Doublet Group distance statistics: 55070

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 12, 11, 5, 7, 6, 9, 2, 7, 19, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.009, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.009, 0.017, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.009, 0.018, 0.028, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.008, 0.018, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N7	A	0, 0.008, 0.026, 0.043, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.009, 0.029, 0.050, 0.106 max_d=0.106 avg_d=0.029 std_dev=0.020
C8	A	0, 0.011, 0.032, 0.053, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C2	B	0, 0.186, 0.353, 0.519, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.353 std_dev=0.167
N3	B	0, 0.238, 0.410, 0.583, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.410 std_dev=0.173
N1	B	0, 0.200, 0.414, 0.629, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.414 std_dev=0.214
N2	B	0, 0.230, 0.446, 0.662, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.446 std_dev=0.216
C6	B	0, 0.322, 0.589, 0.856, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.589 std_dev=0.267
O6	B	0, 0.354, 0.673, 0.991, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.673 std_dev=0.319
C4	B	0, 0.284, 0.612, 0.940, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.612 std_dev=0.328
C5	B	0, 0.336, 0.711, 1.086, 1.364 max_d=1.364 avg_d=0.711 std_dev=0.375
N9	B	0, 0.263, 0.804, 1.344, 2.150 max_d=2.150 avg_d=0.804 std_dev=0.540
N7	B	0, 0.350, 0.949, 1.547, 2.046 max_d=2.046 avg_d=0.949 std_dev=0.599
C1'	B	0, 0.226, 0.828, 1.429, 2.598 max_d=2.598 avg_d=0.828 std_dev=0.602
O2'	B	0, 0.256, 0.902, 1.548, 3.087 max_d=3.087 avg_d=0.902 std_dev=0.646
C2'	B	0, 0.205, 0.854, 1.502, 2.873 max_d=2.873 avg_d=0.854 std_dev=0.648
O4'	B	0, 0.228, 0.920, 1.612, 3.095 max_d=3.095 avg_d=0.920 std_dev=0.692
C8	B	0, 0.301, 0.998, 1.694, 2.562 max_d=2.562 avg_d=0.998 std_dev=0.697
C3'	B	0, 0.242, 0.983, 1.725, 3.351 max_d=3.351 avg_d=0.983 std_dev=0.742
C4'	B	0, 0.255, 1.023, 1.790, 3.559 max_d=3.559 avg_d=1.023 std_dev=0.768
O3'	B	0, 0.294, 1.076, 1.859, 3.757 max_d=3.757 avg_d=1.076 std_dev=0.783
C5'	B	0, 0.354, 1.217, 2.080, 3.990 max_d=3.990 avg_d=1.217 std_dev=0.863
O5'	B	0, 0.364, 1.268, 2.172, 3.916 max_d=3.916 avg_d=1.268 std_dev=0.904
OP1	B	0, 0.608, 1.550, 2.491, 4.856 max_d=4.856 avg_d=1.550 std_dev=0.941
P	B	0, 0.499, 1.447, 2.394, 3.909 max_d=3.909 avg_d=1.447 std_dev=0.947
O4'	A	0, 0.009, 0.970, 1.931, 2.364 max_d=2.364 avg_d=0.970 std_dev=0.961
C2'	A	0, 0.007, 1.011, 2.014, 2.492 max_d=2.492 avg_d=1.011 std_dev=1.003
OP2	B	0, 0.452, 1.579, 2.707, 4.889 max_d=4.889 avg_d=1.579 std_dev=1.128
C4'	A	0, 0.107, 1.267, 2.426, 2.969 max_d=2.969 avg_d=1.267 std_dev=1.160
