Doublet Group distance statistics: 55038

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 9, 22, 7, 11, 7, 5, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.010, 0.016, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.010, 0.017, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.017, 0.026, 0.035, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.016, 0.026, 0.035, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.015, 0.026, 0.036, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.022, 0.035, 0.048, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.035 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.025, 0.039, 0.052, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.039 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.032, 0.054, 0.076, 0.116 max_d=0.116 avg_d=0.054 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.026, 0.050, 0.074, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.050 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.031, 0.061, 0.090, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.061 std_dev=0.029
C3'	A	0, 0.062, 0.135, 0.209, 0.441 max_d=0.441 avg_d=0.135 std_dev=0.073
O3'	A	0, 0.117, 0.223, 0.330, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.223 std_dev=0.106
C2'	A	0, 0.027, 0.146, 0.265, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.146 std_dev=0.119
O4'	A	0, 0.010, 0.137, 0.264, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.137 std_dev=0.127
OP2	B	0, 0.209, 0.390, 0.571, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.390 std_dev=0.181
P	B	0, 0.167, 0.349, 0.531, 0.829 max_d=0.829 avg_d=0.349 std_dev=0.182
OP1	B	0, 0.120, 0.318, 0.517, 0.941 max_d=0.941 avg_d=0.318 std_dev=0.198
C4'	A	0, -0.005, 0.198, 0.401, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.198 std_dev=0.203
O2'	A	0, 0.085, 0.310, 0.535, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.310 std_dev=0.225
O5'	B	0, 0.145, 0.377, 0.609, 0.991 max_d=0.991 avg_d=0.377 std_dev=0.232
C5'	B	0, 0.085, 0.374, 0.663, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.374 std_dev=0.289
C5	B	0, 0.090, 0.430, 0.769, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.430 std_dev=0.340
C6	B	0, 0.072, 0.426, 0.780, 1.578 max_d=1.578 avg_d=0.426 std_dev=0.354
C5'	A	0, -0.054, 0.337, 0.727, 1.501 max_d=1.501 avg_d=0.337 std_dev=0.390
C4'	B	0, 0.035, 0.427, 0.818, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.427 std_dev=0.391
C4	B	0, 0.070, 0.476, 0.882, 1.752 max_d=1.752 avg_d=0.476 std_dev=0.406
N4	B	0, 0.087, 0.503, 0.919, 1.758 max_d=1.758 avg_d=0.503 std_dev=0.416
O4'	B	0, 0.017, 0.443, 0.869, 1.919 max_d=1.919 avg_d=0.443 std_dev=0.426
N1	B	0, 0.009, 0.482, 0.955, 2.180 max_d=2.180 avg_d=0.482 std_dev=0.473
C3'	B	0, 0.007, 0.491, 0.975, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.491 std_dev=0.484
N3	B	0, 0.024, 0.522, 1.020, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.522 std_dev=0.498
C1'	B	0, -0.028, 0.510, 1.049, 2.449 max_d=2.449 avg_d=0.510 std_dev=0.539
C2	B	0, -0.018, 0.528, 1.073, 2.521 max_d=2.521 avg_d=0.528 std_dev=0.546
O3'	B	0, -0.027, 0.545, 1.116, 2.446 max_d=2.446 avg_d=0.545 std_dev=0.572
O5'	A	0, -0.104, 0.534, 1.172, 2.181 max_d=2.181 avg_d=0.534 std_dev=0.638
C2'	B	0, -0.064, 0.579, 1.222, 2.816 max_d=2.816 avg_d=0.579 std_dev=0.643
O2	B	0, -0.080, 0.591, 1.262, 3.072 max_d=3.072 avg_d=0.591 std_dev=0.671
