Doublet Group distance statistics: 55127

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.012, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.012 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C2	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C6	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O4	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O2	A	0, 0.000, 0.043, 0.087, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.043 std_dev=0.043
O4'	A	0, 0.000, 0.104, 0.208, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.104 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.000, 0.138, 0.276, 0.276 max_d=0.276 avg_d=0.138 std_dev=0.138
C4'	A	0, 0.000, 0.172, 0.344, 0.344 max_d=0.344 avg_d=0.172 std_dev=0.172
P	A	0, 0.000, 0.219, 0.439, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.219 std_dev=0.219
OP1	A	0, 0.000, 0.219, 0.439, 0.439 max_d=0.439 avg_d=0.219 std_dev=0.219
O2'	B	0, 0.000, 0.313, 0.626, 0.626 max_d=0.626 avg_d=0.313 std_dev=0.313
C2'	B	0, 0.000, 0.344, 0.687, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.344 std_dev=0.344
O3'	A	0, 0.000, 0.382, 0.763, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.382 std_dev=0.382
C3'	A	0, 0.000, 0.410, 0.820, 0.820 max_d=0.820 avg_d=0.410 std_dev=0.410
O3'	B	0, 0.000, 0.415, 0.830, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.415 std_dev=0.415
O5'	A	0, 0.000, 0.469, 0.938, 0.938 max_d=0.938 avg_d=0.469 std_dev=0.469
C3'	B	0, 0.000, 0.486, 0.973, 0.973 max_d=0.973 avg_d=0.486 std_dev=0.486
C1'	B	0, 0.000, 0.527, 1.054, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.527 std_dev=0.527
OP2	A	0, 0.000, 0.539, 1.078, 1.078 max_d=1.078 avg_d=0.539 std_dev=0.539
O2'	A	0, 0.000, 0.577, 1.154, 1.154 max_d=1.154 avg_d=0.577 std_dev=0.577
C5'	A	0, 0.000, 0.609, 1.217, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.609 std_dev=0.609
O2	B	0, 0.000, 0.716, 1.432, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.716 std_dev=0.716
N1	B	0, 0.000, 0.970, 1.940, 1.940 max_d=1.940 avg_d=0.970 std_dev=0.970
C2	B	0, 0.000, 1.027, 2.055, 2.055 max_d=2.055 avg_d=1.027 std_dev=1.027
O4'	B	0, 0.000, 1.098, 2.196, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.098 std_dev=1.098
C4'	B	0, 0.000, 1.297, 2.594, 2.594 max_d=2.594 avg_d=1.297 std_dev=1.297
C6	B	0, 0.000, 1.535, 3.070, 3.070 max_d=3.070 avg_d=1.535 std_dev=1.535
N3	B	0, 0.000, 1.657, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.657 std_dev=1.657
O5'	B	0, 0.000, 1.803, 3.606, 3.606 max_d=3.606 avg_d=1.803 std_dev=1.803
C5	B	0, 0.000, 2.066, 4.132, 4.132 max_d=4.132 avg_d=2.066 std_dev=2.066
C4	B	0, 0.000, 2.159, 4.318, 4.318 max_d=4.318 avg_d=2.159 std_dev=2.159
C5'	B	0, 0.000, 2.163, 4.327, 4.327 max_d=4.327 avg_d=2.163 std_dev=2.163
P	B	0, 0.000, 2.707, 5.414, 5.414 max_d=5.414 avg_d=2.707 std_dev=2.707
O4	B	0, 0.000, 2.726, 5.452, 5.452 max_d=5.452 avg_d=2.726 std_dev=2.726
OP2	B	0, 0.000, 2.783, 5.567, 5.567 max_d=5.567 avg_d=2.783 std_dev=2.783
OP1	B	0, 0.000, 3.251, 6.503, 6.503 max_d=6.503 avg_d=3.251 std_dev=3.251

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.07	0.34	0.04
C2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.01	0.02	0.01	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00	0.24	0.05	0.01	0.01	0.09	0.02	0.35	0.03
