Doublet Group distance statistics: 55088

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 6, 19, 31, 17, 8, 3, 3, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.008, 0.016, 0.023, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.016 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.014, 0.025, 0.036, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.025 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.014, 0.026, 0.038, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.026 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.015, 0.027, 0.040, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.027 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.014, 0.028, 0.043, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.028 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.022, 0.037, 0.052, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.037 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.036, 0.056, 0.077, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.056 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.023, 0.044, 0.065, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.044 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.046, 0.070, 0.094, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.070 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.025, 0.055, 0.085, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.055 std_dev=0.030
O2'	A	0, 0.180, 0.298, 0.415, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.298 std_dev=0.118
C2'	A	0, 0.091, 0.227, 0.362, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.227 std_dev=0.135
O4'	A	0, 0.011, 0.165, 0.320, 0.673 max_d=0.673 avg_d=0.165 std_dev=0.154
C4	B	0, 0.315, 0.501, 0.687, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.501 std_dev=0.186
C5	B	0, 0.371, 0.563, 0.754, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.563 std_dev=0.191
N9	B	0, 0.370, 0.574, 0.778, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.574 std_dev=0.204
C6	B	0, 0.357, 0.589, 0.821, 1.300 max_d=1.300 avg_d=0.589 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.341, 0.576, 0.811, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.576 std_dev=0.235
N3	B	0, 0.264, 0.501, 0.738, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.501 std_dev=0.237
N7	B	0, 0.454, 0.693, 0.933, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.693 std_dev=0.239
C3'	A	0, 0.075, 0.328, 0.580, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.328 std_dev=0.252
C8	B	0, 0.450, 0.707, 0.964, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.707 std_dev=0.257
N6	B	0, 0.421, 0.688, 0.956, 1.748 max_d=1.748 avg_d=0.688 std_dev=0.268
C4'	A	0, 0.010, 0.278, 0.546, 1.127 max_d=1.127 avg_d=0.278 std_dev=0.268
O3'	B	0, 0.406, 0.693, 0.979, 1.597 max_d=1.597 avg_d=0.693 std_dev=0.287
O5'	A	0, 0.266, 0.579, 0.892, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.579 std_dev=0.313
N1	B	0, 0.276, 0.597, 0.919, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.597 std_dev=0.321
C2'	B	0, 0.424, 0.747, 1.071, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.747 std_dev=0.323
C2	B	0, 0.232, 0.561, 0.890, 1.675 max_d=1.675 avg_d=0.561 std_dev=0.329
C3'	B	0, 0.330, 0.662, 0.995, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.662 std_dev=0.333
P	A	0, 0.227, 0.593, 0.958, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.593 std_dev=0.366
O3'	A	0, 0.087, 0.467, 0.847, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.467 std_dev=0.380
C5'	A	0, 0.046, 0.452, 0.858, 1.780 max_d=1.780 avg_d=0.452 std_dev=0.406
O4'	B	0, 0.309, 0.735, 1.162, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.735 std_dev=0.427
OP1	A	0, 0.627, 1.097, 1.567, 2.006 max_d=2.006 avg_d=1.097 std_dev=0.470
OP2	A	0, 0.623, 1.107, 1.591, 2.204 max_d=2.204 avg_d=1.107 std_dev=0.484
O2'	B	0, 0.435, 0.949, 1.463, 3.686 max_d=3.686 avg_d=0.949 std_dev=0.514
C4'	B	0, 0.269, 0.828, 1.387, 1.985 max_d=1.985 avg_d=0.828 std_dev=0.559
O5'	B	0, 0.291, 1.231, 2.171, 3.315 max_d=3.315 avg_d=1.231 std_dev=0.940
