Doublet Group distance statistics: 55045

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 0, 1, 1, 1, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.009, 0.017, 0.024, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.010, 0.019, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.019 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.016, 0.030, 0.044, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.030 std_dev=0.014
N7	A	0, 0.019, 0.038, 0.057, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.038 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.021, 0.040, 0.060, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.040 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.021, 0.041, 0.061, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.041 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.013, 0.033, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.033 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.026, 0.051, 0.076, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.051 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.006, 0.031, 0.057, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.031 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.009, 0.043, 0.077, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.043 std_dev=0.034
P	A	0, 0.524, 0.837, 1.149, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.837 std_dev=0.312
O4'	A	0, 0.380, 0.694, 1.008, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.694 std_dev=0.314
C5	B	0, 0.459, 0.792, 1.126, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.792 std_dev=0.333
C3'	A	0, 0.601, 0.937, 1.272, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.937 std_dev=0.335
C4'	A	0, 0.547, 0.914, 1.281, 1.283 max_d=1.283 avg_d=0.914 std_dev=0.367
C2'	A	0, 0.562, 0.929, 1.297, 1.256 max_d=1.256 avg_d=0.929 std_dev=0.367
OP1	B	0, 0.277, 0.646, 1.015, 1.187 max_d=1.187 avg_d=0.646 std_dev=0.369
C6	B	0, 0.432, 0.809, 1.185, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.809 std_dev=0.377
P	B	0, 0.206, 0.582, 0.959, 1.087 max_d=1.087 avg_d=0.582 std_dev=0.377
OP2	B	0, 0.218, 0.597, 0.976, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.597 std_dev=0.379
O5'	B	0, 0.177, 0.571, 0.966, 1.200 max_d=1.200 avg_d=0.571 std_dev=0.394
OP2	A	0, 0.602, 1.005, 1.409, 1.470 max_d=1.470 avg_d=1.005 std_dev=0.403
N4	B	0, 0.550, 0.980, 1.410, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.980 std_dev=0.430
O3'	A	0, 0.825, 1.265, 1.705, 1.548 max_d=1.548 avg_d=1.265 std_dev=0.440
C4	B	0, 0.477, 0.941, 1.404, 1.481 max_d=1.481 avg_d=0.941 std_dev=0.463
O5'	A	0, 0.862, 1.349, 1.835, 1.726 max_d=1.726 avg_d=1.349 std_dev=0.486
C5'	B	0, 0.227, 0.714, 1.200, 1.374 max_d=1.374 avg_d=0.714 std_dev=0.487
O4'	B	0, 0.357, 0.909, 1.462, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.909 std_dev=0.553
C5'	A	0, 0.714, 1.276, 1.838, 1.900 max_d=1.900 avg_d=1.276 std_dev=0.562
OP1	A	0, 0.570, 1.132, 1.695, 1.865 max_d=1.865 avg_d=1.132 std_dev=0.562
N1	B	0, 0.382, 0.946, 1.509, 1.644 max_d=1.644 avg_d=0.946 std_dev=0.563
C4'	B	0, 0.316, 0.897, 1.478, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.897 std_dev=0.581
C1'	B	0, 0.365, 1.006, 1.647, 1.820 max_d=1.820 avg_d=1.006 std_dev=0.641
N3	B	0, 0.409, 1.066, 1.723, 1.933 max_d=1.933 avg_d=1.066 std_dev=0.657
C3'	B	0, 0.262, 0.925, 1.588, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.925 std_dev=0.663
O2'	A	0, 0.932, 1.600, 2.267, 2.245 max_d=2.245 avg_d=1.600 std_dev=0.668
