Doublet Group distance statistics: 55096

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 3, 11, 9, 1, 8, 3, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.013, 0.021, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.021 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.014, 0.022, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.021, 0.029, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.029 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.020, 0.031, 0.043, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.031 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.012, 0.024, 0.036, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.024 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.037, 0.052, 0.068, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.052 std_dev=0.016
O2	A	0, 0.048, 0.068, 0.088, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.068 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.049, 0.097, 0.145, 0.217 max_d=0.217 avg_d=0.097 std_dev=0.048
O4'	A	0, 0.416, 0.561, 0.707, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.561 std_dev=0.145
C2'	A	0, 0.449, 0.611, 0.773, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.611 std_dev=0.162
O2'	B	0, 0.434, 0.610, 0.786, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.610 std_dev=0.176
O3'	B	0, 0.430, 0.621, 0.813, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.621 std_dev=0.191
C5'	A	0, 0.683, 0.882, 1.082, 1.236 max_d=1.236 avg_d=0.882 std_dev=0.199
OP1	A	0, 0.495, 0.702, 0.909, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.702 std_dev=0.207
C2'	B	0, 0.511, 0.737, 0.963, 1.151 max_d=1.151 avg_d=0.737 std_dev=0.226
C4'	A	0, 0.746, 0.983, 1.221, 1.214 max_d=1.214 avg_d=0.983 std_dev=0.237
P	A	0, 0.372, 0.626, 0.879, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.626 std_dev=0.253
O5'	A	0, 0.871, 1.135, 1.398, 1.489 max_d=1.489 avg_d=1.135 std_dev=0.263
C3'	A	0, 1.104, 1.372, 1.640, 1.533 max_d=1.533 avg_d=1.372 std_dev=0.268
C3'	B	0, 0.269, 0.564, 0.859, 1.212 max_d=1.212 avg_d=0.564 std_dev=0.295
O2'	A	0, 1.105, 1.404, 1.702, 1.798 max_d=1.798 avg_d=1.404 std_dev=0.298
C5	B	0, 0.594, 0.915, 1.236, 1.829 max_d=1.829 avg_d=0.915 std_dev=0.321
C4'	B	0, 0.800, 1.148, 1.495, 1.890 max_d=1.890 avg_d=1.148 std_dev=0.347
OP2	A	0, 0.468, 0.818, 1.168, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.818 std_dev=0.350
C1'	B	0, 1.008, 1.366, 1.723, 1.984 max_d=1.984 avg_d=1.366 std_dev=0.357
C6	B	0, 0.282, 0.679, 1.076, 1.717 max_d=1.717 avg_d=0.679 std_dev=0.397
O4'	B	0, 1.159, 1.562, 1.964, 2.351 max_d=2.351 avg_d=1.562 std_dev=0.403
N1	B	0, 1.175, 1.589, 2.004, 2.231 max_d=2.231 avg_d=1.589 std_dev=0.415
C5'	B	0, 1.359, 1.814, 2.268, 2.643 max_d=2.643 avg_d=1.814 std_dev=0.455
O3'	A	0, 2.135, 2.660, 3.185, 2.931 max_d=2.931 avg_d=2.660 std_dev=0.525
C4	B	0, 1.794, 2.362, 2.930, 3.101 max_d=3.101 avg_d=2.362 std_dev=0.568
C2	B	0, 2.433, 3.082, 3.731, 3.587 max_d=3.587 avg_d=3.082 std_dev=0.649
O4	B	0, 2.184, 2.846, 3.509, 3.771 max_d=3.771 avg_d=2.846 std_dev=0.663
O5'	B	0, 3.120, 3.844, 4.567, 4.574 max_d=4.574 avg_d=3.844 std_dev=0.723
N3	B	0, 2.676, 3.400, 4.123, 4.025 max_d=4.025 avg_d=3.400 std_dev=0.724
O2	B	0, 3.309, 4.114, 4.919, 4.665 max_d=4.665 avg_d=4.114 std_dev=0.805
OP1	B	0, 4.359, 5.244, 6.130, 5.753 max_d=5.753 avg_d=5.244 std_dev=0.885