C3'	A	0, 0.076, 1.488, 2.901, 3.506 max_d=3.506 avg_d=1.488 std_dev=1.413
O2'	A	0, -0.126, 1.454, 3.033, 3.789 max_d=3.789 avg_d=1.454 std_dev=1.579
O3'	A	0, 0.202, 1.889, 3.576, 4.304 max_d=4.304 avg_d=1.889 std_dev=1.687
C5'	A	0, 0.080, 2.425, 4.770, 5.778 max_d=5.778 avg_d=2.425 std_dev=2.345
O5'	A	0, -0.024, 3.020, 6.064, 7.372 max_d=7.372 avg_d=3.020 std_dev=3.044
P	A	0, 0.588, 4.199, 7.811, 9.244 max_d=9.244 avg_d=4.199 std_dev=3.612
OP2	A	0, 0.855, 4.665, 8.475, 9.997 max_d=9.997 avg_d=4.665 std_dev=3.810
OP1	A	0, 0.441, 5.121, 9.801, 11.697 max_d=11.697 avg_d=5.121 std_dev=4.680

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.27	0.01	0.42	0.47	0.38	0.34
C2	0.03	0.00	0.24	0.35	0.01	0.61	0.01	1.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.30	0.52	0.46	0.60	0.91	0.40
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.13	0.01	0.07	0.16	0.12	0.09	0.19	0.24	0.09	0.05	0.02	0.00	0.02	0.03	0.13	0.15	0.16	0.15
C3'	0.01	0.35	0.00	0.00	0.12	0.01	0.25	0.02	0.18	0.54	0.20	0.36	0.26	0.49	0.23	0.02	0.01	0.02	0.11	0.15	0.27	0.20
C4	0.01	0.01	0.13	0.12	0.00	0.23	0.00	0.44	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.21	0.16	0.28	0.41	0.80	0.57	0.44
C4'	0.02	0.61	0.01	0.01	0.23	0.00	0.05	0.01	0.16	0.47	0.42	0.61	0.07	0.35	0.09	0.30	0.02	0.00	0.02	0.19	0.32	0.13
C5	0.01	0.01	0.07	0.25	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.35	0.12	0.12	0.92	1.46	1.07	1.05
C5'	0.04	1.17	0.16	0.02	0.44	0.01	0.13	0.00	0.37	0.74	0.84	1.10	0.19	0.56	0.11	0.13	0.19	0.02	0.01	0.38	0.42	0.02
C6	0.01	0.01	0.12	0.18	0.01	0.16	0.01	0.37	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.33	0.17	0.23	0.65	1.29	0.89	0.81
C8	0.01	0.01	0.09	0.54	0.01	0.47	0.01	0.74	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.41	0.15	0.29	1.70	2.06	1.74	1.76
N1	0.02	0.00	0.19	0.20	0.01	0.42	0.01	0.84	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.23	0.40	0.19	0.76	0.68	0.20
N3	0.03	0.00	0.24	0.36	0.00	0.61	0.01	1.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.31	0.53	0.43	0.51	0.81	0.39
N6	0.02	0.01	0.09	0.26	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.40	0.19	0.15	0.94	1.71	1.22	1.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.49	0.01	0.35	0.00	0.56	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.44	0.18	0.16	1.63	2.22	1.83	1.81
N9	0.01	0.01	0.02	0.23	0.00	0.09	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.24	0.08	0.01	0.86	1.09	0.82	0.85
O2'	0.01	0.17	0.00	0.02	0.21	0.30	0.35	0.13	0.33	0.41	0.23	0.15	0.40	0.44	0.24	0.00	0.05	0.20	0.16	0.16	0.28	0.17
O3'	0.27	0.30	0.02	0.01	0.16	0.02	0.12	0.19	0.17	0.15	0.23	0.31	0.19	0.18	0.08	0.05	0.00	0.15	0.13	0.32	0.52	0.27
O4'	0.01	0.52	0.03	0.02	0.28	0.00	0.12	0.02	0.23	0.29	0.40	0.53	0.15	0.16	0.01	0.20	0.15	0.00	0.42	0.44	0.28	0.29
