Doublet Group distance statistics: 55010

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 1, 0, 1, 3, 7, 4, 2, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.008, 0.015, 0.022, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C6	A	0, 0.007, 0.017, 0.028, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.012, 0.024, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.024 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.013, 0.025, 0.036, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.012, 0.034, 0.055, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.034 std_dev=0.022
N9	A	0, 0.021, 0.045, 0.069, 0.082 max_d=0.082 avg_d=0.045 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.020, 0.047, 0.075, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.047 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.019, 0.049, 0.078, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.049 std_dev=0.029
C8	A	0, 0.023, 0.064, 0.105, 0.138 max_d=0.138 avg_d=0.064 std_dev=0.041
O4'	A	0, 0.224, 0.383, 0.542, 0.632 max_d=0.632 avg_d=0.383 std_dev=0.159
C2'	A	0, 0.209, 0.373, 0.537, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.373 std_dev=0.164
O2'	A	0, 0.130, 0.319, 0.507, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.319 std_dev=0.188
OP1	B	0, 0.382, 0.627, 0.872, 1.287 max_d=1.287 avg_d=0.627 std_dev=0.245
C4'	A	0, 0.352, 0.604, 0.857, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.604 std_dev=0.253
C3'	A	0, 0.364, 0.631, 0.898, 1.152 max_d=1.152 avg_d=0.631 std_dev=0.267
P	B	0, 0.404, 0.687, 0.970, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.687 std_dev=0.283
OP1	A	0, 0.152, 0.501, 0.850, 1.701 max_d=1.701 avg_d=0.501 std_dev=0.349
C5'	A	0, 0.538, 0.933, 1.328, 1.700 max_d=1.700 avg_d=0.933 std_dev=0.395
O5'	B	0, 0.589, 0.986, 1.382, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.986 std_dev=0.396
O3'	A	0, 0.562, 0.972, 1.382, 1.694 max_d=1.694 avg_d=0.972 std_dev=0.410
OP2	B	0, 0.731, 1.172, 1.612, 1.875 max_d=1.875 avg_d=1.172 std_dev=0.440
P	A	0, 0.441, 0.912, 1.382, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.912 std_dev=0.471
O5'	A	0, 0.635, 1.113, 1.592, 2.119 max_d=2.119 avg_d=1.113 std_dev=0.478
OP2	A	0, 0.759, 1.327, 1.896, 2.725 max_d=2.725 avg_d=1.327 std_dev=0.569
C5'	B	0, 0.883, 1.500, 2.116, 2.800 max_d=2.800 avg_d=1.500 std_dev=0.617
C6	B	0, 0.884, 1.578, 2.271, 3.149 max_d=3.149 avg_d=1.578 std_dev=0.694
N6	B	0, 1.074, 1.812, 2.550, 3.014 max_d=3.014 avg_d=1.812 std_dev=0.738
C4	B	0, 0.967, 1.778, 2.590, 3.479 max_d=3.479 avg_d=1.778 std_dev=0.811
C5	B	0, 1.077, 1.890, 2.704, 3.311 max_d=3.311 avg_d=1.890 std_dev=0.814
C4'	B	0, 1.148, 2.004, 2.860, 3.617 max_d=3.617 avg_d=2.004 std_dev=0.856
O4'	B	0, 1.221, 2.116, 3.010, 3.810 max_d=3.810 avg_d=2.116 std_dev=0.895
