Doublet Group distance statistics: 55009

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 1, 1, 2, 6, 4, 3, 1, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.008, 0.017, 0.026, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.006, 0.017, 0.027, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.006, 0.019, 0.033, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.012, 0.025, 0.039, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.001, 0.016, 0.030, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.014, 0.030, 0.045, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.020, 0.036, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.036 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.022 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.001, 0.034, 0.068, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.034 std_dev=0.033
C3'	A	0, 0.223, 0.342, 0.462, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.342 std_dev=0.120
O3'	A	0, 0.264, 0.417, 0.570, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.417 std_dev=0.153
O4'	A	0, 0.228, 0.403, 0.578, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.403 std_dev=0.175
O4'	B	0, 0.345, 0.521, 0.697, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.521 std_dev=0.176
C4'	A	0, 0.293, 0.485, 0.676, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.485 std_dev=0.192
C2'	A	0, 0.188, 0.391, 0.593, 0.668 max_d=0.668 avg_d=0.391 std_dev=0.203
P	B	0, 0.379, 0.663, 0.946, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.663 std_dev=0.283
C4'	B	0, 0.464, 0.752, 1.040, 1.153 max_d=1.153 avg_d=0.752 std_dev=0.288
O5'	B	0, 0.477, 0.769, 1.061, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.769 std_dev=0.292
OP1	B	0, 0.253, 0.550, 0.846, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.550 std_dev=0.297
C5'	B	0, 0.554, 0.853, 1.151, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.853 std_dev=0.298
N9	B	0, 0.691, 1.003, 1.315, 1.509 max_d=1.509 avg_d=1.003 std_dev=0.312
C1'	B	0, 0.676, 0.993, 1.310, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.993 std_dev=0.317
C8	B	0, 0.729, 1.048, 1.367, 1.621 max_d=1.621 avg_d=1.048 std_dev=0.319
C4	B	0, 0.747, 1.078, 1.409, 1.617 max_d=1.617 avg_d=1.078 std_dev=0.331
O2'	A	0, 0.370, 0.707, 1.043, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.707 std_dev=0.337
N7	B	0, 0.756, 1.100, 1.444, 1.786 max_d=1.786 avg_d=1.100 std_dev=0.344
C5	B	0, 0.767, 1.114, 1.461, 1.793 max_d=1.793 avg_d=1.114 std_dev=0.347
N3	B	0, 0.818, 1.170, 1.522, 1.594 max_d=1.594 avg_d=1.170 std_dev=0.352
OP2	B	0, 0.720, 1.093, 1.467, 1.715 max_d=1.715 avg_d=1.093 std_dev=0.373
C5'	A	0, 0.488, 0.869, 1.249, 1.413 max_d=1.413 avg_d=0.869 std_dev=0.381
C6	B	0, 0.833, 1.215, 1.597, 2.005 max_d=2.005 avg_d=1.215 std_dev=0.382
C2	B	0, 0.906, 1.290, 1.674, 1.891 max_d=1.891 avg_d=1.290 std_dev=0.384
N1	B	0, 0.912, 1.310, 1.709, 2.113 max_d=2.113 avg_d=1.310 std_dev=0.398
C3'	B	0, 0.801, 1.216, 1.632, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.216 std_dev=0.415
N6	B	0, 0.851, 1.271, 1.691, 2.251 max_d=2.251 avg_d=1.271 std_dev=0.420
C2'	B	0, 1.007, 1.432, 1.857, 2.010 max_d=2.010 avg_d=1.432 std_dev=0.425
O3'	B	0, 0.793, 1.256, 1.720, 1.862 max_d=1.862 avg_d=1.256 std_dev=0.463
O5'	A	0, 0.556, 1.074, 1.592, 2.412 max_d=2.412 avg_d=1.074 std_dev=0.518
O2'	B	0, 1.475, 2.044, 2.614, 2.744 max_d=2.744 avg_d=2.044 std_dev=0.569
P	A	0, 1.354, 2.189, 3.025, 2.972 max_d=2.972 avg_d=2.189 std_dev=0.836
OP2	A	0, 1.393, 2.594, 3.795, 5.043 max_d=5.043 avg_d=2.594 std_dev=1.201
OP1	A	0, 1.751, 3.090, 4.430, 4.369 max_d=4.369 avg_d=3.090 std_dev=1.339

