Doublet Group distance statistics: 55040

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 13, 16, 11, 6, 2, 0, 0, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.001, 0.008, 0.015, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.012 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.021, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.012 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.014 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.003, 0.015, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.006, 0.023, 0.040, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.005, 0.025, 0.044, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.025 std_dev=0.020
OP1	B	0, 0.120, 0.261, 0.403, 0.599 max_d=0.599 avg_d=0.261 std_dev=0.142
P	B	0, 0.118, 0.292, 0.466, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.292 std_dev=0.174
O4'	A	0, -0.097, 0.151, 0.399, 1.165 max_d=1.165 avg_d=0.151 std_dev=0.248
C2'	A	0, -0.079, 0.173, 0.426, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.173 std_dev=0.253
OP2	B	0, 0.095, 0.365, 0.635, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.365 std_dev=0.270
O2'	A	0, -0.158, 0.271, 0.701, 1.925 max_d=1.925 avg_d=0.271 std_dev=0.429
C3'	A	0, -0.173, 0.285, 0.743, 2.000 max_d=2.000 avg_d=0.285 std_dev=0.458
C4'	A	0, -0.204, 0.266, 0.737, 2.065 max_d=2.065 avg_d=0.266 std_dev=0.471
O5'	A	0, -0.215, 0.411, 1.036, 2.671 max_d=2.671 avg_d=0.411 std_dev=0.625
O3'	A	0, -0.221, 0.425, 1.072, 2.730 max_d=2.730 avg_d=0.425 std_dev=0.647
C5'	A	0, -0.250, 0.412, 1.075, 2.869 max_d=2.869 avg_d=0.412 std_dev=0.663
P	A	0, -0.284, 0.512, 1.308, 3.428 max_d=3.428 avg_d=0.512 std_dev=0.796
OP2	A	0, -0.311, 0.544, 1.399, 3.698 max_d=3.698 avg_d=0.544 std_dev=0.855
O5'	B	0, -0.382, 0.517, 1.416, 3.949 max_d=3.949 avg_d=0.517 std_dev=0.899
OP1	A	0, -0.400, 0.603, 1.606, 4.303 max_d=4.303 avg_d=0.603 std_dev=1.003
C5'	B	0, -0.721, 0.615, 1.952, 5.556 max_d=5.556 avg_d=0.615 std_dev=1.336
C4'	B	0, -1.094, 0.815, 2.725, 7.838 max_d=7.838 avg_d=0.815 std_dev=1.909
C5	B	0, -0.975, 0.966, 2.908, 8.315 max_d=8.315 avg_d=0.966 std_dev=1.942
C3'	B	0, -1.092, 0.885, 2.861, 8.155 max_d=8.155 avg_d=0.885 std_dev=1.977
C6	B	0, -1.056, 0.938, 2.933, 8.430 max_d=8.430 avg_d=0.938 std_dev=1.995
O3'	B	0, -1.218, 0.931, 3.079, 8.820 max_d=8.820 avg_d=0.931 std_dev=2.148
O4'	B	0, -1.329, 0.939, 3.208, 9.308 max_d=9.308 avg_d=0.939 std_dev=2.268
N4	B	0, -1.293, 1.199, 3.692, 10.595 max_d=10.595 avg_d=1.199 std_dev=2.493
C2'	B	0, -1.422, 1.101, 3.624, 10.307 max_d=10.307 avg_d=1.101 std_dev=2.523
C4	B	0, -1.376, 1.151, 3.679, 10.625 max_d=10.625 avg_d=1.151 std_dev=2.527
N1	B	0, -1.497, 1.099, 3.696, 10.710 max_d=10.710 avg_d=1.099 std_dev=2.597
C1'	B	0, -1.538, 1.091, 3.721, 10.748 max_d=10.748 avg_d=1.091 std_dev=2.629
O2'	B	0, -1.685, 1.264, 4.212, 11.939 max_d=11.939 avg_d=1.264 std_dev=2.948
N3	B	0, -1.808, 1.312, 4.433, 12.888 max_d=12.888 avg_d=1.312 std_dev=3.120
C2	B	0, -1.870, 1.303, 4.476, 13.014 max_d=13.014 avg_d=1.303 std_dev=3.173
O2	B	0, -2.231, 1.491, 5.212, 15.157 max_d=15.157 avg_d=1.491 std_dev=3.722

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.01	0.04	0.05	0.06	0.04
C2	0.02	0.00	0.15	0.12	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.12	0.12	0.18	0.18	0.33	0.21
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.05	0.06	0.08	0.08	0.12	0.15	0.06	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.16	0.17	0.19	0.17
