Doublet Group distance statistics: 55093

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.000, 0.024, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.000, 0.025, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.025 std_dev=0.025
C6	A	0, 0.000, 0.026, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.026 std_dev=0.026
C1'	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.034 std_dev=0.034
N7	A	0, 0.000, 0.040, 0.080, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.040 std_dev=0.040
C8	A	0, 0.000, 0.049, 0.097, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.049 std_dev=0.049
N6	A	0, 0.000, 0.068, 0.137, 0.137 max_d=0.137 avg_d=0.068 std_dev=0.068
C2'	A	0, 0.000, 0.190, 0.379, 0.379 max_d=0.379 avg_d=0.190 std_dev=0.190
O4'	A	0, 0.000, 0.202, 0.403, 0.403 max_d=0.403 avg_d=0.202 std_dev=0.202
O2'	A	0, 0.000, 0.237, 0.473, 0.473 max_d=0.473 avg_d=0.237 std_dev=0.237
O5'	A	0, 0.000, 0.251, 0.502, 0.502 max_d=0.502 avg_d=0.251 std_dev=0.251
C3'	A	0, 0.000, 0.332, 0.664, 0.664 max_d=0.664 avg_d=0.332 std_dev=0.332
C4'	A	0, 0.000, 0.342, 0.685, 0.685 max_d=0.685 avg_d=0.342 std_dev=0.342
O3'	A	0, 0.000, 0.434, 0.868, 0.868 max_d=0.868 avg_d=0.434 std_dev=0.434
N3	B	0, 0.000, 0.451, 0.903, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.451 std_dev=0.451
C2	B	0, 0.000, 0.493, 0.985, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.493 std_dev=0.493
P	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
OP2	B	0, 0.000, 0.571, 1.142, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.571 std_dev=0.571
C4	B	0, 0.000, 0.571, 1.143, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.571 std_dev=0.571
OP1	B	0, 0.000, 0.616, 1.232, 1.232 max_d=1.232 avg_d=0.616 std_dev=0.616
P	A	0, 0.000, 0.642, 1.285, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.642 std_dev=0.642
N1	B	0, 0.000, 0.664, 1.329, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.664 std_dev=0.664
O3'	B	0, 0.000, 0.672, 1.344, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.672 std_dev=0.672
C5'	A	0, 0.000, 0.676, 1.353, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.676 std_dev=0.676
O2'	B	0, 0.000, 0.680, 1.361, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.680 std_dev=0.680
N9	B	0, 0.000, 0.695, 1.390, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.695 std_dev=0.695
C2'	B	0, 0.000, 0.703, 1.407, 1.407 max_d=1.407 avg_d=0.703 std_dev=0.703
C5	B	0, 0.000, 0.721, 1.443, 1.443 max_d=1.443 avg_d=0.721 std_dev=0.721
C6	B	0, 0.000, 0.768, 1.537, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.768 std_dev=0.768
C1'	B	0, 0.000, 0.781, 1.563, 1.563 max_d=1.563 avg_d=0.781 std_dev=0.781
C3'	B	0, 0.000, 0.825, 1.649, 1.649 max_d=1.649 avg_d=0.825 std_dev=0.825
C8	B	0, 0.000, 0.864, 1.728, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.864 std_dev=0.864
N7	B	0, 0.000, 0.889, 1.778, 1.778 max_d=1.778 avg_d=0.889 std_dev=0.889
O5'	B	0, 0.000, 0.913, 1.825, 1.825 max_d=1.825 avg_d=0.913 std_dev=0.913
N6	B	0, 0.000, 0.988, 1.976, 1.976 max_d=1.976 avg_d=0.988 std_dev=0.988
OP2	A	0, 0.000, 1.039, 2.079, 2.079 max_d=2.079 avg_d=1.039 std_dev=1.039
O4'	B	0, 0.000, 1.044, 2.089, 2.089 max_d=2.089 avg_d=1.044 std_dev=1.044
OP1	A	0, 0.000, 1.052, 2.105, 2.105 max_d=2.105 avg_d=1.052 std_dev=1.052
C4'	B	0, 0.000, 1.066, 2.133, 2.133 max_d=2.133 avg_d=1.066 std_dev=1.066
C5'	B	0, 0.000, 1.288, 2.575, 2.575 max_d=2.575 avg_d=1.288 std_dev=1.288

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.05	0.04	0.01	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.40	0.08	0.17
C2	0.03	0.00	0.10	0.14	0.01	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.12	0.04	0.13	0.32	0.15	0.13
