Doublet Group distance statistics: 55119

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.003, 0.012, 0.022, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C4	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, -0.001, 0.017, 0.035, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.005, 0.027, 0.048, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.027 std_dev=0.021
C1'	A	0, 0.005, 0.028, 0.050, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.023
O4	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.031 std_dev=0.024
C2	A	0, -0.003, 0.023, 0.048, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.023 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.006, 0.082, 0.158, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.082 std_dev=0.076
C2	B	0, 0.147, 0.528, 0.908, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.528 std_dev=0.380
N1	B	0, 0.171, 0.594, 1.018, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.594 std_dev=0.423
O2	B	0, 0.177, 0.617, 1.056, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.617 std_dev=0.440
C2'	A	0, 0.050, 0.533, 1.016, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.533 std_dev=0.483
C1'	B	0, 0.124, 0.610, 1.095, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.610 std_dev=0.486
O4'	A	0, 0.022, 0.523, 1.025, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.523 std_dev=0.501
N3	B	0, 0.216, 0.739, 1.262, 1.111 max_d=1.111 avg_d=0.739 std_dev=0.523
O2'	A	0, 0.085, 0.627, 1.170, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.627 std_dev=0.543
O2'	B	0, 0.175, 0.742, 1.308, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.742 std_dev=0.567
O5'	A	0, 0.212, 0.779, 1.347, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.779 std_dev=0.567
C2'	B	0, 0.161, 0.806, 1.452, 1.581 max_d=1.581 avg_d=0.806 std_dev=0.646
C6	B	0, 0.217, 0.874, 1.530, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.874 std_dev=0.656
O4'	B	0, 0.090, 0.757, 1.424, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.757 std_dev=0.667
C4'	A	0, 0.051, 0.757, 1.462, 1.698 max_d=1.698 avg_d=0.757 std_dev=0.706
O5'	B	0, 0.218, 0.931, 1.644, 1.732 max_d=1.732 avg_d=0.931 std_dev=0.713
C4	B	0, 0.269, 1.008, 1.747, 1.753 max_d=1.753 avg_d=1.008 std_dev=0.739
C3'	A	0, 0.068, 0.837, 1.607, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.837 std_dev=0.769
C5	B	0, 0.254, 1.069, 1.884, 1.975 max_d=1.975 avg_d=1.069 std_dev=0.815
C3'	B	0, 0.157, 0.994, 1.831, 2.048 max_d=2.048 avg_d=0.994 std_dev=0.837
O3'	B	0, 0.174, 1.019, 1.864, 2.068 max_d=2.068 avg_d=1.019 std_dev=0.845
P	A	0, 0.265, 1.145, 2.026, 2.140 max_d=2.140 avg_d=1.145 std_dev=0.880
C4'	B	0, 0.078, 0.965, 1.851, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.965 std_dev=0.887
O4	B	0, 0.303, 1.244, 2.185, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.244 std_dev=0.941
P	B	0, 0.348, 1.299, 2.250, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.299 std_dev=0.951
C5'	B	0, 0.102, 1.156, 2.209, 2.548 max_d=2.548 avg_d=1.156 std_dev=1.053
OP2	B	0, 0.424, 1.533, 2.642, 2.586 max_d=2.586 avg_d=1.533 std_dev=1.109
O3'	A	0, 0.117, 1.235, 2.353, 2.707 max_d=2.707 avg_d=1.235 std_dev=1.118
OP2	A	0, 0.456, 1.611, 2.766, 2.650 max_d=2.650 avg_d=1.611 std_dev=1.155
C5'	A	0, 0.088, 1.345, 2.603, 3.026 max_d=3.026 avg_d=1.345 std_dev=1.258
OP1	B	0, 0.503, 1.930, 3.356, 3.404 max_d=3.404 avg_d=1.930 std_dev=1.426