C5'	B	0, 0.162, 1.154, 2.146, 3.220 max_d=3.220 avg_d=1.154 std_dev=0.992
P	B	0, 0.631, 1.904, 3.178, 4.899 max_d=4.899 avg_d=1.904 std_dev=1.274
OP1	B	0, 0.906, 2.190, 3.474, 4.849 max_d=4.849 avg_d=2.190 std_dev=1.284
OP2	B	0, 0.796, 2.165, 3.533, 5.506 max_d=5.506 avg_d=2.165 std_dev=1.369

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.10	0.22	0.13	0.09
C2	0.03	0.00	0.17	0.26	0.01	0.14	0.01	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.33	0.03	0.23	0.29	0.34	0.20
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.02	0.09	0.06	0.14	0.16	0.07	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.11	0.20	0.09
C3'	0.01	0.26	0.00	0.00	0.17	0.00	0.15	0.02	0.20	0.09	0.25	0.24	0.18	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.12	0.11	0.22	0.11
C4	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.19	0.02	0.21	0.29	0.27	0.16
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.11	0.08	0.13	0.12	0.11	0.09	0.05	0.05	0.02	0.00	0.01	0.11	0.19	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.18	0.03	0.25	0.32	0.32	0.19
C5'	0.02	0.18	0.02	0.02	0.14	0.01	0.16	0.00	0.18	0.12	0.19	0.15	0.19	0.15	0.09	0.05	0.03	0.01	0.01	0.11	0.25	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.20	0.01	0.11	0.01	0.18	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.06	0.25	0.04	0.27	0.33	0.37	0.21
C8	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.08	0.01	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.25	0.31	0.21	0.14
N1	0.02	0.00	0.14	0.25	0.01	0.13	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.31	0.03	0.26	0.31	0.38	0.21
N3	0.03	0.00	0.16	0.24	0.00	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.28	0.03	0.20	0.28	0.28	0.17
N6	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.11	0.02	0.19	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.23	0.05	0.28	0.34	0.40	0.22
N7	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.09	0.01	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.03	0.13	0.04	0.28	0.33	0.30	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.08	0.02	0.18	0.27	0.19	0.13
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.05	0.05	0.04	0.05	0.06	0.04	0.09	0.11	0.05	0.03	0.02	0.00	0.04	0.06	0.04	0.14	0.20	0.06
O3'	0.02	0.33	0.02	0.01	0.19	0.02	0.18	0.03	0.25	0.10	0.31	0.28	0.23	0.13	0.08	0.04	0.00	0.02	0.19	0.18	0.28	0.14
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.23	0.11	0.09
O5'	0.10	0.23	0.06	0.12	0.21	0.01	0.25	0.01	0.27	0.25	0.26	0.20	0.28	0.28	0.18	0.04	0.19	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.22	0.29	0.11	0.11	0.29	0.11	0.32	0.11	0.33	0.31	0.31	0.28	0.34	0.33	0.27	0.14	0.18	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.34	0.20	0.22	0.27	0.19	0.32	0.25	0.37	0.21	0.38	0.28	0.40	0.30	0.19	0.20	0.28	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.20	0.09	0.11	0.16	0.03	0.19	0.02	0.21	0.14	0.21	0.17	0.22	0.18	0.13	0.06	0.14	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.21	0.27	0.27	0.22	0.47	0.22	0.52	0.19	0.31	0.20	0.20	0.20	0.27	0.28	0.48	0.34	0.52	0.41	0.48	0.36	0.41
C2	0.23	0.19	0.28	0.17	0.16	0.35	0.16	0.39	0.17	0.20	0.21	0.15	0.19	0.17	0.20	0.59	0.31	0.48	0.31	0.32	0.36	0.32
C2'	0.28	0.21	0.23	0.20	0.19	0.40	0.19	0.43	0.18	0.26	0.20	0.18	0.18	0.22	0.24	0.44	0.27	0.47	0.33	0.49	0.39	0.34
C3'	0.22	0.20	0.21	0.16	0.14	0.33	0.14	0.36	0.15	0.20	0.19	0.16	0.15	0.17	0.18	0.42	0.22	0.37	0.27	0.55	0.46	0.34
C4	0.27	0.20	0.26	0.18	0.18	0.37	0.18	0.40	0.18	0.24	0.20	0.18	0.18	0.21	0.23	0.55	0.31	0.49	0.33	0.35	0.34	0.33
C4'	0.25	0.19	0.24	0.22	0.17	0.39	0.18	0.45	0.16	0.26	0.18	0.17	0.16	0.23	0.22	0.43	0.26	0.40	0.35	0.56	0.39	0.39
C5	0.24	0.20	0.27	0.17	0.18	0.31	0.17	0.33	0.18	0.21	0.20	0.18	0.18	0.19	0.21	0.57	0.30	0.44	0.29	0.29	0.34	0.29
C5'	0.18	0.18	0.21	0.18	0.13	0.31	0.14	0.39	0.13	0.21	0.16	0.15	0.13	0.19	0.17	0.38	0.20	0.30	0.31	0.60	0.43	0.40
C6	0.21	0.19	0.30	0.19	0.16	0.28	0.15	0.30	0.17	0.18	0.20	0.15	0.18	0.16	0.18	0.60	0.30	0.41	0.28	0.27	0.36	0.29
C8	0.30	0.22	0.26	0.20	0.23	0.37	0.23	0.39	0.21	0.29	0.22	0.21	0.21	0.26	0.27	0.49	0.31	0.46	0.34	0.36	0.33	0.32
