Doublet Group distance statistics: 55021

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.004, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.004 std_dev=0.005
C5	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.007 std_dev=0.008
C4	A	0, -0.002, 0.007, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
N6	A	0, -0.001, 0.008, 0.018, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.008 std_dev=0.010
N9	A	0, -0.002, 0.008, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.001, 0.012, 0.022, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.010
N1	A	0, -0.001, 0.010, 0.021, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.002, 0.013, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.015
N3	A	0, -0.002, 0.014, 0.030, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.014 std_dev=0.016
C1'	A	0, -0.004, 0.018, 0.040, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.018 std_dev=0.022
C2'	A	0, -0.074, 0.223, 0.520, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.223 std_dev=0.297
O4'	A	0, -0.083, 0.239, 0.561, 0.694 max_d=0.694 avg_d=0.239 std_dev=0.322
OP1	B	0, 0.089, 0.450, 0.811, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.450 std_dev=0.361
OP2	B	0, 0.137, 0.572, 1.007, 1.053 max_d=1.053 avg_d=0.572 std_dev=0.435
P	B	0, 0.148, 0.619, 1.091, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.619 std_dev=0.471
C4'	A	0, -0.174, 0.499, 1.173, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.499 std_dev=0.673
C5'	A	0, -0.153, 0.533, 1.219, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.533 std_dev=0.686
O2'	A	0, -0.194, 0.544, 1.282, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.544 std_dev=0.738
C3'	A	0, -0.209, 0.636, 1.481, 1.830 max_d=1.830 avg_d=0.636 std_dev=0.845
O5'	A	0, -0.113, 0.772, 1.657, 2.012 max_d=2.012 avg_d=0.772 std_dev=0.885
P	A	0, -0.218, 1.015, 2.247, 2.749 max_d=2.749 avg_d=1.015 std_dev=1.232
OP1	A	0, -0.227, 1.133, 2.493, 3.046 max_d=3.046 avg_d=1.133 std_dev=1.360
O3'	A	0, -0.382, 1.134, 2.650, 3.277 max_d=3.277 avg_d=1.134 std_dev=1.516
O5'	B	0, -0.221, 1.584, 3.388, 4.109 max_d=4.109 avg_d=1.584 std_dev=1.805
OP2	A	0, -0.536, 1.711, 3.958, 4.886 max_d=4.886 avg_d=1.711 std_dev=2.247
C5'	B	0, -0.424, 2.081, 4.587, 5.606 max_d=5.606 avg_d=2.081 std_dev=2.506
N7	B	0, -0.769, 2.802, 6.374, 7.842 max_d=7.842 avg_d=2.802 std_dev=3.571
C8	B	0, -0.808, 2.846, 6.501, 8.006 max_d=8.006 avg_d=2.846 std_dev=3.655
C4'	B	0, -0.843, 3.055, 6.953, 8.556 max_d=8.556 avg_d=3.055 std_dev=3.898
O4'	B	0, -1.025, 3.310, 7.645, 9.434 max_d=9.434 avg_d=3.310 std_dev=4.335
C3'	B	0, -0.981, 3.563, 8.106, 9.975 max_d=9.975 avg_d=3.563 std_dev=4.544
N6	B	0, -1.102, 3.568, 8.238, 10.165 max_d=10.165 avg_d=3.568 std_dev=4.670
C5	B	0, -1.149, 3.619, 8.387, 10.356 max_d=10.356 avg_d=3.619 std_dev=4.768
N9	B	0, -1.168, 3.653, 8.474, 10.465 max_d=10.465 avg_d=3.653 std_dev=4.821
O3'	B	0, -1.052, 3.999, 9.050, 11.124 max_d=11.124 avg_d=3.999 std_dev=5.051
C1'	B	0, -1.277, 3.972, 9.220, 11.387 max_d=11.387 avg_d=3.972 std_dev=5.248
C6	B	0, -1.307, 3.998, 9.304, 11.496 max_d=11.496 avg_d=3.998 std_dev=5.306
C4	B	0, -1.374, 4.171, 9.715, 12.006 max_d=12.006 avg_d=4.171 std_dev=5.544
C2'	B	0, -1.322, 4.321, 9.965, 12.293 max_d=12.293 avg_d=4.321 std_dev=5.644
N1	B	0, -1.652, 4.883, 11.419, 14.120 max_d=14.120 avg_d=4.883 std_dev=6.535
O2'	B	0, -1.553, 5.005, 11.564, 14.270 max_d=14.270 avg_d=5.005 std_dev=6.558
N3	B	0, -1.683, 5.072, 11.828, 14.620 max_d=14.620 avg_d=5.072 std_dev=6.755
C2	B	0, -1.797, 5.362, 12.521, 15.481 max_d=15.481 avg_d=5.362 std_dev=7.159

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.31	0.00	0.03	0.07	0.18	0.03
C2	0.03	0.00	0.18	0.19	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.26	0.12	0.26	0.24	0.80	0.37
