Doublet Group distance statistics: 55075

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 5, 6, 2, 4, 1, 2, 2, 4, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.008, 0.020, 0.031, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.005, 0.020, 0.035, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.020 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.007, 0.023, 0.038, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N1	A	0, 0.006, 0.024, 0.041, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.024 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.009, 0.031, 0.053, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.013, 0.036, 0.060, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.036 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.015, 0.040, 0.064, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.040 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.011, 0.046, 0.081, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.046 std_dev=0.035
N3	B	0, 0.139, 0.325, 0.510, 0.849 max_d=0.849 avg_d=0.325 std_dev=0.186
C4	B	0, 0.132, 0.369, 0.606, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.369 std_dev=0.237
C5	B	0, 0.170, 0.435, 0.700, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.435 std_dev=0.265
C2	B	0, 0.151, 0.419, 0.687, 0.972 max_d=0.972 avg_d=0.419 std_dev=0.268
N9	B	0, 0.149, 0.463, 0.777, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.463 std_dev=0.314
N7	B	0, 0.148, 0.467, 0.786, 1.429 max_d=1.429 avg_d=0.467 std_dev=0.319
C6	B	0, 0.226, 0.551, 0.876, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.551 std_dev=0.325
C8	B	0, 0.160, 0.512, 0.865, 1.409 max_d=1.409 avg_d=0.512 std_dev=0.353
N1	B	0, 0.178, 0.542, 0.907, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.542 std_dev=0.365
N2	B	0, 0.070, 0.452, 0.834, 1.304 max_d=1.304 avg_d=0.452 std_dev=0.382
C1'	B	0, 0.134, 0.540, 0.946, 1.469 max_d=1.469 avg_d=0.540 std_dev=0.406
O6	B	0, 0.250, 0.677, 1.105, 1.544 max_d=1.544 avg_d=0.677 std_dev=0.427
O2'	B	0, 0.152, 0.739, 1.326, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.739 std_dev=0.587
O2'	A	0, -0.142, 0.559, 1.261, 1.961 max_d=1.961 avg_d=0.559 std_dev=0.701
C2'	A	0, -0.225, 0.478, 1.181, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.478 std_dev=0.703
O4'	A	0, -0.251, 0.452, 1.156, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.452 std_dev=0.703
C2'	B	0, 0.062, 0.803, 1.544, 2.370 max_d=2.370 avg_d=0.803 std_dev=0.741
O4'	B	0, -0.017, 0.978, 1.973, 3.057 max_d=3.057 avg_d=0.978 std_dev=0.995
C4'	A	0, -0.359, 0.713, 1.784, 2.755 max_d=2.755 avg_d=0.713 std_dev=1.071
C3'	A	0, -0.370, 0.769, 1.907, 2.947 max_d=2.947 avg_d=0.769 std_dev=1.139
C3'	B	0, -0.159, 1.144, 2.446, 4.010 max_d=4.010 avg_d=1.144 std_dev=1.302
C4'	B	0, -0.102, 1.301, 2.703, 4.178 max_d=4.178 avg_d=1.301 std_dev=1.403
O3'	B	0, -0.341, 1.270, 2.882, 4.689 max_d=4.689 avg_d=1.270 std_dev=1.611
O3'	A	0, -0.525, 1.115, 2.755, 4.266 max_d=4.266 avg_d=1.115 std_dev=1.640
