Doublet Group distance statistics: 55080

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.014, 0.029, 0.043, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.029 std_dev=0.015
C6	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.021, 0.040, 0.058, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.040 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.012, 0.034, 0.055, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.034 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.015, 0.040, 0.066, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.040 std_dev=0.025
C1'	A	0, 0.028, 0.055, 0.082, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.055 std_dev=0.027
C2	A	0, 0.022, 0.053, 0.085, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.053 std_dev=0.031
N3	A	0, 0.031, 0.063, 0.094, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.063 std_dev=0.032
N9	A	0, 0.014, 0.050, 0.085, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.050 std_dev=0.036
N6	A	0, 0.042, 0.105, 0.167, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.105 std_dev=0.062
C2'	A	0, 0.065, 0.162, 0.258, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.162 std_dev=0.096
O4'	A	0, 0.107, 0.213, 0.320, 0.357 max_d=0.357 avg_d=0.213 std_dev=0.107
C4'	A	0, 0.069, 0.201, 0.334, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.201 std_dev=0.133
O2'	A	0, 0.098, 0.262, 0.426, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.262 std_dev=0.164
C3'	A	0, 0.139, 0.316, 0.493, 0.481 max_d=0.481 avg_d=0.316 std_dev=0.177
C5'	A	0, 0.187, 0.407, 0.626, 0.745 max_d=0.745 avg_d=0.407 std_dev=0.220
O3'	A	0, 0.212, 0.514, 0.815, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.514 std_dev=0.302
O2'	B	0, 0.254, 0.624, 0.994, 0.980 max_d=0.980 avg_d=0.624 std_dev=0.370
N2	B	0, 0.172, 0.648, 1.124, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.648 std_dev=0.476
N3	B	0, 0.210, 0.716, 1.222, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.716 std_dev=0.506
O4'	B	0, 0.393, 0.937, 1.481, 1.497 max_d=1.497 avg_d=0.937 std_dev=0.544
C1'	B	0, 0.330, 0.904, 1.478, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.904 std_dev=0.574
C2	B	0, 0.206, 0.783, 1.359, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.783 std_dev=0.576
C4	B	0, 0.279, 0.925, 1.570, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.925 std_dev=0.646
N9	B	0, 0.328, 0.974, 1.620, 1.628 max_d=1.628 avg_d=0.974 std_dev=0.646
C2'	B	0, 0.255, 0.990, 1.724, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.990 std_dev=0.734
N1	B	0, 0.283, 1.047, 1.811, 1.812 max_d=1.812 avg_d=1.047 std_dev=0.764
O5'	A	0, -0.141, 0.630, 1.400, 2.308 max_d=2.308 avg_d=0.630 std_dev=0.771
C8	B	0, 0.394, 1.167, 1.939, 1.911 max_d=1.911 avg_d=1.167 std_dev=0.772
C5	B	0, 0.338, 1.141, 1.944, 1.905 max_d=1.905 avg_d=1.141 std_dev=0.803
N7	B	0, 0.407, 1.274, 2.140, 2.082 max_d=2.082 avg_d=1.274 std_dev=0.866
C6	B	0, 0.350, 1.233, 2.116, 2.107 max_d=2.107 avg_d=1.233 std_dev=0.883