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.06	0.20	0.10	0.07	0.15	0.18	0.08	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.41	0.33	0.46	0.44
C3'	0.01	0.19	0.00	0.00	0.26	0.00	0.38	0.00	0.37	0.40	0.29	0.13	0.43	0.45	0.26	0.02	0.01	0.02	0.07	0.01	0.16	0.08
C4	0.02	0.00	0.11	0.26	0.00	0.06	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.10	0.06	0.30	0.24	0.79	0.38
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.11	0.21	0.05	0.03	0.15	0.21	0.10	0.32	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.38	0.00	0.14	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.35	0.10	0.03	0.46	0.43	1.14	0.58
C5'	0.06	0.01	0.20	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.14	0.19	0.07	0.03	0.19	0.22	0.06	0.09	0.22	0.00	0.00	0.09	0.03	0.01
C6	0.02	0.00	0.10	0.37	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.38	0.07	0.06	0.48	0.48	1.23	0.62
C8	0.00	0.00	0.07	0.40	0.00	0.21	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.29	0.23	0.07	0.49	0.38	1.01	0.54
N1	0.03	0.00	0.15	0.29	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.33	0.10	0.10	0.38	0.38	1.05	0.52
N3	0.03	0.00	0.18	0.13	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.20	0.32	0.12	0.18	0.14	0.62	0.27
N6	0.02	0.00	0.08	0.43	0.01	0.15	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.41	0.17	0.04	0.57	0.61	1.45	0.75
N7	0.00	0.01	0.02	0.45	0.00	0.21	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.36	0.27	0.03	0.57	0.53	1.31	0.69
N9	0.00	0.01	0.02	0.26	0.01	0.10	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.21	0.03	0.00	0.26	0.18	0.64	0.30
O2'	0.02	0.26	0.00	0.02	0.27	0.32	0.35	0.09	0.38	0.29	0.33	0.20	0.41	0.36	0.21	0.00	0.01	0.24	0.31	0.19	0.61	0.40
O3'	0.31	0.26	0.02	0.01	0.10	0.01	0.10	0.22	0.07	0.23	0.10	0.32	0.17	0.27	0.03	0.01	0.00	0.21	0.15	0.36	0.03	0.18
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.07	0.10	0.12	0.04	0.03	0.00	0.24	0.21	0.00	0.14	0.03	0.33	0.18
O5'	0.03	0.26	0.41	0.07	0.30	0.01	0.46	0.00	0.48	0.49	0.38	0.18	0.57	0.57	0.26	0.31	0.15	0.14	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.07	0.24	0.33	0.01	0.24	0.07	0.43	0.09	0.48	0.38	0.38	0.14	0.61	0.53	0.18	0.19	0.36	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.80	0.46	0.16	0.79	0.02	1.14	0.03	1.23	1.01	1.05	0.62	1.45	1.31	0.64	0.61	0.03	0.33	0.01	0.00	0.00	0.01
P	0.03	0.37	0.44	0.08	0.38	0.01	0.58	0.01	0.62	0.54	0.52	0.27	0.75	0.69	0.30	0.40	0.18	0.18	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.88	1.01	1.05	0.92	0.95	0.68	0.92	0.42	0.94	0.79	0.98	1.00	0.88	0.81	0.88	1.07	0.98	0.68	0.38	0.06	0.05	0.16
C2	1.47	1.57	1.75	1.59	1.55	1.18	1.42	0.78	1.35	1.32	1.44	1.62	1.09	1.27	1.49	1.71	1.65	1.15	0.75	0.09	0.09	0.22
C2'	1.38	1.63	1.43	1.19	1.53	1.04	1.53	0.72	1.61	1.31	1.64	1.58	1.62	1.37	1.41	1.48	1.15	1.17	0.61	0.22	0.06	0.37
C3'	1.45	1.60	1.47	1.27	1.56	1.17	1.56	0.90	1.61	1.42	1.60	1.58	1.62	1.47	1.48	1.52	1.23	1.30	0.83	0.55	0.39	0.67
C4	0.73	0.68	0.91	0.83	0.72	0.60	0.66	0.38	0.59	0.67	0.61	0.73	0.45	0.64	0.73	0.90	0.89	0.57	0.38	0.08	0.03	0.16
C4'	0.80	0.83	0.92	0.82	0.83	0.66	0.82	0.45	0.82	0.76	0.82	0.84	0.80	0.77	0.80	0.94	0.86	0.67	0.44	0.27	0.16	0.34
C5	0.11	0.22	0.24	0.28	0.07	0.16	0.15	0.09	0.31	0.09	0.31	0.11	0.44	0.06	0.06	0.23	0.34	0.11	0.13	0.10	0.04	0.12
C5'	0.38	0.10	0.44	0.44	0.28	0.37	0.28	0.29	0.16	0.42	0.06	0.19	0.12	0.38	0.36	0.44	0.48	0.37	0.31	0.33	0.22	0.36
C6	0.13	0.19	0.28	0.33	0.07	0.19	0.17	0.11	0.30	0.06	0.28	0.09	0.43	0.12	0.07	0.27	0.41	0.11	0.17	0.10	0.07	0.12
C8	0.11	0.55	0.02	0.05	0.31	0.03	0.37	0.03	0.57	0.09	0.64	0.41	0.70	0.20	0.15	0.03	0.10	0.08	0.03	0.11	0.04	0.12
N1	0.90	0.78	1.13	1.09	0.83	0.79	0.70	0.52	0.59	0.79	0.65	0.86	0.38	0.65	0.88	1.09	1.14	0.72	0.56	0.09	0.08	0.18