C2'	B	0, 1.165, 2.062, 2.959, 3.985 max_d=3.985 avg_d=2.062 std_dev=0.897
N9	B	0, 1.196, 2.131, 3.066, 3.739 max_d=3.739 avg_d=2.131 std_dev=0.935
C3'	B	0, 1.192, 2.140, 3.088, 3.801 max_d=3.801 avg_d=2.140 std_dev=0.948
C1'	B	0, 1.200, 2.190, 3.179, 4.054 max_d=4.054 avg_d=2.190 std_dev=0.990
N1	B	0, 1.653, 2.861, 4.068, 4.473 max_d=4.473 avg_d=2.861 std_dev=1.207
O2'	B	0, 1.554, 2.789, 4.025, 5.712 max_d=5.712 avg_d=2.789 std_dev=1.236
O3'	B	0, 1.627, 2.868, 4.108, 4.733 max_d=4.733 avg_d=2.868 std_dev=1.241
N3	B	0, 1.780, 3.153, 4.527, 4.776 max_d=4.776 avg_d=3.153 std_dev=1.373
N7	B	0, 2.028, 3.558, 5.087, 4.672 max_d=4.672 avg_d=3.558 std_dev=1.529
C8	B	0, 2.045, 3.601, 5.158, 4.872 max_d=4.872 avg_d=3.601 std_dev=1.556
C2	B	0, 2.178, 3.820, 5.462, 5.461 max_d=5.461 avg_d=3.820 std_dev=1.642

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.07	0.11	0.08
C2	0.02	0.00	0.12	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.17	0.03	0.09	0.15	0.19	0.16
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.02	0.06	0.01	0.08	0.05	0.10	0.11	0.09	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.15	0.07	0.06
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.12	0.10	0.13	0.11	0.14	0.11	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.19	0.05	0.05
C4	0.01	0.01	0.07	0.08	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.08	0.13	0.18	0.14
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.06	0.06	0.06	0.05	0.07	0.06	0.03	0.06	0.02	0.00	0.01	0.07	0.02	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.13	0.03	0.11	0.16	0.21	0.17
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.08	0.07	0.04	0.08	0.09	0.04	0.06	0.03	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.16	0.03	0.11	0.18	0.22	0.18
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.06	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.13	0.13	0.19	0.14
N1	0.02	0.00	0.10	0.13	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.18	0.03	0.10	0.17	0.21	0.18
N3	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.08	0.13	0.17	0.14
N6	0.03	0.01	0.09	0.14	0.02	0.07	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.06	0.19	0.04	0.12	0.19	0.23	0.19
N7	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.13	0.03	0.13	0.17	0.23	0.17
N9	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.08	0.11	0.15	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.06	0.04	0.06	0.06	0.03	0.08	0.10	0.06	0.03	0.01	0.00	0.03	0.05	0.03	0.13	0.04	0.04
O3'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.10	0.02	0.13	0.03	0.16	0.11	0.18	0.14	0.19	0.13	0.06	0.03	0.00	0.02	0.07	0.28	0.11	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.12	0.09	0.10