C4'	B	0, 0.282, 1.249, 2.216, 2.294 max_d=2.294 avg_d=1.249 std_dev=0.967
P	A	0, -0.234, 0.770, 1.775, 2.968 max_d=2.968 avg_d=0.770 std_dev=1.005
O6	B	0, 0.436, 1.478, 2.519, 2.546 max_d=2.546 avg_d=1.478 std_dev=1.042
OP1	B	0, 0.895, 1.979, 3.063, 2.954 max_d=2.954 avg_d=1.979 std_dev=1.084
OP1	A	0, -0.227, 0.864, 1.956, 3.255 max_d=3.255 avg_d=0.864 std_dev=1.091
OP2	A	0, -0.265, 0.841, 1.948, 3.248 max_d=3.248 avg_d=0.841 std_dev=1.107
C5'	B	0, 0.218, 1.340, 2.463, 2.562 max_d=2.562 avg_d=1.340 std_dev=1.122
C3'	B	0, 0.216, 1.665, 3.114, 3.157 max_d=3.157 avg_d=1.665 std_dev=1.449
O5'	B	0, 0.355, 2.048, 3.740, 3.885 max_d=3.885 avg_d=2.048 std_dev=1.692
P	B	0, 0.889, 2.844, 4.799, 4.785 max_d=4.785 avg_d=2.844 std_dev=1.955
O3'	B	0, 0.187, 2.201, 4.216, 4.236 max_d=4.236 avg_d=2.201 std_dev=2.015
OP2	B	0, 1.387, 3.960, 6.533, 6.351 max_d=6.351 avg_d=3.960 std_dev=2.573

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.32	0.33	0.24	0.32
C2	0.03	0.00	0.09	0.12	0.03	0.05	0.04	0.07	0.03	0.03	0.01	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.14	0.03	0.59	0.61	0.73	0.67
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.04	0.09	0.07	0.07	0.07	0.03	0.01	0.02	0.01	0.13	0.13	0.07	0.12
C3'	0.02	0.12	0.01	0.00	0.10	0.01	0.13	0.01	0.13	0.11	0.12	0.10	0.13	0.14	0.08	0.02	0.01	0.01	0.06	0.10	0.14	0.06
C4	0.01	0.03	0.06	0.10	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.12	0.02	0.61	0.63	0.67	0.67
C4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.06	0.03	0.05	0.03	0.00	0.02	0.13	0.17	0.01
C5	0.01	0.04	0.07	0.13	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.16	0.03	0.74	0.81	0.88	0.84
C5'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.06	0.06	0.06	0.09	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.29	0.29	0.01
C6	0.01	0.03	0.08	0.13	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.18	0.04	0.76	0.84	0.95	0.87
C8	0.01	0.03	0.04	0.11	0.01	0.05	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.04	0.13	0.03	0.77	0.79	0.75	0.81
N1	0.03	0.01	0.09	0.12	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.16	0.04	0.69	0.74	0.87	0.79
N3	0.03	0.01	0.07	0.10	0.02	0.04	0.02	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.02	0.04	0.11	0.03	0.52	0.53	0.60	0.58
N6	0.02	0.03	0.07	0.13	0.01	0.03	0.02	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.04	0.02	0.03	0.19	0.05	0.81	0.94	1.06	0.96
N7	0.02	0.04	0.07	0.14	0.02	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.02	0.04	0.04	0.00	0.02	0.04	0.18	0.03	0.82	0.91	0.95	0.93
N9	0.01	0.03	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.08	0.01	0.58	0.58	0.55	0.60
O2'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.08	0.11	0.07
O3'	0.01	0.14	0.02	0.01	0.12	0.03	0.16	0.04	0.18	0.13	0.16	0.11	0.19	0.18	0.08	0.02	0.00	0.02	0.33	0.25	0.39	0.31
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.28	0.33	0.13	0.27
O5'	0.32	0.59	0.13	0.06	0.61	0.02	0.74	0.01	0.76	0.77	0.69	0.52	0.81	0.82	0.58	0.07	0.33	0.28	0.00	0.01	0.03	0.01
