Doublet Group distance statistics: 55125

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.021 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C2	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
C6	A	0, 0.000, 0.030, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O4	A	0, 0.000, 0.040, 0.081, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.040 std_dev=0.040
O2'	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
O2	A	0, 0.000, 0.081, 0.163, 0.163 max_d=0.163 avg_d=0.081 std_dev=0.081
C2'	A	0, 0.000, 0.094, 0.188, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.094 std_dev=0.094
O2'	B	0, 0.000, 0.167, 0.333, 0.333 max_d=0.333 avg_d=0.167 std_dev=0.167
O4'	A	0, 0.000, 0.186, 0.372, 0.372 max_d=0.372 avg_d=0.186 std_dev=0.186
C2'	B	0, 0.000, 0.313, 0.626, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.313 std_dev=0.313
C3'	A	0, 0.000, 0.335, 0.670, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.335 std_dev=0.335
O3'	A	0, 0.000, 0.406, 0.811, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.406 std_dev=0.406
P	A	0, 0.000, 0.513, 1.025, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.513 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.000, 0.516, 1.031, 1.031 max_d=1.031 avg_d=0.516 std_dev=0.516
C4'	A	0, 0.000, 0.542, 1.085, 1.085 max_d=1.085 avg_d=0.542 std_dev=0.542
O5'	A	0, 0.000, 0.549, 1.099, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.549 std_dev=0.549
O3'	B	0, 0.000, 0.561, 1.122, 1.122 max_d=1.122 avg_d=0.561 std_dev=0.561
C3'	B	0, 0.000, 0.617, 1.234, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.617 std_dev=0.617
OP2	B	0, 0.000, 0.618, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.618 std_dev=0.618
OP2	A	0, 0.000, 0.680, 1.360, 1.360 max_d=1.360 avg_d=0.680 std_dev=0.680
C1'	B	0, 0.000, 0.685, 1.370, 1.370 max_d=1.370 avg_d=0.685 std_dev=0.685
C5'	A	0, 0.000, 0.844, 1.688, 1.688 max_d=1.688 avg_d=0.844 std_dev=0.844
O2	B	0, 0.000, 0.865, 1.731, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.865 std_dev=0.865
C2	B	0, 0.000, 1.123, 2.245, 2.245 max_d=2.245 avg_d=1.123 std_dev=1.123
C4'	B	0, 0.000, 1.140, 2.280, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.140 std_dev=1.140
O4'	B	0, 0.000, 1.148, 2.296, 2.296 max_d=2.296 avg_d=1.148 std_dev=1.148
N1	B	0, 0.000, 1.254, 2.509, 2.509 max_d=2.509 avg_d=1.254 std_dev=1.254
P	B	0, 0.000, 1.338, 2.676, 2.676 max_d=2.676 avg_d=1.338 std_dev=1.338
O5'	B	0, 0.000, 1.415, 2.830, 2.830 max_d=2.830 avg_d=1.415 std_dev=1.415
C5'	B	0, 0.000, 1.673, 3.346, 3.346 max_d=3.346 avg_d=1.673 std_dev=1.673
N3	B	0, 0.000, 1.767, 3.534, 3.534 max_d=3.534 avg_d=1.767 std_dev=1.767
C6	B	0, 0.000, 2.095, 4.191, 4.191 max_d=4.191 avg_d=2.095 std_dev=2.095
OP1	B	0, 0.000, 2.163, 4.327, 4.327 max_d=4.327 avg_d=2.163 std_dev=2.163
C4	B	0, 0.000, 2.498, 4.997, 4.997 max_d=4.997 avg_d=2.498 std_dev=2.498
C5	B	0, 0.000, 2.682, 5.365, 5.365 max_d=5.365 avg_d=2.682 std_dev=2.682
O4	B	0, 0.000, 3.039, 6.079, 6.079 max_d=6.079 avg_d=3.039 std_dev=3.039

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.09	0.02	0.01	0.34	0.19	0.30	0.28
C2	0.04	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.08	0.31	0.16	0.24	0.24
