Doublet Group distance statistics: 55044

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 4, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.019, 0.032, 0.045, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.032 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.011, 0.025, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.025 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.025, 0.044, 0.063, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.044 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.023, 0.043, 0.063, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.043 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.024, 0.045, 0.065, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.045 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.022, 0.045, 0.068, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.045 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.031, 0.058, 0.085, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.058 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.018, 0.046, 0.073, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.046 std_dev=0.027
N7	A	0, 0.011, 0.039, 0.068, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.039 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.028, 0.060, 0.093, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.060 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.147, 0.295, 0.443, 0.421 max_d=0.421 avg_d=0.295 std_dev=0.148
P	B	0, 0.124, 0.294, 0.464, 0.583 max_d=0.583 avg_d=0.294 std_dev=0.170
OP1	B	0, 0.216, 0.395, 0.573, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.395 std_dev=0.178
C2'	A	0, 0.218, 0.455, 0.692, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.455 std_dev=0.237
C4'	A	0, 0.246, 0.501, 0.756, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.501 std_dev=0.255
OP2	B	0, 0.080, 0.357, 0.634, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.357 std_dev=0.277
O5'	B	0, 0.254, 0.531, 0.809, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.531 std_dev=0.278
N4	B	0, 0.355, 0.656, 0.957, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.656 std_dev=0.301
O5'	A	0, 0.303, 0.650, 0.997, 0.998 max_d=0.998 avg_d=0.650 std_dev=0.347
C3'	A	0, 0.342, 0.700, 1.058, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.700 std_dev=0.358
O2'	A	0, 0.351, 0.724, 1.097, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.724 std_dev=0.373
C4	B	0, 0.304, 0.708, 1.112, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.708 std_dev=0.404
C5	B	0, 0.278, 0.684, 1.089, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.684 std_dev=0.405
C5'	A	0, 0.422, 0.867, 1.311, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.867 std_dev=0.444
P	A	0, 0.444, 0.954, 1.464, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.954 std_dev=0.510
O3'	A	0, 0.515, 1.060, 1.605, 1.550 max_d=1.550 avg_d=1.060 std_dev=0.545
C6	B	0, 0.292, 0.838, 1.383, 1.474 max_d=1.474 avg_d=0.838 std_dev=0.546
N3	B	0, 0.274, 0.827, 1.381, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.827 std_dev=0.553
OP2	A	0, 0.511, 1.100, 1.690, 1.630 max_d=1.630 avg_d=1.100 std_dev=0.590
OP1	A	0, 0.546, 1.175, 1.804, 1.740 max_d=1.740 avg_d=1.175 std_dev=0.629
N1	B	0, 0.403, 1.069, 1.734, 1.780 max_d=1.780 avg_d=1.069 std_dev=0.666
C2	B	0, 0.346, 1.012, 1.679, 1.734 max_d=1.734 avg_d=1.012 std_dev=0.667
C5'	B	0, 0.436, 1.113, 1.791, 1.817 max_d=1.817 avg_d=1.113 std_dev=0.677
C3'	B	0, 0.563, 1.280, 1.996, 1.920 max_d=1.920 avg_d=1.280 std_dev=0.717
O4'	B	0, 0.561, 1.296, 2.030, 1.977 max_d=1.977 avg_d=1.296 std_dev=0.735