O5'	B	0, -0.169, 1.543, 3.255, 5.067 max_d=5.067 avg_d=1.543 std_dev=1.712
C5'	A	0, -0.609, 1.154, 2.918, 4.523 max_d=4.523 avg_d=1.154 std_dev=1.764
O5'	A	0, -0.584, 1.214, 3.013, 4.612 max_d=4.612 avg_d=1.214 std_dev=1.799
C5'	B	0, -0.056, 1.792, 3.640, 5.408 max_d=5.408 avg_d=1.792 std_dev=1.848
OP2	B	0, -0.193, 1.737, 3.667, 5.531 max_d=5.531 avg_d=1.737 std_dev=1.930
P	B	0, -0.476, 1.770, 4.015, 6.200 max_d=6.200 avg_d=1.770 std_dev=2.246
P	A	0, -0.811, 1.714, 4.239, 6.520 max_d=6.520 avg_d=1.714 std_dev=2.525
OP1	B	0, -0.695, 2.122, 4.938, 7.652 max_d=7.652 avg_d=2.122 std_dev=2.816
OP1	A	0, -0.848, 2.096, 5.041, 7.703 max_d=7.703 avg_d=2.096 std_dev=2.944
OP2	A	0, -1.066, 2.204, 5.474, 8.288 max_d=8.288 avg_d=2.204 std_dev=3.270

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.24	0.06	0.08
C2	0.04	0.00	0.39	0.20	0.01	0.23	0.01	0.46	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.41	0.33	0.41	0.50	1.15	0.58	0.67
C2'	0.00	0.39	0.00	0.00	0.22	0.01	0.13	0.02	0.21	0.18	0.32	0.38	0.17	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.05	0.11	0.14	0.04
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.13	0.11	0.18	0.18	0.12	0.08	0.04	0.01	0.01	0.01	0.05	0.13	0.18	0.04
C4	0.02	0.01	0.22	0.11	0.00	0.12	0.01	0.25	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.20	0.17	0.22	0.30	0.87	0.20	0.38
C4'	0.01	0.23	0.01	0.00	0.12	0.00	0.08	0.00	0.13	0.11	0.20	0.21	0.11	0.06	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.21	0.19	0.01
C5	0.01	0.01	0.13	0.09	0.01	0.08	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.12	0.25	1.03	0.16	0.34
C5'	0.02	0.46	0.02	0.01	0.25	0.00	0.19	0.00	0.30	0.17	0.42	0.40	0.26	0.08	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.37	0.33	0.01
C6	0.02	0.01	0.21	0.13	0.01	0.13	0.01	0.30	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.21	0.21	0.36	1.25	0.22	0.51
C8	0.01	0.01	0.18	0.11	0.01	0.11	0.01	0.17	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.14	0.21	0.15	0.51	0.58	0.17
N1	0.03	0.00	0.32	0.18	0.01	0.20	0.01	0.42	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.33	0.30	0.33	0.48	1.29	0.46	0.65
N3	0.03	0.01	0.38	0.18	0.00	0.21	0.01	0.40	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.38	0.28	0.39	0.44	0.94	0.49	0.55
N6	0.02	0.01	0.17	0.12	0.01	0.11	0.01	0.26	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.17	0.20	0.15	0.32	1.33	0.21	0.47
N7	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.07	0.10	0.09	0.09	0.83	0.55	0.12
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.05	0.01	0.11	0.55	0.13	0.14
O2'	0.01	0.41	0.00	0.01	0.20	0.04	0.12	0.04	0.21	0.15	0.33	0.38	0.17	0.07	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.11	0.09	0.04
O3'	0.01	0.33	0.01	0.01	0.17	0.01	0.14	0.03	0.21	0.14	0.30	0.28	0.20	0.10	0.05	0.04	0.00	0.01	0.09	0.39	0.25	0.10
O4'	0.00	0.41	0.01	0.01	0.22	0.00	0.12	0.01	0.21	0.21	0.33	0.39	0.15	0.09	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.08	0.21	0.05