OP1	A	0, 0.600, 2.108, 3.617, 3.445 max_d=3.445 avg_d=2.108 std_dev=1.509

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.13	0.51	0.23	0.24
C2	0.02	0.00	0.13	0.14	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.17	0.01	0.07	0.17	0.39	0.26	0.10
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.01	0.12	0.00	0.09	0.21	0.00	0.00	0.02	0.00	0.18	0.48	0.19	0.16
C3'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.15	0.01	0.12	0.20	0.01	0.00	0.06	0.01	0.36	0.44	0.33	0.29
C4	0.02	0.01	0.02	0.05	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.21	0.19	0.41	0.06
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.06	0.00	0.02	0.43	0.21	0.14
C5	0.02	0.02	0.10	0.11	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.14	0.01	0.11	0.22	0.14	0.42	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.08	0.01	0.11	0.00	0.10	0.04	0.04	0.05	0.03	0.05	0.09	0.01	0.00	0.22	0.33	0.01
C6	0.03	0.01	0.12	0.15	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.17	0.01	0.13	0.20	0.23	0.34	0.03
N1	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.37	0.26	0.11
N3	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.16	0.01	0.02	0.19	0.31	0.33	0.05
O2	0.07	0.01	0.21	0.20	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.15	0.27	0.01	0.16	0.13	0.46	0.22	0.13
O2'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.07	0.03	0.07	0.01	0.06	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.58	0.05	0.19
O3'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.06	0.01	0.14	0.05	0.17	0.01	0.16	0.27	0.00	0.00	0.07	0.01	0.51	0.54	0.49	0.46
O4	0.02	0.01	0.02	0.06	0.00	0.06	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.05	0.22	0.14	0.45	0.09
O4'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.05	0.00	0.11	0.01	0.13	0.01	0.02	0.16	0.01	0.01	0.05	0.00	0.28	0.55	0.43	0.39
O5'	0.13	0.17	0.18	0.36	0.21	0.02	0.22	0.00	0.20	0.17	0.19	0.13	0.06	0.51	0.22	0.28	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.51	0.39	0.48	0.44	0.19	0.43	0.14	0.22	0.23	0.37	0.31	0.46	0.58	0.54	0.14	0.55	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.23	0.26	0.19	0.33	0.41	0.21	0.42	0.33	0.34	0.26	0.33	0.22	0.05	0.49	0.45	0.43	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.24	0.10	0.16	0.29	0.06	0.14	0.07	0.01	0.03	0.11	0.05	0.13	0.19	0.46	0.09	0.39	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.18	0.25	0.27	0.12	0.26	0.14	0.24	0.05	0.10	0.08	0.37	0.26	0.28	0.17	0.22	0.38	0.35	0.32	0.25
C2	0.12	0.04	0.07	0.10	0.32	0.12	0.42	0.15	0.33	0.14	0.09	0.28	0.07	0.13	0.37	0.14	0.28	0.33	0.47	0.31
C2'	0.10	0.09	0.10	0.13	0.18	0.12	0.29	0.13	0.25	0.08	0.05	0.30	0.10	0.15	0.21	0.12	0.19	0.46	0.59	0.38
C3'	0.31	0.16	0.28	0.29	0.30	0.29	0.41	0.30	0.41	0.31	0.19	0.03	0.24	0.29	0.29	0.31	0.26	0.59	0.78	0.55
C4	0.24	0.15	0.16	0.15	0.36	0.22	0.58	0.29	0.51	0.30	0.15	0.22	0.09	0.13	0.34	0.27	0.27	0.39	0.58	0.43
C4'	0.16	0.20	0.04	0.07	0.26	0.10	0.26	0.09	0.22	0.20	0.24	0.17	0.14	0.08	0.28	0.19	0.07	0.34	0.47	0.26
C5	0.23	0.17	0.15	0.14	0.22	0.20	0.43	0.24	0.44	0.27	0.14	0.23	0.09	0.13	0.17	0.24	0.27	0.37	0.57	0.41
C5'	0.52	0.51	0.23	0.28	0.41	0.46	0.38	0.38	0.40	0.49	0.47	0.57	0.05	0.35	0.39	0.59	0.23	0.34	0.60	0.38
C6	0.16	0.13	0.09	0.09	0.13	0.13	0.28	0.16	0.27	0.16	0.08	0.26	0.05	0.09	0.12	0.16	0.28	0.33	0.50	0.33
N1	0.12	0.09	0.10	0.12	0.19	0.13	0.29	0.14	0.23	0.09	0.02	0.30	0.12	0.14	0.22	0.13	0.30	0.32	0.43	0.29