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.07	0.63	0.25	0.24
C2	0.04	0.00	0.12	0.09	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.22	0.12	0.08	0.18	0.82	0.55	0.41
C2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.07	0.01	0.04	0.07	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.01	0.23	0.69	0.19	0.14
C3'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.04	0.02	0.05	0.03	0.07	0.09	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.24	0.48	0.20	0.10
C4	0.02	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.06	0.05	0.16	0.85	0.51	0.41
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.26	0.17	0.08
C5	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.05	0.03	0.17	0.96	0.59	0.47
C5'	0.04	0.08	0.07	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.10	0.12	0.09	0.07	0.11	0.11	0.08	0.06	0.02	0.02	0.01	0.18	0.18	0.02
C6	0.03	0.01	0.07	0.05	0.01	0.04	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.12	0.07	0.05	0.19	0.97	0.63	0.49
C8	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.08	0.03	0.06	0.15	0.98	0.51	0.45
N1	0.04	0.00	0.10	0.07	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.10	0.07	0.19	0.91	0.61	0.46
N3	0.04	0.00	0.12	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.21	0.11	0.08	0.16	0.77	0.49	0.37
N6	0.04	0.01	0.06	0.05	0.02	0.05	0.02	0.11	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.10	0.06	0.05	0.20	1.02	0.68	0.52
N7	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.03	0.04	0.17	1.03	0.61	0.49
N9	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.13	0.83	0.42	0.37
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.11	0.01	0.07	0.06	0.12	0.08	0.18	0.21	0.10	0.05	0.02	0.00	0.07	0.01	0.26	0.79	0.26	0.15
O3'	0.03	0.12	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.10	0.11	0.06	0.03	0.03	0.07	0.00	0.04	0.16	0.47	0.14	0.09
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.07	0.08	0.05	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.17	0.40	0.36	0.23
O5'	0.07	0.18	0.23	0.24	0.16	0.02	0.17	0.01	0.19	0.15	0.19	0.16	0.20	0.17	0.13	0.26	0.16	0.17	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.63	0.82	0.69	0.48	0.85	0.26	0.96	0.18	0.97	0.98	0.91	0.77	1.02	1.03	0.83	0.79	0.47	0.40	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.25	0.55	0.19	0.20	0.51	0.17	0.59	0.18	0.63	0.51	0.61	0.49	0.68	0.61	0.42	0.26	0.14	0.36	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.41	0.14	0.10	0.41	0.08	0.47	0.02	0.49	0.45	0.46	0.37	0.52	0.49	0.37	0.15	0.09	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.24	0.16	0.13	0.16	0.11	0.17	0.12	0.19	0.20	0.24	0.19	0.18	0.21	0.16	0.20	0.16	0.12	0.13	0.16	0.32	0.17
C2	0.16	0.21	0.15	0.14	0.14	0.14	0.12	0.15	0.14	0.19	0.18	0.19	0.16	0.18	0.16	0.17	0.16	0.15	0.18	0.15	0.29	0.18
C2'	0.13	0.23	0.16	0.12	0.15	0.10	0.17	0.15	0.19	0.20	0.24	0.18	0.20	0.21	0.15	0.19	0.13	0.10	0.14	0.18	0.32	0.17
C3'	0.16	0.24	0.19	0.15	0.19	0.11	0.20	0.12	0.21	0.22	0.25	0.20	0.22	0.23	0.18	0.24	0.17	0.12	0.14	0.17	0.32	0.17
C4	0.13	0.22	0.13	0.12	0.13	0.10	0.12	0.12	0.15	0.19	0.21	0.17	0.15	0.18	0.14	0.15	0.13	0.11	0.13	0.15	0.30	0.17
C4'	0.24	0.33	0.26	0.22	0.27	0.16	0.27	0.12	0.30	0.26	0.34	0.29	0.29	0.27	0.25	0.32	0.27	0.18	0.15	0.17	0.32	0.19
C5	0.11	0.20	0.12	0.11	0.12	0.09	0.13	0.12	0.18	0.16	0.21	0.16	0.19	0.14	0.11	0.13	0.11	0.11	0.12	0.15	0.30	0.17
C5'	0.30	0.39	0.33	0.28	0.33	0.21	0.34	0.15	0.38	0.31	0.41	0.35	0.40	0.32	0.31	0.40	0.34	0.23	0.19	0.22	0.36	0.24
C6	0.11	0.19	0.11	0.11	0.12	0.10	0.12	0.13	0.17	0.14	0.20	0.16	0.18	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.12	0.14	0.29	0.16
C8	0.13	0.23	0.15	0.12	0.16	0.10	0.18	0.12	0.23	0.17	0.26	0.18	0.26	0.17	0.14	0.18	0.13	0.11	0.11	0.17	0.31	0.18