P	B	0, 4.448, 5.381, 6.314, 6.034 max_d=6.034 avg_d=5.381 std_dev=0.933
OP2	B	0, 6.581, 7.914, 9.247, 8.657 max_d=8.657 avg_d=7.914 std_dev=1.333

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.13	0.03	0.00	0.14	0.18	0.10	0.08
C2	0.02	0.00	0.07	0.06	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.05	0.19	0.18	0.11	0.11
C2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.05	0.01	0.08	0.09	0.09	0.02	0.06	0.12	0.00	0.02	0.06	0.02	0.33	0.27	0.29	0.25
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.02	0.07	0.05	0.08	0.07	0.02	0.01	0.10	0.01	0.19	0.19	0.19	0.12
C4	0.02	0.02	0.05	0.09	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.02	0.01	0.02	0.14	0.08	0.01	0.03	0.21	0.16	0.13	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.03	0.03	0.05	0.08	0.03	0.04	0.00	0.02	0.16	0.07	0.04
C5	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.17	0.07	0.01	0.05	0.22	0.15	0.13	0.13
C5'	0.04	0.07	0.09	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.07	0.07	0.08	0.05	0.06	0.09	0.01	0.01	0.19	0.07	0.02
C6	0.01	0.01	0.09	0.07	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.07	0.01	0.06	0.21	0.17	0.12	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.02	0.01	0.19	0.18	0.11	0.10
N3	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.10	0.02	0.04	0.20	0.17	0.12	0.11
O2	0.03	0.01	0.12	0.07	0.02	0.05	0.02	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.16	0.02	0.08	0.17	0.18	0.12	0.11
O2'	0.01	0.08	0.00	0.02	0.14	0.08	0.17	0.05	0.16	0.08	0.10	0.13	0.00	0.04	0.15	0.05	0.29	0.24	0.31	0.25
O3'	0.13	0.12	0.02	0.01	0.08	0.03	0.07	0.06	0.07	0.09	0.10	0.16	0.04	0.00	0.09	0.10	0.11	0.16	0.16	0.07
O4	0.03	0.02	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.02	0.02	0.15	0.09	0.00	0.04	0.22	0.15	0.13	0.13
O4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.08	0.05	0.10	0.04	0.00	0.07	0.19	0.07	0.11
O5'	0.14	0.19	0.33	0.19	0.21	0.02	0.22	0.01	0.21	0.19	0.20	0.17	0.29	0.11	0.22	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.18	0.18	0.27	0.19	0.16	0.16	0.15	0.19	0.17	0.18	0.17	0.18	0.24	0.16	0.15	0.19	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.11	0.29	0.19	0.13	0.07	0.13	0.07	0.12	0.11	0.12	0.12	0.31	0.16	0.13	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.11	0.25	0.12	0.12	0.04	0.13	0.02	0.12	0.10	0.11	0.11	0.25	0.07	0.13	0.11	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.12	0.09	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.11	0.09	0.13	0.17	0.10	0.14	0.13	0.11	0.13	0.14	0.13	0.12
C2	0.14	0.17	0.13	0.15	0.16	0.17	0.15	0.18	0.15	0.14	0.17	0.20	0.14	0.16	0.17	0.16	0.17	0.18	0.19	0.18
C2'	0.19	0.23	0.20	0.19	0.23	0.17	0.22	0.17	0.21	0.21	0.23	0.26	0.19	0.18	0.24	0.18	0.20	0.21	0.23	0.20
C3'	0.11	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.11	0.10	0.08	0.11	0.18	0.16	0.12	0.12	0.12	0.11	0.15	0.12	0.11
C4	0.23	0.24	0.19	0.20	0.22	0.23	0.22	0.23	0.23	0.23	0.23	0.26	0.20	0.16	0.22	0.24	0.22	0.22	0.25	0.23
C4'	0.20	0.20	0.20	0.19	0.18	0.19	0.19	0.18	0.20	0.19	0.19	0.24	0.23	0.20	0.19	0.20	0.19	0.17	0.17	0.17
C5	0.22	0.22	0.20	0.20	0.21	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.22	0.24	0.20	0.16	0.21	0.24	0.21	0.19	0.22	0.21
C5'	0.29	0.31	0.29	0.25	0.28	0.24	0.28	0.21	0.29	0.29	0.30	0.34	0.30	0.21	0.29	0.27	0.22	0.16	0.18	0.18
C6	0.16	0.17	0.16	0.16	0.16	0.17	0.17	0.17	0.17	0.16	0.17	0.20	0.16	0.16	0.17	0.18	0.17	0.16	0.17	0.16
