Doublet Group distance statistics: 55011

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 1, 1, 0, 1, 3, 1, 1, 9, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.011, 0.020, 0.028, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.020 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.019, 0.030, 0.042, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.030 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.017, 0.030, 0.042, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.021, 0.036, 0.051, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.036 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.015, 0.032, 0.048, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.032 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.026, 0.049, 0.072, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.049 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.029, 0.055, 0.081, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.055 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.027, 0.056, 0.086, 0.148 max_d=0.148 avg_d=0.056 std_dev=0.029
O4'	A	0, 0.129, 0.261, 0.392, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.261 std_dev=0.132
C2'	A	0, 0.122, 0.258, 0.394, 0.519 max_d=0.519 avg_d=0.258 std_dev=0.136
O2'	A	0, 0.082, 0.239, 0.396, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.239 std_dev=0.157
N7	B	0, 0.237, 0.432, 0.627, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.432 std_dev=0.195
C4'	A	0, 0.215, 0.427, 0.638, 0.852 max_d=0.852 avg_d=0.427 std_dev=0.211
C3'	A	0, 0.229, 0.441, 0.654, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.441 std_dev=0.213
P	B	0, 0.274, 0.496, 0.717, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.496 std_dev=0.221
O5'	B	0, 0.287, 0.523, 0.759, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.523 std_dev=0.236
N6	B	0, 0.087, 0.367, 0.647, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.367 std_dev=0.280
C5'	B	0, 0.178, 0.462, 0.747, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.462 std_dev=0.285
C5	B	0, 0.354, 0.641, 0.927, 1.302 max_d=1.302 avg_d=0.641 std_dev=0.286
C6	B	0, 0.380, 0.669, 0.958, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.669 std_dev=0.289
O3'	A	0, 0.409, 0.719, 1.029, 1.292 max_d=1.292 avg_d=0.719 std_dev=0.310
C8	B	0, 0.338, 0.658, 0.977, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.658 std_dev=0.319
C5'	A	0, 0.279, 0.612, 0.945, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.612 std_dev=0.333
O5'	A	0, 0.194, 0.535, 0.875, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.535 std_dev=0.341
O3'	B	0, 0.303, 0.652, 1.002, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.652 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.389, 0.741, 1.093, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.741 std_dev=0.352
P	A	0, 0.090, 0.470, 0.851, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.470 std_dev=0.380
OP1	B	0, 0.378, 0.792, 1.206, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.792 std_dev=0.414
OP2	B	0, 0.442, 0.868, 1.294, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.868 std_dev=0.426
N1	B	0, 0.633, 1.104, 1.576, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.104 std_dev=0.471
O4'	B	0, 0.507, 0.982, 1.458, 2.037 max_d=2.037 avg_d=0.982 std_dev=0.475
C4	B	0, 0.578, 1.062, 1.546, 2.040 max_d=2.040 avg_d=1.062 std_dev=0.484
C3'	B	0, 0.539, 1.055, 1.571, 2.052 max_d=2.052 avg_d=1.055 std_dev=0.516
N9	B	0, 0.488, 1.013, 1.538, 2.081 max_d=2.081 avg_d=1.013 std_dev=0.525
C2	B	0, 0.855, 1.470, 2.085, 2.662 max_d=2.662 avg_d=1.470 std_dev=0.615
N3	B	0, 0.845, 1.488, 2.131, 2.607 max_d=2.607 avg_d=1.488 std_dev=0.643
C1'	B	0, 0.635, 1.385, 2.135, 2.751 max_d=2.751 avg_d=1.385 std_dev=0.750
OP1	A	0, 0.747, 1.660, 2.574, 2.761 max_d=2.761 avg_d=1.660 std_dev=0.914