C2'	0.00	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.00	0.13	0.02	0.02	0.07	0.10	0.00	0.07	0.04	0.02	0.17	0.12	0.25	0.05
C3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.17	0.00	0.22	0.01	0.21	0.11	0.10	0.02	0.02	0.00	0.18	0.01	0.34	0.30	0.04	0.27
C4	0.01	0.01	0.04	0.17	0.00	0.00	0.00	0.21	0.00	0.00	0.00	0.02	0.18	0.13	0.00	0.03	0.13	0.01	0.32	0.02
C4'	0.01	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.22	0.05	0.00	0.01	0.02	0.11	0.27	0.01
C5	0.02	0.01	0.00	0.22	0.00	0.02	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.18	0.00	0.04	0.11	0.00	0.34	0.03
C5'	0.10	0.21	0.13	0.01	0.21	0.00	0.17	0.00	0.15	0.18	0.23	0.21	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.19	0.38	0.01
C6	0.02	0.00	0.02	0.21	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.17	0.00	0.04	0.08	0.02	0.38	0.04
N1	0.00	0.00	0.02	0.11	0.00	0.00	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.10	0.01	0.01	0.06	0.03	0.37	0.05
N3	0.01	0.00	0.07	0.10	0.00	0.02	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.02	0.25	0.08	0.01	0.02	0.11	0.00	0.34	0.03
O2	0.03	0.00	0.10	0.02	0.02	0.04	0.01	0.21	0.00	0.00	0.02	0.00	0.34	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.35	0.03
O2'	0.00	0.24	0.00	0.02	0.18	0.22	0.08	0.09	0.02	0.10	0.25	0.34	0.00	0.15	0.20	0.13	0.27	0.29	0.18	0.16
O3'	0.05	0.05	0.07	0.00	0.13	0.05	0.18	0.01	0.17	0.10	0.08	0.02	0.15	0.00	0.13	0.04	0.37	0.31	0.09	0.29
O4	0.01	0.01	0.04	0.18	0.00	0.00	0.00	0.22	0.00	0.01	0.01	0.02	0.20	0.13	0.00	0.03	0.14	0.03	0.28	0.01
O4'	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.13	0.04	0.03	0.00	0.10	0.07	0.34	0.08
O5'	0.03	0.09	0.17	0.34	0.13	0.02	0.11	0.01	0.08	0.06	0.11	0.08	0.27	0.37	0.14	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.02	0.12	0.30	0.01	0.11	0.00	0.19	0.02	0.03	0.00	0.02	0.29	0.31	0.03	0.07	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.34	0.35	0.25	0.04	0.32	0.27	0.34	0.38	0.38	0.37	0.34	0.35	0.18	0.09	0.28	0.34	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.04	0.03	0.05	0.27	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.03	0.16	0.29	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.33	0.37	0.25	0.33	0.68	0.59	0.82	1.05	0.75	0.49	0.48	0.20	0.13	0.16	0.72	0.51	1.02	1.93	1.35	1.50
C2	0.34	0.24	0.22	0.33	0.48	0.75	0.65	1.19	0.64	0.40	0.29	0.08	0.10	0.20	0.48	0.62	1.08	1.95	1.23	1.48
C2'	0.35	0.38	0.29	0.36	0.67	0.55	0.80	0.91	0.73	0.49	0.48	0.23	0.19	0.23	0.72	0.49	0.95	1.83	1.32	1.42
C3'	0.48	0.56	0.47	0.49	0.80	0.53	0.89	0.75	0.82	0.62	0.65	0.45	0.42	0.41	0.85	0.52	0.85	1.52	1.18	1.23
C4	0.33	0.11	0.19	0.31	0.25	0.82	0.43	1.13	0.48	0.30	0.11	0.01	0.09	0.23	0.21	0.65	1.01	1.71	0.94	1.26
C4'	0.34	0.46	0.29	0.32	0.75	0.37	0.85	0.66	0.75	0.52	0.58	0.32	0.20	0.16	0.81	0.38	0.81	1.55	1.21	1.24
C5	0.32	0.15	0.20	0.32	0.28	0.78	0.44	1.04	0.48	0.31	0.15	0.03	0.10	0.23	0.26	0.61	0.95	1.59	0.87	1.17
C5'	0.42	0.54	0.36	0.41	0.81	0.43	0.91	0.61	0.83	0.60	0.65	0.41	0.22	0.22	0.86	0.46	0.90	1.45	1.18	1.23
C6	0.32	0.23	0.22	0.33	0.43	0.71	0.58	1.04	0.58	0.37	0.28	0.10	0.11	0.21	0.43	0.56	0.97	1.68	1.01	1.26
N1	0.32	0.27	0.22	0.33	0.52	0.69	0.67	1.11	0.65	0.41	0.34	0.12	0.11	0.18	0.53	0.56	1.03	1.87	1.20	1.42
N3	0.33	0.17	0.20	0.32	0.35	0.81	0.53	1.20	0.56	0.35	0.18	0.02	0.09	0.22	0.33	0.65	1.07	1.88	1.11	1.41
