Doublet Group distance statistics: 55078

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 6, 0, 1, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.012, 0.019, 0.026, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.019 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.012, 0.021, 0.029, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.021 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.011, 0.021, 0.031, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.021 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.017, 0.030, 0.043, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.030 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.020, 0.033, 0.047, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.033 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.026, 0.041, 0.057, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.041 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.023, 0.039, 0.055, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.039 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.050, 0.073, 0.097, 0.101 max_d=0.101 avg_d=0.073 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.040, 0.072, 0.103, 0.113 max_d=0.113 avg_d=0.072 std_dev=0.031
C8	A	0, 0.046, 0.083, 0.120, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.083 std_dev=0.037
N2	B	0, 0.098, 0.248, 0.398, 0.579 max_d=0.579 avg_d=0.248 std_dev=0.150
C2	B	0, 0.038, 0.286, 0.534, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.286 std_dev=0.248
C3'	B	0, 0.168, 0.458, 0.748, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.458 std_dev=0.290
C4'	B	0, 0.177, 0.472, 0.767, 1.229 max_d=1.229 avg_d=0.472 std_dev=0.295
N3	B	0, 0.019, 0.315, 0.611, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.315 std_dev=0.296
N1	B	0, 0.041, 0.348, 0.654, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.348 std_dev=0.306
C5'	B	0, 0.252, 0.580, 0.909, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.580 std_dev=0.329
O3'	B	0, 0.172, 0.539, 0.905, 1.513 max_d=1.513 avg_d=0.539 std_dev=0.366
O4'	A	0, -0.062, 0.321, 0.704, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.321 std_dev=0.383
C2'	B	0, 0.082, 0.480, 0.877, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.480 std_dev=0.397
O4'	B	0, 0.141, 0.546, 0.952, 1.735 max_d=1.735 avg_d=0.546 std_dev=0.406
C6	B	0, 0.030, 0.443, 0.857, 1.560 max_d=1.560 avg_d=0.443 std_dev=0.413
C4	B	0, -0.037, 0.381, 0.799, 1.621 max_d=1.621 avg_d=0.381 std_dev=0.418
O6	B	0, 0.107, 0.545, 0.983, 1.669 max_d=1.669 avg_d=0.545 std_dev=0.438
C2'	A	0, -0.115, 0.323, 0.762, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.323 std_dev=0.438
C1'	B	0, -0.003, 0.478, 0.959, 1.935 max_d=1.935 avg_d=0.478 std_dev=0.481
C5	B	0, -0.048, 0.434, 0.917, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.434 std_dev=0.483
O2'	A	0, 0.201, 0.703, 1.204, 2.263 max_d=2.263 avg_d=0.703 std_dev=0.502
N9	B	0, -0.063, 0.441, 0.945, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.441 std_dev=0.504
C3'	A	0, 0.322, 0.852, 1.382, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.852 std_dev=0.530