OP2	A	0, 0.789, 1.777, 2.765, 2.707 max_d=2.707 avg_d=1.777 std_dev=0.988
C2'	B	0, 0.754, 1.771, 2.787, 3.314 max_d=3.314 avg_d=1.771 std_dev=1.016
O2'	B	0, 0.999, 2.705, 4.410, 4.984 max_d=4.984 avg_d=2.705 std_dev=1.705

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.47	0.33	0.12
C2	0.02	0.00	0.10	0.11	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.14	0.02	0.10	0.65	0.76	0.12
C2'	0.01	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.26	0.14	0.06
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.10	0.10	0.10	0.09	0.10	0.05	0.02	0.01	0.01	0.05	0.11	0.12	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.01	0.09	0.64	0.72	0.11
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.03	0.05	0.05	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.13	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.08	0.71	0.93	0.10
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.06	0.07	0.05	0.06	0.07	0.08	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.10	0.38	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.03	0.09	0.72	0.99	0.09
C8	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.12	0.02	0.11	0.69	0.81	0.11
N1	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.02	0.09	0.69	0.90	0.10
N3	0.02	0.00	0.10	0.10	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.12	0.02	0.10	0.61	0.65	0.12
N6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.05	0.13	0.04	0.10	0.75	1.11	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.03	0.11	0.75	1.01	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.08	0.60	0.61	0.12
O2'	0.02	0.11	0.00	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.05	0.03	0.08	0.10	0.05	0.02	0.01	0.00	0.07	0.04	0.05	0.21	0.10	0.06
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.02	0.09	0.03	0.11	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12	0.05	0.07	0.00	0.02	0.08	0.26	0.34	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.41	0.22	0.15
O5'	0.08	0.10	0.05	0.05	0.09	0.03	0.08	0.01	0.09	0.11	0.09	0.10	0.10	0.11	0.08	0.05	0.08	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.47	0.65	0.26	0.11	0.64	0.13	0.71	0.10	0.72	0.69	0.69	0.61	0.75	0.75	0.60	0.21	0.26	0.41	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.33	0.76	0.14	0.12	0.72	0.17	0.93	0.38	0.99	0.81	0.90	0.65	1.11	1.01	0.61	0.10	0.34	0.22	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.12	0.12	0.06	0.05	0.11	0.04	0.10	0.02	0.09	0.11	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.06	0.09	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.19	0.17	0.40	0.16	0.24	0.14	0.22	0.14	0.19	0.18	0.18	0.17	0.17	0.19	0.30	0.25	0.23	0.30	0.16	0.21	0.30
C2	0.14	0.13	0.33	0.31	0.12	0.23	0.11	0.20	0.12	0.12	0.13	0.13	0.13	0.11	0.13	0.49	0.33	0.24	0.26	0.18	0.28	0.30
C2'	0.14	0.18	0.21	0.35	0.13	0.21	0.13	0.21	0.15	0.14	0.18	0.16	0.17	0.13	0.13	0.47	0.23	0.18	0.27	0.18	0.24	0.29
C3'	0.13	0.22	0.20	0.31	0.15	0.16	0.14	0.17	0.18	0.12	0.22	0.18	0.19	0.12	0.13	0.53	0.16	0.14	0.22	0.20	0.22	0.25
C4	0.15	0.14	0.22	0.36	0.12	0.22	0.11	0.21	0.13	0.14	0.15	0.13	0.15	0.13	0.13	0.40	0.28	0.20	0.28	0.16	0.23	0.30
C4'	0.22	0.24	0.18	0.41	0.19	0.24	0.16	0.22	0.17	0.19	0.22	0.22	0.17	0.16	0.20	0.32	0.21	0.21	0.29	0.16	0.22	0.30
C5	0.12	0.13	0.23	0.35	0.11	0.21	0.11	0.21	0.12	0.12	0.13	0.12	0.14	0.12	0.12	0.44	0.27	0.17	0.28	0.16	0.23	0.30
C5'	0.27	0.29	0.25	0.47	0.24	0.28	0.21	0.25	0.20	0.23	0.26	0.28	0.18	0.20	0.25	0.30	0.24	0.24	0.32	0.17	0.26	0.34
C6	0.11	0.13	0.32	0.32	0.12	0.20	0.11	0.20	0.12	0.10	0.13	0.13	0.12	0.10	0.11	0.52	0.30	0.17	0.27	0.18	0.25	0.30
C8	0.19	0.17	0.19	0.40	0.16	0.23	0.15	0.23	0.15	0.19	0.17	0.16	0.18	0.17	0.18	0.34	0.23	0.19	0.30	0.16	0.20	0.30
N1	0.13	0.13	0.37	0.30	0.13	0.22	0.12	0.20	0.12	0.12	0.13	0.13	0.12	0.11	0.13	0.54	0.34	0.22	0.26	0.19	0.28	0.30
N3	0.15	0.14	0.26	0.34	0.12	0.23	0.11	0.20	0.12	0.13	0.14	0.13	0.15	0.12	0.13	0.42	0.30	0.23	0.27	0.17	0.25	0.30