O5'	0.42	0.46	0.13	0.11	0.41	0.02	0.92	0.01	0.65	1.70	0.19	0.43	0.94	1.63	0.86	0.16	0.13	0.42	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.47	0.60	0.15	0.15	0.80	0.19	1.46	0.38	1.29	2.06	0.76	0.51	1.71	2.22	1.09	0.16	0.32	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.38	0.91	0.16	0.27	0.57	0.32	1.07	0.42	0.89	1.74	0.68	0.81	1.22	1.83	0.82	0.28	0.52	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.34	0.40	0.15	0.20	0.44	0.13	1.05	0.02	0.81	1.76	0.20	0.39	1.18	1.81	0.85	0.17	0.27	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.12	0.18	0.19	0.14	0.27	0.14	0.29	0.13	0.18	0.13	0.14	0.12	0.16	0.18	0.20	0.18	0.27	0.25	0.14	0.35	0.26	0.32
C2	0.15	0.12	0.15	0.15	0.13	0.16	0.13	0.16	0.14	0.15	0.13	0.15	0.12	0.14	0.14	0.14	0.18	0.20	0.16	0.15	0.18	0.17	0.17
C2'	0.41	0.26	0.22	0.22	0.37	0.39	0.38	0.43	0.34	0.45	0.28	0.18	0.30	0.44	0.41	0.22	0.19	0.50	0.41	0.36	0.39	0.47	0.47
C3'	0.25	0.26	0.35	0.42	0.25	0.35	0.28	0.34	0.32	0.25	0.31	0.25	0.23	0.28	0.24	0.47	0.62	0.29	0.28	0.37	0.40	0.22	0.29
C4	0.19	0.12	0.16	0.16	0.14	0.22	0.13	0.23	0.13	0.16	0.12	0.13	0.12	0.15	0.16	0.18	0.17	0.24	0.20	0.13	0.27	0.19	0.25
C4'	0.20	0.52	0.19	0.27	0.35	0.33	0.42	0.35	0.55	0.27	0.59	0.59	0.38	0.36	0.25	0.30	0.40	0.25	0.27	0.61	0.44	0.24	0.32
C5	0.19	0.12	0.17	0.17	0.14	0.23	0.14	0.24	0.13	0.17	0.12	0.13	0.13	0.15	0.17	0.18	0.17	0.25	0.21	0.13	0.28	0.19	0.26
C5'	0.24	1.02	0.28	0.42	0.63	0.51	0.78	0.55	1.04	0.42	1.16	1.20	0.73	0.63	0.39	0.47	0.64	0.33	0.38	1.16	0.60	0.28	0.41
C6	0.17	0.13	0.16	0.15	0.14	0.18	0.13	0.19	0.13	0.15	0.13	0.14	0.13	0.14	0.15	0.16	0.17	0.22	0.17	0.13	0.21	0.15	0.20
C8	0.21	0.12	0.19	0.21	0.15	0.29	0.14	0.32	0.13	0.19	0.12	0.13	0.13	0.16	0.18	0.21	0.21	0.28	0.27	0.13	0.38	0.27	0.34
N1	0.14	0.12	0.15	0.15	0.12	0.14	0.13	0.14	0.13	0.13	0.13	0.13	0.12	0.13	0.13	0.14	0.18	0.18	0.15	0.13	0.17	0.15	0.15
N3	0.17	0.12	0.15	0.15	0.13	0.19	0.13	0.20	0.13	0.16	0.13	0.14	0.12	0.15	0.15	0.16	0.17	0.22	0.18	0.15	0.22	0.18	0.21
N6	0.20	0.14	0.16	0.15	0.15	0.20	0.15	0.20	0.14	0.18	0.14	0.16	0.14	0.16	0.18	0.15	0.16	0.25	0.19	0.14	0.21	0.15	0.21
N7	0.22	0.13	0.19	0.21	0.15	0.28	0.15	0.30	0.13	0.19	0.13	0.14	0.14	0.17	0.18	0.21	0.20	0.28	0.26	0.13	0.35	0.25	0.32
N9	0.20	0.12	0.18	0.19	0.14	0.26	0.14	0.28	0.13	0.18	0.13	0.13	0.13	0.16	0.17	0.20	0.18	0.27	0.24	0.13	0.33	0.24	0.30
O2'	0.88	0.32	0.66	0.71	0.62	0.97	0.61	1.04	0.46	0.84	0.32	0.19	0.48	0.75	0.79	0.68	0.58	1.05	0.97	0.44	0.95	1.01	1.04
O3'	0.32	0.28	0.26	0.29	0.31	0.30	0.33	0.32	0.32	0.35	0.29	0.26	0.28	0.35	0.32	0.33	0.45	0.38	0.30	0.34	0.30	0.31	0.33
O4'	0.18	0.47	0.18	0.18	0.31	0.27	0.36	0.30	0.46	0.23	0.51	0.54	0.35	0.30	0.23	0.19	0.21	0.23	0.24	0.50	0.41	0.25	0.33
O5'	1.12	0.28	1.34	1.55	0.47	1.63	0.33	1.66	0.29	0.75	0.40	0.45	0.36	0.48	0.78	1.60	1.85	1.34	1.43	0.40	1.71	1.13	1.43
OP1	2.13	0.80	2.42	2.74	1.31	2.84	1.15	2.92	0.87	1.72	0.78	0.70	1.11	1.40	1.73	2.70	3.14	2.43	2.64	0.83	3.01	2.33	2.66
