Doublet Group distance statistics: 55067

back

Distances from reference structure (by RMSD)

3, 2, 8, 10, 13, 10, 5, 2, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.014 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.010, 0.027, 0.045, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.027 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.026 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C1'	A	0, -0.006, 0.018, 0.041, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.018 std_dev=0.023
C2	A	0, -0.010, 0.015, 0.040, 0.129 max_d=0.129 avg_d=0.015 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.008, 0.039, 0.071, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.039 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.022, 0.084, 0.147, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.084 std_dev=0.063
C2'	A	0, 0.019, 0.109, 0.199, 0.398 max_d=0.398 avg_d=0.109 std_dev=0.090
C4'	A	0, 0.024, 0.131, 0.237, 0.437 max_d=0.437 avg_d=0.131 std_dev=0.106
O2'	A	0, 0.035, 0.155, 0.275, 0.479 max_d=0.479 avg_d=0.155 std_dev=0.120
C3'	A	0, 0.040, 0.165, 0.290, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.165 std_dev=0.125
N3	B	0, 0.153, 0.310, 0.467, 0.793 max_d=0.793 avg_d=0.310 std_dev=0.157
C4	B	0, 0.174, 0.347, 0.520, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.347 std_dev=0.173
C2	B	0, 0.175, 0.356, 0.537, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.356 std_dev=0.181
C5'	A	0, 0.049, 0.233, 0.418, 0.923 max_d=0.923 avg_d=0.233 std_dev=0.185
O3'	A	0, 0.093, 0.279, 0.466, 0.774 max_d=0.774 avg_d=0.279 std_dev=0.186
N9	B	0, 0.241, 0.443, 0.645, 1.041 max_d=1.041 avg_d=0.443 std_dev=0.202
C5	B	0, 0.186, 0.388, 0.591, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.388 std_dev=0.202
N7	B	0, 0.224, 0.442, 0.660, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.442 std_dev=0.218
C8	B	0, 0.258, 0.478, 0.698, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.478 std_dev=0.220
O5'	A	0, 0.052, 0.296, 0.540, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.296 std_dev=0.244
N1	B	0, 0.203, 0.452, 0.702, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.452 std_dev=0.249
C1'	B	0, 0.269, 0.527, 0.785, 1.452 max_d=1.452 avg_d=0.527 std_dev=0.258
C6	B	0, 0.189, 0.451, 0.713, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.451 std_dev=0.262
P	A	0, 0.097, 0.388, 0.679, 1.886 max_d=1.886 avg_d=0.388 std_dev=0.291
C2'	B	0, 0.299, 0.592, 0.886, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.592 std_dev=0.294
O4'	B	0, 0.327, 0.648, 0.969, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.648 std_dev=0.321
C3'	B	0, 0.363, 0.705, 1.047, 2.015 max_d=2.015 avg_d=0.705 std_dev=0.342
N6	B	0, 0.215, 0.571, 0.926, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.571 std_dev=0.356
OP2	A	0, 0.082, 0.453, 0.823, 2.554 max_d=2.554 avg_d=0.453 std_dev=0.371
O2'	B	0, 0.258, 0.632, 1.006, 2.433 max_d=2.433 avg_d=0.632 std_dev=0.374
C4'	B	0, 0.370, 0.748, 1.126, 2.241 max_d=2.241 avg_d=0.748 std_dev=0.378
OP1	A	0, 0.084, 0.476, 0.867, 2.560 max_d=2.560 avg_d=0.476 std_dev=0.391
C5'	B	0, 0.424, 0.842, 1.259, 2.240 max_d=2.240 avg_d=0.842 std_dev=0.417
O3'	B	0, 0.367, 0.816, 1.265, 2.982 max_d=2.982 avg_d=0.816 std_dev=0.449
O5'	B	0, 0.388, 0.949, 1.510, 3.472 max_d=3.472 avg_d=0.949 std_dev=0.561
OP1	B	0, 0.479, 1.041, 1.603, 3.371 max_d=3.371 avg_d=1.041 std_dev=0.562
P	B	0, 0.385, 1.086, 1.787, 4.311 max_d=4.311 avg_d=1.086 std_dev=0.701
OP2	B	0, 0.138, 1.241, 2.345, 7.004 max_d=7.004 avg_d=1.241 std_dev=1.103

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.16	0.10	0.10