C4'	A	0, -0.093, 0.486, 1.066, 2.374 max_d=2.374 avg_d=0.486 std_dev=0.579
O5'	B	0, 1.074, 1.667, 2.260, 2.401 max_d=2.401 avg_d=1.667 std_dev=0.593
O2'	B	0, -0.009, 0.587, 1.182, 2.408 max_d=2.408 avg_d=0.587 std_dev=0.596
N7	B	0, -0.087, 0.520, 1.127, 2.343 max_d=2.343 avg_d=0.520 std_dev=0.607
C8	B	0, -0.121, 0.501, 1.122, 2.405 max_d=2.405 avg_d=0.501 std_dev=0.621
O3'	A	0, 1.079, 1.703, 2.328, 2.985 max_d=2.985 avg_d=1.703 std_dev=0.624
P	B	0, 1.733, 2.620, 3.506, 3.608 max_d=3.608 avg_d=2.620 std_dev=0.887
O5'	A	0, -0.325, 0.699, 1.722, 4.068 max_d=4.068 avg_d=0.699 std_dev=1.023
C5'	A	0, -0.525, 0.536, 1.597, 4.042 max_d=4.042 avg_d=0.536 std_dev=1.061
OP1	B	0, 2.905, 4.221, 5.536, 5.304 max_d=5.304 avg_d=4.221 std_dev=1.315
OP2	A	0, -0.217, 1.117, 2.450, 5.456 max_d=5.456 avg_d=1.117 std_dev=1.333
P	A	0, -0.503, 0.849, 2.200, 5.301 max_d=5.301 avg_d=0.849 std_dev=1.352
OP2	B	0, 2.901, 4.455, 6.009, 5.657 max_d=5.657 avg_d=4.455 std_dev=1.554
OP1	A	0, -0.696, 1.225, 3.146, 7.550 max_d=7.550 avg_d=1.225 std_dev=1.921

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.00	0.07	0.11	0.07	0.06
C2	0.02	0.00	0.31	0.21	0.00	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.21	0.11	0.23	0.05	0.16	0.25	0.04
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.16	0.01	0.08	0.11	0.15	0.15	0.25	0.30	0.11	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.25	0.24	0.38	0.28
C3'	0.01	0.21	0.00	0.00	0.19	0.00	0.24	0.01	0.26	0.18	0.24	0.17	0.27	0.23	0.14	0.01	0.01	0.02	0.04	0.09	0.16	0.06
C4	0.01	0.00	0.16	0.19	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.12	0.05	0.08	0.26	0.07
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.03	0.16	0.05	0.10	0.06	0.14	0.05	0.19	0.02	0.00	0.01	0.08	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.08	0.24	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.08	0.05	0.13	0.12	0.42	0.16
C5'	0.03	0.15	0.11	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.19	0.09	0.15	0.08	0.17	0.05	0.09	0.13	0.01	0.01	0.08	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.15	0.26	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.10	0.12	0.10	0.46	0.15
C8	0.01	0.01	0.15	0.18	0.00	0.16	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.35	0.05	0.13	0.21	0.21	0.39	0.24
N1	0.01	0.00	0.25	0.24	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.10	0.18	0.06	0.09	0.37	0.07
N3	0.02	0.00	0.30	0.17	0.00	0.10	0.00	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.13	0.22	0.07	0.17	0.18	0.06
N6	0.01	0.00	0.11	0.27	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.12	0.07	0.17	0.17	0.56	0.22
N7	0.00	0.01	0.07	0.23	0.00	0.14	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.32	0.09	0.07	0.23	0.24	0.52	0.28
N9	0.00	0.01	0.01	0.14	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.06	0.01	0.07	0.06	0.21	0.09
O2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.03	0.19	0.15	0.09	0.09	0.35	0.09	0.22	0.16	0.32	0.14	0.00	0.05	0.13	0.16	0.13	0.42	0.22
O3'	0.21	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.13	0.10	0.05	0.10	0.13	0.12	0.09	0.06	0.05	0.00	0.13	0.15	0.23	0.12	0.16