O2'	B	0, -0.115, 0.695, 1.505, 3.475 max_d=3.475 avg_d=0.695 std_dev=0.810
P	A	0, -0.212, 0.687, 1.585, 3.156 max_d=3.156 avg_d=0.687 std_dev=0.899
OP2	A	0, -0.215, 0.763, 1.740, 3.394 max_d=3.394 avg_d=0.763 std_dev=0.978
OP1	A	0, -0.254, 0.797, 1.847, 3.721 max_d=3.721 avg_d=0.797 std_dev=1.051

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.38	0.32	0.35	0.32
C2	0.02	0.00	0.09	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.07	0.48	0.55	0.44	0.46
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.31	0.17	0.27	0.21
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.10	0.10	0.07
C4	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.04	0.03	0.51	0.54	0.48	0.49
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.03	0.06	0.06	0.09	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02	0.57	0.61	0.56	0.57
C5'	0.04	0.07	0.05	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.14	0.19	0.10	0.05	0.17	0.20	0.11	0.04	0.02	0.01	0.01	0.17	0.29	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.04	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.03	0.57	0.64	0.56	0.58
C8	0.01	0.01	0.06	0.03	0.01	0.10	0.01	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.13	0.03	0.08	0.59	0.56	0.58	0.59
N1	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.06	0.05	0.53	0.61	0.51	0.53
N3	0.02	0.00	0.09	0.04	0.00	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.07	0.08	0.46	0.50	0.42	0.42
N6	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.09	0.04	0.04	0.59	0.68	0.61	0.62
N7	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.13	0.02	0.06	0.60	0.63	0.62	0.63
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.52	0.49	0.48	0.47
O2'	0.01	0.14	0.00	0.02	0.06	0.01	0.08	0.04	0.08	0.13	0.10	0.14	0.09	0.13	0.04	0.00	0.04	0.01	0.27	0.17	0.22	0.18
O3'	0.03	0.07	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.02	0.03	0.04	0.00	0.06	0.13	0.14	0.12	0.15
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.08	0.05	0.08	0.04	0.06	0.01	0.01	0.06	0.00	0.33	0.30	0.36	0.30
O5'	0.38	0.48	0.31	0.05	0.51	0.01	0.57	0.01	0.57	0.59	0.53	0.46	0.59	0.60	0.52	0.27	0.13	0.33	0.00	0.02	0.03	0.00
OP1	0.32	0.55	0.17	0.10	0.54	0.08	0.61	0.17	0.64	0.56	0.61	0.50	0.68	0.63	0.49	0.17	0.14	0.30	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.44	0.27	0.10	0.48	0.15	0.56	0.29	0.56	0.58	0.51	0.42	0.61	0.62	0.48	0.22	0.12	0.36	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.32	0.46	0.21	0.07	0.49	0.02	0.57	0.01	0.58	0.59	0.53	0.42	0.62	0.63	0.47	0.18	0.15	0.30	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.25	0.24	0.25	0.27	0.24	0.28	0.29	0.26	0.24	0.26	0.28	0.23	0.23	0.25	0.23	0.26	0.14	0.17	0.17
C2	0.32	0.31	0.34	0.32	0.30	0.32	0.29	0.32	0.30	0.31	0.31	0.29	0.32	0.37	0.31	0.31	0.27	0.16	0.18	0.18
C2'	0.26	0.30	0.29	0.31	0.32	0.29	0.32	0.34	0.31	0.29	0.31	0.33	0.28	0.27	0.32	0.26	0.30	0.16	0.20	0.20
C3'	0.24	0.28	0.29	0.30	0.31	0.27	0.31	0.31	0.29	0.27	0.30	0.32	0.27	0.26	0.32	0.24	0.28	0.15	0.19	0.19
C4	0.23	0.26	0.23	0.24	0.28	0.25	0.28	0.30	0.27	0.25	0.27	0.28	0.24	0.22	0.22	0.25	0.26	0.14	0.17	0.17
C4'	0.25	0.28	0.28	0.29	0.32	0.27	0.32	0.32	0.30	0.28	0.31	0.33	0.27	0.25	0.30	0.25	0.29	0.16	0.19	0.19
C5	0.18	0.21	0.15	0.16	0.26	0.20	0.26	0.28	0.24	0.21	0.23	0.27	0.19	0.14	0.12	0.21	0.25	0.14	0.16	0.17
C5'	0.36	0.42	0.39	0.41	0.47	0.38	0.46	0.43	0.43	0.41	0.45	0.49	0.40	0.34	0.41	0.36	0.41	0.26	0.31	0.30