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.16	0.00	0.22	0.01	0.22	0.25	0.18	0.10	0.25	0.27	0.16	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.04	0.06
C4	0.01	0.00	0.08	0.16	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.04	0.06	0.22	0.23	0.32	0.24
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.06	0.19	0.03	0.08	0.09	0.17	0.07	0.17	0.02	0.00	0.01	0.04	0.02	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.22	0.01	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.10	0.03	0.34	0.37	0.48	0.39
C5'	0.02	0.06	0.06	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.12	0.25	0.06	0.07	0.17	0.25	0.10	0.10	0.07	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.08	0.22	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.08	0.06	0.33	0.38	0.52	0.40
C8	0.01	0.01	0.08	0.25	0.01	0.19	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.23	0.18	0.08	0.39	0.40	0.41	0.40
N1	0.01	0.01	0.12	0.18	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.06	0.10	0.26	0.29	0.45	0.32
N3	0.02	0.00	0.15	0.10	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.09	0.15	0.12	0.13	0.13	0.25	0.16
N6	0.01	0.01	0.06	0.25	0.01	0.09	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.14	0.04	0.39	0.48	0.62	0.48
N7	0.01	0.01	0.04	0.27	0.01	0.17	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.20	0.05	0.43	0.49	0.56	0.49
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.03	0.01	0.21	0.21	0.24	0.22
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.11	0.17	0.18	0.10	0.17	0.23	0.12	0.09	0.21	0.24	0.13	0.00	0.04	0.12	0.09	0.10	0.18	0.11
O3'	0.13	0.12	0.01	0.00	0.04	0.02	0.10	0.07	0.08	0.18	0.06	0.15	0.14	0.20	0.03	0.04	0.00	0.08	0.06	0.12	0.12	0.08
O4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.06	0.00	0.03	0.01	0.06	0.08	0.10	0.12	0.04	0.05	0.01	0.12	0.08	0.00	0.06	0.07	0.07	0.07
O5'	0.04	0.18	0.16	0.05	0.22	0.01	0.34	0.01	0.33	0.39	0.26	0.13	0.39	0.43	0.21	0.09	0.06	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.05	0.18	0.17	0.10	0.23	0.04	0.37	0.05	0.38	0.40	0.29	0.13	0.48	0.49	0.21	0.10	0.12	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.33	0.19	0.04	0.32	0.02	0.48	0.02	0.52	0.41	0.45	0.25	0.62	0.56	0.24	0.18	0.12	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.21	0.17	0.06	0.24	0.02	0.39	0.02	0.40	0.40	0.32	0.16	0.48	0.49	0.22	0.11	0.08	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.44	0.40	0.39	0.41	0.19	0.38	0.12	0.23	0.17	0.33	0.32	0.15	0.53	0.32	0.40	0.39	0.14	0.09	0.11	0.11
C2	0.15	0.11	0.11	0.11	0.17	0.19	0.21	0.21	0.16	0.10	0.12	0.21	0.15	0.19	0.19	0.22	0.14	0.13	0.15	0.16
C2'	0.65	0.61	0.60	0.58	0.31	0.53	0.19	0.29	0.27	0.50	0.50	0.25	0.80	0.60	0.63	0.55	0.14	0.13	0.17	0.09
C3'	0.41	0.39	0.39	0.37	0.11	0.29	0.10	0.07	0.08	0.27	0.28	0.09	0.57	0.38	0.44	0.29	0.12	0.30	0.33	0.25
C4	0.28	0.22	0.25	0.28	0.09	0.26	0.09	0.16	0.08	0.18	0.15	0.09	0.32	0.17	0.24	0.26	0.11	0.10	0.12	0.11
C4'	0.31	0.29	0.30	0.33	0.10	0.23	0.08	0.09	0.08	0.21	0.22	0.08	0.43	0.24	0.36	0.22	0.07	0.12	0.14	0.09
C5	0.23	0.17	0.27	0.30	0.07	0.18	0.09	0.08	0.07	0.13	0.11	0.08	0.25	0.20	0.30	0.16	0.08	0.10	0.11	0.09
C5'	0.14	0.13	0.18	0.21	0.11	0.07	0.18	0.15	0.13	0.07	0.08	0.14	0.24	0.13	0.28	0.07	0.17	0.18	0.18	0.17
C6	0.11	0.07	0.13	0.16	0.14	0.09	0.17	0.09	0.13	0.07	0.09	0.16	0.10	0.09	0.10	0.09	0.10	0.10	0.11	0.10
C8	0.39	0.35	0.46	0.48	0.17	0.28	0.11	0.09	0.15	0.29	0.28	0.14	0.46	0.43	0.56	0.25	0.08	0.10	0.11	0.09