N1	0.21	0.19	0.30	0.18	0.16	0.30	0.16	0.33	0.18	0.18	0.21	0.15	0.20	0.16	0.18	0.61	0.31	0.43	0.29	0.29	0.37	0.31
N3	0.26	0.20	0.27	0.18	0.17	0.39	0.17	0.43	0.17	0.23	0.20	0.16	0.18	0.19	0.22	0.57	0.31	0.50	0.34	0.36	0.34	0.34
N6	0.20	0.18	0.33	0.23	0.16	0.25	0.16	0.26	0.18	0.18	0.20	0.16	0.19	0.16	0.18	0.59	0.31	0.36	0.29	0.27	0.39	0.30
N7	0.26	0.22	0.26	0.16	0.21	0.29	0.21	0.30	0.20	0.24	0.22	0.21	0.20	0.22	0.23	0.52	0.30	0.42	0.29	0.29	0.33	0.28
N9	0.30	0.21	0.26	0.22	0.21	0.41	0.21	0.44	0.19	0.28	0.21	0.20	0.19	0.25	0.26	0.51	0.32	0.50	0.36	0.39	0.34	0.35
O2'	0.28	0.22	0.23	0.21	0.21	0.42	0.21	0.47	0.19	0.27	0.21	0.20	0.19	0.24	0.25	0.45	0.26	0.48	0.35	0.51	0.36	0.36
O3'	0.19	0.22	0.20	0.14	0.13	0.30	0.13	0.33	0.16	0.17	0.21	0.17	0.16	0.14	0.15	0.39	0.19	0.33	0.25	0.62	0.56	0.39
O4'	0.33	0.21	0.30	0.33	0.24	0.50	0.25	0.56	0.22	0.35	0.21	0.21	0.22	0.31	0.30	0.47	0.37	0.52	0.47	0.55	0.40	0.47
O5'	0.15	0.23	0.20	0.09	0.16	0.34	0.15	0.40	0.16	0.16	0.20	0.21	0.15	0.15	0.15	0.37	0.02	0.28	0.29	0.66	0.52	0.45
OP1	0.24	0.26	0.20	0.17	0.23	0.39	0.22	0.46	0.22	0.24	0.24	0.27	0.21	0.24	0.23	0.35	0.03	0.38	0.38	0.71	0.55	0.54
OP2	0.32	0.52	0.42	0.20	0.45	0.23	0.47	0.38	0.51	0.38	0.53	0.48	0.53	0.43	0.39	0.65	0.02	0.15	0.33	0.74	0.56	0.50
P	0.06	0.16	0.16	0.02	0.10	0.21	0.11	0.28	0.12	0.12	0.15	0.15	0.13	0.12	0.08	0.32	0.01	0.13	0.19	0.60	0.45	0.38

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.04	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.01	0.15	0.15	0.27	0.16
C2	0.04	0.00	0.21	0.15	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.02	0.33	0.20	0.13	0.24	0.27	0.51	0.37
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.11	0.01	0.07	0.12	0.10	0.14	0.16	0.21	0.09	0.10	0.04	0.00	0.04	0.01	0.29	0.36	0.40	0.31
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.09	0.00	0.08	0.02	0.10	0.10	0.13	0.14	0.09	0.09	0.05	0.02	0.01	0.01	0.14	0.37	0.35	0.23
C4	0.02	0.01	0.11	0.09	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.13	0.07	0.26	0.29	0.49	0.37
C4'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.10	0.06	0.07	0.06	0.09	0.04	0.11	0.03	0.00	0.02	0.18	0.20	0.07
C5	0.02	0.01	0.07	0.08	0.00	0.05	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.10	0.04	0.32	0.42	0.65	0.49
C5'	0.06	0.12	0.12	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.17	0.23	0.14	0.10	0.20	0.23	0.14	0.06	0.12	0.02	0.01	0.12	0.12	0.01
C6	0.03	0.01	0.10	0.10	0.01	0.05	0.01	0.17	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.12	0.06	0.32	0.45	0.69	0.51
C8	0.02	0.02	0.14	0.10	0.01	0.10	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.20	0.08	0.09	0.36	0.42	0.60	0.48
N1	0.04	0.00	0.16	0.13	0.01	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.27	0.17	0.10	0.28	0.37	0.61	0.45
N3	0.04	0.00	0.21	0.14	0.01	0.07	0.01	0.10	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.20	0.13	0.21	0.22	0.43	0.31
N6	0.02	0.02	0.09	0.09	0.01	0.06	0.01	0.20	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.20	0.11	0.05	0.34	0.55	0.79	0.58
N7	0.01	0.02	0.10	0.09	0.01	0.09	0.01	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.07	0.06	0.36	0.52	0.75	0.56
N9	0.00	0.02	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.09	0.02	0.26	0.25	0.42	0.33
O2'	0.01	0.33	0.00	0.02	0.18	0.11	0.16	0.06	0.20	0.20	0.27	0.32	0.20	0.19	0.09	0.00	0.07	0.07	0.25	0.39	0.51	0.33
O3'	0.14	0.20	0.04	0.01	0.13	0.03	0.10	0.12	0.12	0.08	0.17	0.20	0.11	0.07	0.09	0.07	0.00	0.12	0.15	0.46	0.38	0.27
O4'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.09	0.10	0.13	0.05	0.06	0.02	0.07	0.12	0.00	0.08	0.10	0.28	0.17
O5'	0.15	0.24	0.29	0.14	0.26	0.02	0.32	0.01	0.32	0.36	0.28	0.21	0.34	0.36	0.26	0.25	0.15	0.08	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.15	0.27	0.36	0.37	0.29	0.18	0.42	0.12	0.45	0.42	0.37	0.22	0.55	0.52	0.25	0.39	0.46	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.51	0.40	0.35	0.49	0.20	0.65	0.12	0.69	0.60	0.61	0.43	0.79	0.75	0.42	0.51	0.38	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.37	0.31	0.23	0.37	0.07	0.49	0.01	0.51	0.48	0.45	0.31	0.58	0.56	0.33	0.33	0.27	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00