C6	0.19	0.21	0.15	0.15	0.25	0.19	0.26	0.27	0.24	0.21	0.23	0.26	0.19	0.14	0.11	0.22	0.25	0.14	0.17	0.17
C8	0.17	0.20	0.15	0.16	0.26	0.19	0.27	0.28	0.24	0.20	0.23	0.28	0.18	0.14	0.14	0.20	0.25	0.14	0.17	0.17
N1	0.26	0.27	0.25	0.23	0.27	0.26	0.27	0.30	0.27	0.27	0.27	0.27	0.26	0.25	0.20	0.28	0.26	0.16	0.18	0.18
N3	0.30	0.31	0.33	0.32	0.30	0.31	0.30	0.32	0.30	0.30	0.31	0.30	0.31	0.35	0.32	0.30	0.27	0.15	0.18	0.18
N6	0.16	0.18	0.13	0.13	0.23	0.16	0.24	0.23	0.21	0.18	0.20	0.24	0.16	0.16	0.19	0.20	0.23	0.15	0.16	0.17
N7	0.15	0.19	0.13	0.14	0.25	0.17	0.26	0.26	0.22	0.19	0.22	0.27	0.16	0.15	0.14	0.19	0.24	0.14	0.16	0.17
N9	0.21	0.24	0.21	0.22	0.28	0.23	0.28	0.30	0.26	0.24	0.26	0.29	0.22	0.19	0.20	0.23	0.26	0.14	0.17	0.17
O2'	0.24	0.26	0.27	0.29	0.28	0.26	0.28	0.30	0.27	0.26	0.27	0.29	0.25	0.25	0.31	0.23	0.26	0.15	0.18	0.18
O3'	0.19	0.20	0.23	0.24	0.23	0.21	0.23	0.25	0.22	0.20	0.22	0.23	0.20	0.22	0.27	0.18	0.22	0.13	0.15	0.15
O4'	0.22	0.24	0.23	0.24	0.27	0.24	0.28	0.29	0.26	0.24	0.26	0.29	0.23	0.22	0.23	0.23	0.25	0.13	0.16	0.16
O5'	0.31	0.26	0.30	0.29	0.26	0.30	0.29	0.25	0.30	0.29	0.25	0.25	0.26	0.32	0.29	0.30	0.32	0.49	0.46	0.43
OP1	0.35	0.31	0.34	0.34	0.33	0.36	0.36	0.34	0.37	0.34	0.30	0.32	0.29	0.36	0.34	0.36	0.43	0.63	0.59	0.56
OP2	0.25	0.20	0.24	0.24	0.22	0.25	0.26	0.23	0.27	0.24	0.19	0.22	0.19	0.25	0.24	0.25	0.32	0.53	0.50	0.46
P	0.28	0.23	0.27	0.27	0.25	0.28	0.28	0.25	0.29	0.26	0.22	0.24	0.22	0.29	0.27	0.28	0.34	0.54	0.51	0.47

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.12	0.09
C2	0.01	0.00	0.05	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.08	0.09	0.16	0.11
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.04	0.03	0.10	0.00	0.02	0.00	0.05	0.11	0.07	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.05	0.05	0.09	0.01	0.01	0.02	0.07	0.14	0.10	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.02	0.12	0.14	0.20	0.14
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.00	0.01	0.06	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.13	0.14	0.20	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.08	0.00	0.09	0.00	0.08	0.04	0.06	0.08	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.11	0.11	0.17	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.08	0.15	0.11
N3	0.02	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.10	0.11	0.19	0.13
N4	0.02	0.01	0.03	0.05	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.12	0.15	0.21	0.14
O2	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.11	0.11	0.05	0.07	0.07	0.15	0.10
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.05	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.04	0.11	0.00	0.04	0.03	0.04	0.10	0.06	0.04
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.05	0.02	0.07	0.03	0.08	0.03	0.06	0.06	0.11	0.04	0.00	0.02	0.11	0.23	0.18	0.16
O4'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02	0.00	0.09	0.11	0.17	0.15
O5'	0.05	0.08	0.05	0.07	0.12	0.01	0.13	0.01	0.11	0.08	0.10	0.12	0.07	0.04	0.11	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.06	0.09	0.11	0.14	0.14	0.06	0.14	0.05	0.11	0.08	0.11	0.15	0.07	0.10	0.23	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.16	0.07	0.10	0.20	0.03	0.20	0.02	0.17	0.15	0.19	0.21	0.15	0.06	0.18	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.11	0.05	0.09	0.14	0.02	0.14	0.01	0.12	0.11	0.13	0.14	0.10	0.04	0.16	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00