O5'	0.06	0.09	0.05	0.05	0.08	0.01	0.11	0.01	0.11	0.13	0.10	0.08	0.12	0.13	0.08	0.03	0.07	0.06	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.07	0.15	0.15	0.19	0.13	0.07	0.16	0.09	0.18	0.13	0.17	0.13	0.19	0.17	0.11	0.13	0.28	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.19	0.07	0.05	0.18	0.02	0.21	0.02	0.22	0.19	0.21	0.17	0.23	0.23	0.15	0.04	0.11	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.16	0.06	0.05	0.14	0.03	0.17	0.02	0.18	0.14	0.18	0.14	0.19	0.17	0.12	0.04	0.08	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.25	0.77	0.17	0.14	0.13	0.17	0.35	0.14	0.15	0.75	0.57	0.52	0.46	0.84	0.32	0.23	0.20	0.21	0.16	0.19	0.22	0.17
C2	0.28	1.20	0.19	0.18	0.09	0.22	0.45	0.22	0.13	1.17	0.82	0.85	0.53	1.26	0.43	0.24	0.18	0.27	0.17	0.19	0.29	0.20
C2'	0.14	0.88	0.14	0.08	0.15	0.09	0.26	0.08	0.11	0.67	0.66	0.62	0.40	0.77	0.22	0.24	0.14	0.15	0.17	0.12	0.17	0.12
C3'	0.08	0.75	0.15	0.10	0.15	0.08	0.18	0.10	0.11	0.49	0.58	0.54	0.32	0.57	0.13	0.25	0.15	0.11	0.18	0.11	0.13	0.08
C4	0.24	1.03	0.17	0.13	0.11	0.16	0.41	0.14	0.14	0.96	0.74	0.71	0.53	1.09	0.36	0.23	0.16	0.21	0.16	0.18	0.23	0.17
C4'	0.17	0.54	0.12	0.09	0.10	0.12	0.22	0.11	0.10	0.47	0.41	0.36	0.31	0.53	0.20	0.20	0.19	0.16	0.15	0.17	0.18	0.12
C5	0.23	1.09	0.17	0.12	0.11	0.13	0.43	0.11	0.14	0.98	0.78	0.74	0.55	1.14	0.36	0.24	0.15	0.19	0.16	0.19	0.20	0.17
C5'	0.16	0.33	0.12	0.11	0.10	0.14	0.17	0.14	0.10	0.32	0.26	0.22	0.24	0.36	0.17	0.19	0.21	0.16	0.14	0.21	0.19	0.13
C6	0.25	1.23	0.19	0.14	0.10	0.15	0.46	0.14	0.14	1.15	0.82	0.88	0.54	1.29	0.41	0.25	0.14	0.21	0.16	0.19	0.22	0.17
C8	0.20	0.76	0.17	0.12	0.14	0.12	0.34	0.10	0.16	0.66	0.58	0.50	0.51	0.79	0.28	0.24	0.20	0.17	0.17	0.19	0.17	0.16
N1	0.27	1.25	0.20	0.17	0.10	0.20	0.47	0.20	0.14	1.22	0.83	0.90	0.53	1.31	0.44	0.26	0.16	0.25	0.16	0.18	0.27	0.19
N3	0.27	1.10	0.18	0.16	0.10	0.20	0.43	0.19	0.13	1.06	0.78	0.77	0.53	1.16	0.40	0.23	0.17	0.24	0.16	0.18	0.26	0.19
N6	0.24	1.27	0.20	0.13	0.12	0.13	0.47	0.12	0.15	1.22	0.81	0.94	0.51	1.34	0.42	0.27	0.13	0.20	0.16	0.21	0.20	0.17
N7	0.20	0.91	0.17	0.12	0.13	0.12	0.38	0.10	0.15	0.77	0.69	0.60	0.56	0.94	0.30	0.25	0.19	0.17	0.18	0.20	0.17	0.16
N9	0.23	0.86	0.16	0.13	0.12	0.14	0.36	0.12	0.15	0.79	0.64	0.58	0.50	0.91	0.32	0.23	0.18	0.19	0.16	0.18	0.21	0.16
O2'	0.19	0.86	0.14	0.10	0.13	0.14	0.29	0.12	0.12	0.73	0.63	0.61	0.41	0.81	0.27	0.23	0.16	0.20	0.16	0.16	0.22	0.15
O3'	0.09	0.76	0.21	0.17	0.20	0.13	0.15	0.14	0.15	0.42	0.60	0.57	0.27	0.51	0.11	0.32	0.19	0.13	0.23	0.09	0.12	0.10
O4'	0.27	0.56	0.19	0.18	0.16	0.20	0.32	0.17	0.17	0.61	0.42	0.37	0.41	0.68	0.31	0.24	0.26	0.24	0.16	0.22	0.23	0.18
O5'	0.14	0.30	0.11	0.10	0.10	0.13	0.16	0.14	0.10	0.29	0.25	0.20	0.24	0.33	0.15	0.19	0.20	0.16	0.12	0.25	0.21	0.16
OP1	0.24	0.20	0.24	0.25	0.23	0.29	0.27	0.29	0.24	0.31	0.21	0.20	0.27	0.32	0.26	0.27	0.35	0.32	0.23	0.32	0.27	0.24
OP2	0.23	0.18	0.22	0.23	0.23	0.26	0.26	0.27	0.25	0.29	0.20	0.20	0.30	0.30	0.25	0.25	0.31	0.28	0.24	0.39	0.31	0.29
