Doublet Group distance statistics: 55072

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 7, 1, 3, 1, 3, 5, 4, 1, 2, 6, 3, 3, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.019, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.017, 0.030, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.007, 0.021, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.021 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.004, 0.024, 0.043, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.024 std_dev=0.020
N3	A	0, 0.000, 0.023, 0.045, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C1'	A	0, 0.000, 0.023, 0.046, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.023 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.013, 0.036, 0.059, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.036 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.004, 0.027, 0.051, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.027 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.009, 0.034, 0.060, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.034 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.013, 0.042, 0.072, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.042 std_dev=0.029
C1'	B	0, 0.148, 0.430, 0.713, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.430 std_dev=0.283
N3	B	0, 0.155, 0.467, 0.778, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.467 std_dev=0.311
N9	B	0, 0.202, 0.539, 0.876, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.539 std_dev=0.337
C2'	B	0, 0.128, 0.496, 0.865, 1.659 max_d=1.659 avg_d=0.496 std_dev=0.368
C4	B	0, 0.196, 0.578, 0.960, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.578 std_dev=0.382
N2	B	0, 0.198, 0.584, 0.971, 1.727 max_d=1.727 avg_d=0.584 std_dev=0.387
O2'	B	0, 0.169, 0.558, 0.946, 1.635 max_d=1.635 avg_d=0.558 std_dev=0.388
O4'	B	0, 0.177, 0.575, 0.973, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.575 std_dev=0.398
C2	B	0, 0.192, 0.609, 1.026, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.609 std_dev=0.417
C8	B	0, 0.251, 0.716, 1.180, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.716 std_dev=0.465
C4'	B	0, 0.127, 0.644, 1.161, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.644 std_dev=0.517
C3'	B	0, 0.147, 0.669, 1.191, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.669 std_dev=0.522
C5	B	0, 0.244, 0.799, 1.354, 1.703 max_d=1.703 avg_d=0.799 std_dev=0.555
N1	B	0, 0.257, 0.841, 1.424, 1.866 max_d=1.866 avg_d=0.841 std_dev=0.583
N7	B	0, 0.272, 0.872, 1.472, 2.005 max_d=2.005 avg_d=0.872 std_dev=0.600
C6	B	0, 0.276, 0.949, 1.622, 1.964 max_d=1.964 avg_d=0.949 std_dev=0.673
C5'	B	0, 0.092, 0.787, 1.482, 3.869 max_d=3.869 avg_d=0.787 std_dev=0.695
O3'	B	0, 0.212, 0.911, 1.609, 3.188 max_d=3.188 avg_d=0.911 std_dev=0.698
O5'	B	0, 0.064, 0.802, 1.540, 4.117 max_d=4.117 avg_d=0.802 std_dev=0.738
O4'	A	0, -0.075, 0.669, 1.414, 2.126 max_d=2.126 avg_d=0.669 std_dev=0.744
C2'	A	0, -0.106, 0.703, 1.511, 2.274 max_d=2.274 avg_d=0.703 std_dev=0.808
