Doublet Group distance statistics: 55028

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N9	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.015, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.015 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.000, 0.016, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.000, 0.019, 0.037, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
OP2	B	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
C2'	A	0, 0.000, 0.534, 1.069, 1.069 max_d=1.069 avg_d=0.534 std_dev=0.534
O4'	A	0, 0.000, 0.538, 1.076, 1.076 max_d=1.076 avg_d=0.538 std_dev=0.538
P	B	0, 0.000, 0.588, 1.177, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.588 std_dev=0.588
C3'	A	0, 0.000, 0.872, 1.744, 1.744 max_d=1.744 avg_d=0.872 std_dev=0.872
C4'	A	0, 0.000, 0.891, 1.782, 1.782 max_d=1.782 avg_d=0.891 std_dev=0.891
O2'	A	0, 0.000, 0.919, 1.838, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.919 std_dev=0.919
O5'	A	0, 0.000, 1.136, 2.273, 2.273 max_d=2.273 avg_d=1.136 std_dev=1.136
OP1	B	0, 0.000, 1.147, 2.293, 2.293 max_d=2.293 avg_d=1.147 std_dev=1.147
C5'	A	0, 0.000, 1.240, 2.481, 2.481 max_d=2.481 avg_d=1.240 std_dev=1.240
O3'	A	0, 0.000, 1.270, 2.540, 2.540 max_d=2.540 avg_d=1.270 std_dev=1.270
P	A	0, 0.000, 1.448, 2.895, 2.895 max_d=2.895 avg_d=1.448 std_dev=1.448
O5'	B	0, 0.000, 1.508, 3.016, 3.016 max_d=3.016 avg_d=1.508 std_dev=1.508
C5'	B	0, 0.000, 1.778, 3.556, 3.556 max_d=3.556 avg_d=1.778 std_dev=1.778
OP2	A	0, 0.000, 2.144, 4.288, 4.288 max_d=4.288 avg_d=2.144 std_dev=2.144
OP1	A	0, 0.000, 2.528, 5.056, 5.056 max_d=5.056 avg_d=2.528 std_dev=2.528
C4'	B	0, 0.000, 3.220, 6.439, 6.439 max_d=6.439 avg_d=3.220 std_dev=3.220
O4'	B	0, 0.000, 3.910, 7.819, 7.819 max_d=7.819 avg_d=3.910 std_dev=3.910
C3'	B	0, 0.000, 4.146, 8.292, 8.292 max_d=8.292 avg_d=4.146 std_dev=4.146
C8	B	0, 0.000, 4.550, 9.100, 9.100 max_d=9.100 avg_d=4.550 std_dev=4.550
O3'	B	0, 0.000, 4.670, 9.339, 9.339 max_d=9.339 avg_d=4.670 std_dev=4.670
C1'	B	0, 0.000, 5.131, 10.261, 10.261 max_d=10.261 avg_d=5.131 std_dev=5.131
N7	B	0, 0.000, 5.158, 10.317, 10.317 max_d=10.317 avg_d=5.158 std_dev=5.158
N9	B	0, 0.000, 5.366, 10.732, 10.732 max_d=10.732 avg_d=5.366 std_dev=5.366
C2'	B	0, 0.000, 5.383, 10.766, 10.766 max_d=10.766 avg_d=5.383 std_dev=5.383
O2'	B	0, 0.000, 6.310, 12.619, 12.619 max_d=12.619 avg_d=6.310 std_dev=6.310
C5	B	0, 0.000, 6.393, 12.787, 12.787 max_d=12.787 avg_d=6.393 std_dev=6.393
C4	B	0, 0.000, 6.552, 13.105, 13.105 max_d=13.105 avg_d=6.552 std_dev=6.552
C6	B	0, 0.000, 7.510, 15.020, 15.020 max_d=15.020 avg_d=7.510 std_dev=7.510
N6	B	0, 0.000, 7.575, 15.151, 15.151 max_d=15.151 avg_d=7.575 std_dev=7.575
N3	B	0, 0.000, 7.702, 15.403, 15.403 max_d=15.403 avg_d=7.702 std_dev=7.702
N1	B	0, 0.000, 8.632, 17.265, 17.265 max_d=17.265 avg_d=8.632 std_dev=8.632
C2	B	0, 0.000, 8.652, 17.305, 17.305 max_d=17.305 avg_d=8.652 std_dev=8.652

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.00	0.04	0.26	0.13	0.09
C2	0.01	0.00	0.22	0.15	0.00	0.07	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.21	0.16	0.09	0.38	0.54	0.00
C2'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.11	0.01	0.05	0.11	0.10	0.11	0.17	0.21	0.07	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.24	0.22	0.17	0.28
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.18	0.01	0.26	0.02	0.27	0.26	0.22	0.11	0.31	0.30	0.17	0.03	0.00	0.02	0.04	0.16	0.05	0.06
C4	0.01	0.00	0.11	0.18	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.11	0.08	0.12	0.30	0.52	0.03
