Doublet Group distance statistics: 55056

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.004, 0.018, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.002, 0.018, 0.033, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.004, 0.021, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.021 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.002, 0.022, 0.042, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.022 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.006, 0.028, 0.050, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.028 std_dev=0.022
C4	A	0, 0.001, 0.025, 0.048, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.025 std_dev=0.023
C8	A	0, 0.006, 0.030, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.002, 0.030, 0.058, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.030 std_dev=0.028
N6	A	0, 0.007, 0.038, 0.069, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.031
N3	A	0, -0.001, 0.030, 0.062, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.030 std_dev=0.031
O4'	A	0, -0.013, 0.137, 0.288, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.137 std_dev=0.151
C2'	A	0, -0.047, 0.139, 0.325, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.139 std_dev=0.186
C3'	A	0, -0.047, 0.218, 0.483, 0.591 max_d=0.591 avg_d=0.218 std_dev=0.265
OP1	A	0, -0.011, 0.258, 0.527, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.258 std_dev=0.269
C4'	A	0, -0.034, 0.245, 0.524, 0.636 max_d=0.636 avg_d=0.245 std_dev=0.279
O2'	A	0, -0.030, 0.251, 0.532, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.251 std_dev=0.281
O3'	A	0, -0.088, 0.311, 0.711, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.311 std_dev=0.400
P	A	0, -0.052, 0.354, 0.760, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.354 std_dev=0.406
C5'	A	0, -0.075, 0.363, 0.802, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.363 std_dev=0.439
OP2	A	0, -0.043, 0.405, 0.852, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.405 std_dev=0.448
O5'	A	0, -0.109, 0.440, 0.989, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.440 std_dev=0.549
OP1	B	0, 0.005, 0.584, 1.163, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.584 std_dev=0.579
P	B	0, -0.040, 0.595, 1.230, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.595 std_dev=0.635
O5'	B	0, -0.050, 0.637, 1.324, 1.591 max_d=1.591 avg_d=0.637 std_dev=0.687
OP2	B	0, -0.048, 0.649, 1.346, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.649 std_dev=0.697
O2'	B	0, 0.007, 0.966, 1.925, 2.273 max_d=2.273 avg_d=0.966 std_dev=0.959
C2'	B	0, -0.053, 0.953, 1.959, 2.345 max_d=2.345 avg_d=0.953 std_dev=1.006
C1'	B	0, -0.095, 0.997, 2.089, 2.517 max_d=2.517 avg_d=0.997 std_dev=1.092
O4'	B	0, -0.127, 0.967, 2.062, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.967 std_dev=1.094
C3'	B	0, -0.127, 0.979, 2.084, 2.523 max_d=2.523 avg_d=0.979 std_dev=1.105
N1	B	0, -0.121, 1.026, 2.174, 2.628 max_d=2.628 avg_d=1.026 std_dev=1.147
C6	B	0, -0.141, 1.011, 2.162, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.011 std_dev=1.151
O3'	B	0, -0.143, 1.010, 2.162, 2.622 max_d=2.622 avg_d=1.010 std_dev=1.152
C4'	B	0, -0.174, 1.005, 2.183, 2.659 max_d=2.659 avg_d=1.005 std_dev=1.179
C5	B	0, -0.132, 1.048, 2.229, 2.698 max_d=2.698 avg_d=1.048 std_dev=1.181
C2	B	0, -0.093, 1.088, 2.269, 2.729 max_d=2.729 avg_d=1.088 std_dev=1.181
O2	B	0, -0.060, 1.124, 2.309, 2.762 max_d=2.762 avg_d=1.124 std_dev=1.185
C4	B	0, -0.110, 1.093, 2.297, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.093 std_dev=1.203
N3	B	0, -0.090, 1.115, 2.320, 2.789 max_d=2.789 avg_d=1.115 std_dev=1.205