C2'	B	0, 0.380, 1.074, 1.768, 1.938 max_d=1.938 avg_d=1.074 std_dev=0.694
C2	B	0, 0.356, 1.067, 1.779, 2.011 max_d=2.011 avg_d=1.067 std_dev=0.711
O2'	B	0, 0.522, 1.309, 2.096, 2.376 max_d=2.376 avg_d=1.309 std_dev=0.787
O3'	B	0, 0.380, 1.180, 1.980, 2.168 max_d=2.168 avg_d=1.180 std_dev=0.800
O2	B	0, 0.308, 1.197, 2.085, 2.425 max_d=2.425 avg_d=1.197 std_dev=0.889

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.05	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.39	0.08	0.11
C2	0.06	0.00	0.10	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.16	0.10	0.17	0.21	0.06	0.07
C2'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.05	0.04	0.09	0.07	0.10	0.04	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.32	0.50	0.25	0.31
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.05	0.05	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.31	0.43	0.19	0.23
C4	0.03	0.01	0.05	0.03	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.05	0.19	0.25	0.06	0.06
C4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.09	0.03	0.08	0.07	0.09	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.33	0.10	0.04
C5	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.04	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.09	0.01	0.29	0.16	0.12	0.12
C5'	0.04	0.08	0.05	0.01	0.10	0.00	0.16	0.00	0.16	0.17	0.12	0.05	0.21	0.19	0.10	0.02	0.02	0.01	0.01	0.25	0.11	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.30	0.15	0.16	0.16
C8	0.02	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.14	0.05	0.09	0.31	0.24	0.09	0.07
N1	0.05	0.00	0.07	0.05	0.01	0.03	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.15	0.07	0.24	0.16	0.11	0.12
N3	0.06	0.00	0.10	0.05	0.00	0.08	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.11	0.12	0.27	0.04	0.06
N6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.10	0.09	0.03	0.37	0.20	0.23	0.23
N7	0.01	0.01	0.07	0.03	0.01	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.15	0.06	0.07	0.36	0.14	0.15	0.15
N9	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.18	0.32	0.05	0.05
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.03	0.03	0.08	0.02	0.07	0.14	0.05	0.11	0.10	0.15	0.05	0.00	0.04	0.02	0.36	0.52	0.29	0.35
O3'	0.07	0.16	0.01	0.01	0.10	0.02	0.09	0.02	0.11	0.05	0.15	0.15	0.09	0.06	0.06	0.04	0.00	0.05	0.22	0.41	0.14	0.17
O4'	0.00	0.10	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.03	0.09	0.07	0.11	0.03	0.07	0.01	0.02	0.05	0.00	0.20	0.37	0.11	0.09
O5'	0.07	0.17	0.32	0.31	0.19	0.01	0.29	0.01	0.30	0.31	0.24	0.12	0.37	0.36	0.18	0.36	0.22	0.20	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.39	0.21	0.50	0.43	0.25	0.33	0.16	0.25	0.15	0.24	0.16	0.27	0.20	0.14	0.32	0.52	0.41	0.37	0.01	0.00	0.02	0.00
OP2	0.08	0.06	0.25	0.19	0.06	0.10	0.12	0.11	0.16	0.09	0.11	0.04	0.23	0.15	0.05	0.29	0.14	0.11	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.07	0.31	0.23	0.06	0.04	0.12	0.01	0.16	0.07	0.12	0.06	0.23	0.15	0.05	0.35	0.17	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.23	0.11	0.08	0.19	0.09	0.13	0.05	0.12	0.16	0.24	0.21	0.27	0.13	0.09	0.14	0.05	0.09	0.07	0.06
C2	0.23	0.30	0.17	0.11	0.27	0.16	0.22	0.13	0.20	0.24	0.31	0.28	0.33	0.20	0.09	0.22	0.15	0.14	0.18	0.13
C2'	0.13	0.17	0.11	0.10	0.16	0.08	0.13	0.07	0.11	0.13	0.18	0.20	0.20	0.11	0.12	0.14	0.07	0.15	0.10	0.10
C3'	0.16	0.22	0.13	0.10	0.20	0.10	0.15	0.07	0.13	0.17	0.24	0.22	0.26	0.14	0.11	0.15	0.07	0.13	0.09	0.09
C4	0.14	0.21	0.09	0.04	0.18	0.08	0.12	0.05	0.10	0.15	0.23	0.21	0.25	0.11	0.05	0.13	0.06	0.10	0.09	0.07