O4'	0.00	0.23	0.02	0.02	0.12	0.00	0.05	0.01	0.10	0.13	0.18	0.22	0.07	0.07	0.01	0.13	0.13	0.00	0.05	0.10	0.10	0.07
O5'	0.07	0.05	0.25	0.04	0.05	0.01	0.13	0.01	0.12	0.21	0.06	0.07	0.17	0.23	0.07	0.16	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.11	0.16	0.24	0.09	0.08	0.08	0.12	0.08	0.10	0.21	0.09	0.17	0.17	0.24	0.06	0.13	0.23	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.25	0.38	0.16	0.26	0.06	0.42	0.06	0.46	0.39	0.37	0.18	0.56	0.52	0.21	0.42	0.12	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.04	0.28	0.06	0.07	0.01	0.16	0.01	0.15	0.24	0.07	0.06	0.22	0.28	0.09	0.22	0.16	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.14	0.35	0.19	0.16	0.11	0.17	0.22	0.17	0.19	0.15	0.13	0.15	0.18	0.18	0.65	0.25	0.17	0.15	0.18	0.15	0.34	0.18
C2	0.09	0.08	0.25	0.12	0.07	0.26	0.08	0.36	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.08	0.08	0.55	0.16	0.36	0.15	0.11	0.20	0.31	0.21
C2'	0.16	0.31	0.34	0.12	0.25	0.19	0.28	0.30	0.32	0.22	0.33	0.33	0.26	0.26	0.21	0.67	0.17	0.23	0.24	0.35	0.24	0.44	0.27
C3'	0.29	0.25	0.51	0.34	0.26	0.09	0.24	0.17	0.24	0.26	0.24	0.25	0.26	0.25	0.27	0.87	0.43	0.11	0.16	0.23	0.15	0.34	0.18
C4	0.10	0.11	0.31	0.14	0.11	0.17	0.11	0.27	0.12	0.11	0.12	0.12	0.10	0.11	0.11	0.63	0.19	0.27	0.14	0.13	0.16	0.36	0.20
C4'	0.14	0.12	0.34	0.21	0.09	0.18	0.10	0.32	0.14	0.09	0.15	0.14	0.09	0.09	0.10	0.68	0.35	0.25	0.30	0.16	0.26	0.46	0.30
C5	0.08	0.13	0.31	0.13	0.10	0.18	0.11	0.25	0.12	0.10	0.13	0.14	0.11	0.10	0.09	0.63	0.18	0.29	0.13	0.13	0.15	0.42	0.22
C5'	0.14	0.20	0.32	0.22	0.15	0.24	0.19	0.40	0.24	0.14	0.25	0.20	0.14	0.18	0.13	0.67	0.38	0.32	0.43	0.28	0.37	0.58	0.41
C6	0.06	0.11	0.26	0.10	0.05	0.24	0.07	0.30	0.10	0.04	0.12	0.15	0.07	0.05	0.04	0.59	0.14	0.37	0.13	0.11	0.17	0.41	0.23
C8	0.17	0.15	0.36	0.19	0.16	0.11	0.16	0.18	0.16	0.18	0.15	0.15	0.16	0.17	0.17	0.65	0.26	0.20	0.16	0.16	0.14	0.45	0.22
N1	0.11	0.07	0.23	0.12	0.05	0.28	0.05	0.36	0.07	0.06	0.09	0.11	0.05	0.05	0.07	0.54	0.15	0.40	0.14	0.09	0.20	0.35	0.23
N3	0.09	0.09	0.28	0.13	0.09	0.22	0.10	0.32	0.11	0.10	0.11	0.10	0.08	0.10	0.09	0.59	0.18	0.30	0.15	0.13	0.18	0.31	0.20
N6	0.10	0.14	0.24	0.09	0.07	0.26	0.08	0.28	0.12	0.07	0.15	0.18	0.10	0.07	0.07	0.58	0.13	0.41	0.12	0.13	0.16	0.48	0.26
N7	0.14	0.15	0.34	0.17	0.15	0.13	0.15	0.20	0.15	0.15	0.15	0.16	0.15	0.15	0.15	0.65	0.22	0.25	0.16	0.15	0.14	0.49	0.24
N9	0.15	0.13	0.34	0.17	0.15	0.12	0.15	0.22	0.15	0.16	0.14	0.13	0.14	0.16	0.16	0.65	0.24	0.20	0.15	0.16	0.14	0.38	0.19
O2'	0.08	0.23	0.17	0.11	0.16	0.31	0.22	0.39	0.30	0.15	0.30	0.25	0.15	0.21	0.12	0.44	0.12	0.34	0.31	0.35	0.32	0.54	0.35
O3'	0.12	0.11	0.37	0.22	0.09	0.15	0.09	0.27	0.12	0.09	0.13	0.13	0.09	0.08	0.10	0.72	0.32	0.25	0.22	0.13	0.19	0.43	0.25
O4'	0.11	0.16	0.28	0.17	0.09	0.18	0.11	0.31	0.16	0.07	0.19	0.20	0.10	0.08	0.08	0.60	0.29	0.26	0.27	0.18	0.24	0.44	0.28
O5'	0.19	0.12	0.40	0.27	0.12	0.17	0.13	0.31	0.14	0.14	0.14	0.12	0.12	0.13	0.14	0.76	0.43	0.25	0.38	0.17	0.32	0.55	0.36
OP1	0.09	0.20	0.31	0.21	0.16	0.22	0.24	0.41	0.31	0.16	0.29	0.19	0.13	0.24	0.11	0.71	0.45	0.35	0.54	0.37	0.46	0.70	0.51
