	0.12
N9	0.13	0.17	0.20	0.26	0.14	0.15	0.15	0.17	0.18	0.15	0.20	0.15	0.22	0.15	0.13	0.17	0.33	0.14	0.22	0.16	0.27	0.12
O2'	0.28	0.32	0.37	0.40	0.29	0.28	0.28	0.24	0.29	0.28	0.32	0.30	0.29	0.27	0.28	0.36	0.48	0.27	0.27	0.28	0.30	0.25
O3'	0.29	0.44	0.45	0.50	0.36	0.30	0.36	0.28	0.42	0.28	0.46	0.39	0.44	0.30	0.31	0.42	0.62	0.23	0.34	0.32	0.37	0.25
O4'	0.15	0.20	0.19	0.23	0.16	0.15	0.17	0.17	0.20	0.16	0.23	0.17	0.24	0.16	0.15	0.17	0.30	0.19	0.21	0.16	0.28	0.13
O5'	0.60	0.66	0.72	0.78	0.65	0.62	0.67	0.61	0.71	0.62	0.70	0.65	0.75	0.65	0.62	0.67	0.87	0.55	0.71	0.64	0.79	0.57
OP1	1.86	1.89	1.88	1.87	1.92	1.81	1.95	1.76	1.99	1.88	1.94	1.89	2.04	1.91	1.89	1.85	1.86	1.82	1.79	1.59	1.77	1.63
OP2	1.36	1.46	1.49	1.52	1.41	1.36	1.40	1.31	1.45	1.31	1.48	1.44	1.43	1.31	1.37	1.46	1.60	1.28	1.35	1.30	1.31	1.18
P	1.02	1.10	1.11	1.14	1.08	1.01	1.10	0.97	1.14	1.03	1.13	1.08	1.17	1.06	1.05	1.07	1.19	0.97	1.04	0.92	1.06	0.88

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.05	0.13	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.15	0.05	0.12	0.22	0.16	0.13
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.06	0.10	0.11	0.07	0.06	0.03	0.00	0.02	0.01	0.05	0.27	0.12	0.09
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.12	0.11	0.12	0.10	0.13	0.12	0.07	0.02	0.01	0.01	0.06	0.32	0.13	0.13
C4	0.01	0.01	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.10	0.03	0.11	0.18	0.14	0.11
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.07	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.14	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.13	0.02	0.15	0.19	0.18	0.14
C5'	0.02	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.10	0.09	0.06	0.12	0.12	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.08	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.12	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.15	0.03	0.16	0.22	0.20	0.16
C8	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.13	0.03	0.15	0.14	0.16	0.12
N1	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.15	0.05	0.14	0.23	0.19	0.15
N3	0.02	0.00	0.11	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.12	0.05	0.10	0.20	0.14	0.11
N6	0.02	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.17	0.03	0.18	0.23	0.23	0.18
N7	0.01	0.01	0.06	0.12	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.15	0.02	0.17	0.17	0.19	0.15
N9	0.00	0.01	0.03	0.07	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.01	0.10	0.15	0.13	0.10
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.04	0.02	0.00	0.05	0.04	0.04	0.26	0.10	0.07
O3'	0.02	0.15	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.15	0.13	0.15	0.12	0.17	0.15	0.07	0.05	0.00	0.02	0.08	0.44	0.19	0.20
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.06	0.10	0.14	0.12
O5'	0.05	0.12	0.05	0.06	0.11	0.01	0.15	0.01	0.16	0.15	0.14	0.10	0.18	0.17	0.10	0.04	0.08	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.13	0.22	0.27	0.32	0.18	0.14	0.19	0.08	0.22	0.14	0.23	0.20	0.23	0.17	0.15	0.26	0.44	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.16	0.12	0.13	0.14	0.06	0.18	0.02	0.20	0.16	0.19	0.14	0.23	0.19	0.13	0.10	0.19	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.13	0.09	0.13	0.11	0.03	0.14	0.01	0.16	0.12	0.15	0.11	0.18	0.15	0.10	0.07	0.20	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00