C2'	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.05	0.06	0.11	0.06	0.02	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.05	0.33	0.13	0.31	0.25
C3'	0.02	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.10	0.01	0.01	0.13	0.00	0.01	0.06	0.04	0.18	0.04	0.21	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.12	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.07	0.00	0.01	0.19	0.02	0.10	0.12
C4'	0.00	0.03	0.05	0.01	0.12	0.00	0.20	0.00	0.19	0.06	0.03	0.15	0.02	0.07	0.14	0.00	0.01	0.05	0.08	0.01
C5	0.01	0.02	0.06	0.11	0.00	0.20	0.00	0.44	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.12	0.01	0.04	0.16	0.00	0.09	0.10
C5'	0.07	0.15	0.11	0.02	0.36	0.00	0.44	0.00	0.39	0.21	0.24	0.01	0.09	0.03	0.39	0.01	0.01	0.11	0.16	0.03
C6	0.01	0.02	0.06	0.10	0.00	0.19	0.00	0.39	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.05	0.22	0.08	0.17	0.18
N1	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.21	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.00	0.01	0.31	0.16	0.25	0.25
N3	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.04	0.00	0.06	0.26	0.10	0.18	0.19
O2	0.06	0.01	0.04	0.13	0.03	0.15	0.03	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.05	0.05	0.03	0.14	0.36	0.21	0.31	0.29
O2'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.09	0.02	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.02	0.04	0.30	0.12	0.30	0.23
O3'	0.09	0.02	0.01	0.01	0.07	0.07	0.12	0.03	0.12	0.08	0.04	0.05	0.04	0.00	0.08	0.19	0.07	0.02	0.17	0.06
O4	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.14	0.01	0.39	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.08	0.00	0.01	0.15	0.03	0.04	0.07
O4'	0.01	0.08	0.05	0.04	0.01	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.06	0.14	0.04	0.19	0.01	0.00	0.23	0.16	0.22	0.20
O5'	0.34	0.31	0.33	0.18	0.19	0.01	0.16	0.01	0.22	0.31	0.26	0.36	0.30	0.07	0.15	0.23	0.00	0.05	0.03	0.02
OP1	0.19	0.16	0.13	0.04	0.02	0.05	0.00	0.11	0.08	0.16	0.10	0.21	0.12	0.02	0.03	0.16	0.05	0.00	0.04	0.03
OP2	0.30	0.24	0.31	0.21	0.10	0.08	0.09	0.16	0.17	0.25	0.18	0.31	0.30	0.17	0.04	0.22	0.03	0.04	0.00	0.02
P	0.28	0.24	0.25	0.12	0.12	0.01	0.10	0.03	0.18	0.25	0.19	0.29	0.23	0.06	0.07	0.20	0.02	0.03	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.15	0.01	0.17	0.49	0.39	0.55	0.44	0.44	0.22	0.30	0.05	0.08	0.30	0.56	0.24	0.46	0.13	0.07	0.24
C2	0.12	0.09	0.07	0.30	0.31	0.59	0.28	0.72	0.17	0.06	0.22	0.00	0.08	0.35	0.39	0.44	0.60	0.19	0.06	0.33
C2'	0.11	0.22	0.08	0.07	0.57	0.22	0.66	0.24	0.56	0.32	0.37	0.03	0.06	0.19	0.63	0.09	0.29	0.08	0.01	0.09
C3'	0.36	0.35	0.31	0.21	0.80	0.09	1.00	0.11	0.92	0.57	0.50	0.00	0.11	0.02	0.84	0.22	0.07	0.15	0.12	0.07
C4	0.24	0.03	0.13	0.37	0.01	0.72	0.11	0.92	0.18	0.15	0.02	0.00	0.03	0.32	0.05	0.61	0.69	0.18	0.01	0.36
C4'	0.38	0.30	0.36	0.27	0.68	0.13	0.89	0.13	0.84	0.53	0.41	0.01	0.22	0.10	0.70	0.25	0.08	0.07	0.22	0.07
C5	0.25	0.07	0.13	0.37	0.06	0.71	0.15	0.89	0.21	0.18	0.04	0.03	0.01	0.31	0.02	0.61	0.68	0.16	0.03	0.35
C5'	0.39	0.17	0.38	0.31	0.37	0.24	0.58	0.21	0.62	0.40	0.19	0.03	0.37	0.22	0.34	0.32	0.05	0.09	0.27	0.12
C6	0.19	0.03	0.11	0.34	0.07	0.63	0.04	0.75	0.03	0.07	0.04	0.07	0.05	0.34	0.12	0.50	0.63	0.16	0.07	0.33
N1	0.11	0.06	0.07	0.29	0.28	0.56	0.27	0.66	0.18	0.06	0.17	0.05	0.09	0.35	0.34	0.41	0.58	0.18	0.08	0.32
N3	0.18	0.04	0.10	0.34	0.17	0.67	0.09	0.84	0.00	0.04	0.14	0.02	0.06	0.35	0.24	0.54	0.66	0.20	0.04	0.35
