Doublet Group distance statistics: 55015

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 5, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.012, 0.022, 0.031, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.016, 0.027, 0.039, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.027 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.029, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.029 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.015, 0.031, 0.047, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.031 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.015, 0.034, 0.052, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.023, 0.042, 0.061, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.020, 0.040, 0.059, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.022, 0.044, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.025, 0.049, 0.073, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.049 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.040, 0.068, 0.096, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.068 std_dev=0.028
OP2	B	0, 0.195, 0.409, 0.622, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.409 std_dev=0.213
P	B	0, 0.133, 0.348, 0.563, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.348 std_dev=0.215
O4'	A	0, 0.195, 0.495, 0.796, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.495 std_dev=0.301
C2'	A	0, 0.191, 0.492, 0.794, 1.116 max_d=1.116 avg_d=0.492 std_dev=0.302
OP1	B	0, 0.526, 0.948, 1.369, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.948 std_dev=0.421
N7	B	0, 0.408, 0.837, 1.267, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.837 std_dev=0.429
N6	B	0, 0.621, 1.167, 1.713, 2.064 max_d=2.064 avg_d=1.167 std_dev=0.546
C6	B	0, 0.615, 1.186, 1.757, 1.808 max_d=1.808 avg_d=1.186 std_dev=0.571
C8	B	0, 0.533, 1.130, 1.726, 1.711 max_d=1.711 avg_d=1.130 std_dev=0.597
C5	B	0, 0.472, 1.081, 1.691, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.081 std_dev=0.610
O5'	A	0, 0.613, 1.235, 1.858, 1.797 max_d=1.797 avg_d=1.235 std_dev=0.623
C4'	A	0, 0.345, 0.985, 1.625, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.985 std_dev=0.640
O5'	B	0, 0.446, 1.096, 1.746, 1.662 max_d=1.662 avg_d=1.096 std_dev=0.650
C5'	A	0, 0.482, 1.148, 1.814, 1.715 max_d=1.715 avg_d=1.148 std_dev=0.666
O2'	A	0, 0.509, 1.201, 1.892, 2.306 max_d=2.306 avg_d=1.201 std_dev=0.692
P	A	0, 0.614, 1.306, 1.998, 1.980 max_d=1.980 avg_d=1.306 std_dev=0.692
N1	B	0, 0.700, 1.463, 2.226, 2.377 max_d=2.377 avg_d=1.463 std_dev=0.763
C3'	A	0, 0.430, 1.246, 2.063, 2.027 max_d=2.027 avg_d=1.246 std_dev=0.816
C5'	B	0, 0.523, 1.351, 2.179, 2.114 max_d=2.114 avg_d=1.351 std_dev=0.828
N9	B	0, 0.671, 1.547, 2.422, 2.428 max_d=2.428 avg_d=1.547 std_dev=0.876
C4	B	0, 0.543, 1.430, 2.316, 2.392 max_d=2.392 avg_d=1.430 std_dev=0.887
O4'	B	0, 0.872, 1.888, 2.904, 2.831 max_d=2.831 avg_d=1.888 std_dev=1.016
C2	B	0, 0.599, 1.640, 2.681, 2.899 max_d=2.899 avg_d=1.640 std_dev=1.041
C4'	B	0, 0.892, 1.996, 3.100, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.996 std_dev=1.104
C1'	B	0, 0.951, 2.068, 3.186, 3.131 max_d=3.131 avg_d=2.068 std_dev=1.117
N3	B	0, 0.606, 1.730, 2.855, 3.007 max_d=3.007 avg_d=1.730 std_dev=1.124
OP1	A	0, 0.773, 1.971, 3.169, 3.202 max_d=3.202 avg_d=1.971 std_dev=1.198
C3'	B	0, 1.065, 2.308, 3.550, 3.441 max_d=3.441 avg_d=2.308 std_dev=1.242
C2'	B	0, 1.137, 2.470, 3.803, 3.707 max_d=3.707 avg_d=2.470 std_dev=1.333
O3'	A	0, 0.788, 2.228, 3.668, 3.612 max_d=3.612 avg_d=2.228 std_dev=1.440
O3'	B	0, 1.433, 2.938, 4.443, 4.271 max_d=4.271 avg_d=2.938 std_dev=1.505
O2'	B	0, 1.463, 3.083, 4.702, 4.554 max_d=4.554 avg_d=3.083 std_dev=1.619
OP2	A	0, 0.833, 2.647, 4.461, 4.486 max_d=4.486 avg_d=2.647 std_dev=1.814