OP2	1.62	0.89	1.76	2.02	0.94	2.23	0.87	2.31	0.91	1.24	1.01	1.09	0.84	1.00	1.25	2.05	2.32	1.94	2.00	1.00	2.34	1.69	2.03
P	1.54	0.18	1.76	2.04	0.71	2.17	0.51	2.24	0.19	1.12	0.26	0.37	0.52	0.78	1.13	2.05	2.38	1.83	1.96	0.23	2.30	1.65	1.98

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.02	0.09	0.09	0.05
C2	0.02	0.00	0.13	0.15	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.04	0.19	0.01	0.18	0.24	0.14
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.10	0.16	0.13	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.08	0.05	0.13	0.11	0.06
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.10	0.00	0.08	0.01	0.10	0.07	0.14	0.18	0.14	0.06	0.04	0.02	0.01	0.02	0.09	0.09	0.16	0.13	0.08
C4	0.01	0.01	0.07	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.19	0.01	0.17	0.22	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.05	0.04	0.07	0.04	0.05	0.02	0.00	0.01	0.07	0.09	0.06	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.02	0.23	0.01	0.23	0.29	0.21
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.11	0.11	0.09	0.05	0.05	0.13	0.07	0.05	0.03	0.01	0.01	0.13	0.12	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.13	0.02	0.24	0.00	0.25	0.32	0.23
C8	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.07	0.05	0.23	0.02	0.21	0.25	0.20
N1	0.02	0.00	0.10	0.14	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.18	0.03	0.22	0.01	0.22	0.29	0.19
N2	0.02	0.01	0.16	0.18	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.24	0.06	0.17	0.02	0.17	0.23	0.12
N3	0.02	0.00	0.13	0.14	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.18	0.04	0.17	0.01	0.15	0.20	0.11
N7	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04	0.25	0.02	0.26	0.32	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.18	0.02	0.14	0.18	0.12
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.05	0.08	0.12	0.10	0.05	0.03	0.00	0.05	0.04	0.04	0.07	0.15	0.07	0.07
O3'	0.01	0.20	0.02	0.01	0.12	0.02	0.10	0.03	0.13	0.07	0.18	0.24	0.18	0.07	0.05	0.05	0.00	0.01	0.08	0.12	0.20	0.14	0.10
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.10	0.03	0.10	0.12	0.09
O5'	0.10	0.19	0.08	0.09	0.19	0.01	0.23	0.01	0.24	0.23	0.22	0.17	0.17	0.25	0.18	0.04	0.08	0.10	0.00	0.26	0.02	0.02	0.00
O6	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.07	0.12	0.03	0.26	0.00	0.29	0.37	0.27
OP1	0.09	0.18	0.13	0.16	0.17	0.09	0.23	0.12	0.25	0.21	0.22	0.17	0.15	0.26	0.14	0.15	0.20	0.10	0.02	0.29	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.24	0.11	0.13	0.22	0.06	0.29	0.07	0.32	0.25	0.29	0.23	0.20	0.32	0.18	0.07	0.14	0.12	0.02	0.37	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.14	0.06	0.08	0.14	0.05	0.21	0.02	0.23	0.20	0.19	0.12	0.11	0.25	0.12	0.07	0.10	0.09	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00