O2	0.34	0.27	0.23	0.33	0.54	0.73	0.71	1.21	0.68	0.43	0.34	0.10	0.10	0.19	0.55	0.61	1.09	2.04	1.34	1.56
O2'	0.45	0.53	0.38	0.46	0.91	0.63	1.05	1.07	0.94	0.64	0.67	0.33	0.23	0.30	0.98	0.59	1.14	2.11	1.67	1.71
O3'	0.46	0.57	0.46	0.46	0.80	0.45	0.87	0.60	0.79	0.61	0.66	0.47	0.42	0.39	0.86	0.47	0.75	1.37	1.12	1.13
O4	0.32	0.04	0.17	0.29	0.13	0.84	0.33	1.10	0.40	0.25	0.01	0.06	0.08	0.23	0.07	0.67	0.98	1.65	0.85	1.20
O4'	0.34	0.43	0.27	0.33	0.75	0.51	0.87	0.95	0.78	0.53	0.56	0.27	0.15	0.12	0.81	0.46	0.97	1.83	1.33	1.44
O5'	0.03	0.14	0.08	0.02	0.29	0.08	0.32	0.06	0.27	0.15	0.21	0.09	0.12	0.01	0.32	0.03	0.17	0.60	0.31	0.38
OP1	0.08	0.23	0.10	0.00	0.29	0.19	0.27	0.41	0.22	0.19	0.27	0.22	0.12	0.00	0.31	0.05	0.08	0.23	0.01	0.10
OP2	0.10	0.12	0.12	0.00	0.15	0.05	0.17	0.05	0.18	0.13	0.12	0.12	0.18	0.01	0.14	0.07	0.21	0.52	0.10	0.28
P	0.06	0.14	0.10	0.00	0.22	0.06	0.24	0.13	0.22	0.14	0.17	0.12	0.13	0.00	0.23	0.00	0.18	0.48	0.14	0.27

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.08	0.03	0.01	0.03	0.05	0.00	0.02	0.04	0.01	0.14	0.15	0.20	0.01
C2	0.03	0.00	0.02	0.07	0.01	0.04	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.07	0.00	0.05	0.24	0.11	0.17	0.01
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.11	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.20	0.29	0.12	0.09
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.17	0.00	0.21	0.00	0.21	0.10	0.11	0.03	0.01	0.00	0.18	0.01	0.28	0.47	0.10	0.28
C4	0.04	0.01	0.01	0.17	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.03	0.00	0.00	0.15	0.18	0.00	0.06	0.34	0.10	0.09	0.07
C4'	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.04	0.07	0.19	0.06	0.04	0.01	0.00	0.20	0.21	0.00
C5	0.04	0.00	0.01	0.21	0.00	0.03	0.00	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.23	0.01	0.04	0.35	0.11	0.10	0.08
C5'	0.08	0.11	0.11	0.00	0.16	0.00	0.19	0.00	0.18	0.14	0.13	0.04	0.07	0.10	0.16	0.00	0.00	0.26	0.34	0.01
C6	0.03	0.00	0.02	0.21	0.01	0.02	0.01	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.22	0.01	0.03	0.31	0.12	0.16	0.04
N1	0.01	0.01	0.01	0.10	0.03	0.02	0.02	0.14	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.10	0.03	0.02	0.23	0.12	0.18	0.01
N3	0.03	0.00	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.13	0.00	0.02	0.00	0.01	0.18	0.11	0.01	0.06	0.29	0.10	0.13	0.03
O2	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.02	0.01	0.08	0.21	0.13	0.17	0.01
O2'	0.00	0.16	0.00	0.01	0.15	0.19	0.08	0.07	0.04	0.09	0.18	0.16	0.00	0.09	0.17	0.10	0.25	0.42	0.07	0.18
O3'	0.02	0.07	0.06	0.00	0.18	0.06	0.23	0.10	0.22	0.10	0.11	0.02	0.09	0.00	0.19	0.03	0.27	0.60	0.19	0.36
O4	0.04	0.00	0.01	0.18	0.00	0.04	0.01	0.16	0.01	0.03	0.01	0.01	0.17	0.19	0.00	0.07	0.36	0.10	0.04	0.09
O4'	0.01	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.06	0.08	0.10	0.03	0.07	0.00	0.03	0.09	0.25	0.07
O5'	0.14	0.24	0.20	0.28	0.34	0.00	0.35	0.00	0.31	0.23	0.29	0.21	0.25	0.27	0.36	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.15	0.11	0.29	0.47	0.10	0.20	0.11	0.26	0.12	0.12	0.10	0.13	0.42	0.60	0.10	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.17	0.12	0.10	0.09	0.21	0.10	0.34	0.16	0.18	0.13	0.17	0.07	0.19	0.04	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.01	0.09	0.28	0.07	0.00	0.08	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.18	0.36	0.09	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00