O2	0.08	0.14	0.06	0.28	0.42	0.55	0.41	0.67	0.28	0.13	0.29	0.00	0.10	0.37	0.52	0.40	0.59	0.20	0.08	0.33
O2'	0.15	0.36	0.10	0.04	0.78	0.21	0.83	0.21	0.67	0.43	0.56	0.09	0.08	0.16	0.88	0.07	0.22	0.21	0.00	0.02
O3'	0.34	0.35	0.28	0.24	0.97	0.12	1.21	0.18	1.07	0.62	0.57	0.08	0.03	0.05	1.03	0.24	0.03	0.17	0.10	0.09
O4	0.27	0.05	0.13	0.37	0.09	0.74	0.23	0.98	0.28	0.20	0.02	0.03	0.00	0.29	0.04	0.65	0.70	0.16	0.03	0.36
O4'	0.12	0.18	0.12	0.05	0.53	0.25	0.65	0.30	0.56	0.31	0.31	0.05	0.02	0.21	0.59	0.09	0.41	0.21	0.02	0.22
O5'	0.07	0.12	0.06	0.12	0.16	0.03	0.40	0.09	0.42	0.13	0.07	0.35	0.10	0.01	0.15	0.06	0.20	0.10	0.14	0.04
OP1	0.06	0.28	0.03	0.10	0.30	0.12	0.19	0.18	0.11	0.16	0.34	0.31	0.06	0.09	0.35	0.10	0.46	0.43	0.09	0.26
OP2	0.04	0.47	0.11	0.13	0.38	0.26	0.10	0.42	0.03	0.18	0.53	0.59	0.12	0.13	0.45	0.15	0.10	0.17	0.16	0.00
P	0.04	0.32	0.06	0.01	0.24	0.03	0.05	0.08	0.03	0.13	0.35	0.42	0.06	0.01	0.28	0.01	0.28	0.21	0.13	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.14	0.24	0.25	0.07
C2	0.01	0.00	0.14	0.15	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.06	0.14	0.04	0.13	0.19	0.13	0.68	0.24
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.02	0.02	0.09	0.01	0.13	0.01	0.12	0.24	0.00	0.02	0.02	0.00	0.23	0.12	0.16	0.10
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.15	0.00	0.10	0.01	0.05	0.09	0.18	0.16	0.01	0.00	0.17	0.00	0.30	0.10	0.08	0.16
C4	0.00	0.03	0.02	0.15	0.00	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.03	0.06	0.15	0.00	0.01	0.63	0.59	1.49	0.92
C4'	0.00	0.02	0.02	0.00	0.10	0.00	0.18	0.00	0.19	0.06	0.03	0.10	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.23	0.23	0.14
C5	0.01	0.01	0.09	0.10	0.01	0.18	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.02	0.13	0.09	0.02	0.13	0.88	0.91	1.69	1.20
C5'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.18	0.00	0.31	0.00	0.30	0.10	0.05	0.14	0.07	0.04	0.19	0.00	0.01	0.16	0.25	0.01
C6	0.02	0.00	0.13	0.05	0.01	0.19	0.00	0.30	0.00	0.00	0.02	0.00	0.13	0.03	0.02	0.18	0.81	0.71	1.32	0.99
N1	0.01	0.00	0.01	0.09	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.02	0.39	0.13	0.77	0.45
N3	0.00	0.01	0.12	0.18	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.00	0.02	0.02	0.18	0.03	0.08	0.36	0.14	1.05	0.51
O2	0.02	0.00	0.24	0.16	0.03	0.10	0.02	0.14	0.00	0.00	0.02	0.00	0.16	0.15	0.06	0.23	0.07	0.55	0.32	0.12
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.07	0.13	0.07	0.13	0.03	0.02	0.16	0.00	0.05	0.07	0.06	0.12	0.38	0.10	0.11
O3'	0.03	0.14	0.02	0.00	0.15	0.01	0.09	0.04	0.03	0.06	0.18	0.15	0.05	0.00	0.18	0.01	0.25	0.05	0.18	0.03
O4	0.01	0.04	0.02	0.17	0.00	0.10	0.02	0.19	0.02	0.01	0.03	0.06	0.07	0.18	0.00	0.00	0.66	0.70	1.67	1.02
O4'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.01	0.00	0.13	0.00	0.18	0.02	0.08	0.23	0.06	0.01	0.00	0.00	0.04	0.32	0.03	0.07
O5'	0.14	0.19	0.23	0.30	0.63	0.02	0.88	0.01	0.81	0.39	0.36	0.07	0.12	0.25	0.66	0.04	0.00	0.03	0.04	0.01
OP1	0.24	0.13	0.12	0.10	0.59	0.23	0.91	0.16	0.71	0.13	0.14	0.55	0.38	0.05	0.70	0.32	0.03	0.00	0.04	0.01
OP2	0.25	0.68	0.16	0.08	1.49	0.23	1.69	0.25	1.32	0.77	1.05	0.32	0.10	0.18	1.67	0.03	0.04	0.04	0.00	0.00
P	0.07	0.24	0.10	0.16	0.92	0.14	1.20	0.01	0.99	0.45	0.51	0.12	0.11	0.03	1.02	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00