N3	1.37	1.58	1.63	1.45	1.51	1.08	1.44	0.70	1.42	1.24	1.50	1.59	1.23	1.26	1.40	1.62	1.51	1.07	0.65	0.08	0.07	0.21
N6	0.60	1.01	0.50	0.36	0.89	0.37	1.00	0.28	1.08	0.72	1.08	0.91	1.12	0.93	0.73	0.49	0.26	0.49	0.20	0.12	0.14	0.03
N7	0.42	1.01	0.35	0.23	0.73	0.23	0.82	0.17	1.06	0.40	1.11	0.84	1.21	0.59	0.51	0.37	0.17	0.31	0.10	0.12	0.07	0.10
N9	0.53	0.41	0.67	0.62	0.49	0.44	0.44	0.27	0.37	0.49	0.36	0.47	0.26	0.45	0.51	0.67	0.68	0.42	0.27	0.08	0.02	0.15
O2'	1.30	1.95	1.36	0.99	1.60	0.78	1.59	0.34	1.85	1.14	2.01	1.77	1.90	1.26	1.35	1.45	0.94	0.97	0.18	0.43	0.57	0.21
O3'	1.56	2.04	1.56	1.26	1.80	1.13	1.80	0.76	1.99	1.47	2.08	1.92	2.04	1.57	1.62	1.64	1.19	1.32	0.66	0.30	0.11	0.43
O4'	0.47	0.47	0.67	0.62	0.47	0.39	0.44	0.21	0.42	0.41	0.44	0.49	0.36	0.40	0.46	0.68	0.72	0.33	0.22	0.05	0.03	0.11
O5'	0.49	0.09	0.46	0.51	0.28	0.54	0.28	0.53	0.07	0.59	0.14	0.13	0.04	0.51	0.46	0.46	0.49	0.57	0.56	0.66	0.54	0.68
OP1	0.11	0.73	0.05	0.19	0.21	0.32	0.18	0.44	0.51	0.29	0.80	0.47	0.56	0.18	0.07	0.03	0.17	0.32	0.50	0.85	0.69	0.80
OP2	0.73	0.36	0.58	0.75	0.30	0.97	0.31	1.13	0.12	0.93	0.46	0.03	0.23	0.76	0.67	0.55	0.68	1.00	1.17	1.48	1.37	1.47
P	0.20	0.68	0.13	0.27	0.14	0.40	0.12	0.52	0.48	0.37	0.76	0.41	0.55	0.25	0.15	0.10	0.25	0.40	0.57	0.85	0.73	0.83

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.01	0.17
C2	0.05	0.00	0.02	0.10	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.05	0.19	0.06	0.31	0.04
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.07	0.08	0.02
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.00	0.10	0.08	0.10	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.06	0.21	0.10	0.07
C4	0.02	0.00	0.02	0.07	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.01	0.15	0.03	0.20	0.04
C4'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.04	0.00	0.10	0.08	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06
C5	0.01	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.20	0.03	0.27	0.03
C5'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.17	0.14	0.13	0.06	0.21	0.18	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.24	0.10	0.36	0.09
C8	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.06	0.10	0.12	0.06	0.11
N1	0.04	0.00	0.01	0.10	0.01	0.04	0.00	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.11	0.02	0.23	0.10	0.37	0.08
N3	0.05	0.00	0.03	0.08	0.00	0.00	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.14	0.02	0.22	0.04
N6	0.01	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.21	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.04	0.28	0.16	0.43	0.15
N7	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.08	0.00	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.03	0.06	0.18	0.01	0.20	0.01
N9	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.08	0.12	0.07	0.12
O2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.02	0.06	0.02	0.08	0.07	0.05	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04
O3'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.11	0.09	0.10	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.08	0.43	0.15	0.19
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.02	0.06	0.04	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.32	0.11	0.25
O5'	0.01	0.19	0.05	0.06	0.15	0.00	0.20	0.00	0.24	0.10	0.23	0.14	0.28	0.18	0.08	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.18	0.06	0.07	0.21	0.03	0.05	0.03	0.07	0.10	0.12	0.10	0.02	0.16	0.01	0.12	0.04	0.43	0.32	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.01	0.31	0.08	0.10	0.20	0.01	0.27	0.02	0.36	0.06	0.37	0.22	0.43	0.20	0.07	0.05	0.15	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.04	0.02	0.07	0.04	0.06	0.03	0.01	0.09	0.11	0.08	0.04	0.15	0.01	0.12	0.04	0.19	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00