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.07	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.25	0.01	0.23	0.80	0.14	0.29
C2	0.05	0.00	0.18	0.22	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.28	0.23	0.11	0.50	0.69	0.84	0.20
C2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.11	0.02	0.10	0.17	0.12	0.13	0.15	0.17	0.12	0.12	0.06	0.01	0.04	0.02	0.42	0.31	0.35	0.28
C3'	0.03	0.22	0.01	0.00	0.27	0.00	0.39	0.01	0.39	0.41	0.31	0.17	0.45	0.46	0.26	0.01	0.01	0.01	0.29	0.44	0.42	0.26
C4	0.03	0.01	0.11	0.27	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.23	0.21	0.06	0.52	0.76	0.75	0.19
C4'	0.02	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.15	0.00	0.14	0.21	0.09	0.03	0.18	0.22	0.11	0.23	0.04	0.01	0.01	0.33	0.17	0.14
C5	0.02	0.01	0.10	0.39	0.00	0.15	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.25	0.33	0.04	0.68	0.78	1.04	0.29
C5'	0.07	0.14	0.17	0.01	0.18	0.00	0.28	0.00	0.27	0.34	0.20	0.11	0.33	0.37	0.19	0.11	0.17	0.01	0.01	0.17	0.37	0.02
C6	0.03	0.01	0.12	0.39	0.01	0.14	0.01	0.27	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.28	0.34	0.06	0.70	0.74	1.17	0.33
C8	0.01	0.01	0.13	0.41	0.00	0.21	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.20	0.36	0.05	0.68	0.91	0.79	0.25
N1	0.05	0.00	0.15	0.31	0.02	0.09	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.29	0.26	0.09	0.61	0.70	1.06	0.28
N3	0.05	0.00	0.17	0.17	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.27	0.25	0.11	0.43	0.71	0.65	0.17
N6	0.03	0.02	0.12	0.45	0.02	0.18	0.01	0.33	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.29	0.42	0.05	0.78	0.72	1.36	0.41
N7	0.01	0.01	0.12	0.46	0.00	0.22	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.24	0.43	0.03	0.77	0.86	1.11	0.33
N9	0.00	0.02	0.06	0.26	0.01	0.11	0.01	0.19	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.16	0.21	0.01	0.48	0.82	0.54	0.19
O2'	0.02	0.28	0.01	0.01	0.23	0.23	0.25	0.11	0.28	0.20	0.29	0.27	0.29	0.24	0.16	0.00	0.06	0.17	0.28	0.33	0.22	0.22
O3'	0.25	0.23	0.04	0.01	0.21	0.04	0.33	0.17	0.34	0.36	0.26	0.25	0.42	0.43	0.21	0.06	0.00	0.18	0.28	0.93	0.48	0.52
O4'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.11	0.05	0.03	0.01	0.17	0.18	0.00	0.05	0.92	0.22	0.43
O5'	0.23	0.50	0.42	0.29	0.52	0.01	0.68	0.01	0.70	0.68	0.61	0.43	0.78	0.77	0.48	0.28	0.28	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.80	0.69	0.31	0.44	0.76	0.33	0.78	0.17	0.74	0.91	0.70	0.71	0.72	0.86	0.82	0.33	0.93	0.92	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.14	0.84	0.35	0.42	0.75	0.17	1.04	0.37	1.17	0.79	1.06	0.65	1.36	1.11	0.54	0.22	0.48	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.29	0.20	0.28	0.26	0.19	0.14	0.29	0.02	0.33	0.25	0.28	0.17	0.41	0.33	0.19	0.22	0.52	0.43	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.17	0.10	0.09	0.13	0.08	0.13	0.07	0.15	0.13	0.17	0.15	0.16	0.12	0.13	0.11	0.13	0.16	0.08	0.20	0.21	0.15
C2	0.18	0.20	0.14	0.12	0.18	0.12	0.19	0.07	0.21	0.17	0.22	0.19	0.24	0.18	0.18	0.15	0.11	0.20	0.05	0.18	0.13	0.09
C2'	0.29	0.41	0.29	0.27	0.34	0.22	0.34	0.13	0.39	0.27	0.42	0.38	0.41	0.29	0.30	0.29	0.29	0.26	0.12	0.22	0.21	0.15
C3'	0.69	0.87	0.75	0.74	0.77	0.63	0.76	0.51	0.84	0.64	0.88	0.82	0.86	0.67	0.70	0.75	0.77	0.62	0.49	0.45	0.45	0.43
C4	0.17	0.22	0.13	0.10	0.19	0.09	0.19	0.05	0.21	0.16	0.23	0.20	0.23	0.16	0.17	0.13	0.11	0.18	0.05	0.21	0.20	0.14
C4'	0.36	0.49	0.36	0.34	0.41	0.27	0.39	0.16	0.45	0.32	0.50	0.45	0.45	0.32	0.36	0.37	0.37	0.33	0.13	0.18	0.20	0.13
C5	0.18	0.25	0.14	0.11	0.22	0.10	0.23	0.03	0.25	0.18	0.26	0.23	0.27	0.20	0.19	0.15	0.11	0.18	0.06	0.23	0.24	0.16
C5'	0.59	0.75	0.57	0.51	0.64	0.48	0.61	0.36	0.67	0.52	0.74	0.70	0.64	0.52	0.59	0.59	0.53	0.55	0.30	0.19	0.19	0.21
C6	0.20	0.26	0.15	0.12	0.23	0.11	0.25	0.03	0.27	0.20	0.27	0.24	0.28	0.23	0.21	0.16	0.11	0.19	0.03	0.22	0.21	0.14