N4	B	0, -0.096, 1.134, 2.364, 2.843 max_d=2.843 avg_d=1.134 std_dev=1.230
C5'	B	0, -0.252, 1.064, 2.380, 2.919 max_d=2.919 avg_d=1.064 std_dev=1.316

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.04	0.15	0.15
C2	0.04	0.00	0.14	0.12	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.18	0.20	0.02	0.09	0.08	0.09	0.05
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.05	0.11	0.13	0.07	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.13	0.05	0.04
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.12	0.08	0.12	0.01	0.10	0.03	0.01	0.00	0.04	0.22	0.21	0.04	0.06
C4	0.02	0.00	0.06	0.03	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01	0.09	0.09	0.07	0.04
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.00	0.03	0.14	0.02	0.08	0.05	0.13	0.05	0.03	0.02	0.01	0.03	0.18	0.09	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.06	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.03	0.17	0.13	0.02	0.04
C5'	0.02	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.15	0.00	0.13	0.23	0.06	0.03	0.17	0.24	0.11	0.03	0.02	0.02	0.01	0.27	0.09	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.03	0.01	0.03	0.00	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.08	0.02	0.18	0.14	0.01	0.06
C8	0.01	0.01	0.05	0.12	0.01	0.14	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.06	0.16	0.13	0.02	0.03
N1	0.03	0.00	0.11	0.08	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.16	0.15	0.01	0.14	0.12	0.04	0.02
N3	0.04	0.00	0.13	0.12	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.16	0.17	0.03	0.05	0.06	0.12	0.09
N6	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03	0.22	0.17	0.05	0.10
N7	0.01	0.00	0.03	0.10	0.00	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.22	0.17	0.06	0.09
N9	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.06	0.08	0.08	0.06
O2'	0.01	0.18	0.00	0.01	0.08	0.03	0.07	0.03	0.12	0.02	0.16	0.16	0.11	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.11	0.05	0.05
O3'	0.01	0.20	0.01	0.00	0.06	0.02	0.02	0.02	0.08	0.11	0.15	0.17	0.07	0.07	0.02	0.03	0.00	0.01	0.27	0.27	0.11	0.13
O4'	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.06	0.01	0.03	0.03	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.25	0.01	0.25	0.25
O5'	0.07	0.09	0.11	0.22	0.09	0.03	0.17	0.01	0.18	0.16	0.14	0.05	0.22	0.22	0.06	0.03	0.27	0.25	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.08	0.13	0.21	0.09	0.18	0.13	0.27	0.14	0.13	0.12	0.06	0.17	0.17	0.08	0.11	0.27	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.09	0.05	0.04	0.07	0.09	0.02	0.09	0.01	0.02	0.04	0.12	0.05	0.06	0.08	0.05	0.11	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.04	0.01	0.06	0.03	0.02	0.09	0.10	0.09	0.06	0.05	0.13	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.09	0.12	0.29	0.11	0.19	0.11	0.36	0.09	0.07	0.11	0.13	0.11	0.05	0.36	0.04	0.24	0.27	0.21	0.24
C2	0.19	0.17	0.29	0.49	0.24	0.41	0.30	0.66	0.28	0.22	0.19	0.25	0.13	0.12	0.56	0.21	0.15	0.13	0.12	0.13
C2'	0.06	0.11	0.09	0.26	0.11	0.15	0.10	0.34	0.08	0.07	0.12	0.13	0.13	0.08	0.34	0.05	0.33	0.34	0.27	0.32
C3'	0.07	0.11	0.08	0.24	0.12	0.11	0.11	0.27	0.08	0.08	0.12	0.13	0.13	0.09	0.31	0.07	0.33	0.34	0.26	0.31
C4	0.05	0.08	0.15	0.33	0.11	0.22	0.13	0.42	0.12	0.08	0.10	0.13	0.10	0.04	0.40	0.05	0.22	0.22	0.19	0.22
C4'	0.04	0.09	0.13	0.28	0.11	0.16	0.12	0.32	0.09	0.07	0.10	0.13	0.10	0.05	0.34	0.04	0.23	0.25	0.16	0.21
C5	0.08	0.12	0.08	0.26	0.11	0.13	0.11	0.32	0.08	0.08	0.12	0.12	0.16	0.09	0.33	0.07	0.23	0.21	0.21	0.23
C5'	0.06	0.07	0.19	0.33	0.13	0.20	0.15	0.33	0.12	0.09	0.10	0.14	0.06	0.03	0.38	0.06	0.13	0.15	0.07	0.11
C6	0.04	0.08	0.12	0.32	0.12	0.19	0.15	0.42	0.12	0.07	0.09	0.14	0.11	0.07	0.38	0.04	0.19	0.13	0.15	0.18