N1	0.13	0.14	0.12	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.14	0.13	0.15	0.18	0.12	0.15	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.15
N3	0.19	0.20	0.17	0.17	0.19	0.20	0.19	0.21	0.19	0.19	0.20	0.24	0.17	0.16	0.20	0.20	0.20	0.20	0.23	0.21
O2	0.13	0.16	0.12	0.14	0.16	0.15	0.14	0.17	0.14	0.13	0.17	0.20	0.12	0.16	0.18	0.14	0.16	0.17	0.18	0.17
O2'	0.38	0.42	0.34	0.29	0.40	0.31	0.38	0.30	0.37	0.39	0.42	0.46	0.35	0.24	0.40	0.36	0.31	0.28	0.32	0.30
O3'	0.17	0.17	0.15	0.14	0.18	0.15	0.18	0.15	0.17	0.16	0.18	0.21	0.19	0.16	0.22	0.16	0.14	0.16	0.14	0.14
O4	0.27	0.28	0.22	0.21	0.26	0.26	0.26	0.26	0.27	0.27	0.27	0.31	0.22	0.16	0.26	0.29	0.26	0.24	0.29	0.27
O4'	0.20	0.18	0.20	0.22	0.18	0.23	0.20	0.23	0.21	0.19	0.18	0.20	0.20	0.24	0.19	0.22	0.23	0.21	0.21	0.21
O5'	0.16	0.22	0.17	0.07	0.17	0.07	0.15	0.04	0.15	0.17	0.20	0.28	0.22	0.02	0.16	0.12	0.09	0.13	0.12	0.09
OP1	0.03	0.11	0.05	0.04	0.11	0.08	0.12	0.15	0.10	0.06	0.12	0.16	0.10	0.01	0.13	0.06	0.18	0.22	0.20	0.19
OP2	0.08	0.16	0.11	0.04	0.13	0.06	0.13	0.12	0.11	0.09	0.17	0.22	0.15	0.02	0.15	0.06	0.16	0.17	0.16	0.16
P	0.05	0.13	0.08	0.01	0.11	0.03	0.11	0.08	0.09	0.07	0.13	0.18	0.11	0.01	0.12	0.02	0.11	0.14	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.07	0.09	0.06
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.02	0.03	0.11	0.12	0.18	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.06	0.10	0.00	0.02	0.06	0.01	0.04	0.09	0.08	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.05	0.07	0.08	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.10	0.07	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.01	0.03	0.18	0.20	0.28	0.22
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06	0.02	0.06	0.00	0.01	0.07	0.03	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.04	0.19	0.21	0.28	0.22
C5'	0.02	0.05	0.01	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.11	0.06	0.08	0.06	0.06	0.04	0.12	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.09	0.01	0.07	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.09	0.01	0.03	0.16	0.15	0.20	0.17
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.11	0.10	0.15	0.11
N3	0.02	0.01	0.06	0.07	0.01	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.08	0.01	0.02	0.15	0.16	0.24	0.17
O2	0.05	0.01	0.10	0.08	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.15	0.11	0.02	0.06	0.10	0.13	0.16	0.12
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.08	0.06	0.04	0.06	0.03	0.04	0.10	0.15	0.00	0.04	0.10	0.04	0.03	0.12	0.06	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.09	0.02	0.10	0.04	0.09	0.05	0.08	0.11	0.04	0.00	0.09	0.02	0.08	0.16	0.11	0.10
O4	0.02	0.02	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.02	0.10	0.09	0.00	0.03	0.19	0.22	0.31	0.24
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.04	0.02	0.03	0.00	0.06	0.07	0.08	0.07
O5'	0.06	0.11	0.04	0.05	0.18	0.01	0.19	0.01	0.16	0.11	0.15	0.10	0.03	0.08	0.19	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.12	0.09	0.10	0.20	0.07	0.21	0.05	0.15	0.10	0.16	0.13	0.12	0.16	0.22	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.18	0.08	0.07	0.28	0.03	0.28	0.02	0.20	0.15	0.24	0.16	0.06	0.11	0.31	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.13	0.05	0.06	0.22	0.03	0.22	0.02	0.17	0.11	0.17	0.12	0.05	0.10	0.24	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00