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.04	0.02	0.03	0.02	0.06	0.04	0.09	0.10	0.06	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.39	0.13	0.17
C3'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.05	0.00	0.03	0.02	0.09	0.08	0.12	0.12	0.09	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.25	0.36	0.15	0.17
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.09	0.00	0.21	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.02	0.03	0.14	0.33	0.10	0.15
C4'	0.00	0.12	0.02	0.00	0.09	0.00	0.11	0.00	0.14	0.05	0.14	0.10	0.16	0.09	0.05	0.10	0.01	0.01	0.00	0.32	0.22	0.06
C5	0.03	0.00	0.03	0.03	0.00	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05	0.16	0.26	0.08	0.13
C5'	0.05	0.25	0.02	0.02	0.21	0.00	0.26	0.00	0.30	0.17	0.29	0.21	0.34	0.23	0.15	0.09	0.03	0.01	0.00	0.30	0.30	0.00
C6	0.04	0.00	0.06	0.09	0.02	0.14	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.06	0.14	0.22	0.12	0.10
C8	0.01	0.01	0.04	0.08	0.00	0.05	0.01	0.17	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.13	0.04	0.17	0.29	0.00	0.17
N1	0.04	0.00	0.09	0.12	0.01	0.14	0.00	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.09	0.05	0.14	0.27	0.14	0.11
N3	0.03	0.00	0.10	0.12	0.00	0.10	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.10	0.03	0.12	0.35	0.13	0.14
N6	0.05	0.01	0.06	0.09	0.02	0.16	0.02	0.34	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.07	0.03	0.08	0.13	0.15	0.12	0.05
N7	0.02	0.00	0.02	0.04	0.00	0.09	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.10	0.05	0.17	0.22	0.02	0.13
N9	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.02	0.15	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.13	0.36	0.06	0.17
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.05	0.10	0.03	0.09	0.07	0.03	0.10	0.10	0.07	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.12	0.43	0.11	0.18
O3'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.13	0.09	0.10	0.03	0.10	0.04	0.03	0.00	0.01	0.25	0.30	0.16	0.15
O4'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.04	0.05	0.03	0.08	0.05	0.03	0.04	0.01	0.00	0.03	0.41	0.09	0.15
O5'	0.07	0.13	0.16	0.25	0.14	0.00	0.16	0.00	0.14	0.17	0.14	0.12	0.13	0.17	0.13	0.12	0.25	0.03	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.40	0.32	0.39	0.36	0.33	0.32	0.26	0.30	0.22	0.29	0.27	0.35	0.15	0.22	0.36	0.43	0.30	0.41	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.15	0.13	0.15	0.10	0.22	0.08	0.30	0.12	0.00	0.14	0.13	0.12	0.02	0.06	0.11	0.16	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.17	0.13	0.17	0.17	0.15	0.06	0.13	0.00	0.10	0.17	0.11	0.14	0.05	0.13	0.17	0.18	0.15	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.12	0.08	0.19	0.00	0.24	0.06	0.31	0.02	0.15	0.06	0.10	0.06	0.14	0.07	0.04	0.25	0.15	0.35	0.15	0.30	0.13
C2	0.08	0.22	0.14	0.19	0.09	0.21	0.11	0.22	0.17	0.00	0.23	0.15	0.18	0.06	0.01	0.17	0.25	0.14	0.26	0.13	0.36	0.14
C2'	0.04	0.13	0.06	0.17	0.00	0.21	0.06	0.29	0.03	0.14	0.06	0.11	0.07	0.14	0.06	0.02	0.25	0.13	0.38	0.11	0.37	0.18
C3'	0.03	0.11	0.03	0.15	0.02	0.19	0.10	0.28	0.07	0.18	0.03	0.10	0.13	0.19	0.08	0.02	0.23	0.12	0.42	0.04	0.44	0.24
C4	0.06	0.16	0.12	0.20	0.04	0.21	0.02	0.24	0.06	0.07	0.12	0.12	0.04	0.04	0.03	0.10	0.26	0.13	0.29	0.15	0.34	0.13
C4'	0.07	0.19	0.09	0.03	0.07	0.11	0.02	0.22	0.01	0.10	0.11	0.19	0.05	0.11	0.01	0.13	0.10	0.03	0.33	0.14	0.28	0.12
C5	0.03	0.15	0.10	0.17	0.06	0.15	0.03	0.17	0.06	0.03	0.11	0.13	0.05	0.01	0.00	0.07	0.22	0.08	0.24	0.15	0.34	0.11
C5'	0.22	0.33	0.27	0.13	0.21	0.02	0.11	0.13	0.14	0.02	0.24	0.34	0.07	0.00	0.15	0.31	0.04	0.10	0.27	0.12	0.25	0.11
C6	0.02	0.21	0.10	0.14	0.11	0.13	0.12	0.13	0.16	0.05	0.20	0.16	0.16	0.08	0.05	0.10	0.19	0.06	0.19	0.14	0.35	0.10
C8	0.02	0.06	0.06	0.18	0.02	0.15	0.09	0.21	0.08	0.13	0.01	0.07	0.11	0.14	0.06	0.06	0.23	0.08	0.29	0.18	0.32	0.10