OP1	0.33	0.61	0.13	0.10	0.63	0.13	0.81	0.29	0.84	0.79	0.74	0.53	0.94	0.91	0.58	0.08	0.25	0.33	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.73	0.07	0.14	0.67	0.17	0.88	0.29	0.95	0.75	0.87	0.60	1.06	0.95	0.55	0.11	0.39	0.13	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.32	0.67	0.12	0.06	0.67	0.01	0.84	0.01	0.87	0.81	0.79	0.58	0.96	0.93	0.60	0.07	0.31	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.18	0.04	0.26	0.09	0.13	0.13	0.13	0.21	0.08	0.24	0.23	0.08	0.11	0.08	0.21	0.78	0.09	0.04	0.26	0.09	0.35	0.23
C2	0.23	0.22	0.35	0.25	0.17	0.27	0.18	0.17	0.21	0.16	0.23	0.24	0.17	0.17	0.17	0.12	0.11	0.21	0.43	0.22	0.19	0.89	0.57
C2'	0.08	0.21	0.06	0.24	0.12	0.11	0.17	0.13	0.27	0.10	0.29	0.25	0.11	0.15	0.10	0.26	0.72	0.09	0.08	0.33	0.03	0.48	0.24
C3'	0.18	0.13	0.13	0.44	0.11	0.26	0.11	0.28	0.18	0.14	0.21	0.18	0.10	0.11	0.16	0.38	0.93	0.20	0.13	0.24	0.15	0.31	0.12
C4	0.06	0.11	0.09	0.13	0.07	0.05	0.08	0.09	0.11	0.08	0.14	0.17	0.06	0.07	0.08	0.21	0.54	0.06	0.12	0.14	0.02	0.54	0.27
C4'	0.14	0.15	0.10	0.46	0.08	0.27	0.10	0.26	0.19	0.10	0.22	0.21	0.07	0.09	0.12	0.28	1.02	0.17	0.17	0.25	0.18	0.16	0.22
C5	0.13	0.07	0.04	0.22	0.16	0.09	0.14	0.17	0.09	0.18	0.06	0.08	0.13	0.16	0.18	0.28	0.56	0.12	0.06	0.07	0.10	0.52	0.17
C5'	0.27	0.10	0.24	0.66	0.16	0.42	0.12	0.41	0.11	0.22	0.14	0.16	0.13	0.15	0.24	0.37	1.22	0.30	0.36	0.15	0.29	0.07	0.30
C6	0.07	0.11	0.09	0.05	0.16	0.07	0.16	0.08	0.14	0.17	0.11	0.08	0.15	0.17	0.15	0.24	0.28	0.05	0.17	0.13	0.13	0.70	0.29
C8	0.24	0.07	0.16	0.47	0.19	0.27	0.15	0.31	0.08	0.24	0.07	0.11	0.14	0.19	0.25	0.34	0.91	0.24	0.19	0.07	0.17	0.28	0.09
N1	0.16	0.05	0.31	0.24	0.04	0.25	0.03	0.12	0.04	0.04	0.05	0.08	0.04	0.03	0.06	0.13	0.07	0.16	0.39	0.04	0.16	0.90	0.51
N3	0.15	0.22	0.25	0.09	0.15	0.15	0.18	0.09	0.24	0.13	0.26	0.26	0.15	0.16	0.12	0.13	0.33	0.13	0.30	0.27	0.13	0.72	0.46
N6	0.16	0.27	0.04	0.12	0.32	0.04	0.33	0.16	0.32	0.31	0.28	0.20	0.30	0.33	0.29	0.34	0.23	0.11	0.11	0.32	0.23	0.71	0.22
N7	0.27	0.11	0.18	0.46	0.25	0.25	0.22	0.32	0.15	0.30	0.09	0.07	0.20	0.26	0.30	0.37	0.82	0.25	0.18	0.12	0.21	0.37	0.06
N9	0.12	0.11	0.04	0.30	0.09	0.16	0.08	0.19	0.12	0.12	0.15	0.17	0.08	0.10	0.13	0.26	0.76	0.13	0.06	0.15	0.08	0.37	0.16
O2'	0.13	0.34	0.17	0.10	0.24	0.06	0.33	0.06	0.44	0.22	0.45	0.36	0.22	0.31	0.17	0.15	0.61	0.11	0.21	0.52	0.16	0.59	0.41
O3'	0.16	0.16	0.13	0.43	0.11	0.25	0.13	0.27	0.23	0.11	0.25	0.19	0.10	0.12	0.14	0.40	0.93	0.17	0.10	0.30	0.13	0.36	0.14
O4'	0.10	0.15	0.04	0.39	0.06	0.22	0.09	0.20	0.17	0.08	0.21	0.21	0.06	0.08	0.09	0.21	0.96	0.13	0.15	0.22	0.19	0.18	0.25
O5'	0.96	0.65	0.97	1.31	0.82	1.04	0.75	1.03	0.63	0.88	0.58	0.57	0.78	0.79	0.91	1.04	1.79	0.97	0.97	0.56	0.82	0.76	0.75
OP1	1.16	0.72	1.21	1.64	0.94	1.32	0.86	1.32	0.70	1.05	0.63	0.62	0.89	0.93	1.07	1.27	2.13	1.19	1.27	0.62	1.09	1.04	1.06
OP2	1.39	0.96	1.43	1.83	1.20	1.50	1.14	1.51	1.00	1.32	0.90	0.83	1.13	1.22	1.33	1.46	2.25	1.40	1.47	0.94	1.32	1.28	1.29
P	1.21	0.81	1.24	1.64	1.02	1.33	0.95	1.32	0.81	1.12	0.74	0.70	0.97	1.02	1.14	1.28	2.12	1.23	1.29	0.74	1.10	1.08	1.07

