Doublet Group distance statistics: 55128

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.014, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C6	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C4	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
C5'	A	0, 0.000, 0.025, 0.051, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.025
O2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.000, 0.036, 0.072, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O4	A	0, 0.000, 0.043, 0.086, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.043 std_dev=0.043
C4'	A	0, 0.000, 0.064, 0.127, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.064 std_dev=0.064
C3'	A	0, 0.000, 0.087, 0.174, 0.174 max_d=0.174 avg_d=0.087 std_dev=0.087
C2'	A	0, 0.000, 0.104, 0.208, 0.208 max_d=0.208 avg_d=0.104 std_dev=0.104
O5'	A	0, 0.000, 0.133, 0.266, 0.266 max_d=0.266 avg_d=0.133 std_dev=0.133
C2'	B	0, 0.000, 0.148, 0.296, 0.296 max_d=0.296 avg_d=0.148 std_dev=0.148
O2'	A	0, 0.000, 0.157, 0.315, 0.315 max_d=0.315 avg_d=0.157 std_dev=0.157
O3'	A	0, 0.000, 0.161, 0.323, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.161 std_dev=0.161
P	A	0, 0.000, 0.269, 0.538, 0.538 max_d=0.538 avg_d=0.269 std_dev=0.269
OP1	A	0, 0.000, 0.275, 0.551, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.275 std_dev=0.275
C1'	B	0, 0.000, 0.282, 0.564, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.282 std_dev=0.282
O3'	B	0, 0.000, 0.403, 0.806, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.403 std_dev=0.403
C3'	B	0, 0.000, 0.408, 0.815, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.408 std_dev=0.408
OP2	A	0, 0.000, 0.419, 0.838, 0.838 max_d=0.838 avg_d=0.419 std_dev=0.419
O2'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
O4'	B	0, 0.000, 0.776, 1.553, 1.553 max_d=1.553 avg_d=0.776 std_dev=0.776
O2	B	0, 0.000, 0.815, 1.629, 1.629 max_d=1.629 avg_d=0.815 std_dev=0.815
N1	B	0, 0.000, 0.841, 1.682, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.841 std_dev=0.841
C2	B	0, 0.000, 0.908, 1.817, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.908 std_dev=0.908
C4'	B	0, 0.000, 0.958, 1.917, 1.917 max_d=1.917 avg_d=0.958 std_dev=0.958
N3	B	0, 0.000, 1.435, 2.871, 2.871 max_d=2.871 avg_d=1.435 std_dev=1.435
C6	B	0, 0.000, 1.473, 2.946, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.473 std_dev=1.473
C5'	B	0, 0.000, 1.630, 3.259, 3.259 max_d=3.259 avg_d=1.630 std_dev=1.630
O5'	B	0, 0.000, 1.817, 3.635, 3.635 max_d=3.635 avg_d=1.817 std_dev=1.817
C4	B	0, 0.000, 1.941, 3.883, 3.883 max_d=3.883 avg_d=1.941 std_dev=1.941
C5	B	0, 0.000, 1.984, 3.969, 3.969 max_d=3.969 avg_d=1.984 std_dev=1.984
O4	B	0, 0.000, 2.377, 4.754, 4.754 max_d=4.754 avg_d=2.377 std_dev=2.377
P	B	0, 0.000, 2.594, 5.189, 5.189 max_d=5.189 avg_d=2.594 std_dev=2.594
OP2	B	0, 0.000, 2.811, 5.622, 5.622 max_d=5.622 avg_d=2.811 std_dev=2.811
OP1	B	0, 0.000, 2.812, 5.623, 5.623 max_d=5.623 avg_d=2.812 std_dev=2.812