O5'	0.07	0.50	0.05	0.05	0.30	0.01	0.25	0.01	0.36	0.15	0.48	0.44	0.32	0.09	0.11	0.04	0.09	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.24	1.15	0.11	0.13	0.87	0.21	1.03	0.37	1.25	0.51	1.29	0.94	1.33	0.83	0.55	0.11	0.39	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.58	0.14	0.18	0.20	0.19	0.16	0.33	0.22	0.58	0.46	0.49	0.21	0.55	0.13	0.09	0.25	0.21	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.67	0.04	0.04	0.38	0.01	0.34	0.01	0.51	0.17	0.65	0.55	0.47	0.12	0.14	0.04	0.10	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.08	0.53	0.11	0.06	0.28	0.08	0.32	0.11	0.07	0.12	0.10	0.05	0.07	0.07	0.58	0.41	0.42	0.28	0.14	0.32	0.49	0.46
C2	0.13	0.07	0.50	0.17	0.07	0.24	0.06	0.27	0.10	0.08	0.12	0.12	0.06	0.07	0.09	0.47	0.39	0.41	0.26	0.13	0.27	0.45	0.40
C2'	0.37	0.46	0.30	0.15	0.45	0.42	0.47	0.46	0.49	0.44	0.49	0.45	0.43	0.47	0.42	0.36	0.51	0.64	0.46	0.50	0.47	0.75	0.67
C3'	0.14	0.27	0.45	0.10	0.23	0.21	0.27	0.24	0.30	0.21	0.31	0.28	0.23	0.25	0.19	0.50	0.40	0.37	0.27	0.33	0.26	0.52	0.42
C4	0.09	0.06	0.53	0.13	0.05	0.22	0.06	0.25	0.09	0.06	0.10	0.08	0.05	0.06	0.07	0.56	0.38	0.37	0.23	0.11	0.23	0.43	0.37
C4'	0.25	0.30	0.75	0.27	0.28	0.14	0.30	0.16	0.33	0.28	0.33	0.30	0.27	0.30	0.27	0.81	0.26	0.13	0.17	0.35	0.15	0.26	0.17
C5	0.07	0.07	0.56	0.16	0.06	0.16	0.07	0.16	0.08	0.06	0.09	0.08	0.06	0.06	0.06	0.60	0.35	0.29	0.16	0.09	0.15	0.37	0.26
C5'	0.60	0.61	1.02	0.49	0.62	0.40	0.64	0.39	0.65	0.64	0.64	0.59	0.60	0.65	0.62	1.09	0.11	0.37	0.42	0.67	0.35	0.29	0.21
C6	0.06	0.09	0.57	0.19	0.06	0.11	0.08	0.11	0.09	0.06	0.10	0.10	0.07	0.07	0.06	0.59	0.32	0.24	0.14	0.10	0.13	0.34	0.20
C8	0.08	0.06	0.56	0.13	0.06	0.20	0.06	0.21	0.08	0.06	0.09	0.07	0.05	0.06	0.06	0.63	0.36	0.32	0.18	0.09	0.18	0.40	0.30
N1	0.09	0.08	0.54	0.19	0.04	0.15	0.06	0.16	0.09	0.05	0.11	0.11	0.04	0.05	0.05	0.50	0.35	0.31	0.18	0.11	0.15	0.38	0.27
N3	0.13	0.07	0.50	0.14	0.07	0.27	0.07	0.31	0.10	0.09	0.12	0.11	0.06	0.07	0.09	0.50	0.41	0.43	0.29	0.13	0.31	0.49	0.45
N6	0.11	0.13	0.61	0.23	0.12	0.14	0.12	0.13	0.13	0.11	0.13	0.14	0.12	0.11	0.11	0.64	0.27	0.16	0.18	0.13	0.23	0.32	0.13
N7	0.08	0.07	0.57	0.16	0.07	0.16	0.07	0.16	0.08	0.07	0.09	0.08	0.07	0.07	0.07	0.64	0.33	0.26	0.15	0.09	0.15	0.36	0.23
N9	0.09	0.06	0.53	0.12	0.05	0.24	0.06	0.27	0.09	0.07	0.10	0.08	0.05	0.06	0.07	0.59	0.39	0.38	0.23	0.11	0.25	0.45	0.39
O2'	0.45	0.50	0.26	0.19	0.51	0.53	0.53	0.58	0.53	0.52	0.52	0.47	0.49	0.54	0.49	0.32	0.55	0.76	0.58	0.54	0.61	0.88	0.82
O3'	0.26	0.48	0.34	0.12	0.42	0.28	0.48	0.31	0.55	0.39	0.55	0.49	0.41	0.46	0.36	0.40	0.46	0.47	0.35	0.59	0.34	0.65	0.53
O4'	0.30	0.51	0.81	0.29	0.43	0.15	0.49	0.19	0.56	0.40	0.57	0.53	0.42	0.46	0.37	0.86	0.28	0.14	0.18	0.61	0.16	0.23	0.17
O5'	0.69	0.63	1.09	0.57	0.67	0.53	0.67	0.52	0.66	0.70	0.64	0.60	0.65	0.69	0.69	1.17	0.09	0.49	0.53	0.66	0.50	0.40	0.36
OP1	1.88	1.48	2.24	1.75	1.67	1.81	1.61	1.82	1.48	1.78	1.41	1.38	1.62	1.68	1.79	2.36	1.26	1.76	1.78	1.41	1.80	1.58	1.65
OP2	0.88	0.82	1.06	0.53	0.88	0.66	0.92	0.66	0.91	0.94	0.86	0.74	0.83	0.96	0.90	1.10	0.26	0.76	0.70	0.94	0.68	0.64	0.62