N6	0.14	0.15	0.38	0.31	0.15	0.19	0.13	0.20	0.13	0.13	0.13	0.16	0.12	0.13	0.14	0.59	0.31	0.13	0.27	0.23	0.27	0.30
N7	0.16	0.14	0.20	0.39	0.14	0.22	0.13	0.23	0.13	0.16	0.14	0.14	0.16	0.15	0.15	0.39	0.23	0.17	0.30	0.17	0.21	0.29
N9	0.18	0.17	0.18	0.38	0.15	0.23	0.13	0.22	0.14	0.18	0.17	0.16	0.17	0.16	0.17	0.34	0.25	0.20	0.29	0.15	0.21	0.30
O2'	0.18	0.18	0.21	0.37	0.14	0.24	0.13	0.24	0.14	0.17	0.18	0.16	0.16	0.15	0.16	0.41	0.26	0.22	0.30	0.20	0.26	0.32
O3'	0.14	0.25	0.25	0.27	0.17	0.14	0.17	0.16	0.21	0.14	0.25	0.21	0.21	0.15	0.15	0.63	0.13	0.13	0.20	0.23	0.23	0.23
O4'	0.27	0.23	0.20	0.43	0.20	0.26	0.17	0.23	0.16	0.23	0.21	0.23	0.18	0.19	0.23	0.23	0.24	0.24	0.31	0.16	0.20	0.31
O5'	0.21	0.28	0.21	0.40	0.22	0.22	0.19	0.21	0.22	0.17	0.27	0.26	0.20	0.16	0.20	0.40	0.19	0.19	0.28	0.21	0.25	0.31
OP1	0.98	0.79	1.02	1.22	0.91	1.01	0.89	0.96	0.81	0.96	0.75	0.87	0.73	0.92	0.96	0.67	0.88	0.93	1.02	0.79	0.97	1.06
OP2	1.25	1.19	1.14	0.92	1.26	1.19	1.27	1.24	1.28	1.24	1.22	1.22	1.29	1.24	1.26	1.51	1.20	1.32	1.12	1.29	1.03	0.98
P	0.16	0.24	0.20	0.38	0.17	0.16	0.14	0.18	0.16	0.12	0.23	0.21	0.15	0.11	0.15	0.34	0.14	0.16	0.25	0.15	0.17	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.03	0.30	0.01	0.23	0.23	0.22	0.15
C2	0.03	0.00	0.35	0.32	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.23	0.16	0.17	0.17	0.21	0.15	0.14
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.18	0.02	0.09	0.25	0.16	0.18	0.27	0.35	0.12	0.10	0.03	0.01	0.02	0.01	0.51	0.47	0.52	0.53
C3'	0.01	0.32	0.00	0.00	0.29	0.00	0.34	0.01	0.37	0.26	0.36	0.27	0.40	0.32	0.22	0.03	0.01	0.01	0.04	0.16	0.18	0.05
C4	0.01	0.01	0.18	0.29	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.20	0.08	0.09	0.16	0.22	0.12	0.10
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.09	0.14	0.06	0.05	0.11	0.14	0.08	0.29	0.03	0.00	0.02	0.25	0.14	0.05
C5	0.01	0.01	0.09	0.34	0.01	0.10	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.30	0.08	0.05	0.17	0.23	0.11	0.14
C5'	0.09	0.10	0.25	0.01	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.07	0.06	0.23	0.01	0.01	0.18	0.15	0.02
C6	0.02	0.01	0.16	0.37	0.01	0.09	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.29	0.09	0.08	0.19	0.23	0.15	0.18
C8	0.02	0.01	0.18	0.26	0.01	0.14	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.35	0.13	0.12	0.15	0.25	0.11	0.10
N1	0.02	0.01	0.27	0.36	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.24	0.09	0.14	0.18	0.22	0.15	0.17
N3	0.03	0.00	0.35	0.27	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.19	0.17	0.17	0.21	0.15	0.11
N6	0.03	0.01	0.12	0.40	0.02	0.11	0.03	0.10	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.05	0.03	0.34	0.16	0.07	0.21	0.24	0.20	0.24
N7	0.02	0.02	0.10	0.32	0.01	0.14	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.01	0.38	0.16	0.07	0.17	0.23	0.12	0.15
N9	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.20	0.08	0.01	0.16	0.23	0.13	0.09
O2'	0.03	0.23	0.01	0.03	0.20	0.29	0.30	0.06	0.29	0.35	0.24	0.22	0.34	0.38	0.20	0.00	0.08	0.22	0.42	0.45	0.41	0.50
O3'	0.30	0.16	0.02	0.01	0.08	0.03	0.08	0.23	0.09	0.13	0.09	0.19	0.16	0.16	0.08	0.08	0.00	0.23	0.26	0.29	0.34	0.25
O4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.00	0.05	0.01	0.08	0.12	0.14	0.17	0.07	0.07	0.01	0.22	0.23	0.00	0.07	0.36	0.11	0.14
O5'	0.23	0.17	0.51	0.04	0.16	0.02	0.17	0.01	0.19	0.15	0.18	0.17	0.21	0.17	0.16	0.42	0.26	0.07	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.23	0.21	0.47	0.16	0.22	0.25	0.23	0.18	0.23	0.25	0.22	0.21	0.24	0.23	0.23	0.45	0.29	0.36	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.15	0.52	0.18	0.12	0.14	0.11	0.15	0.15	0.11	0.15	0.15	0.20	0.12	0.13	0.41	0.34	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.15	0.14	0.53	0.05	0.10	0.05	0.14	0.02	0.18	0.10	0.17	0.11	0.24	0.15	0.09	0.50	0.25	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00