Doublet Group distance statistics: 55083

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 19, 15, 13, 0, 5, 3, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.009, 0.015, 0.020, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.009, 0.015, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.002, 0.009, 0.015, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.008, 0.015, 0.021, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.015 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.014 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.024, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.016 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.024, 0.035, 0.046, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.011
O4	A	0, 0.021, 0.050, 0.078, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.050 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.194, 0.353, 0.511, 0.958 max_d=0.958 avg_d=0.353 std_dev=0.159
C5	B	0, 0.213, 0.384, 0.556, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.384 std_dev=0.171
C6	B	0, 0.292, 0.474, 0.656, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.474 std_dev=0.182
C2'	A	0, 0.045, 0.229, 0.412, 0.833 max_d=0.833 avg_d=0.229 std_dev=0.184
N1	B	0, 0.270, 0.469, 0.667, 1.219 max_d=1.219 avg_d=0.469 std_dev=0.199
O5'	B	0, 0.764, 0.972, 1.180, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.972 std_dev=0.208
O5'	A	0, 0.459, 0.694, 0.930, 1.377 max_d=1.377 avg_d=0.694 std_dev=0.236
C1'	B	0, 0.364, 0.601, 0.838, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.601 std_dev=0.237
O4'	B	0, 0.416, 0.672, 0.928, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.672 std_dev=0.256
C3'	B	0, 0.750, 1.008, 1.266, 1.751 max_d=1.751 avg_d=1.008 std_dev=0.258
C4	B	0, 0.149, 0.413, 0.678, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.413 std_dev=0.264
C4'	A	0, 0.128, 0.393, 0.658, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.393 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.617, 0.883, 1.149, 1.975 max_d=1.975 avg_d=0.883 std_dev=0.266
C3'	A	0, 0.179, 0.449, 0.720, 1.579 max_d=1.579 avg_d=0.449 std_dev=0.270
C5'	A	0, 0.460, 0.739, 1.018, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.739 std_dev=0.279
C4'	B	0, 0.635, 0.927, 1.218, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.927 std_dev=0.291
O2'	A	0, 0.103, 0.398, 0.692, 1.352 max_d=1.352 avg_d=0.398 std_dev=0.295
N4	B	0, 0.173, 0.480, 0.787, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.480 std_dev=0.307
C5'	B	0, 0.783, 1.095, 1.406, 1.831 max_d=1.831 avg_d=1.095 std_dev=0.311
P	A	0, 0.736, 1.047, 1.359, 1.931 max_d=1.931 avg_d=1.047 std_dev=0.312
C2	B	0, 0.402, 0.719, 1.036, 1.510 max_d=1.510 avg_d=0.719 std_dev=0.317
P	B	0, 0.917, 1.240, 1.562, 1.675 max_d=1.675 avg_d=1.240 std_dev=0.322
O3'	A	0, 0.668, 1.006, 1.345, 2.350 max_d=2.350 avg_d=1.006 std_dev=0.338
N3	B	0, 0.402, 0.746, 1.090, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.746 std_dev=0.344
O2'	B	0, 0.597, 0.948, 1.299, 2.501 max_d=2.501 avg_d=0.948 std_dev=0.351
O3'	B	0, 1.038, 1.397, 1.756, 2.087 max_d=2.087 avg_d=1.397 std_dev=0.359
O2	B	0, 0.677, 1.067, 1.456, 2.051 max_d=2.051 avg_d=1.067 std_dev=0.390
OP1	B	0, 1.599, 2.093, 2.588, 2.721 max_d=2.721 avg_d=2.093 std_dev=0.494
OP1	A	0, 1.819, 2.405, 2.991, 3.978 max_d=3.978 avg_d=2.405 std_dev=0.586