C4'	B	0, 0.550, 1.286, 2.023, 1.951 max_d=1.951 avg_d=1.286 std_dev=0.737
O2	B	0, 0.446, 1.187, 1.928, 1.953 max_d=1.953 avg_d=1.187 std_dev=0.741
C1'	B	0, 0.584, 1.336, 2.088, 2.039 max_d=2.039 avg_d=1.336 std_dev=0.752
O3'	B	0, 0.606, 1.365, 2.124, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.365 std_dev=0.759
C2'	B	0, 0.656, 1.417, 2.178, 2.070 max_d=2.070 avg_d=1.417 std_dev=0.761
O2'	B	0, 0.835, 1.705, 2.574, 2.522 max_d=2.522 avg_d=1.705 std_dev=0.870

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.04	0.04
C2	0.03	0.00	0.11	0.07	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.18	0.11	0.03	0.06	0.06	0.13	0.08
C2'	0.00	0.11	0.00	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.12	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02
C3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.05	0.15	0.03	0.08	0.09	0.13	0.05	0.01	0.00	0.01	0.07	0.06	0.07	0.07
C4	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.03	0.02	0.05	0.06	0.10	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.02	0.04	0.08	0.08	0.03	0.04	0.01	0.01	0.02	0.05	0.03	0.02
C5	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.05	0.07	0.02	0.10	0.13	0.17	0.13
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.06	0.03	0.13	0.12	0.04	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.02	0.01
C6	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.05	0.01	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.08	0.04	0.03	0.11	0.15	0.20	0.16
C8	0.01	0.03	0.07	0.15	0.02	0.09	0.02	0.11	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.00	0.04	0.16	0.02	0.09	0.10	0.10	0.09
N1	0.03	0.01	0.08	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.14	0.05	0.03	0.08	0.11	0.18	0.12
N3	0.03	0.01	0.12	0.08	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.18	0.12	0.03	0.05	0.05	0.09	0.06
N6	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.08	0.02	0.13	0.01	0.04	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.04	0.15	0.22	0.27	0.21
N7	0.02	0.02	0.05	0.13	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.02	0.15	0.02	0.13	0.16	0.18	0.15
N9	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.04	0.04	0.05	0.04
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.09	0.04	0.05	0.03	0.08	0.04	0.14	0.18	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03
O3'	0.02	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.04	0.16	0.05	0.12	0.09	0.15	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.11	0.11	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.11	0.09	0.10
O5'	0.05	0.06	0.02	0.07	0.05	0.02	0.10	0.00	0.11	0.09	0.08	0.05	0.15	0.13	0.04	0.03	0.11	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.06	0.06	0.04	0.06	0.06	0.05	0.13	0.05	0.15	0.10	0.11	0.05	0.22	0.16	0.04	0.05	0.11	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.13	0.03	0.07	0.10	0.03	0.17	0.02	0.20	0.10	0.18	0.09	0.27	0.18	0.05	0.04	0.11	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.08	0.02	0.07	0.07	0.02	0.13	0.01	0.16	0.09	0.12	0.06	0.21	0.15	0.04	0.03	0.10	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.12	0.09	0.09	0.15	0.11	0.13	0.10	0.12	0.11	0.13	0.18	0.11	0.14	0.12	0.14	0.08	0.08	0.09	0.08
C2	0.23	0.24	0.17	0.16	0.25	0.22	0.25	0.24	0.24	0.23	0.25	0.27	0.23	0.18	0.13	0.27	0.16	0.17	0.17	0.16
C2'	0.13	0.13	0.09	0.10	0.16	0.11	0.15	0.11	0.13	0.12	0.15	0.21	0.12	0.14	0.14	0.15	0.10	0.09	0.11	0.10
C3'	0.11	0.14	0.05	0.05	0.19	0.07	0.16	0.05	0.13	0.12	0.18	0.24	0.13	0.10	0.09	0.13	0.06	0.09	0.07	0.06
C4	0.15	0.16	0.10	0.09	0.19	0.13	0.17	0.13	0.16	0.15	0.18	0.22	0.15	0.14	0.11	0.18	0.10	0.10	0.11	0.10