P	B	0, 0.141, 0.978, 1.815, 4.752 max_d=4.752 avg_d=0.978 std_dev=0.837
O6	B	0, 0.332, 1.174, 2.015, 2.466 max_d=2.466 avg_d=1.174 std_dev=0.841
OP2	B	0, 0.165, 1.029, 1.892, 4.602 max_d=4.602 avg_d=1.029 std_dev=0.864
OP1	B	0, 0.192, 1.129, 2.066, 5.255 max_d=5.255 avg_d=1.129 std_dev=0.937
O2'	A	0, -0.152, 0.884, 1.921, 2.762 max_d=2.762 avg_d=0.884 std_dev=1.037
C4'	A	0, -0.089, 0.989, 2.066, 3.018 max_d=3.018 avg_d=0.989 std_dev=1.078
C3'	A	0, -0.137, 1.076, 2.289, 3.510 max_d=3.510 avg_d=1.076 std_dev=1.213
O3'	A	0, -0.190, 1.503, 3.196, 5.045 max_d=5.045 avg_d=1.503 std_dev=1.693
C5'	A	0, -0.140, 1.665, 3.471, 5.338 max_d=5.338 avg_d=1.665 std_dev=1.806
O5'	A	0, -0.154, 1.658, 3.470, 5.519 max_d=5.519 avg_d=1.658 std_dev=1.812
P	A	0, 0.009, 2.347, 4.684, 7.053 max_d=7.053 avg_d=2.347 std_dev=2.338
OP1	A	0, 0.180, 2.773, 5.366, 9.113 max_d=9.113 avg_d=2.773 std_dev=2.593
OP2	A	0, -0.157, 2.845, 5.847, 9.257 max_d=9.257 avg_d=2.845 std_dev=3.002

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.21	0.01	0.22	0.26	0.35	0.20
C2	0.05	0.00	0.35	0.68	0.01	0.54	0.01	0.81	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.17	0.59	0.35	0.51	0.94	0.79	0.73
C2'	0.01	0.35	0.00	0.00	0.18	0.01	0.08	0.15	0.15	0.19	0.27	0.36	0.11	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01	0.40	0.36	0.51	0.38
C3'	0.01	0.68	0.00	0.00	0.35	0.01	0.28	0.02	0.37	0.36	0.55	0.67	0.34	0.31	0.16	0.02	0.01	0.02	0.31	0.45	0.26	0.29
C4	0.03	0.01	0.18	0.35	0.00	0.24	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.22	0.19	0.37	0.76	0.58	0.39
C4'	0.01	0.54	0.01	0.01	0.24	0.00	0.12	0.01	0.21	0.35	0.40	0.53	0.16	0.26	0.08	0.20	0.02	0.00	0.02	0.22	0.21	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.28	0.01	0.12	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.12	0.08	0.60	1.05	0.89	0.56
C5'	0.06	0.81	0.15	0.02	0.32	0.01	0.19	0.00	0.32	0.56	0.61	0.75	0.25	0.45	0.13	0.06	0.15	0.02	0.01	0.38	0.40	0.02
C6	0.03	0.01	0.15	0.37	0.01	0.21	0.01	0.32	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.17	0.23	0.15	0.53	1.14	0.83	0.56
C8	0.02	0.02	0.19	0.36	0.01	0.35	0.01	0.56	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.30	0.33	0.22	0.97	1.06	1.30	0.91
N1	0.04	0.01	0.27	0.55	0.01	0.40	0.01	0.61	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.13	0.44	0.27	0.46	1.05	0.74	0.62
N3	0.05	0.01	0.36	0.67	0.01	0.53	0.01	0.75	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.18	0.55	0.35	0.45	0.78	0.67	0.63
N6	0.02	0.02	0.11	0.34	0.02	0.16	0.01	0.25	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.21	0.20	0.10	0.66	1.33	1.03	0.67
N7	0.01	0.02	0.11	0.31	0.01	0.26	0.01	0.45	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.30	0.26	0.12	0.94	1.28	1.36	0.92
N9	0.00	0.02	0.02	0.16	0.01	0.08	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.09	0.01	0.48	0.63	0.68	0.40
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.10	0.20	0.19	0.06	0.17	0.30	0.13	0.18	0.21	0.30	0.14	0.00	0.06	0.15	0.25	0.24	0.45	0.29
O3'	0.21	0.59	0.02	0.01	0.22	0.02	0.12	0.15	0.23	0.33	0.44	0.55	0.20	0.26	0.09	0.06	0.00	0.15	0.26	0.63	0.33	0.37
