Doublet Group distance statistics: 55016

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.008 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.002, 0.012, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.027, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.001, 0.014, 0.027, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.014 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.003, 0.019, 0.035, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.019 std_dev=0.016
N9	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.009, 0.032, 0.054, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N6	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.011, 0.038, 0.066, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.038 std_dev=0.027
OP1	B	0, 0.111, 0.240, 0.369, 0.397 max_d=0.397 avg_d=0.240 std_dev=0.129
N6	B	0, 0.171, 0.358, 0.545, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.358 std_dev=0.187
N7	B	0, 0.098, 0.360, 0.622, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.360 std_dev=0.262
C6	B	0, 0.190, 0.455, 0.719, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.455 std_dev=0.264
P	B	0, 0.043, 0.346, 0.649, 0.916 max_d=0.916 avg_d=0.346 std_dev=0.303
C5	B	0, 0.135, 0.442, 0.749, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.442 std_dev=0.307
OP2	B	0, 0.069, 0.400, 0.730, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.400 std_dev=0.330
C8	B	0, 0.090, 0.433, 0.777, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.433 std_dev=0.343
N1	B	0, 0.232, 0.588, 0.944, 1.176 max_d=1.176 avg_d=0.588 std_dev=0.356
C4	B	0, 0.122, 0.557, 0.992, 1.318 max_d=1.318 avg_d=0.557 std_dev=0.435
N9	B	0, 0.093, 0.540, 0.986, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.540 std_dev=0.447
C2	B	0, 0.205, 0.683, 1.160, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.683 std_dev=0.478
O5'	B	0, 0.061, 0.550, 1.039, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.550 std_dev=0.489
C5'	B	0, 0.092, 0.616, 1.140, 1.559 max_d=1.559 avg_d=0.616 std_dev=0.524
N3	B	0, 0.149, 0.677, 1.206, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.677 std_dev=0.529
O4'	B	0, 0.098, 0.630, 1.162, 1.567 max_d=1.567 avg_d=0.630 std_dev=0.532
C1'	B	0, 0.080, 0.624, 1.168, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.624 std_dev=0.544
C4'	B	0, 0.072, 0.647, 1.223, 1.699 max_d=1.699 avg_d=0.647 std_dev=0.575
C2'	B	0, 0.017, 0.637, 1.257, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.637 std_dev=0.620
C3'	B	0, 0.007, 0.671, 1.336, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.671 std_dev=0.664
O2'	B	0, 0.014, 0.686, 1.357, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.686 std_dev=0.672
O3'	B	0, 0.002, 0.738, 1.473, 2.081 max_d=2.081 avg_d=0.738 std_dev=0.735
C2'	A	0, -0.170, 0.593, 1.356, 1.826 max_d=1.826 avg_d=0.593 std_dev=0.763
O4'	A	0, -0.168, 0.597, 1.362, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.597 std_dev=0.765
C3'	A	0, -0.308, 0.720, 1.748, 2.372 max_d=2.372 avg_d=0.720 std_dev=1.028
C4'	A	0, -0.306, 0.831, 1.968, 2.674 max_d=2.674 avg_d=0.831 std_dev=1.137
O3'	A	0, -0.364, 0.789, 1.941, 2.621 max_d=2.621 avg_d=0.789 std_dev=1.152
O2'	A	0, -0.202, 0.951, 2.104, 2.817 max_d=2.817 avg_d=0.951 std_dev=1.153
O5'	A	0, -0.295, 1.256, 2.807, 3.771 max_d=3.771 avg_d=1.256 std_dev=1.551
C5'	A	0, -0.425, 1.280, 2.985, 4.056 max_d=4.056 avg_d=1.280 std_dev=1.705
P	A	0, -0.338, 1.633, 3.605, 4.838 max_d=4.838 avg_d=1.633 std_dev=1.972
OP2	A	0, -0.298, 1.728, 3.754, 4.992 max_d=4.992 avg_d=1.728 std_dev=2.026
OP1	A	0, -0.608, 2.428, 5.465, 7.356 max_d=7.356 avg_d=2.428 std_dev=3.037