OP2	B	0, 2.154, 2.788, 3.423, 3.626 max_d=3.626 avg_d=2.788 std_dev=0.635
OP2	A	0, 2.060, 2.934, 3.809, 3.771 max_d=3.771 avg_d=2.934 std_dev=0.875

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.02	0.00	0.10	0.12	0.16	0.12
C2	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.10	0.01	0.08	0.10	0.16	0.15	0.10
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.11	0.08	0.02	0.07	0.14	0.00	0.02	0.04	0.01	0.22	0.25	0.33	0.25
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.19	0.00	0.20	0.01	0.17	0.11	0.15	0.07	0.01	0.01	0.21	0.01	0.05	0.11	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.03	0.19	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.08	0.00	0.02	0.13	0.26	0.20	0.11
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.08	0.00	0.10	0.00	0.10	0.04	0.06	0.08	0.14	0.02	0.08	0.00	0.01	0.11	0.10	0.02
C5	0.02	0.01	0.06	0.20	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.12	0.01	0.06	0.13	0.26	0.20	0.11
C5'	0.04	0.07	0.11	0.01	0.08	0.00	0.10	0.00	0.08	0.04	0.07	0.10	0.05	0.10	0.10	0.01	0.01	0.16	0.16	0.01
C6	0.01	0.01	0.08	0.17	0.01	0.10	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.09	0.01	0.08	0.11	0.21	0.17	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.11	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.01	0.09	0.15	0.15	0.09
N3	0.01	0.00	0.07	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.17	0.05	0.01	0.05	0.11	0.21	0.17	0.10
O2	0.02	0.00	0.14	0.07	0.01	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.19	0.02	0.13	0.10	0.15	0.15	0.12
O2'	0.02	0.16	0.00	0.01	0.16	0.14	0.17	0.05	0.16	0.10	0.17	0.22	0.00	0.03	0.18	0.11	0.16	0.21	0.40	0.22
O3'	0.16	0.10	0.02	0.01	0.08	0.02	0.12	0.10	0.09	0.05	0.05	0.19	0.03	0.00	0.10	0.12	0.13	0.24	0.17	0.17
O4	0.02	0.01	0.04	0.21	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.02	0.18	0.10	0.00	0.03	0.14	0.28	0.22	0.12
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.13	0.11	0.12	0.03	0.00	0.05	0.05	0.11	0.07
O5'	0.10	0.10	0.22	0.05	0.13	0.01	0.13	0.01	0.11	0.09	0.11	0.10	0.16	0.13	0.14	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.12	0.16	0.25	0.11	0.26	0.11	0.26	0.16	0.21	0.15	0.21	0.15	0.21	0.24	0.28	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.15	0.33	0.07	0.20	0.10	0.20	0.16	0.17	0.15	0.17	0.15	0.40	0.17	0.22	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.10	0.25	0.05	0.11	0.02	0.11	0.01	0.09	0.09	0.10	0.12	0.22	0.17	0.12	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.12	0.12	0.10	0.14	0.09	0.12	0.12	0.10	0.11	0.14	0.16	0.13	0.11	0.09	0.11	0.15	0.35	0.25	0.15
C2	0.08	0.10	0.10	0.08	0.10	0.07	0.08	0.10	0.07	0.08	0.11	0.13	0.10	0.11	0.11	0.08	0.14	0.38	0.32	0.14
C2'	0.14	0.19	0.20	0.16	0.18	0.08	0.16	0.10	0.15	0.16	0.19	0.19	0.20	0.18	0.18	0.10	0.16	0.27	0.46	0.21
C3'	0.27	0.21	0.19	0.20	0.18	0.32	0.21	0.41	0.24	0.23	0.19	0.16	0.21	0.20	0.16	0.35	0.45	0.16	0.64	0.50
C4	0.08	0.09	0.12	0.09	0.10	0.07	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.12	0.10	0.12	0.11	0.09	0.13	0.37	0.33	0.15
C4'	0.29	0.27	0.23	0.21	0.26	0.27	0.27	0.29	0.27	0.27	0.26	0.25	0.26	0.24	0.16	0.32	0.29	0.25	0.25	0.25
C5	0.09	0.10	0.12	0.09	0.11	0.08	0.09	0.12	0.08	0.09	0.11	0.13	0.10	0.11	0.10	0.10	0.14	0.35	0.31	0.15
C5'	0.31	0.29	0.24	0.21	0.28	0.30	0.28	0.32	0.29	0.29	0.28	0.27	0.29	0.26	0.16	0.35	0.30	0.28	0.29	0.26