P	0.18	0.18	0.20	0.21	0.19	0.25	0.20	0.26	0.19	0.23	0.18	0.17	0.22	0.23	0.20	0.22	0.29	0.26	0.23	0.26	0.22	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.03	0.01	0.00	0.02	0.18	0.01	0.16	0.35	0.14	0.16
C2	0.05	0.00	0.18	0.18	0.03	0.35	0.02	0.63	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.31	0.24	0.33	0.78	0.96	0.91	0.94
C2'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.09	0.02	0.05	0.07	0.08	0.10	0.14	0.18	0.07	0.08	0.02	0.00	0.05	0.03	0.29	0.36	0.18	0.24
C3'	0.03	0.18	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.12	0.13	0.17	0.06	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.18	0.22	0.13	0.13
C4	0.03	0.03	0.09	0.07	0.00	0.13	0.01	0.19	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.15	0.17	0.16	0.21	0.15	0.14	0.14
C4'	0.02	0.35	0.02	0.01	0.13	0.00	0.03	0.01	0.09	0.27	0.24	0.35	0.05	0.22	0.05	0.03	0.03	0.01	0.01	0.17	0.07	0.04
C5	0.02	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.12	0.17	0.04	0.27	0.52	0.32	0.34
C5'	0.03	0.63	0.07	0.01	0.19	0.01	0.11	0.00	0.11	0.59	0.40	0.61	0.11	0.50	0.15	0.05	0.06	0.01	0.01	0.14	0.07	0.02
C6	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.09	0.01	0.11	0.00	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.15	0.17	0.11	0.18	0.22	0.09	0.11
C8	0.02	0.04	0.10	0.12	0.01	0.27	0.02	0.59	0.04	0.00	0.04	0.02	0.06	0.00	0.01	0.24	0.23	0.23	0.89	1.36	1.03	1.11
N1	0.05	0.01	0.14	0.13	0.02	0.24	0.02	0.40	0.01	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.24	0.20	0.23	0.48	0.52	0.53	0.54
N3	0.06	0.01	0.18	0.17	0.01	0.35	0.01	0.61	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.31	0.24	0.34	0.75	0.83	0.82	0.86
N6	0.03	0.01	0.07	0.06	0.02	0.05	0.03	0.11	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.07	0.03	0.16	0.19	0.06	0.25	0.50	0.34	0.34
N7	0.01	0.02	0.08	0.10	0.02	0.22	0.01	0.50	0.03	0.00	0.03	0.02	0.07	0.00	0.02	0.20	0.21	0.16	0.77	1.30	0.98	1.03
N9	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.15	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.08	0.17	0.02	0.32	0.55	0.33	0.36
O2'	0.02	0.31	0.00	0.01	0.15	0.03	0.12	0.05	0.15	0.24	0.24	0.31	0.16	0.20	0.08	0.00	0.06	0.03	0.31	0.40	0.21	0.29
O3'	0.18	0.24	0.05	0.01	0.17	0.03	0.17	0.06	0.17	0.23	0.20	0.24	0.19	0.21	0.17	0.06	0.00	0.11	0.13	0.19	0.19	0.12
O4'	0.01	0.33	0.03	0.01	0.16	0.01	0.04	0.01	0.11	0.23	0.23	0.34	0.06	0.16	0.02	0.03	0.11	0.00	0.11	0.27	0.13	0.15
O5'	0.16	0.78	0.29	0.18	0.21	0.01	0.27	0.01	0.18	0.89	0.48	0.75	0.25	0.77	0.32	0.31	0.13	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.35	0.96	0.36	0.22	0.15	0.17	0.52	0.14	0.22	1.36	0.52	0.83	0.50	1.30	0.55	0.40	0.19	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.91	0.18	0.13	0.14	0.07	0.32	0.07	0.09	1.03	0.53	0.82	0.34	0.98	0.33	0.21	0.19	0.13	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.94	0.24	0.13	0.14	0.04	0.34	0.02	0.11	1.11	0.54	0.86	0.34	1.03	0.36	0.29	0.12	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00