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.33	0.00	0.07	0.19	0.08	0.11
C2	0.02	0.00	0.38	0.20	0.01	0.23	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.25	0.26	0.40	0.08	0.44	0.47	0.16
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.20	0.01	0.10	0.18	0.19	0.19	0.31	0.37	0.13	0.09	0.01	0.00	0.02	0.02	0.41	0.34	0.47	0.46
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.24	0.01	0.34	0.02	0.35	0.34	0.28	0.15	0.39	0.39	0.23	0.02	0.01	0.02	0.05	0.10	0.08	0.05
C4	0.01	0.01	0.20	0.24	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.15	0.20	0.11	0.22	0.49	0.07
C4'	0.00	0.23	0.01	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.31	0.13	0.23	0.07	0.26	0.10	0.32	0.01	0.00	0.02	0.08	0.03	0.02
C5	0.00	0.00	0.10	0.34	0.00	0.07	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.01	0.08	0.27	0.08	0.75	0.18
C5'	0.04	0.28	0.18	0.02	0.08	0.01	0.08	0.00	0.03	0.35	0.17	0.28	0.09	0.30	0.07	0.12	0.23	0.02	0.01	0.09	0.05	0.02
C6	0.00	0.00	0.19	0.35	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.03	0.16	0.24	0.14	0.81	0.15
C8	0.01	0.01	0.19	0.34	0.00	0.31	0.00	0.35	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.52	0.11	0.25	0.43	0.26	0.72	0.34
N1	0.01	0.00	0.31	0.28	0.01	0.13	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.14	0.30	0.13	0.31	0.66	0.09
N3	0.02	0.00	0.37	0.15	0.00	0.23	0.00	0.28	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.31	0.40	0.09	0.43	0.34	0.18
N6	0.00	0.00	0.13	0.39	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.25	0.06	0.10	0.34	0.10	0.98	0.26
N7	0.01	0.01	0.09	0.39	0.00	0.26	0.00	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.48	0.13	0.14	0.45	0.27	0.93	0.38
N9	0.00	0.00	0.01	0.23	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.11	0.01	0.15	0.09	0.40	0.07
O2'	0.01	0.25	0.00	0.02	0.04	0.32	0.24	0.12	0.14	0.52	0.08	0.27	0.25	0.48	0.22	0.00	0.02	0.21	0.29	0.16	0.55	0.37
O3'	0.33	0.26	0.02	0.01	0.15	0.01	0.01	0.23	0.03	0.11	0.14	0.31	0.06	0.13	0.11	0.02	0.00	0.23	0.21	0.46	0.17	0.27
O4'	0.00	0.40	0.02	0.02	0.20	0.00	0.08	0.02	0.16	0.25	0.30	0.40	0.10	0.14	0.01	0.21	0.23	0.00	0.10	0.16	0.25	0.08
O5'	0.07	0.08	0.41	0.05	0.11	0.02	0.27	0.01	0.24	0.43	0.13	0.09	0.34	0.45	0.15	0.29	0.21	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.19	0.44	0.34	0.10	0.22	0.08	0.08	0.09	0.14	0.26	0.31	0.43	0.10	0.27	0.09	0.16	0.46	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.47	0.47	0.08	0.49	0.03	0.75	0.05	0.81	0.72	0.66	0.34	0.98	0.93	0.40	0.55	0.17	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.16	0.46	0.05	0.07	0.02	0.18	0.02	0.15	0.34	0.09	0.18	0.26	0.38	0.07	0.37	0.27	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.04	0.10	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.09	0.09	0.05	0.11	0.08	0.10	0.05	0.04	0.08	0.04	0.02	0.04	0.03	0.11	0.08
C2	0.12	0.11	0.11	0.09	0.12	0.07	0.12	0.07	0.12	0.14	0.11	0.11	0.13	0.14	0.13	0.14	0.09	0.10	0.09	0.07	0.18	0.15
C2'	0.19	0.41	0.15	0.12	0.28	0.06	0.28	0.10	0.37	0.14	0.44	0.35	0.39	0.17	0.21	0.25	0.18	0.12	0.09	0.13	0.16	0.12
C3'	0.37	0.36	0.46	0.44	0.37	0.40	0.38	0.48	0.37	0.38	0.36	0.37	0.37	0.38	0.37	0.45	0.40	0.34	0.50	0.41	0.40	0.43
C4	0.08	0.10	0.06	0.05	0.09	0.03	0.10	0.07	0.11	0.09	0.11	0.09	0.13	0.10	0.09	0.11	0.06	0.06	0.04	0.03	0.12	0.09
C4'	0.26	0.50	0.34	0.29	0.36	0.21	0.36	0.23	0.46	0.23	0.53	0.43	0.48	0.26	0.28	0.40	0.28	0.17	0.23	0.06	0.08	0.09
C5	0.09	0.12	0.06	0.05	0.11	0.04	0.11	0.08	0.12	0.09	0.12	0.11	0.14	0.10	0.10	0.10	0.07	0.07	0.04	0.03	0.09	0.07
C5'	0.38	0.69	0.51	0.42	0.51	0.28	0.51	0.29	0.64	0.34	0.74	0.60	0.67	0.38	0.41	0.61	0.40	0.23	0.33	0.08	0.09	0.16
C6	0.13	0.14	0.09	0.07	0.14	0.06	0.14	0.06	0.14	0.14	0.13	0.14	0.14	0.14	0.14	0.13	0.09	0.11	0.05	0.03	0.11	0.10