C4'	0.11	0.13	0.06	0.05	0.18	0.07	0.15	0.05	0.12	0.11	0.17	0.23	0.12	0.11	0.08	0.13	0.06	0.09	0.08	0.06
C5	0.13	0.14	0.09	0.09	0.17	0.11	0.16	0.10	0.14	0.13	0.16	0.21	0.13	0.13	0.14	0.16	0.09	0.08	0.09	0.09
C5'	0.14	0.18	0.08	0.07	0.22	0.08	0.19	0.07	0.15	0.14	0.21	0.27	0.16	0.12	0.07	0.14	0.10	0.14	0.11	0.11
C6	0.15	0.17	0.09	0.08	0.21	0.12	0.20	0.13	0.18	0.16	0.20	0.24	0.16	0.11	0.12	0.19	0.11	0.10	0.13	0.12
C8	0.12	0.10	0.11	0.12	0.13	0.12	0.11	0.11	0.09	0.09	0.12	0.17	0.10	0.17	0.17	0.14	0.08	0.05	0.07	0.06
N1	0.21	0.23	0.14	0.13	0.25	0.19	0.25	0.22	0.23	0.22	0.24	0.28	0.21	0.15	0.11	0.25	0.15	0.16	0.17	0.16
N3	0.20	0.20	0.14	0.13	0.22	0.18	0.21	0.19	0.20	0.20	0.22	0.25	0.19	0.16	0.11	0.23	0.14	0.14	0.14	0.13
N6	0.12	0.16	0.07	0.10	0.21	0.09	0.19	0.09	0.16	0.14	0.19	0.24	0.14	0.10	0.17	0.16	0.10	0.06	0.12	0.11
N7	0.12	0.10	0.11	0.13	0.14	0.12	0.11	0.12	0.09	0.09	0.12	0.18	0.10	0.17	0.19	0.14	0.08	0.05	0.06	0.06
N9	0.13	0.12	0.09	0.09	0.15	0.11	0.14	0.10	0.12	0.12	0.14	0.19	0.12	0.14	0.12	0.15	0.09	0.08	0.09	0.08
O2'	0.15	0.14	0.14	0.14	0.16	0.15	0.15	0.14	0.15	0.14	0.15	0.20	0.14	0.18	0.19	0.17	0.14	0.14	0.16	0.15
O3'	0.12	0.16	0.05	0.05	0.21	0.07	0.18	0.05	0.13	0.12	0.20	0.26	0.14	0.09	0.09	0.13	0.06	0.09	0.07	0.06
O4'	0.10	0.09	0.06	0.06	0.13	0.08	0.11	0.06	0.09	0.08	0.11	0.17	0.08	0.13	0.10	0.12	0.06	0.06	0.07	0.06
O5'	0.12	0.17	0.07	0.08	0.23	0.07	0.20	0.08	0.15	0.13	0.22	0.29	0.15	0.11	0.11	0.12	0.11	0.15	0.14	0.12
OP1	0.19	0.27	0.13	0.11	0.33	0.11	0.29	0.12	0.23	0.22	0.32	0.40	0.25	0.15	0.10	0.17	0.19	0.22	0.23	0.21
OP2	0.19	0.26	0.14	0.13	0.33	0.13	0.29	0.14	0.23	0.22	0.31	0.38	0.24	0.15	0.12	0.18	0.22	0.26	0.26	0.25
P	0.16	0.23	0.11	0.10	0.29	0.10	0.25	0.10	0.20	0.19	0.28	0.35	0.21	0.13	0.09	0.15	0.17	0.20	0.21	0.19

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.08	0.08
C2	0.03	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.03	0.10	0.10	0.13	0.12
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.07	0.04	0.12	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.08	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.07	0.05	0.10	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.11	0.09
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.02	0.12	0.15	0.19	0.16
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.06	0.03	0.12	0.15	0.18	0.15
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.06	0.04	0.11	0.12	0.13	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.09	0.09	0.11	0.10
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.00	0.03	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.07	0.08	0.03	0.12	0.13	0.17	0.15
N4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.03	0.14	0.17	0.22	0.19
O2	0.05	0.01	0.12	0.10	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.05	0.08	0.07	0.11	0.10
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02	0.07	0.04	0.12	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.06	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.06	0.03	0.08	0.07	0.11	0.04	0.00	0.01	0.15	0.18	0.18	0.17
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03	0.01	0.00	0.11	0.11	0.10	0.11
O5'	0.07	0.10	0.04	0.09	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.09	0.12	0.14	0.08	0.03	0.15	0.11	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.07	0.10	0.06	0.09	0.15	0.03	0.15	0.07	0.12	0.09	0.13	0.17	0.07	0.06	0.18	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.13	0.08	0.11	0.19	0.02	0.18	0.02	0.13	0.11	0.17	0.22	0.11	0.06	0.18	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.05	0.09	0.16	0.01	0.15	0.01	0.12	0.10	0.15	0.19	0.10	0.03	0.17	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00