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.09	0.00	0.06	0.19	0.01	0.08	0.10	0.17	0.07	0.21	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.00
C5	0.00	0.00	0.05	0.26	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.22	0.02	0.02	0.22	0.24	0.74	0.13
C5'	0.02	0.05	0.11	0.02	0.03	0.00	0.12	0.00	0.10	0.21	0.02	0.07	0.15	0.22	0.07	0.10	0.20	0.01	0.00	0.00	0.13	0.01
C6	0.00	0.00	0.10	0.27	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.00	0.06	0.23	0.26	0.80	0.15
C8	0.01	0.00	0.11	0.26	0.00	0.19	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.12	0.12	0.25	0.14	0.64	0.15
N1	0.01	0.00	0.17	0.22	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.09	0.11	0.12	0.16	0.34	0.70	0.08
N3	0.01	0.00	0.21	0.11	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.25	0.16	0.04	0.37	0.42	0.04
N6	0.01	0.01	0.07	0.31	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.07	0.02	0.29	0.20	0.94	0.22
N7	0.01	0.00	0.05	0.30	0.00	0.17	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.14	0.07	0.31	0.14	0.84	0.22
N9	0.00	0.00	0.00	0.17	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.06	0.01	0.10	0.26	0.42	0.01
O2'	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.21	0.22	0.10	0.19	0.28	0.09	0.03	0.24	0.30	0.16	0.00	0.11	0.15	0.15	0.06	0.17	0.18
O3'	0.23	0.21	0.04	0.00	0.11	0.02	0.02	0.20	0.00	0.12	0.11	0.25	0.07	0.14	0.06	0.11	0.00	0.13	0.23	0.51	0.24	0.31
O4'	0.00	0.16	0.01	0.02	0.08	0.00	0.02	0.01	0.06	0.12	0.12	0.16	0.02	0.07	0.01	0.15	0.13	0.00	0.02	0.28	0.13	0.03
O5'	0.04	0.09	0.24	0.04	0.12	0.01	0.22	0.00	0.23	0.25	0.16	0.04	0.29	0.31	0.10	0.15	0.23	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.26	0.38	0.22	0.16	0.30	0.05	0.24	0.00	0.26	0.14	0.34	0.37	0.20	0.14	0.26	0.06	0.51	0.28	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.13	0.54	0.17	0.05	0.52	0.02	0.74	0.13	0.80	0.64	0.70	0.42	0.94	0.84	0.42	0.17	0.24	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.00	0.28	0.06	0.03	0.00	0.13	0.01	0.15	0.15	0.08	0.04	0.22	0.22	0.01	0.18	0.31	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	1.70	2.29	1.68	1.21	2.10	1.06	2.24	0.71	2.42	1.91	2.43	2.14	2.54	2.14	1.90	1.77	0.98	1.35	0.68	0.01	0.24	0.36
C2	0.63	0.44	0.67	0.51	0.59	0.47	0.63	0.40	0.54	0.79	0.45	0.49	0.55	0.78	0.66	0.71	0.42	0.54	0.40	0.26	0.31	0.35
C2'	1.78	2.36	1.84	1.35	2.14	1.15	2.21	0.75	2.38	1.88	2.44	2.22	2.43	2.05	1.93	1.99	1.18	1.39	0.69	0.06	0.16	0.28
C3'	1.66	2.47	1.70	1.17	2.13	0.95	2.23	0.52	2.49	1.77	2.60	2.25	2.59	2.00	1.85	1.85	0.99	1.23	0.48	0.35	0.05	0.05
C4	1.37	1.64	1.40	1.04	1.61	0.91	1.72	0.64	1.76	1.59	1.71	1.58	1.81	1.73	1.52	1.45	0.86	1.11	0.63	0.07	0.25	0.35
C4'	1.90	2.87	1.84	1.29	2.48	1.14	2.64	0.72	2.97	2.10	3.06	2.60	3.16	2.40	2.15	1.95	1.02	1.50	0.68	0.12	0.17	0.30
C5	1.52	1.78	1.57	1.20	1.76	1.03	1.85	0.71	1.87	1.74	1.83	1.73	1.88	1.87	1.67	1.61	1.03	1.22	0.70	0.01	0.23	0.34
C5'	2.13	3.39	2.03	1.40	2.85	1.23	3.02	0.74	3.45	2.30	3.62	3.03	3.68	2.67	2.42	2.14	1.09	1.66	0.69	0.25	0.09	0.24
C6	1.12	1.10	1.21	0.96	1.17	0.82	1.21	0.61	1.14	1.27	1.10	1.12	1.11	1.29	1.19	1.22	0.85	0.91	0.61	0.10	0.26	0.34
C8	2.06	2.79	2.07	1.53	2.57	1.31	2.72	0.85	2.89	2.28	2.91	2.62	2.97	2.56	2.31	2.15	1.29	1.63	0.81	0.11	0.18	0.33
N1	0.63	0.40	0.70	0.56	0.55	0.50	0.56	0.43	0.46	0.74	0.39	0.47	0.43	0.70	0.64	0.73	0.50	0.53	0.43	0.25	0.31	0.34
N3	0.97	1.00	0.99	0.73	1.07	0.66	1.15	0.50	1.13	1.16	1.05	1.00	1.18	1.24	1.06	1.03	0.58	0.80	0.50	0.18	0.29	0.36
N6	1.17	1.08	1.31	1.10	1.17	0.91	1.14	0.67	1.06	1.27	1.04	1.13	0.97	1.22	1.21	1.31	1.01	0.96	0.69	0.04	0.22	0.32