C2	0.05	0.00	0.10	0.09	0.02	0.07	0.02	0.08	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.12	0.12	0.05	0.14	0.26	0.21	0.15
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.08	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.07	0.09	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.08	0.09	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.01	0.11	0.08	0.09	0.08
C4	0.02	0.02	0.06	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02	0.13	0.24	0.20	0.13
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.05
C5	0.02	0.02	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02	0.16	0.29	0.25	0.15
C5'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.09	0.09	0.08	0.07	0.10	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.02	0.17	0.32	0.28	0.17
C8	0.01	0.02	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.15	0.26	0.22	0.14
N1	0.04	0.01	0.08	0.08	0.02	0.05	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.10	0.03	0.16	0.29	0.25	0.16
N3	0.05	0.01	0.10	0.09	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.11	0.05	0.12	0.23	0.18	0.13
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.05	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.07	0.03	0.19	0.36	0.32	0.20
N7	0.01	0.02	0.04	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.17	0.32	0.27	0.16
N9	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.11	0.22	0.17	0.12
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.06	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.11	0.12	0.07	0.03	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.07	0.06	0.06
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.06	0.02	0.05	0.02	0.07	0.06	0.10	0.11	0.07	0.07	0.03	0.05	0.00	0.02	0.11	0.15	0.12	0.09
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.05	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.18	0.10	0.13
O5'	0.05	0.14	0.08	0.11	0.13	0.01	0.16	0.01	0.17	0.15	0.16	0.12	0.19	0.17	0.11	0.03	0.11	0.06	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.16	0.26	0.07	0.08	0.24	0.07	0.29	0.07	0.32	0.26	0.29	0.23	0.36	0.32	0.22	0.07	0.15	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.10	0.21	0.09	0.09	0.20	0.07	0.25	0.13	0.28	0.22	0.25	0.18	0.32	0.27	0.17	0.06	0.12	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.07	0.08	0.13	0.05	0.15	0.02	0.17	0.14	0.16	0.13	0.20	0.16	0.12	0.06	0.09	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.16	0.17	0.08	0.16	0.10	0.15	0.14	0.08	0.15	0.08	0.16	0.09	0.08	0.21	0.24	0.12	0.13	0.14	0.12	0.12
C2	0.15	0.15	0.17	0.17	0.14	0.16	0.14	0.16	0.16	0.14	0.17	0.14	0.17	0.14	0.14	0.19	0.21	0.15	0.22	0.19	0.33	0.25
C2'	0.09	0.12	0.13	0.13	0.09	0.12	0.10	0.11	0.13	0.09	0.14	0.09	0.15	0.10	0.08	0.14	0.19	0.10	0.11	0.12	0.12	0.11
C3'	0.08	0.11	0.13	0.14	0.07	0.10	0.09	0.10	0.11	0.07	0.13	0.08	0.13	0.08	0.07	0.15	0.21	0.09	0.10	0.12	0.14	0.10
C4	0.11	0.12	0.17	0.17	0.09	0.15	0.10	0.14	0.13	0.09	0.14	0.09	0.15	0.09	0.09	0.21	0.23	0.11	0.13	0.13	0.16	0.14
C4'	0.09	0.11	0.16	0.18	0.07	0.14	0.09	0.14	0.12	0.07	0.14	0.08	0.15	0.08	0.07	0.20	0.26	0.10	0.12	0.13	0.17	0.12
C5	0.11	0.11	0.18	0.18	0.07	0.15	0.09	0.14	0.12	0.08	0.13	0.08	0.14	0.08	0.08	0.23	0.24	0.11	0.12	0.13	0.14	0.13
C5'	0.10	0.12	0.19	0.21	0.08	0.16	0.09	0.16	0.12	0.08	0.14	0.09	0.14	0.08	0.08	0.23	0.31	0.10	0.14	0.15	0.24	0.14
C6	0.12	0.11	0.17	0.17	0.08	0.15	0.09	0.13	0.11	0.09	0.13	0.08	0.13	0.08	0.09	0.22	0.22	0.12	0.16	0.15	0.22	0.17
C8	0.12	0.11	0.19	0.20	0.07	0.18	0.09	0.17	0.12	0.08	0.14	0.08	0.14	0.08	0.08	0.25	0.28	0.13	0.15	0.15	0.17	0.14
N1	0.15	0.13	0.17	0.17	0.12	0.16	0.12	0.15	0.13	0.13	0.14	0.12	0.14	0.12	0.13	0.20	0.20	0.14	0.22	0.19	0.33	0.25
