Doublet Group distance statistics: 55090

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 6, 11, 3, 8, 7, 2, 2, 2, 1, 3, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C2	A	0, -0.002, 0.011, 0.024, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.011 std_dev=0.013
N1	A	0, -0.001, 0.012, 0.026, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C1'	A	0, -0.001, 0.015, 0.031, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.015 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.002, 0.015, 0.032, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.015 std_dev=0.017
N3	A	0, -0.004, 0.014, 0.033, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.014 std_dev=0.019
N9	A	0, -0.002, 0.018, 0.038, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.018 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.002, 0.024, 0.045, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.024 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.002, 0.024, 0.046, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.024 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.000, 0.028, 0.056, 0.144 max_d=0.144 avg_d=0.028 std_dev=0.028
N9	B	0, 0.770, 1.053, 1.336, 1.512 max_d=1.512 avg_d=1.053 std_dev=0.283
C1'	B	0, 0.726, 1.009, 1.293, 1.459 max_d=1.459 avg_d=1.009 std_dev=0.283
C4	B	0, 0.777, 1.060, 1.344, 1.608 max_d=1.608 avg_d=1.060 std_dev=0.284
N3	B	0, 0.700, 0.994, 1.288, 1.636 max_d=1.636 avg_d=0.994 std_dev=0.294
C5	B	0, 0.891, 1.207, 1.523, 1.877 max_d=1.877 avg_d=1.207 std_dev=0.316
C8	B	0, 0.846, 1.171, 1.497, 1.761 max_d=1.761 avg_d=1.171 std_dev=0.326
C2'	B	0, 0.566, 0.898, 1.229, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.898 std_dev=0.331
N7	B	0, 0.928, 1.268, 1.608, 1.806 max_d=1.806 avg_d=1.268 std_dev=0.340
C2	B	0, 0.722, 1.089, 1.455, 1.981 max_d=1.981 avg_d=1.089 std_dev=0.367
C6	B	0, 0.929, 1.300, 1.671, 2.234 max_d=2.234 avg_d=1.300 std_dev=0.371
C3'	B	0, 0.957, 1.338, 1.719, 1.986 max_d=1.986 avg_d=1.338 std_dev=0.381
O2'	B	0, 0.351, 0.752, 1.154, 2.098 max_d=2.098 avg_d=0.752 std_dev=0.402
O4'	B	0, 1.013, 1.421, 1.829, 2.195 max_d=2.195 avg_d=1.421 std_dev=0.408
N1	B	0, 0.821, 1.236, 1.652, 2.287 max_d=2.287 avg_d=1.236 std_dev=0.415
N6	B	0, 1.054, 1.473, 1.892, 2.528 max_d=2.528 avg_d=1.473 std_dev=0.419
O3'	B	0, 1.019, 1.444, 1.869, 2.252 max_d=2.252 avg_d=1.444 std_dev=0.425
C4'	B	0, 1.015, 1.468, 1.921, 2.354 max_d=2.354 avg_d=1.468 std_dev=0.453
O5'	B	0, 1.141, 1.719, 2.297, 3.092 max_d=3.092 avg_d=1.719 std_dev=0.578
OP2	B	0, 1.038, 1.635, 2.232, 2.624 max_d=2.624 avg_d=1.635 std_dev=0.597
P	B	0, 0.950, 1.559, 2.168, 2.731 max_d=2.731 avg_d=1.559 std_dev=0.609
C2'	A	0, -0.128, 0.485, 1.098, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.485 std_dev=0.613
O4'	A	0, -0.174, 0.454, 1.081, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.454 std_dev=0.627
OP1	B	0, 1.040, 1.678, 2.316, 3.024 max_d=3.024 avg_d=1.678 std_dev=0.638
O2'	A	0, -0.001, 0.653, 1.307, 2.157 max_d=2.157 avg_d=0.653 std_dev=0.654
C5'	B	0, 1.378, 2.073, 2.768, 3.277 max_d=3.277 avg_d=2.073 std_dev=0.695
C4'	A	0, -0.173, 0.677, 1.526, 2.641 max_d=2.641 avg_d=0.677 std_dev=0.849
C3'	A	0, -0.151, 0.782, 1.715, 2.945 max_d=2.945 avg_d=0.782 std_dev=0.933
O3'	A	0, -0.075, 1.151, 2.377, 4.059 max_d=4.059 avg_d=1.151 std_dev=1.226
C5'	A	0, -0.298, 1.217, 2.731, 4.682 max_d=4.682 avg_d=1.217 std_dev=1.515
O5'	A	0, -0.517, 1.823, 4.162, 6.813 max_d=6.813 avg_d=1.823 std_dev=2.339
OP1	A	0, 0.951, 4.090, 7.228, 11.116 max_d=11.116 avg_d=4.090 std_dev=3.138
P	A	0, -0.485, 2.754, 5.992, 9.617 max_d=9.617 avg_d=2.754 std_dev=3.238
OP2	A	0, -0.423, 3.068, 6.558, 10.805 max_d=10.805 avg_d=3.068 std_dev=3.490

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.22	0.28	0.22