C6	0.10	0.10	0.12	0.09	0.12	0.09	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.14	0.11	0.11	0.09	0.11	0.14	0.34	0.29	0.16
N1	0.09	0.11	0.11	0.08	0.12	0.08	0.09	0.12	0.09	0.09	0.12	0.14	0.11	0.10	0.09	0.10	0.14	0.36	0.29	0.15
N3	0.08	0.09	0.11	0.09	0.10	0.07	0.08	0.10	0.08	0.08	0.10	0.12	0.10	0.12	0.12	0.08	0.14	0.38	0.33	0.14
O2	0.08	0.10	0.11	0.10	0.10	0.07	0.07	0.10	0.07	0.08	0.11	0.14	0.11	0.11	0.13	0.08	0.14	0.40	0.31	0.14
O2'	0.35	0.34	0.36	0.33	0.32	0.31	0.35	0.25	0.36	0.35	0.33	0.32	0.35	0.35	0.33	0.33	0.23	0.57	0.35	0.15
O3'	0.55	0.50	0.41	0.40	0.46	0.55	0.51	0.61	0.56	0.54	0.47	0.41	0.49	0.42	0.29	0.63	0.69	0.29	0.69	0.67
O4	0.09	0.10	0.13	0.10	0.10	0.07	0.08	0.10	0.08	0.09	0.10	0.11	0.10	0.13	0.12	0.09	0.13	0.37	0.34	0.15
O4'	0.26	0.27	0.24	0.20	0.29	0.22	0.29	0.21	0.27	0.27	0.28	0.28	0.26	0.24	0.17	0.26	0.22	0.36	0.12	0.14
O5'	0.27	0.23	0.21	0.19	0.22	0.29	0.23	0.33	0.24	0.25	0.22	0.21	0.23	0.22	0.15	0.32	0.33	0.28	0.42	0.34
OP1	0.28	0.24	0.18	0.20	0.25	0.32	0.24	0.39	0.25	0.25	0.25	0.26	0.24	0.22	0.21	0.35	0.35	0.26	0.57	0.40
OP2	0.28	0.22	0.20	0.23	0.21	0.33	0.23	0.40	0.26	0.25	0.21	0.20	0.22	0.22	0.23	0.36	0.41	0.32	0.63	0.43
P	0.28	0.25	0.20	0.19	0.24	0.30	0.25	0.35	0.26	0.26	0.24	0.24	0.25	0.22	0.16	0.34	0.34	0.29	0.47	0.35

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.16	0.19	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.09	0.25	0.24	0.10
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.05	0.10	0.00	0.02	0.01	0.04	0.11	0.27	0.08
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.07	0.09	0.09	0.02	0.01	0.01	0.09	0.07	0.29	0.09
C4	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.05	0.12	0.02	0.14	0.32	0.28	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.05	0.02	0.03	0.05	0.06	0.05	0.02	0.00	0.01	0.13	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.14	0.03	0.14	0.33	0.25	0.13
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.04	0.06	0.10	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.21	0.13	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.05	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.12	0.03	0.11	0.27	0.19	0.09
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.08	0.23	0.20	0.08
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.02	0.12	0.29	0.27	0.11
N4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.03	0.16	0.35	0.32	0.16
O2	0.04	0.00	0.10	0.09	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.11	0.05	0.08	0.23	0.26	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.03	0.02	0.07	0.05	0.12	0.00	0.06	0.04	0.04	0.10	0.25	0.07
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.12	0.02	0.14	0.02	0.12	0.05	0.09	0.14	0.11	0.06	0.00	0.02	0.14	0.11	0.33	0.10
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.00	0.08	0.16	0.17	0.07
O5'	0.05	0.09	0.04	0.09	0.14	0.01	0.14	0.01	0.11	0.08	0.12	0.16	0.08	0.04	0.14	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.25	0.11	0.07	0.32	0.13	0.33	0.21	0.27	0.23	0.29	0.35	0.23	0.10	0.11	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.24	0.27	0.29	0.28	0.17	0.25	0.13	0.19	0.20	0.27	0.32	0.26	0.25	0.33	0.17	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.07	0.10	0.08	0.09	0.13	0.04	0.13	0.01	0.09	0.08	0.11	0.16	0.11	0.07	0.10	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00