N1	0.13	0.20	0.12	0.12	0.12	0.12	0.11	0.15	0.15	0.15	0.19	0.17	0.16	0.13	0.12	0.13	0.12	0.13	0.17	0.14	0.28	0.17
N3	0.16	0.22	0.15	0.14	0.15	0.13	0.13	0.14	0.11	0.21	0.19	0.19	0.13	0.20	0.17	0.18	0.16	0.14	0.16	0.14	0.30	0.17
N6	0.15	0.20	0.15	0.15	0.16	0.14	0.16	0.14	0.19	0.13	0.21	0.18	0.20	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.11	0.15	0.28	0.17
N7	0.12	0.21	0.14	0.12	0.15	0.10	0.17	0.12	0.22	0.16	0.24	0.17	0.25	0.17	0.13	0.16	0.12	0.11	0.11	0.18	0.30	0.18
N9	0.14	0.24	0.15	0.12	0.16	0.10	0.16	0.12	0.20	0.19	0.25	0.19	0.20	0.18	0.15	0.18	0.14	0.11	0.12	0.16	0.31	0.17
O2'	0.13	0.24	0.14	0.14	0.14	0.16	0.14	0.21	0.17	0.18	0.24	0.19	0.18	0.19	0.13	0.15	0.12	0.14	0.20	0.22	0.34	0.21
O3'	0.15	0.20	0.16	0.13	0.15	0.12	0.17	0.14	0.16	0.21	0.19	0.17	0.18	0.22	0.16	0.21	0.15	0.12	0.16	0.15	0.32	0.17
O4'	0.24	0.32	0.25	0.22	0.26	0.17	0.26	0.13	0.29	0.25	0.33	0.29	0.27	0.26	0.25	0.30	0.26	0.19	0.16	0.18	0.32	0.20
O5'	0.39	0.39	0.45	0.40	0.40	0.31	0.42	0.28	0.42	0.43	0.41	0.39	0.44	0.44	0.41	0.54	0.43	0.31	0.27	0.30	0.36	0.29
OP1	0.97	0.67	1.05	1.02	0.84	0.99	0.84	1.01	0.72	1.02	0.64	0.76	0.70	0.96	0.95	1.09	1.02	0.97	1.10	1.20	1.33	1.19
OP2	0.98	0.79	1.07	0.99	0.93	0.87	0.92	0.81	0.81	1.04	0.74	0.86	0.75	1.01	0.99	1.17	1.02	0.87	0.78	0.81	0.75	0.77
P	0.72	0.61	0.78	0.72	0.69	0.64	0.70	0.58	0.64	0.76	0.60	0.64	0.64	0.76	0.73	0.85	0.75	0.64	0.61	0.65	0.70	0.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.12	0.10	0.07
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.06	0.02	0.09	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.11	0.08	0.10	0.11	0.13	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.06	0.03	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.05	0.05
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.05	0.08
C4	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.08	0.09	0.15	0.06
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.04	0.07
C5	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.04	0.09	0.08	0.19	0.09
C5'	0.02	0.09	0.04	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.09	0.10	0.07	0.13	0.11	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.09	0.07	0.06	0.10	0.08	0.19	0.09
C8	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.12	0.09	0.21	0.13
N1	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.10	0.07	0.11	0.10	0.17	0.08
N3	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.10	0.07	0.08	0.11	0.12	0.06
N6	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.07	0.06	0.12	0.09	0.22	0.11
N7	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.05	0.05	0.03	0.11	0.09	0.22	0.12
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.08	0.15	0.08
O2'	0.01	0.13	0.00	0.01	0.07	0.01	0.06	0.04	0.09	0.05	0.12	0.11	0.09	0.05	0.02	0.00	0.04	0.01	0.05	0.17	0.05	0.06
O3'	0.04	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.10	0.07	0.05	0.04	0.04	0.00	0.04	0.03	0.28	0.10	0.13
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	0.03	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.10	0.10	0.08
O5'	0.06	0.10	0.06	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.10	0.12	0.11	0.08	0.12	0.11	0.08	0.05	0.03	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.11	0.14	0.20	0.09	0.15	0.08	0.04	0.08	0.09	0.10	0.11	0.09	0.09	0.08	0.17	0.28	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.13	0.05	0.05	0.15	0.04	0.19	0.03	0.19	0.21	0.17	0.12	0.22	0.22	0.15	0.05	0.10	0.10	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.07	0.07	0.05	0.08	0.06	0.07	0.09	0.01	0.09	0.13	0.08	0.06	0.11	0.12	0.08	0.06	0.13	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00