C2	0.03	0.00	0.35	0.29	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.40	0.29	0.15	0.29	0.43	0.25
C2'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.20	0.27	0.35	0.10	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.23	0.39	0.30
C3'	0.01	0.29	0.00	0.00	0.18	0.00	0.14	0.02	0.20	0.10	0.27	0.27	0.18	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.35	0.31	0.45	0.36
C4	0.02	0.01	0.18	0.18	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.11	0.22	0.14	0.37	0.34	0.56	0.49
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.03	0.14	0.05	0.10	0.06	0.13	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.18	0.16	0.06
C5	0.01	0.01	0.08	0.14	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.16	0.05	0.62	0.71	0.82	0.82
C5'	0.02	0.16	0.01	0.02	0.06	0.00	0.12	0.00	0.09	0.27	0.10	0.16	0.13	0.25	0.09	0.04	0.02	0.01	0.01	0.23	0.10	0.01
C6	0.02	0.01	0.15	0.20	0.01	0.03	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.25	0.11	0.54	0.61	0.82	0.77
C8	0.02	0.01	0.20	0.10	0.00	0.14	0.01	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.13	0.19	0.92	1.07	0.90	1.05
N1	0.03	0.00	0.27	0.27	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.20	0.36	0.22	0.31	0.30	0.63	0.49
N3	0.04	0.00	0.35	0.27	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.35	0.29	0.12	0.30	0.35	0.19
N6	0.01	0.01	0.10	0.18	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.22	0.07	0.68	0.87	1.00	0.97
N7	0.01	0.01	0.11	0.07	0.01	0.13	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.11	0.93	1.17	1.03	1.16
N9	0.01	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.01	0.50	0.49	0.57	0.57
O2'	0.02	0.28	0.00	0.01	0.11	0.04	0.03	0.04	0.09	0.17	0.20	0.28	0.05	0.12	0.03	0.00	0.03	0.04	0.09	0.29	0.25	0.09
O3'	0.01	0.40	0.01	0.00	0.22	0.02	0.16	0.02	0.25	0.13	0.36	0.35	0.22	0.08	0.05	0.03	0.00	0.01	0.25	0.25	0.39	0.26
O4'	0.00	0.29	0.01	0.01	0.14	0.00	0.05	0.01	0.11	0.19	0.22	0.29	0.07	0.11	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.20	0.15	0.07
O5'	0.22	0.15	0.28	0.35	0.37	0.01	0.62	0.01	0.54	0.92	0.31	0.12	0.68	0.93	0.50	0.09	0.25	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.22	0.29	0.23	0.31	0.34	0.18	0.71	0.23	0.61	1.07	0.30	0.30	0.87	1.17	0.49	0.29	0.25	0.20	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.28	0.43	0.39	0.45	0.56	0.16	0.82	0.10	0.82	0.90	0.63	0.35	1.00	1.03	0.57	0.25	0.39	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.25	0.30	0.36	0.49	0.06	0.82	0.01	0.77	1.05	0.49	0.19	0.97	1.16	0.57	0.09	0.26	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.13	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.14	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.12	0.15	0.12	0.21	0.12	0.13
C2	0.15	0.21	0.17	0.16	0.16	0.16	0.16	0.17	0.19	0.14	0.22	0.18	0.20	0.15	0.14	0.18	0.17	0.17	0.15	0.18	0.15	0.14
C2'	0.28	0.15	0.36	0.42	0.18	0.39	0.18	0.42	0.15	0.28	0.15	0.14	0.15	0.24	0.25	0.35	0.51	0.33	0.40	0.39	0.37	0.40
C3'	0.37	0.22	0.37	0.50	0.13	0.60	0.12	0.66	0.13	0.32	0.22	0.12	0.14	0.22	0.27	0.42	0.58	0.52	0.56	0.58	0.48	0.58
C4	0.12	0.15	0.15	0.13	0.13	0.11	0.13	0.11	0.14	0.13	0.16	0.14	0.15	0.13	0.12	0.14	0.14	0.14	0.12	0.16	0.12	0.12
C4'	0.21	0.21	0.14	0.15	0.11	0.29	0.11	0.32	0.16	0.17	0.22	0.14	0.17	0.12	0.14	0.17	0.14	0.33	0.24	0.23	0.19	0.24
C5	0.13	0.15	0.16	0.15	0.13	0.12	0.13	0.13	0.14	0.13	0.15	0.13	0.14	0.13	0.13	0.14	0.16	0.15	0.14	0.16	0.14	0.15
C5'	0.24	0.37	0.18	0.17	0.18	0.39	0.20	0.44	0.30	0.18	0.39	0.25	0.33	0.16	0.15	0.20	0.21	0.44	0.29	0.29	0.23	0.31
C6	0.14	0.18	0.18	0.16	0.15	0.13	0.15	0.13	0.17	0.14	0.18	0.17	0.17	0.15	0.15	0.16	0.18	0.15	0.15	0.16	0.17	0.16
C8	0.17	0.16	0.15	0.15	0.11	0.19	0.11	0.20	0.13	0.14	0.16	0.13	0.13	0.12	0.13	0.15	0.16	0.22	0.17	0.19	0.15	0.17