C4'	0.20	0.28	0.17	0.12	0.24	0.13	0.16	0.08	0.15	0.21	0.29	0.26	0.33	0.19	0.10	0.18	0.08	0.11	0.10	0.08
C5	0.11	0.18	0.09	0.07	0.17	0.08	0.12	0.07	0.10	0.12	0.20	0.21	0.21	0.09	0.08	0.11	0.06	0.11	0.09	0.08
C5'	0.26	0.34	0.24	0.19	0.30	0.21	0.22	0.17	0.21	0.27	0.35	0.32	0.38	0.26	0.18	0.24	0.19	0.26	0.22	0.18
C6	0.11	0.20	0.07	0.04	0.21	0.05	0.15	0.04	0.11	0.13	0.23	0.26	0.22	0.08	0.05	0.10	0.05	0.10	0.08	0.07
C8	0.16	0.20	0.15	0.14	0.19	0.13	0.15	0.10	0.15	0.17	0.22	0.21	0.23	0.15	0.14	0.16	0.09	0.11	0.09	0.09
N1	0.19	0.28	0.15	0.09	0.27	0.12	0.22	0.09	0.19	0.22	0.29	0.29	0.30	0.16	0.07	0.18	0.12	0.12	0.15	0.10
N3	0.20	0.27	0.13	0.07	0.22	0.13	0.16	0.10	0.15	0.20	0.27	0.24	0.31	0.17	0.05	0.19	0.12	0.13	0.14	0.11
N6	0.07	0.16	0.06	0.08	0.21	0.09	0.14	0.11	0.08	0.09	0.21	0.28	0.16	0.06	0.09	0.09	0.09	0.13	0.13	0.14
N7	0.16	0.18	0.15	0.15	0.18	0.14	0.15	0.12	0.15	0.16	0.20	0.20	0.20	0.15	0.15	0.16	0.11	0.12	0.11	0.11
N9	0.14	0.20	0.11	0.09	0.17	0.09	0.13	0.06	0.11	0.15	0.22	0.20	0.24	0.12	0.09	0.14	0.07	0.10	0.08	0.07
O2'	0.09	0.12	0.10	0.13	0.14	0.05	0.12	0.06	0.09	0.09	0.14	0.18	0.15	0.07	0.18	0.12	0.07	0.11	0.07	0.09
O3'	0.12	0.20	0.09	0.12	0.17	0.07	0.13	0.09	0.11	0.13	0.22	0.20	0.25	0.10	0.16	0.11	0.09	0.14	0.08	0.12
O4'	0.19	0.26	0.15	0.11	0.21	0.12	0.15	0.09	0.14	0.19	0.28	0.24	0.31	0.17	0.11	0.17	0.08	0.09	0.09	0.08
O5'	0.39	0.47	0.35	0.29	0.43	0.33	0.34	0.31	0.34	0.40	0.48	0.45	0.50	0.37	0.27	0.36	0.32	0.34	0.32	0.30
OP1	0.31	0.34	0.30	0.28	0.32	0.28	0.27	0.26	0.28	0.31	0.36	0.34	0.37	0.31	0.29	0.30	0.26	0.28	0.24	0.23
OP2	0.31	0.35	0.31	0.28	0.33	0.27	0.28	0.24	0.27	0.31	0.36	0.34	0.38	0.32	0.28	0.29	0.24	0.28	0.23	0.22
P	0.27	0.31	0.26	0.23	0.29	0.24	0.24	0.22	0.23	0.27	0.33	0.31	0.34	0.26	0.23	0.25	0.22	0.27	0.22	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.06	0.05
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.09	0.10	0.12	0.10
C2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.03	0.05	0.06	0.08	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.12	0.08
C4	0.01	0.01	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.12	0.16	0.17	0.14
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.02	0.12	0.17	0.16	0.14
C5'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.06	0.09	0.04	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.08	0.02	0.11	0.12	0.12	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.08	0.08	0.09	0.08
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.06	0.02	0.10	0.13	0.15	0.12
N4	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.07	0.01	0.13	0.19	0.19	0.16
O2	0.02	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.09	0.03	0.08	0.08	0.11	0.09
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.04	0.04	0.07	0.00	0.02	0.04	0.03	0.07	0.05	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.08	0.03	0.06	0.07	0.09	0.02	0.00	0.01	0.09	0.15	0.16	0.11
O4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.05	0.04	0.08	0.06
O5'	0.04	0.09	0.04	0.07	0.12	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.10	0.13	0.08	0.03	0.09	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.10	0.06	0.10	0.16	0.03	0.17	0.03	0.12	0.08	0.13	0.19	0.08	0.07	0.15	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.12	0.07	0.12	0.17	0.02	0.16	0.01	0.12	0.09	0.15	0.19	0.11	0.05	0.16	0.08	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.10	0.04	0.08	0.14	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.12	0.16	0.09	0.03	0.11	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00