C8	0.05	0.10	0.04	0.03	0.07	0.04	0.07	0.11	0.10	0.04	0.11	0.08	0.11	0.05	0.05	0.08	0.05	0.03	0.08	0.04	0.07	0.05
N1	0.14	0.13	0.11	0.09	0.14	0.08	0.14	0.06	0.13	0.15	0.13	0.13	0.13	0.15	0.15	0.15	0.10	0.12	0.09	0.06	0.16	0.15
N3	0.09	0.10	0.08	0.06	0.10	0.05	0.10	0.07	0.11	0.11	0.11	0.09	0.13	0.11	0.10	0.12	0.07	0.07	0.06	0.05	0.15	0.13
N6	0.15	0.16	0.09	0.08	0.17	0.07	0.16	0.06	0.15	0.16	0.15	0.17	0.13	0.16	0.16	0.13	0.11	0.14	0.05	0.03	0.09	0.07
N7	0.07	0.12	0.04	0.03	0.09	0.04	0.09	0.10	0.12	0.05	0.12	0.10	0.13	0.06	0.07	0.08	0.06	0.05	0.08	0.04	0.07	0.05
N9	0.05	0.09	0.04	0.03	0.07	0.03	0.07	0.09	0.09	0.06	0.10	0.08	0.11	0.06	0.06	0.09	0.05	0.03	0.05	0.03	0.10	0.07
O2'	0.67	0.88	0.71	0.63	0.77	0.50	0.76	0.36	0.84	0.62	0.89	0.82	0.86	0.66	0.69	0.85	0.67	0.53	0.43	0.27	0.30	0.37
O3'	0.18	0.31	0.26	0.23	0.23	0.16	0.22	0.20	0.27	0.14	0.32	0.27	0.28	0.15	0.18	0.30	0.21	0.11	0.20	0.10	0.10	0.11
O4'	0.15	0.43	0.18	0.14	0.27	0.08	0.26	0.09	0.38	0.09	0.46	0.35	0.39	0.13	0.17	0.23	0.16	0.07	0.06	0.12	0.23	0.14
O5'	0.57	0.74	0.73	0.64	0.66	0.51	0.67	0.56	0.75	0.56	0.78	0.69	0.78	0.59	0.60	0.79	0.59	0.45	0.63	0.37	0.37	0.47
OP1	0.52	0.98	0.80	0.62	0.71	0.35	0.71	0.37	0.89	0.48	1.04	0.83	0.92	0.53	0.57	1.01	0.56	0.27	0.51	0.14	0.16	0.28
OP2	1.36	1.43	1.56	1.45	1.43	1.30	1.44	1.35	1.51	1.36	1.49	1.42	1.52	1.37	1.39	1.62	1.36	1.21	1.45	1.12	1.18	1.28
P	0.63	0.93	0.83	0.71	0.77	0.52	0.77	0.56	0.90	0.61	0.99	0.84	0.93	0.65	0.67	0.95	0.65	0.46	0.65	0.32	0.35	0.46

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.24	0.10	0.12
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.12	0.08	0.03	0.05	0.22	0.12	0.12
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.12	0.06	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.04	0.06	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.10	0.07	0.03
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.04	0.02	0.05	0.22	0.12	0.12
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.14	0.04	0.06
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.03	0.02	0.07	0.18	0.12	0.11
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.03	0.09	0.10	0.05	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.02	0.07	0.17	0.12	0.11
C8	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.03	0.07	0.20	0.12	0.12
N1	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.03	0.06	0.20	0.12	0.12
N3	0.02	0.00	0.06	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.03	0.05	0.23	0.12	0.12
N6	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.09	0.14	0.12	0.11
N7	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.08	0.16	0.12	0.11
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.01	0.05	0.23	0.12	0.13
O2'	0.01	0.12	0.00	0.02	0.07	0.01	0.05	0.03	0.07	0.02	0.10	0.12	0.05	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.13	0.08	0.06
O3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.01	0.05	0.04	0.07	0.07	0.04	0.03	0.02	0.03	0.00	0.03	0.05	0.14	0.04	0.02
O4'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.27	0.15	0.17
O5'	0.04	0.05	0.07	0.06	0.05	0.01	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.05	0.09	0.08	0.05	0.08	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00
OP1	0.24	0.22	0.12	0.10	0.22	0.14	0.18	0.01	0.17	0.20	0.20	0.23	0.14	0.16	0.23	0.13	0.14	0.27	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.12	0.06	0.07	0.12	0.04	0.12	0.02	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.12	0.08	0.04	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.12	0.05	0.03	0.12	0.06	0.11	0.01	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.13	0.06	0.02	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00