O4'	0.01	0.35	0.01	0.02	0.19	0.00	0.08	0.02	0.15	0.22	0.27	0.35	0.10	0.12	0.01	0.15	0.15	0.00	0.16	0.23	0.22	0.19
O5'	0.22	0.51	0.40	0.31	0.37	0.02	0.60	0.01	0.53	0.97	0.46	0.45	0.66	0.94	0.48	0.25	0.26	0.16	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.94	0.36	0.45	0.76	0.22	1.05	0.38	1.14	1.06	1.05	0.78	1.33	1.28	0.63	0.24	0.63	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.35	0.79	0.51	0.26	0.58	0.21	0.89	0.40	0.83	1.30	0.74	0.67	1.03	1.36	0.68	0.45	0.33	0.22	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.73	0.38	0.29	0.39	0.04	0.56	0.02	0.56	0.91	0.62	0.63	0.67	0.92	0.40	0.29	0.37	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.24	0.26	0.10	0.17	0.11	0.19	0.12	0.11	0.13	0.15	0.10	0.11	0.10	0.25	0.38	0.17	0.19	0.13	0.22	0.22	0.19
C2	0.16	0.15	0.24	0.23	0.14	0.21	0.14	0.23	0.15	0.14	0.15	0.16	0.15	0.14	0.15	0.26	0.28	0.23	0.24	0.15	0.25	0.28	0.26
C2'	0.14	0.32	0.34	0.39	0.20	0.25	0.23	0.26	0.30	0.16	0.34	0.38	0.23	0.20	0.15	0.35	0.56	0.18	0.25	0.33	0.32	0.27	0.24
C3'	0.32	0.58	0.50	0.57	0.43	0.44	0.48	0.45	0.58	0.38	0.62	0.66	0.47	0.44	0.36	0.49	0.73	0.32	0.45	0.62	0.52	0.48	0.44
C4	0.12	0.12	0.23	0.24	0.10	0.18	0.11	0.20	0.12	0.11	0.12	0.14	0.10	0.11	0.11	0.26	0.32	0.18	0.20	0.12	0.22	0.23	0.20
C4'	0.17	0.39	0.37	0.46	0.24	0.35	0.30	0.38	0.39	0.20	0.44	0.47	0.27	0.26	0.18	0.37	0.62	0.22	0.36	0.43	0.45	0.38	0.36
C5	0.12	0.11	0.24	0.24	0.09	0.18	0.10	0.19	0.11	0.10	0.11	0.13	0.09	0.10	0.10	0.27	0.32	0.17	0.19	0.12	0.21	0.22	0.19
C5'	0.31	0.60	0.52	0.66	0.39	0.59	0.47	0.64	0.61	0.34	0.68	0.72	0.43	0.41	0.31	0.54	0.86	0.41	0.57	0.68	0.71	0.56	0.59
C6	0.14	0.10	0.24	0.23	0.10	0.19	0.10	0.20	0.10	0.11	0.11	0.13	0.10	0.10	0.11	0.28	0.28	0.19	0.21	0.10	0.22	0.24	0.22
C8	0.11	0.12	0.24	0.28	0.10	0.17	0.11	0.18	0.13	0.11	0.13	0.14	0.10	0.12	0.10	0.26	0.40	0.16	0.18	0.14	0.21	0.21	0.18
N1	0.17	0.12	0.24	0.22	0.13	0.21	0.12	0.23	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.13	0.15	0.26	0.27	0.23	0.24	0.12	0.25	0.28	0.25
N3	0.14	0.14	0.24	0.23	0.13	0.19	0.13	0.22	0.14	0.13	0.15	0.16	0.13	0.13	0.13	0.26	0.30	0.21	0.23	0.14	0.24	0.26	0.23
N6	0.14	0.12	0.24	0.22	0.09	0.19	0.09	0.19	0.10	0.10	0.11	0.15	0.10	0.09	0.10	0.28	0.27	0.19	0.20	0.10	0.22	0.23	0.21
N7	0.11	0.12	0.25	0.27	0.11	0.16	0.12	0.17	0.13	0.11	0.13	0.14	0.11	0.12	0.11	0.27	0.39	0.16	0.18	0.14	0.20	0.20	0.18
N9	0.11	0.12	0.24	0.25	0.10	0.17	0.10	0.19	0.12	0.10	0.12	0.14	0.10	0.11	0.10	0.26	0.36	0.17	0.19	0.13	0.21	0.21	0.19
O2'	0.34	0.26	0.51	0.57	0.30	0.43	0.32	0.44	0.32	0.36	0.29	0.25	0.25	0.35	0.33	0.52	0.72	0.36	0.44	0.34	0.51	0.46	0.44
O3'	0.28	0.50	0.53	0.64	0.36	0.47	0.43	0.49	0.53	0.35	0.57	0.57	0.37	0.41	0.31	0.53	0.85	0.28	0.48	0.59	0.60	0.51	0.47
O4'	0.10	0.23	0.24	0.29	0.14	0.21	0.17	0.24	0.22	0.11	0.25	0.28	0.16	0.14	0.10	0.25	0.43	0.18	0.22	0.25	0.28	0.24	0.23
O5'	0.88	0.66	1.03	1.17	0.73	1.15	0.73	1.21	0.72	0.82	0.70	0.65	0.67	0.78	0.80	1.05	1.31	0.99	1.13	0.75	1.24	1.08	1.15
OP1	1.62	1.42	1.84	2.00	1.55	1.87	1.60	1.93	1.57	1.68	1.50	1.32	1.45	1.67	1.62	1.78	2.17	1.67	1.93	1.61	1.96	1.94	1.93