N7	2.01	2.57	2.05	1.55	2.44	1.31	2.57	0.86	2.65	2.25	2.64	2.46	2.66	2.49	2.24	2.10	1.32	1.59	0.83	0.12	0.17	0.32
N9	1.72	2.26	1.72	1.26	2.11	1.10	2.25	0.74	2.38	1.94	2.37	2.13	2.48	2.16	1.92	1.79	1.04	1.37	0.71	0.01	0.22	0.35
O2'	1.88	2.22	1.99	1.54	2.11	1.34	2.14	0.97	2.21	1.96	2.25	2.15	2.21	2.05	1.99	2.15	1.41	1.52	0.92	0.27	0.46	0.55
O3'	1.70	2.37	1.79	1.31	2.09	1.08	2.17	0.69	2.37	1.80	2.46	2.19	2.45	1.98	1.86	1.93	1.16	1.30	0.67	0.11	0.21	0.27
O4'	1.89	2.75	1.79	1.27	2.45	1.16	2.64	0.78	2.92	2.15	2.95	2.51	3.13	2.46	2.15	1.86	0.97	1.53	0.75	0.02	0.28	0.42
O5'	2.17	3.56	2.10	1.43	2.94	1.21	3.10	0.65	3.57	2.30	3.78	3.17	3.77	2.68	2.47	2.24	1.14	1.64	0.58	0.48	0.10	0.05
OP1	2.92	4.63	2.76	2.05	3.84	1.88	4.01	1.30	4.62	3.03	4.90	4.14	4.87	3.46	3.25	2.87	1.70	2.39	1.21	0.05	0.45	0.65
OP2	1.82	3.68	1.74	0.96	2.77	0.68	2.89	0.00	3.53	1.86	3.92	3.15	3.71	2.28	2.14	1.93	0.66	1.18	0.08	1.36	0.87	0.73
P	2.48	4.18	2.37	1.62	3.40	1.40	3.55	0.78	4.14	2.58	4.44	3.70	4.36	3.01	2.81	2.51	1.30	1.90	0.70	0.49	0.07	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.12	0.04	0.12
C2	0.02	0.00	0.24	0.24	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.32	0.16	0.01	0.11	0.17	0.14
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.11	0.02	0.04	0.01	0.10	0.15	0.19	0.24	0.06	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.03	0.08	0.00
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.13	0.00	0.09	0.02	0.14	0.10	0.21	0.22	0.11	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.07	0.03
C4	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.16	0.09	0.01	0.15	0.13	0.15
C4'	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.12	0.06	0.02	0.18	0.14	0.16
C5'	0.01	0.07	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.06	0.08	0.03	0.02	0.10	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00
C6	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.19	0.11	0.02	0.15	0.16	0.15
C8	0.00	0.01	0.15	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.14	0.10	0.07	0.05	0.22	0.05	0.18
N1	0.02	0.00	0.19	0.21	0.01	0.02	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.29	0.14	0.00	0.12	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.24	0.22	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.28	0.15	0.01	0.11	0.15	0.14
N6	0.03	0.00	0.06	0.11	0.01	0.03	0.02	0.08	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.16	0.10	0.03	0.15	0.15	0.13
N7	0.01	0.01	0.09	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.11	0.03	0.02	0.04	0.22	0.10	0.18
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.02	0.17	0.08	0.15
O2'	0.02	0.16	0.00	0.02	0.04	0.11	0.02	0.10	0.02	0.14	0.10	0.16	0.01	0.11	0.04	0.00	0.03	0.09	0.01	0.04	0.05	0.06
O3'	0.00	0.32	0.02	0.00	0.16	0.01	0.12	0.02	0.19	0.10	0.29	0.28	0.16	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.03	0.22	0.11	0.10
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.09	0.00	0.06	0.00	0.11	0.07	0.14	0.15	0.10	0.02	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.17	0.09	0.15
O5'	0.02	0.01	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.12	0.11	0.03	0.10	0.15	0.02	0.18	0.01	0.15	0.22	0.12	0.11	0.15	0.22	0.17	0.04	0.22	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.04	0.17	0.08	0.07	0.13	0.01	0.14	0.01	0.16	0.05	0.18	0.15	0.15	0.10	0.08	0.05	0.11	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.14	0.00	0.03	0.15	0.04	0.16	0.00	0.15	0.18	0.14	0.14	0.13	0.18	0.15	0.06	0.10	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00