P	1.04	0.89	1.35	0.81	0.98	0.87	0.98	0.87	0.94	1.04	0.89	0.83	0.94	1.02	1.02	1.44	0.27	0.88	0.87	0.93	0.85	0.73	0.74

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.33	0.00	0.31	0.02	0.22	0.33	0.16
C2	0.02	0.00	0.38	0.31	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.12	0.15	0.38	0.01	0.18	0.26	0.17
C2'	0.00	0.38	0.00	0.00	0.19	0.01	0.09	0.19	0.16	0.18	0.29	0.46	0.38	0.10	0.01	0.00	0.03	0.02	0.41	0.12	0.37	0.41	0.31
C3'	0.01	0.31	0.00	0.00	0.27	0.01	0.31	0.02	0.34	0.20	0.35	0.30	0.27	0.27	0.19	0.01	0.01	0.03	0.25	0.36	0.35	0.27	0.18
C4	0.01	0.01	0.19	0.27	0.00	0.05	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.10	0.08	0.43	0.01	0.21	0.25	0.18
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.07	0.11	0.05	0.06	0.05	0.11	0.06	0.29	0.03	0.00	0.01	0.08	0.18	0.34	0.08
C5	0.01	0.01	0.09	0.31	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.27	0.04	0.04	0.50	0.02	0.23	0.22	0.21
C5'	0.07	0.06	0.19	0.02	0.08	0.00	0.12	0.00	0.12	0.17	0.08	0.05	0.05	0.17	0.10	0.13	0.20	0.02	0.01	0.14	0.25	0.34	0.01
C6	0.02	0.01	0.16	0.34	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.24	0.05	0.08	0.50	0.00	0.22	0.22	0.22
C8	0.01	0.01	0.18	0.20	0.01	0.11	0.01	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.37	0.04	0.10	0.52	0.03	0.25	0.23	0.23
N1	0.02	0.01	0.29	0.35	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.12	0.06	0.12	0.44	0.01	0.20	0.23	0.19
N2	0.03	0.01	0.46	0.30	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.21	0.15	0.17	0.34	0.01	0.16	0.27	0.16
N3	0.02	0.00	0.38	0.27	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.17	0.14	0.36	0.01	0.18	0.28	0.16
N7	0.01	0.01	0.10	0.27	0.00	0.11	0.00	0.17	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.39	0.05	0.05	0.55	0.03	0.25	0.21	0.25
N9	0.00	0.01	0.01	0.19	0.01	0.06	0.01	0.10	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.13	0.01	0.43	0.02	0.22	0.27	0.18
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.14	0.29	0.27	0.13	0.24	0.37	0.12	0.21	0.13	0.39	0.20	0.00	0.07	0.18	0.37	0.30	0.37	0.37	0.24
O3'	0.33	0.12	0.03	0.01	0.10	0.03	0.04	0.20	0.05	0.04	0.06	0.15	0.17	0.05	0.13	0.07	0.00	0.22	0.29	0.08	0.56	0.37	0.30
O4'	0.00	0.15	0.02	0.03	0.08	0.00	0.04	0.02	0.08	0.10	0.12	0.17	0.14	0.05	0.01	0.18	0.22	0.00	0.20	0.07	0.15	0.37	0.12
O5'	0.31	0.38	0.41	0.25	0.43	0.01	0.50	0.01	0.50	0.52	0.44	0.34	0.36	0.55	0.43	0.37	0.29	0.20	0.00	0.53	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.01	0.12	0.36	0.01	0.08	0.02	0.14	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.30	0.08	0.07	0.53	0.00	0.23	0.22	0.24
OP1	0.22	0.18	0.37	0.35	0.21	0.18	0.23	0.25	0.22	0.25	0.20	0.16	0.18	0.25	0.22	0.37	0.56	0.15	0.02	0.23	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.26	0.41	0.27	0.25	0.34	0.22	0.34	0.22	0.23	0.23	0.27	0.28	0.21	0.27	0.37	0.37	0.37	0.02	0.22	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.17	0.31	0.18	0.18	0.08	0.21	0.01	0.22	0.23	0.19	0.16	0.16	0.25	0.18	0.24	0.30	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00