N1	0.10	0.12	0.10	0.09	0.21	0.12	0.24	0.13	0.20	0.12	0.16	0.24	0.10	0.19	0.21	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14
N3	0.24	0.18	0.15	0.18	0.10	0.26	0.13	0.23	0.10	0.14	0.12	0.13	0.26	0.11	0.10	0.29	0.14	0.12	0.14	0.14
N6	0.08	0.11	0.13	0.14	0.18	0.12	0.21	0.23	0.18	0.12	0.14	0.20	0.09	0.10	0.13	0.15	0.16	0.12	0.12	0.08
N7	0.31	0.26	0.42	0.45	0.12	0.21	0.08	0.07	0.11	0.22	0.20	0.10	0.35	0.39	0.53	0.16	0.07	0.11	0.12	0.09
N9	0.38	0.33	0.37	0.39	0.15	0.31	0.09	0.16	0.13	0.27	0.25	0.11	0.44	0.30	0.40	0.30	0.11	0.10	0.11	0.10
O2'	1.09	1.06	0.97	0.94	0.73	0.96	0.58	0.71	0.68	0.94	0.95	0.66	1.27	0.97	0.95	1.02	0.51	0.21	0.19	0.31
O3'	0.63	0.61	0.57	0.55	0.29	0.51	0.15	0.26	0.23	0.48	0.50	0.22	0.82	0.56	0.60	0.52	0.11	0.20	0.23	0.12
O4'	0.29	0.26	0.27	0.32	0.11	0.24	0.08	0.13	0.09	0.20	0.20	0.09	0.36	0.19	0.31	0.23	0.10	0.11	0.12	0.12
O5'	0.09	0.10	0.08	0.09	0.27	0.20	0.37	0.40	0.32	0.17	0.15	0.31	0.11	0.08	0.19	0.24	0.41	0.40	0.39	0.41
OP1	0.25	0.25	0.13	0.10	0.43	0.37	0.52	0.59	0.47	0.33	0.31	0.46	0.14	0.16	0.11	0.45	0.56	0.50	0.50	0.55
OP2	0.44	0.44	0.25	0.22	0.60	0.59	0.69	0.83	0.65	0.52	0.50	0.63	0.33	0.25	0.08	0.69	0.77	0.65	0.63	0.73
P	0.31	0.31	0.17	0.13	0.47	0.43	0.55	0.63	0.51	0.38	0.36	0.50	0.21	0.21	0.07	0.51	0.59	0.49	0.48	0.54

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.03	0.17	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.04	0.10	0.07	0.14	0.11
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.02	0.09	0.03	0.11	0.02	0.05	0.05	0.15	0.00	0.01	0.01	0.10	0.34	0.25	0.22
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.16	0.00	0.15	0.01	0.14	0.12	0.15	0.16	0.12	0.02	0.01	0.01	0.04	0.28	0.11	0.13
C4	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.07	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.14	0.02	0.16	0.14	0.26	0.22
C4'	0.00	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.10	0.05	0.04	0.07	0.03	0.15	0.02	0.00	0.01	0.14	0.05	0.06
C5	0.02	0.01	0.09	0.15	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.16	0.03	0.19	0.17	0.26	0.24
C5'	0.02	0.04	0.03	0.01	0.09	0.00	0.13	0.00	0.13	0.06	0.06	0.10	0.04	0.11	0.10	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.11	0.14	0.01	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.04	0.16	0.10	0.16	0.17
N1	0.00	0.01	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.06	0.01	0.09	0.07	0.10	0.09
N3	0.02	0.00	0.05	0.15	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.10	0.03	0.13	0.09	0.21	0.17
N4	0.01	0.01	0.05	0.16	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.15	0.02	0.17	0.18	0.30	0.25
O2	0.04	0.01	0.15	0.12	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.06	0.06	0.07	0.10	0.12	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.18	0.15	0.20	0.11	0.18	0.09	0.12	0.20	0.07	0.00	0.04	0.11	0.03	0.29	0.25	0.17
O3'	0.05	0.06	0.01	0.01	0.14	0.02	0.16	0.10	0.13	0.06	0.10	0.15	0.06	0.04	0.00	0.02	0.13	0.19	0.07	0.06
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.06	0.11	0.02	0.00	0.03	0.10	0.04	0.03
O5'	0.03	0.10	0.10	0.04	0.16	0.01	0.19	0.01	0.16	0.09	0.13	0.17	0.07	0.03	0.13	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.17	0.07	0.34	0.28	0.14	0.14	0.17	0.03	0.10	0.07	0.09	0.18	0.10	0.29	0.19	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.14	0.25	0.11	0.26	0.05	0.26	0.01	0.16	0.10	0.21	0.30	0.12	0.25	0.07	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.11	0.22	0.13	0.22	0.06	0.24	0.01	0.17	0.09	0.17	0.25	0.08	0.17	0.06	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00