OP2	0.62	0.41	0.86	0.73	0.48	0.38	0.42	0.26	0.37	0.50	0.36	0.40	0.48	0.44	0.54	1.21	0.92	0.25	0.17	0.33	0.21	0.26	0.18
P	0.21	0.04	0.43	0.31	0.07	0.09	0.05	0.25	0.08	0.09	0.08	0.07	0.08	0.06	0.12	0.80	0.52	0.18	0.38	0.12	0.31	0.56	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.23	0.01	0.15	0.26	0.07
C2	0.01	0.00	0.20	0.08	0.00	0.14	0.00	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.41	0.10	0.22	0.24	0.01	0.27	0.20	0.16
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.09	0.08	0.12	0.15	0.24	0.19	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.15	0.65	0.33
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.07	0.05	0.10	0.07	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.09	0.02	0.16	0.81	0.40
C4	0.01	0.00	0.10	0.02	0.00	0.09	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.20	0.05	0.12	0.31	0.01	0.28	0.21	0.17
C4'	0.00	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.11	0.07	0.13	0.17	0.13	0.07	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.06	0.39	0.12
C5	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.04	0.06	0.37	0.01	0.35	0.39	0.26
C5'	0.08	0.28	0.09	0.01	0.23	0.00	0.25	0.00	0.28	0.19	0.29	0.29	0.24	0.22	0.17	0.08	0.04	0.01	0.00	0.30	0.19	0.17	0.01
C6	0.01	0.00	0.08	0.02	0.00	0.11	0.00	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.11	0.36	0.00	0.37	0.44	0.28
C8	0.01	0.00	0.12	0.07	0.00	0.07	0.00	0.19	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.17	0.07	0.12	0.45	0.02	0.35	0.36	0.27
N1	0.01	0.00	0.15	0.05	0.00	0.13	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.32	0.07	0.18	0.29	0.01	0.32	0.32	0.22
N2	0.02	0.00	0.24	0.10	0.01	0.17	0.00	0.29	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.50	0.13	0.27	0.20	0.01	0.24	0.17	0.14
N3	0.01	0.00	0.19	0.07	0.00	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.38	0.09	0.22	0.23	0.00	0.23	0.16	0.13
N7	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.07	0.00	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.06	0.06	0.45	0.02	0.40	0.51	0.33
N9	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.00	0.34	0.01	0.25	0.17	0.15
O2'	0.01	0.41	0.00	0.01	0.20	0.01	0.10	0.08	0.18	0.17	0.32	0.50	0.38	0.10	0.03	0.00	0.02	0.01	0.08	0.14	0.25	0.84	0.44
O3'	0.04	0.10	0.01	0.00	0.05	0.01	0.04	0.04	0.04	0.07	0.07	0.13	0.09	0.06	0.04	0.02	0.00	0.06	0.14	0.04	0.20	0.91	0.42
O4'	0.00	0.22	0.01	0.01	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.12	0.18	0.27	0.22	0.06	0.00	0.01	0.06	0.00	0.26	0.09	0.24	0.10	0.15
O5'	0.23	0.24	0.10	0.09	0.31	0.01	0.37	0.00	0.36	0.45	0.29	0.20	0.23	0.45	0.34	0.08	0.14	0.26	0.00	0.38	0.01	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.11	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.04	0.09	0.38	0.00	0.41	0.54	0.32
OP1	0.15	0.27	0.15	0.16	0.28	0.06	0.35	0.19	0.37	0.35	0.32	0.24	0.23	0.40	0.25	0.25	0.20	0.24	0.01	0.41	0.00	0.00	0.00
OP2	0.26	0.20	0.65	0.81	0.21	0.39	0.39	0.17	0.44	0.36	0.32	0.17	0.16	0.51	0.17	0.84	0.91	0.10	0.01	0.54	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.16	0.33	0.40	0.17	0.12	0.26	0.01	0.28	0.27	0.22	0.14	0.13	0.33	0.15	0.44	0.42	0.15	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00