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.05	0.05	0.11	0.07
C2	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.03	0.00	0.00	0.07	0.11	0.17	0.12
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.05	0.13	0.07
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.04	0.12	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.04	0.14	0.14	0.13
C4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.02
C5	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.00	0.01	0.03	0.14	0.12	0.12
C5'	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00
C6	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.00	0.01	0.04	0.12	0.12	0.11
N1	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.05	0.09	0.14	0.10
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.05	0.12	0.16	0.13
O2	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.00	0.01	0.08	0.10	0.18	0.13
O2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.06	0.02	0.05	0.02	0.03	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.07	0.02	0.06	0.03	0.12	0.06
O3'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.06	0.02	0.05	0.04	0.03	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.07	0.01	0.08	0.05	0.14	0.08
O4	0.01	0.00	0.06	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.01	0.03	0.15	0.14	0.13
O4'	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.02
O5'	0.05	0.07	0.06	0.06	0.04	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.05	0.08	0.06	0.08	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.05	0.11	0.05	0.04	0.14	0.00	0.14	0.00	0.12	0.09	0.12	0.10	0.03	0.05	0.15	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.17	0.13	0.12	0.14	0.05	0.12	0.02	0.12	0.14	0.16	0.18	0.12	0.14	0.14	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00
P	0.07	0.12	0.07	0.07	0.13	0.02	0.12	0.00	0.11	0.10	0.13	0.13	0.06	0.08	0.13	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.16	0.13	0.00	0.27	0.36	0.54	0.49	1.01	0.45	0.25	0.21	0.03	0.29	0.09	0.38	0.44	1.11	1.52	1.25	1.35
C2	0.13	0.02	0.03	0.28	0.12	0.63	0.25	1.04	0.27	0.13	0.01	0.15	0.26	0.18	0.11	0.48	1.01	1.39	1.03	1.21
C2'	0.15	0.15	0.01	0.25	0.37	0.48	0.49	0.91	0.44	0.25	0.23	0.01	0.27	0.09	0.40	0.40	1.06	1.48	1.25	1.32
C3'	0.14	0.19	0.01	0.22	0.40	0.38	0.48	0.74	0.42	0.26	0.28	0.07	0.22	0.08	0.43	0.33	0.93	1.23	1.11	1.13
C4	0.09	0.14	0.05	0.25	0.14	0.63	0.03	0.90	0.03	0.02	0.18	0.20	0.18	0.23	0.17	0.45	0.77	1.02	0.64	0.87
C4'	0.17	0.26	0.04	0.23	0.52	0.34	0.61	0.74	0.53	0.33	0.37	0.11	0.23	0.01	0.56	0.33	1.01	1.33	1.25	1.23
C5	0.09	0.09	0.05	0.25	0.08	0.60	0.01	0.85	0.06	0.01	0.11	0.14	0.19	0.23	0.10	0.42	0.73	0.91	0.59	0.80
C5'	0.16	0.31	0.06	0.18	0.53	0.19	0.58	0.46	0.50	0.33	0.41	0.19	0.16	0.02	0.57	0.23	0.79	0.85	1.01	0.91
C6	0.12	0.01	0.03	0.27	0.10	0.60	0.19	0.91	0.21	0.11	0.02	0.08	0.24	0.19	0.09	0.43	0.86	1.07	0.80	0.96
N1	0.14	0.04	0.02	0.28	0.19	0.60	0.31	1.00	0.31	0.16	0.07	0.10	0.27	0.16	0.19	0.45	1.00	1.33	1.02	1.17
N3	0.11	0.10	0.05	0.27	0.03	0.64	0.10	0.99	0.14	0.04	0.11	0.20	0.22	0.21	0.06	0.48	0.90	1.24	0.85	1.06
O2	0.15	0.01	0.02	0.29	0.19	0.63	0.33	1.07	0.33	0.16	0.05	0.15	0.27	0.17	0.18	0.49	1.08	1.54	1.17	1.34
O2'	0.19	0.22	0.02	0.27	0.51	0.47	0.64	0.95	0.56	0.33	0.33	0.03	0.28	0.07	0.56	0.44	1.16	1.69	1.47	1.50
O3'	0.17	0.26	0.04	0.22	0.49	0.33	0.55	0.66	0.47	0.30	0.36	0.13	0.18	0.08	0.53	0.32	0.91	1.18	1.16	1.12
O4	0.07	0.21	0.06	0.23	0.26	0.62	0.16	0.86	0.07	0.08	0.28	0.23	0.12	0.24	0.32	0.43	0.69	0.93	0.52	0.77
O4'	0.17	0.20	0.01	0.26	0.45	0.47	0.57	0.95	0.51	0.31	0.30	0.04	0.29	0.03	0.48	0.41	1.11	1.46	1.26	1.33
O5'	0.05	0.15	0.02	0.09	0.26	0.14	0.27	0.33	0.22	0.15	0.21	0.10	0.16	0.00	0.28	0.13	0.52	0.48	0.56	0.53
OP1	0.13	0.37	0.17	0.04	0.44	0.17	0.36	0.30	0.28	0.28	0.44	0.36	0.11	0.01	0.47	0.03	0.03	0.50	0.00	0.20
OP2	0.17	0.11	0.16	0.17	0.22	0.10	0.32	0.11	0.32	0.20	0.13	0.02	0.05	0.01	0.22	0.15	0.12	0.28	0.31	0.24
P	0.00	0.14	0.01	0.01	0.15	0.04	0.09	0.03	0.05	0.07	0.16	0.15	0.02	0.00	0.16	0.02	0.11	0.11	0.06	0.02

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.01
C2	0.00	0.00	0.07	0.07	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.06	0.09	0.09	0.09	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.06	0.06	0.02
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.07	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.07	0.06	0.00	0.01
C4	0.01	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.12	0.13	0.13	0.12
C4'	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02
C5	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.05	0.04	0.01	0.00	0.07	0.10	0.10	0.08
C5'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.07	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.07	0.06	0.08	0.05	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03
C6	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01	0.03	0.04	0.06	0.06	0.03
N1	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.06	0.07	0.06	0.04
N3	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.08	0.00	0.06	0.12	0.11	0.12	0.11
O2	0.01	0.00	0.11	0.08	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.07	0.01	0.08	0.09	0.08	0.08	0.07
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.08	0.06	0.01	0.03	0.08	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.00	0.02	0.04
O3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.05	0.02	0.03	0.08	0.07	0.03	0.00	0.08	0.01	0.14	0.00	0.08	0.08
O4	0.02	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.14	0.16	0.17	0.16
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.06	0.08	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04
O5'	0.02	0.09	0.02	0.07	0.12	0.02	0.07	0.02	0.04	0.06	0.12	0.09	0.06	0.14	0.14	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.03	0.09	0.06	0.06	0.13	0.01	0.10	0.01	0.06	0.07	0.11	0.08	0.00	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.09	0.06	0.00	0.13	0.01	0.10	0.03	0.06	0.06	0.12	0.08	0.02	0.08	0.17	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.08	0.02	0.01	0.12	0.02	0.08	0.03	0.03	0.04	0.11	0.07	0.04	0.08	0.16	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00