N3	0.18	0.09	0.10	0.11	0.40	0.17	0.54	0.22	0.44	0.24	0.13	0.24	0.03	0.11	0.43	0.21	0.27	0.35	0.52	0.37
O2	0.09	0.03	0.07	0.11	0.35	0.11	0.42	0.12	0.31	0.12	0.13	0.28	0.09	0.14	0.43	0.12	0.28	0.32	0.44	0.29
O2'	0.19	0.23	0.17	0.22	0.09	0.27	0.16	0.25	0.08	0.10	0.13	0.45	0.13	0.25	0.14	0.25	0.28	0.41	0.44	0.27
O3'	0.37	0.18	0.38	0.41	0.31	0.38	0.44	0.40	0.46	0.35	0.19	0.05	0.35	0.40	0.29	0.38	0.40	0.74	0.92	0.69
O4	0.29	0.19	0.22	0.21	0.42	0.29	0.67	0.37	0.58	0.35	0.19	0.21	0.14	0.17	0.39	0.33	0.29	0.44	0.62	0.49
O4'	0.17	0.08	0.35	0.35	0.16	0.25	0.09	0.25	0.02	0.06	0.14	0.10	0.47	0.34	0.21	0.14	0.40	0.41	0.24	0.27
O5'	0.15	0.12	0.23	0.14	0.19	0.08	0.22	0.13	0.22	0.18	0.15	0.08	0.30	0.01	0.20	0.11	0.12	0.50	0.61	0.39
OP1	0.08	0.14	0.02	0.07	0.06	0.06	0.03	0.15	0.02	0.07	0.12	0.22	0.07	0.00	0.07	0.05	0.36	0.14	0.39	0.24
OP2	0.18	0.25	0.20	0.04	0.31	0.02	0.30	0.05	0.26	0.23	0.29	0.21	0.32	0.01	0.33	0.08	0.20	0.39	0.51	0.31
P	0.05	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.05	0.03	0.07	0.01	0.00	0.04	0.04	0.16	0.30	0.46	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.23	0.26	0.32	0.17
C2	0.03	0.00	0.03	0.03	0.02	0.10	0.02	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.03	0.13	0.35	0.24	0.21	0.20
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.29	0.47	0.25
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.01	0.06	0.00	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.29	0.40	0.20
C4	0.00	0.02	0.06	0.04	0.00	0.02	0.01	0.06	0.02	0.00	0.01	0.03	0.07	0.03	0.00	0.02	0.49	0.22	0.07	0.23
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.02	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.07	0.21	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.27	0.27	0.09
C5	0.02	0.02	0.05	0.08	0.01	0.09	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.54	0.24	0.11	0.27
C5'	0.03	0.14	0.04	0.01	0.06	0.00	0.12	0.00	0.13	0.06	0.10	0.24	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.27	0.18	0.01
C6	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.10	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.02	0.08	0.02	0.02	0.10	0.51	0.22	0.06	0.23
N1	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.37	0.23	0.22	0.19
N3	0.02	0.01	0.06	0.00	0.01	0.07	0.00	0.10	0.02	0.01	0.00	0.02	0.11	0.06	0.02	0.09	0.41	0.20	0.07	0.19
O2	0.08	0.01	0.02	0.10	0.03	0.21	0.03	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00	0.13	0.13	0.04	0.24	0.30	0.29	0.30	0.25
O2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.08	0.01	0.11	0.13	0.00	0.02	0.08	0.01	0.07	0.34	0.55	0.31
O3'	0.05	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.06	0.13	0.02	0.00	0.03	0.05	0.11	0.29	0.42	0.19
O4	0.00	0.03	0.07	0.05	0.00	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.02	0.04	0.08	0.03	0.00	0.02	0.51	0.24	0.15	0.26
O4'	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.09	0.24	0.01	0.05	0.02	0.00	0.21	0.24	0.22	0.07
O5'	0.23	0.35	0.11	0.08	0.49	0.01	0.54	0.00	0.51	0.37	0.41	0.30	0.07	0.11	0.51	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.26	0.24	0.29	0.29	0.22	0.27	0.24	0.27	0.22	0.23	0.20	0.29	0.34	0.29	0.24	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.32	0.21	0.47	0.40	0.07	0.27	0.11	0.18	0.06	0.22	0.07	0.30	0.55	0.42	0.15	0.22	0.00	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.20	0.25	0.20	0.23	0.09	0.27	0.01	0.23	0.19	0.19	0.25	0.31	0.19	0.26	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00