N1	0.15	0.22	0.18	0.16	0.17	0.16	0.17	0.16	0.20	0.15	0.23	0.20	0.21	0.16	0.15	0.18	0.17	0.17	0.16	0.17	0.17	0.16
N3	0.13	0.18	0.16	0.14	0.14	0.13	0.14	0.14	0.16	0.13	0.18	0.15	0.17	0.13	0.13	0.16	0.15	0.15	0.13	0.18	0.12	0.13
N6	0.17	0.18	0.21	0.20	0.17	0.16	0.17	0.16	0.17	0.16	0.18	0.19	0.17	0.16	0.17	0.17	0.21	0.17	0.19	0.19	0.21	0.20
N7	0.18	0.16	0.18	0.18	0.12	0.20	0.12	0.21	0.13	0.15	0.15	0.13	0.13	0.13	0.14	0.17	0.19	0.22	0.19	0.19	0.17	0.19
N9	0.13	0.14	0.14	0.12	0.11	0.12	0.11	0.13	0.13	0.13	0.14	0.12	0.13	0.12	0.12	0.12	0.13	0.16	0.12	0.17	0.12	0.13
O2'	0.19	0.20	0.28	0.30	0.19	0.22	0.20	0.23	0.20	0.21	0.20	0.18	0.21	0.21	0.20	0.25	0.38	0.19	0.24	0.23	0.25	0.24
O3'	0.44	0.24	0.47	0.64	0.16	0.74	0.15	0.83	0.13	0.39	0.24	0.12	0.14	0.28	0.33	0.51	0.77	0.61	0.72	0.78	0.63	0.75
O4'	0.14	0.15	0.21	0.24	0.11	0.16	0.11	0.17	0.13	0.13	0.15	0.12	0.13	0.12	0.12	0.20	0.32	0.18	0.18	0.32	0.22	0.20
O5'	0.49	1.10	0.82	0.75	0.86	0.30	0.90	0.23	1.05	0.64	1.14	0.96	1.08	0.78	0.67	0.69	0.88	0.23	0.42	0.48	0.61	0.41
OP1	1.09	1.62	1.55	1.61	1.47	0.99	1.57	0.92	1.70	1.34	1.72	1.48	1.77	1.50	1.31	1.31	1.86	0.81	1.22	1.39	1.53	1.25
OP2	0.54	1.56	0.84	0.67	1.13	0.26	1.22	0.29	1.48	0.77	1.64	1.29	1.55	1.00	0.81	0.65	0.73	0.25	0.34	0.39	0.60	0.35
P	0.76	1.59	1.15	1.04	1.27	0.45	1.36	0.33	1.56	0.99	1.67	1.39	1.62	1.19	1.01	0.94	1.17	0.40	0.63	0.66	0.91	0.61

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.05	0.06	0.06	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.09	0.03	0.09	0.09	0.14	0.12
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.05	0.07	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.04	0.12	0.08	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.01	0.06	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.15	0.11	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.06	0.02	0.09	0.09	0.12	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.04	0.03	0.07	0.08	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.07	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.13	0.13	0.17	0.15
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.09	0.00	0.09	0.11	0.08	0.05	0.12	0.12	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.03	0.13	0.15	0.19	0.17
C8	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.10	0.05	0.14	0.14	0.14	0.15
N1	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.11	0.12	0.17	0.15
N3	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.09	0.03	0.08	0.08	0.11	0.10
N6	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.07	0.01	0.12	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.09	0.04	0.16	0.19	0.23	0.20
N7	0.02	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.10	0.05	0.16	0.17	0.19	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.08	0.08	0.10	0.09
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.03	0.08	0.09	0.04	0.03	0.01	0.00	0.05	0.04	0.03	0.12	0.07	0.05
O3'	0.02	0.09	0.02	0.01	0.06	0.02	0.07	0.03	0.08	0.10	0.08	0.09	0.09	0.10	0.05	0.05	0.00	0.02	0.08	0.24	0.17	0.15
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.05	0.03	0.03	0.04	0.05	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.06	0.09	0.09
O5'	0.05	0.09	0.04	0.06	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.14	0.11	0.08	0.16	0.16	0.08	0.03	0.08	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.09	0.12	0.15	0.09	0.07	0.13	0.04	0.15	0.14	0.12	0.08	0.19	0.17	0.08	0.12	0.24	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.14	0.08	0.11	0.12	0.03	0.17	0.02	0.19	0.14	0.17	0.11	0.23	0.19	0.10	0.07	0.17	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.12	0.06	0.09	0.11	0.02	0.15	0.02	0.17	0.15	0.15	0.10	0.20	0.18	0.09	0.05	0.15	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00