C8	0.15	0.20	0.02	0.17	0.18	0.04	0.14	0.18	0.13	0.16	0.21	0.20	0.23	0.14	0.24	0.14	0.27	0.26	0.25	0.27
N1	0.13	0.13	0.24	0.45	0.22	0.35	0.27	0.61	0.25	0.17	0.16	0.23	0.08	0.07	0.52	0.15	0.15	0.10	0.11	0.13
N3	0.14	0.12	0.25	0.43	0.18	0.35	0.23	0.57	0.22	0.16	0.14	0.19	0.09	0.09	0.51	0.16	0.18	0.19	0.15	0.17
N6	0.11	0.12	0.05	0.24	0.10	0.08	0.12	0.30	0.08	0.08	0.10	0.12	0.17	0.14	0.30	0.12	0.20	0.08	0.16	0.19
N7	0.18	0.23	0.02	0.14	0.19	0.00	0.15	0.15	0.14	0.18	0.22	0.20	0.26	0.17	0.21	0.18	0.27	0.25	0.26	0.28
N9	0.06	0.12	0.10	0.26	0.12	0.15	0.10	0.32	0.08	0.08	0.13	0.13	0.14	0.07	0.33	0.05	0.24	0.25	0.22	0.24
O2'	0.04	0.10	0.09	0.28	0.10	0.18	0.09	0.38	0.07	0.06	0.11	0.12	0.12	0.07	0.36	0.04	0.34	0.35	0.28	0.32
O3'	0.12	0.15	0.03	0.18	0.13	0.05	0.11	0.22	0.10	0.11	0.15	0.15	0.17	0.15	0.25	0.13	0.42	0.42	0.33	0.38
O4'	0.04	0.09	0.11	0.26	0.11	0.16	0.11	0.30	0.08	0.07	0.11	0.13	0.11	0.05	0.31	0.04	0.22	0.26	0.17	0.21
O5'	0.07	0.06	0.25	0.41	0.10	0.25	0.11	0.37	0.10	0.07	0.09	0.12	0.06	0.12	0.50	0.07	0.04	0.04	0.06	0.06
OP1	0.09	0.17	0.07	0.19	0.18	0.04	0.15	0.12	0.12	0.12	0.19	0.21	0.19	0.05	0.24	0.09	0.12	0.14	0.11	0.13
OP2	0.15	0.21	0.02	0.14	0.21	0.04	0.18	0.05	0.16	0.17	0.22	0.23	0.22	0.12	0.21	0.17	0.27	0.29	0.24	0.28
P	0.10	0.17	0.07	0.20	0.17	0.04	0.14	0.12	0.11	0.12	0.18	0.20	0.18	0.06	0.27	0.12	0.19	0.20	0.17	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.16	0.18	0.05
C2	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.07	0.05	0.34	0.26	0.03	0.20
C2'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.06	0.03	0.06	0.03	0.03	0.04	0.03	0.00	0.03	0.03	0.23	0.28	0.08	0.15
C3'	0.03	0.08	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.04	0.04	0.06	0.08	0.08	0.09	0.00	0.01	0.01	0.33	0.39	0.08	0.23
C4	0.02	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.06	0.51	0.38	0.21	0.37
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.13	0.33	0.03
C5	0.03	0.01	0.06	0.05	0.00	0.04	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.09	0.07	0.55	0.40	0.21	0.40
C5'	0.05	0.12	0.03	0.04	0.18	0.00	0.18	0.00	0.16	0.12	0.15	0.20	0.10	0.06	0.07	0.01	0.01	0.21	0.46	0.01
C6	0.03	0.01	0.06	0.04	0.00	0.03	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.06	0.06	0.48	0.34	0.05	0.30
N1	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.05	0.34	0.26	0.05	0.19
N3	0.02	0.00	0.03	0.08	0.01	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.06	0.43	0.32	0.12	0.29
N4	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.05	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.07	0.12	0.06	0.54	0.41	0.29	0.41
O2	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02	0.01	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.06	0.03	0.25	0.20	0.07	0.13
O2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.07	0.06	0.06	0.06	0.04	0.04	0.08	0.07	0.07	0.00	0.07	0.11	0.04	0.07	0.25	0.07
O3'	0.01	0.07	0.03	0.01	0.10	0.04	0.09	0.07	0.06	0.05	0.09	0.12	0.06	0.07	0.00	0.03	0.21	0.36	0.14	0.17
O4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.05	0.06	0.06	0.03	0.11	0.03	0.00	0.02	0.06	0.30	0.06
O5'	0.15	0.34	0.23	0.33	0.51	0.02	0.55	0.01	0.48	0.34	0.43	0.54	0.25	0.04	0.21	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.26	0.28	0.39	0.38	0.13	0.40	0.21	0.34	0.26	0.32	0.41	0.20	0.07	0.36	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00
OP2	0.18	0.03	0.08	0.08	0.21	0.33	0.21	0.46	0.05	0.05	0.12	0.29	0.07	0.25	0.14	0.30	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.05	0.20	0.15	0.23	0.37	0.03	0.40	0.01	0.30	0.19	0.29	0.41	0.13	0.07	0.17	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00