N3	0.13	0.14	0.17	0.17	0.13	0.15	0.13	0.14	0.15	0.12	0.17	0.13	0.17	0.13	0.13	0.19	0.22	0.13	0.18	0.16	0.25	0.20
N6	0.11	0.15	0.19	0.18	0.08	0.15	0.10	0.13	0.13	0.09	0.16	0.10	0.14	0.09	0.09	0.25	0.24	0.11	0.16	0.15	0.22	0.17
N7	0.12	0.12	0.20	0.21	0.08	0.18	0.09	0.17	0.12	0.09	0.14	0.09	0.14	0.09	0.09	0.26	0.29	0.12	0.14	0.15	0.15	0.13
N9	0.11	0.11	0.17	0.18	0.07	0.16	0.09	0.15	0.13	0.08	0.14	0.08	0.15	0.08	0.08	0.22	0.25	0.12	0.13	0.14	0.12	0.12
O2'	0.11	0.13	0.14	0.14	0.11	0.12	0.13	0.12	0.16	0.11	0.16	0.11	0.18	0.12	0.10	0.15	0.19	0.11	0.12	0.13	0.13	0.12
O3'	0.09	0.11	0.12	0.13	0.08	0.10	0.09	0.10	0.12	0.08	0.13	0.08	0.14	0.08	0.08	0.12	0.19	0.09	0.11	0.11	0.14	0.11
O4'	0.12	0.12	0.19	0.20	0.07	0.18	0.09	0.18	0.13	0.08	0.15	0.08	0.16	0.08	0.08	0.24	0.28	0.13	0.15	0.16	0.16	0.14
O5'	0.19	0.18	0.26	0.27	0.17	0.22	0.16	0.22	0.16	0.18	0.17	0.18	0.16	0.16	0.18	0.28	0.35	0.19	0.28	0.28	0.39	0.29
OP1	0.38	0.30	0.49	0.53	0.33	0.46	0.32	0.46	0.31	0.36	0.30	0.33	0.30	0.34	0.36	0.53	0.64	0.37	0.43	0.46	0.49	0.42
OP2	0.35	0.31	0.28	0.25	0.33	0.31	0.31	0.31	0.30	0.34	0.30	0.33	0.29	0.32	0.34	0.27	0.23	0.38	0.49	0.41	0.70	0.52
P	0.21	0.19	0.28	0.30	0.18	0.25	0.17	0.26	0.17	0.19	0.18	0.19	0.17	0.17	0.19	0.31	0.40	0.21	0.34	0.33	0.49	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.13	0.07	0.23	0.14
C2	0.02	0.00	0.07	0.10	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.03	0.25	0.15	0.49	0.29
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.08	0.05	0.08	0.06	0.09	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.12	0.09	0.19	0.11
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.13	0.08	0.12	0.08	0.15	0.11	0.06	0.01	0.01	0.01	0.16	0.12	0.19	0.12
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.02	0.27	0.15	0.51	0.31
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.09	0.08	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.05	0.05	0.02
C5	0.01	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.02	0.34	0.21	0.67	0.40
C5'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.11	0.11	0.10	0.05	0.14	0.13	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.16	0.02	0.35	0.22	0.71	0.42
C8	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.07	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.09	0.03	0.36	0.19	0.63	0.40
N1	0.02	0.00	0.08	0.12	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.03	0.30	0.19	0.62	0.36
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.10	0.03	0.22	0.12	0.42	0.25
N6	0.02	0.01	0.09	0.15	0.01	0.09	0.01	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.08	0.19	0.03	0.38	0.26	0.81	0.47
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.06	0.13	0.03	0.39	0.24	0.76	0.46
N9	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.26	0.13	0.45	0.28
O2'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.03	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.06	0.02	0.00	0.05	0.03	0.07	0.08	0.09	0.07
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.09	0.01	0.13	0.02	0.16	0.09	0.15	0.10	0.19	0.13	0.06	0.05	0.00	0.01	0.12	0.16	0.13	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.10	0.08	0.16	0.11
O5'	0.13	0.25	0.12	0.16	0.27	0.01	0.34	0.01	0.35	0.36	0.30	0.22	0.38	0.39	0.26	0.07	0.12	0.10	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.07	0.15	0.09	0.12	0.15	0.05	0.21	0.06	0.22	0.19	0.19	0.12	0.26	0.24	0.13	0.08	0.16	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.49	0.19	0.19	0.51	0.05	0.67	0.02	0.71	0.63	0.62	0.42	0.81	0.76	0.45	0.09	0.13	0.16	0.03	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.29	0.11	0.12	0.31	0.02	0.40	0.01	0.42	0.40	0.36	0.25	0.47	0.46	0.28	0.07	0.12	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00