C8	0.17	0.25	0.13	0.12	0.20	0.08	0.18	0.06	0.22	0.14	0.25	0.22	0.22	0.14	0.17	0.14	0.14	0.16	0.11	0.25	0.28	0.20
N1	0.19	0.23	0.16	0.13	0.21	0.12	0.22	0.06	0.24	0.19	0.24	0.21	0.26	0.21	0.19	0.16	0.11	0.20	0.05	0.19	0.13	0.09
N3	0.17	0.20	0.13	0.11	0.17	0.10	0.18	0.06	0.20	0.16	0.21	0.18	0.22	0.16	0.17	0.14	0.11	0.19	0.04	0.19	0.16	0.11
N6	0.23	0.29	0.18	0.14	0.28	0.13	0.29	0.04	0.30	0.25	0.30	0.28	0.30	0.29	0.25	0.18	0.11	0.22	0.04	0.23	0.26	0.16
N7	0.19	0.28	0.14	0.12	0.23	0.10	0.24	0.06	0.28	0.16	0.29	0.26	0.29	0.18	0.20	0.15	0.14	0.17	0.11	0.26	0.30	0.20
N9	0.16	0.21	0.11	0.10	0.17	0.08	0.16	0.05	0.19	0.14	0.22	0.19	0.20	0.14	0.15	0.13	0.12	0.16	0.08	0.22	0.23	0.16
O2'	0.21	0.26	0.17	0.16	0.20	0.21	0.20	0.27	0.23	0.22	0.27	0.22	0.25	0.20	0.21	0.18	0.16	0.24	0.27	0.36	0.34	0.33
O3'	0.74	0.99	0.85	0.83	0.84	0.67	0.82	0.53	0.93	0.66	1.01	0.92	0.94	0.69	0.75	0.86	0.89	0.65	0.50	0.35	0.35	0.35
O4'	0.14	0.14	0.08	0.09	0.12	0.09	0.11	0.13	0.13	0.14	0.15	0.13	0.15	0.13	0.13	0.09	0.14	0.19	0.14	0.23	0.26	0.19
O5'	1.03	1.10	1.00	0.96	1.06	0.95	1.03	0.84	1.07	0.97	1.10	1.09	1.05	0.96	1.02	1.02	0.94	1.00	0.77	0.60	0.57	0.65
OP1	0.74	0.58	0.56	0.53	0.72	0.69	0.77	0.75	0.72	0.82	0.60	0.64	0.77	0.83	0.77	0.56	0.43	0.81	0.76	0.78	0.80	0.80
OP2	1.64	1.64	1.74	1.77	1.65	1.67	1.61	1.57	1.64	1.56	1.65	1.65	1.57	1.52	1.63	1.72	1.83	1.60	1.51	1.39	1.31	1.39
P	0.68	0.82	0.71	0.67	0.71	0.62	0.66	0.51	0.72	0.58	0.81	0.78	0.66	0.57	0.66	0.73	0.70	0.64	0.44	0.28	0.23	0.31

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.08	0.07
C2	0.02	0.00	0.10	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.17	0.03	0.12	0.17	0.18	0.15
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.08	0.04	0.09	0.09	0.08	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.12	0.07	0.05
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.08	0.00	0.10	0.02	0.12	0.08	0.13	0.10	0.13	0.09	0.05	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.06	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.10	0.02	0.12	0.16	0.17	0.15
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.06	0.04	0.07	0.06	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.01	0.14	0.19	0.21	0.18
C5'	0.03	0.07	0.02	0.02	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.10	0.08	0.06	0.10	0.10	0.07	0.03	0.03	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.16	0.02	0.15	0.21	0.23	0.19
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.06	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.16	0.17	0.18	0.17
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.02	0.14	0.20	0.21	0.18
N3	0.02	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.14	0.03	0.11	0.15	0.16	0.13
N6	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.17	0.02	0.16	0.23	0.25	0.21
N7	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.02	0.16	0.20	0.23	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.14	0.14	0.13
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.07	0.07	0.05	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.12	0.05	0.04
O3'	0.01	0.17	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.03	0.16	0.09	0.17	0.14	0.17	0.11	0.05	0.03	0.00	0.01	0.06	0.20	0.09	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.07	0.06
O5'	0.08	0.12	0.05	0.04	0.12	0.01	0.14	0.01	0.15	0.16	0.14	0.11	0.16	0.16	0.12	0.04	0.06	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.09	0.17	0.12	0.14	0.16	0.07	0.19	0.06	0.21	0.17	0.20	0.15	0.23	0.20	0.14	0.12	0.20	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.18	0.07	0.06	0.17	0.03	0.21	0.01	0.23	0.18	0.21	0.16	0.25	0.23	0.14	0.05	0.09	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.15	0.05	0.05	0.15	0.01	0.18	0.01	0.19	0.17	0.18	0.13	0.21	0.20	0.13	0.04	0.09	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00