OP2	1.45	0.93	1.46	1.67	1.07	1.87	1.04	1.98	0.99	1.26	0.97	0.92	0.98	1.14	1.25	1.60	1.82	1.70	1.76	1.02	1.99	1.59	1.82
P	0.95	0.82	1.10	1.29	0.82	1.29	0.86	1.38	0.91	0.91	0.91	0.85	0.77	0.89	0.87	1.11	1.47	1.10	1.28	0.97	1.42	1.22	1.30

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.13	0.09
C2	0.04	0.00	0.17	0.17	0.01	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.14	0.23	0.11	0.13	0.01	0.15	0.19	0.14
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.09	0.02	0.05	0.01	0.09	0.08	0.14	0.20	0.16	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.08	0.13	0.11	0.06
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.10	0.01	0.10	0.01	0.13	0.10	0.16	0.20	0.15	0.09	0.05	0.02	0.01	0.02	0.07	0.13	0.16	0.09	0.08
C4	0.02	0.01	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.13	0.06	0.11	0.01	0.12	0.18	0.13
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.05	0.08	0.06	0.07	0.04	0.06	0.02	0.00	0.02	0.06	0.09	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.12	0.04	0.12	0.02	0.14	0.21	0.16
C5'	0.02	0.09	0.01	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.09	0.11	0.08	0.12	0.06	0.06	0.03	0.02	0.01	0.10	0.09	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.13	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.17	0.06	0.13	0.01	0.15	0.21	0.16
C8	0.01	0.01	0.08	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.07	0.11	0.06	0.14	0.02	0.15	0.21	0.17
N1	0.03	0.01	0.14	0.16	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.11	0.22	0.09	0.13	0.01	0.15	0.20	0.15
N2	0.04	0.01	0.20	0.20	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.18	0.27	0.14	0.14	0.02	0.16	0.19	0.15
N3	0.03	0.01	0.16	0.15	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.19	0.11	0.12	0.02	0.13	0.17	0.13
N7	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.10	0.03	0.14	0.02	0.17	0.23	0.19
N9	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.10	0.02	0.11	0.17	0.13
O2'	0.01	0.14	0.01	0.02	0.06	0.06	0.04	0.06	0.07	0.07	0.11	0.18	0.13	0.05	0.02	0.00	0.04	0.04	0.04	0.06	0.15	0.08	0.05
O3'	0.02	0.23	0.02	0.01	0.13	0.02	0.12	0.03	0.17	0.11	0.22	0.27	0.19	0.10	0.05	0.04	0.00	0.02	0.12	0.18	0.23	0.14	0.14
O4'	0.01	0.11	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.02	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.03	0.01	0.04	0.02	0.00	0.10	0.05	0.12	0.13	0.11
O5'	0.07	0.13	0.05	0.07	0.11	0.02	0.12	0.01	0.13	0.14	0.13	0.14	0.12	0.14	0.10	0.04	0.12	0.10	0.00	0.14	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.06	0.02	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.18	0.05	0.14	0.00	0.17	0.23	0.18
OP1	0.10	0.15	0.13	0.16	0.12	0.09	0.14	0.09	0.15	0.15	0.15	0.16	0.13	0.17	0.11	0.15	0.23	0.12	0.02	0.17	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.19	0.11	0.09	0.18	0.04	0.21	0.02	0.21	0.21	0.20	0.19	0.17	0.23	0.17	0.08	0.14	0.13	0.02	0.23	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.14	0.06	0.08	0.13	0.02	0.16	0.01	0.16	0.17	0.15	0.15	0.13	0.19	0.13	0.05	0.14	0.11	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00