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.10	0.01	0.03	0.04	0.01	0.01	0.08	0.02	0.04	0.07	0.13	0.10	0.02	0.00	0.02	0.21	0.01	0.14	0.02	0.07	0.40	0.25
C2	0.10	0.00	0.20	0.37	0.01	0.18	0.02	0.11	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.27	0.22	0.06	0.45	0.02	0.26	0.97	0.53
C2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.09	0.02	0.04	0.18	0.07	0.07	0.15	0.26	0.20	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.03	0.22	0.59	0.19
C3'	0.03	0.37	0.01	0.00	0.32	0.01	0.35	0.03	0.38	0.26	0.40	0.38	0.33	0.33	0.24	0.03	0.01	0.03	0.31	0.37	0.33	0.80	0.39
C4	0.04	0.01	0.09	0.32	0.00	0.12	0.01	0.13	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.26	0.14	0.01	0.40	0.02	0.22	0.79	0.45
C4'	0.01	0.18	0.02	0.01	0.12	0.00	0.12	0.01	0.12	0.11	0.15	0.21	0.17	0.12	0.09	0.33	0.03	0.00	0.03	0.12	0.10	0.18	0.06
C5	0.01	0.02	0.04	0.35	0.01	0.12	0.00	0.20	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.27	0.23	0.04	0.44	0.03	0.34	0.82	0.47
C5'	0.08	0.11	0.18	0.03	0.13	0.01	0.20	0.00	0.22	0.21	0.16	0.08	0.08	0.24	0.12	0.14	0.17	0.01	0.01	0.27	0.04	0.08	0.02
C6	0.02	0.02	0.07	0.38	0.01	0.12	0.02	0.22	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.01	0.31	0.28	0.05	0.46	0.01	0.42	0.90	0.51
C8	0.04	0.02	0.07	0.26	0.02	0.11	0.03	0.21	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.14	0.07	0.36	0.07	0.27	0.60	0.35
N1	0.07	0.01	0.15	0.40	0.02	0.15	0.01	0.16	0.01	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.29	0.28	0.02	0.47	0.01	0.35	0.98	0.55
N2	0.13	0.00	0.26	0.38	0.02	0.21	0.02	0.08	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.25	0.23	0.10	0.46	0.03	0.24	1.02	0.56
N3	0.10	0.01	0.20	0.33	0.00	0.17	0.02	0.08	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.25	0.14	0.07	0.41	0.03	0.18	0.87	0.48
N7	0.02	0.03	0.04	0.33	0.01	0.12	0.02	0.24	0.05	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.22	0.23	0.07	0.42	0.07	0.38	0.70	0.41
N9	0.00	0.03	0.01	0.24	0.01	0.09	0.01	0.12	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.17	0.05	0.01	0.32	0.03	0.15	0.63	0.37
O2'	0.02	0.27	0.00	0.03	0.26	0.33	0.27	0.14	0.31	0.16	0.29	0.25	0.25	0.22	0.17	0.00	0.04	0.24	0.31	0.32	0.22	0.70	0.37
O3'	0.21	0.22	0.02	0.01	0.14	0.03	0.23	0.17	0.28	0.14	0.28	0.23	0.14	0.23	0.05	0.04	0.00	0.18	0.32	0.31	0.70	0.99	0.57
O4'	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.07	0.02	0.10	0.07	0.07	0.01	0.24	0.18	0.00	0.14	0.09	0.17	0.27	0.31
O5'	0.14	0.45	0.14	0.31	0.40	0.03	0.44	0.01	0.46	0.36	0.47	0.46	0.41	0.42	0.32	0.31	0.32	0.14	0.00	0.45	0.02	0.02	0.01
O6	0.02	0.02	0.03	0.37	0.02	0.12	0.03	0.27	0.01	0.07	0.01	0.03	0.03	0.07	0.03	0.32	0.31	0.09	0.45	0.00	0.53	0.87	0.50
OP1	0.07	0.26	0.22	0.33	0.22	0.10	0.34	0.04	0.42	0.27	0.35	0.24	0.18	0.38	0.15	0.22	0.70	0.17	0.02	0.53	0.00	0.01	0.01
OP2	0.40	0.97	0.59	0.80	0.79	0.18	0.82	0.08	0.90	0.60	0.98	1.02	0.87	0.70	0.63	0.70	0.99	0.27	0.02	0.87	0.01	0.00	0.01
P	0.25	0.53	0.19	0.39	0.45	0.06	0.47	0.02	0.51	0.35	0.55	0.56	0.48	0.41	0.37	0.37	0.57	0.31	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00