N1	0.05	0.24	0.12	0.16	0.12	0.17	0.15	0.16	0.21	0.05	0.25	0.16	0.22	0.10	0.04	0.15	0.22	0.10	0.22	0.13	0.36	0.12
N3	0.08	0.19	0.14	0.21	0.06	0.23	0.05	0.26	0.10	0.05	0.17	0.13	0.10	0.01	0.02	0.15	0.26	0.15	0.30	0.13	0.35	0.14
N6	0.03	0.24	0.05	0.08	0.16	0.05	0.18	0.04	0.22	0.12	0.24	0.19	0.22	0.16	0.11	0.05	0.13	0.01	0.12	0.16	0.33	0.07
N7	0.00	0.07	0.06	0.16	0.01	0.11	0.04	0.15	0.04	0.07	0.01	0.09	0.06	0.08	0.02	0.06	0.19	0.04	0.24	0.17	0.33	0.09
N9	0.06	0.12	0.10	0.21	0.00	0.22	0.05	0.27	0.01	0.12	0.06	0.10	0.04	0.11	0.06	0.05	0.27	0.14	0.32	0.15	0.33	0.13
O2'	0.06	0.14	0.07	0.19	0.00	0.25	0.07	0.34	0.02	0.17	0.07	0.11	0.07	0.16	0.08	0.04	0.26	0.16	0.41	0.10	0.36	0.19
O3'	0.05	0.03	0.04	0.14	0.08	0.18	0.18	0.27	0.16	0.23	0.06	0.04	0.23	0.26	0.13	0.01	0.22	0.12	0.46	0.00	0.49	0.28
O4'	0.04	0.11	0.03	0.16	0.01	0.22	0.08	0.32	0.05	0.17	0.04	0.10	0.10	0.17	0.08	0.02	0.21	0.14	0.36	0.15	0.28	0.13
O5'	0.04	0.18	0.01	0.07	0.23	0.05	0.35	0.14	0.37	0.33	0.29	0.13	0.44	0.40	0.21	0.12	0.02	0.06	0.33	0.23	0.29	0.10
OP1	0.03	0.09	0.01	0.00	0.11	0.05	0.17	0.09	0.17	0.17	0.14	0.06	0.21	0.20	0.11	0.03	0.02	0.04	0.16	0.32	0.01	0.04
OP2	0.10	0.05	0.03	0.07	0.19	0.22	0.31	0.37	0.28	0.41	0.16	0.04	0.35	0.43	0.24	0.09	0.03	0.20	0.67	0.33	0.72	0.56
P	0.03	0.09	0.02	0.03	0.14	0.08	0.23	0.17	0.23	0.26	0.17	0.06	0.29	0.29	0.16	0.07	0.01	0.07	0.33	0.13	0.28	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.08	0.30	0.10
C2	0.02	0.00	0.05	0.09	0.00	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.09	0.01	0.20	0.12	0.63	0.29
C2'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.07	0.05	0.06	0.04	0.07	0.06	0.04	0.00	0.00	0.01	0.11	0.17	0.27	0.06
C3'	0.02	0.09	0.01	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.14	0.13	0.12	0.07	0.15	0.15	0.10	0.01	0.01	0.01	0.16	0.18	0.23	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.11	0.00	0.20	0.17	0.62	0.32
C4'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.04	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.24	0.04	0.06
C5	0.00	0.01	0.06	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.25	0.32	0.76	0.43
C5'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.06	0.06	0.05	0.03	0.07	0.07	0.04	0.03	0.04	0.02	0.01	0.09	0.00	0.02
C6	0.01	0.00	0.07	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.01	0.25	0.33	0.79	0.43
C8	0.01	0.00	0.05	0.13	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.03	0.24	0.34	0.72	0.44
N1	0.02	0.00	0.06	0.12	0.00	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.23	0.23	0.73	0.37
N3	0.02	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.17	0.06	0.55	0.25
N6	0.00	0.00	0.07	0.15	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.02	0.27	0.42	0.85	0.49
N7	0.01	0.01	0.06	0.15	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.18	0.03	0.26	0.42	0.83	0.50
N9	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.10	0.01	0.18	0.15	0.56	0.30
O2'	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.04	0.31	0.12	0.07
O3'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.11	0.00	0.16	0.04	0.17	0.15	0.14	0.06	0.20	0.18	0.10	0.04	0.00	0.00	0.14	0.33	0.11	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.08	0.17	0.05
O5'	0.06	0.20	0.11	0.16	0.20	0.00	0.25	0.01	0.25	0.24	0.23	0.17	0.27	0.26	0.18	0.04	0.14	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.08	0.12	0.17	0.18	0.17	0.24	0.32	0.09	0.33	0.34	0.23	0.06	0.42	0.42	0.15	0.31	0.33	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.63	0.27	0.23	0.62	0.04	0.76	0.00	0.79	0.72	0.73	0.55	0.85	0.83	0.56	0.12	0.11	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.10	0.29	0.06	0.07	0.32	0.06	0.43	0.02	0.43	0.44	0.37	0.25	0.49	0.50	0.30	0.07	0.04	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00