Doublet Group distance statistics: 55129

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.014, 0.029, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.020, 0.039, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
C2	A	0, 0.000, 0.024, 0.049, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.024 std_dev=0.024
C1'	A	0, 0.000, 0.033, 0.065, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.033 std_dev=0.033
C6	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
N1	A	0, 0.000, 0.036, 0.071, 0.071 max_d=0.071 avg_d=0.036 std_dev=0.036
O2	A	0, 0.000, 0.056, 0.111, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.056 std_dev=0.056
O4	A	0, 0.000, 0.060, 0.121, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.060 std_dev=0.060
C4'	A	0, 0.000, 0.088, 0.176, 0.176 max_d=0.176 avg_d=0.088 std_dev=0.088
C2'	A	0, 0.000, 0.100, 0.199, 0.199 max_d=0.199 avg_d=0.100 std_dev=0.100
C3'	A	0, 0.000, 0.139, 0.278, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.139 std_dev=0.139
O2'	A	0, 0.000, 0.156, 0.313, 0.313 max_d=0.313 avg_d=0.156 std_dev=0.156
O4'	A	0, 0.000, 0.161, 0.323, 0.323 max_d=0.323 avg_d=0.161 std_dev=0.161
O2'	B	0, 0.000, 0.245, 0.491, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.245 std_dev=0.245
C5'	A	0, 0.000, 0.285, 0.569, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.285 std_dev=0.285
O3'	A	0, 0.000, 0.365, 0.730, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.365 std_dev=0.365
C2'	B	0, 0.000, 0.431, 0.861, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.431 std_dev=0.431
O2	B	0, 0.000, 0.445, 0.889, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.445 std_dev=0.445
C1'	B	0, 0.000, 0.547, 1.094, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.547 std_dev=0.547
P	B	0, 0.000, 0.565, 1.129, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.565 std_dev=0.565
N1	B	0, 0.000, 0.643, 1.286, 1.286 max_d=1.286 avg_d=0.643 std_dev=0.643
C2	B	0, 0.000, 0.675, 1.349, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.675 std_dev=0.675
O5'	B	0, 0.000, 0.675, 1.350, 1.350 max_d=1.350 avg_d=0.675 std_dev=0.675
C3'	B	0, 0.000, 0.774, 1.548, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.774 std_dev=0.774
C6	B	0, 0.000, 0.838, 1.676, 1.676 max_d=1.676 avg_d=0.838 std_dev=0.838
OP2	A	0, 0.000, 0.877, 1.754, 1.754 max_d=1.754 avg_d=0.877 std_dev=0.877
O3'	B	0, 0.000, 0.907, 1.815, 1.815 max_d=1.815 avg_d=0.907 std_dev=0.907
O4'	B	0, 0.000, 0.909, 1.817, 1.817 max_d=1.817 avg_d=0.909 std_dev=0.909
P	A	0, 0.000, 0.933, 1.865, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.933 std_dev=0.933
O5'	A	0, 0.000, 0.950, 1.900, 1.900 max_d=1.900 avg_d=0.950 std_dev=0.950
OP1	A	0, 0.000, 1.007, 2.013, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.007 std_dev=1.007
OP1	B	0, 0.000, 1.017, 2.034, 2.034 max_d=2.034 avg_d=1.017 std_dev=1.017
N3	B	0, 0.000, 1.027, 2.054, 2.054 max_d=2.054 avg_d=1.027 std_dev=1.027
C4'	B	0, 0.000, 1.036, 2.072, 2.072 max_d=2.072 avg_d=1.036 std_dev=1.036
C5	B	0, 0.000, 1.147, 2.295, 2.295 max_d=2.295 avg_d=1.147 std_dev=1.147
C5'	B	0, 0.000, 1.258, 2.516, 2.516 max_d=2.516 avg_d=1.258 std_dev=1.258
C4	B	0, 0.000, 1.280, 2.560, 2.560 max_d=2.560 avg_d=1.280 std_dev=1.280
O4	B	0, 0.000, 1.608, 3.215, 3.215 max_d=3.215 avg_d=1.608 std_dev=1.608
OP2	B	0, 0.000, 1.608, 3.216, 3.216 max_d=3.216 avg_d=1.608 std_dev=1.608

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.04	0.24	0.08
C2	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.01	0.10	0.03	0.14	0.01
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.01	0.04	0.01	0.17	0.13	0.05	0.11
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.04	0.06	0.04	0.00	0.01	0.07	0.00	0.33	0.24	0.06	0.24
C4	0.00	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.07	0.07	0.04	0.17	0.04
C4'	0.01	0.00	0.01	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.04	0.06	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.23	0.03
C5	0.02	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.01	0.10	0.02	0.08	0.22	0.08
C5'	0.02	0.04	0.02	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.06	0.04	0.07	0.01	0.05	0.04	0.11	0.00	0.00	0.03	0.30	0.00
C6	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.09	0.01	0.06	0.23	0.07
N1	0.00	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.04	0.01	0.19	0.03
N3	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.01	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.10	0.01	0.04	0.10	0.01	0.14	0.00
O2	0.05	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.13	0.07	0.11	0.04
O2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.06	0.02	0.06	0.10	0.13	0.07	0.07
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.12	0.03	0.11	0.04	0.07	0.04	0.10	0.05	0.06	0.00	0.13	0.03	0.44	0.38	0.23	0.37
O4	0.00	0.01	0.04	0.07	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.13	0.00	0.08	0.07	0.06	0.16	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.09	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.00	0.20	0.14	0.38	0.20
O5'	0.04	0.10	0.17	0.33	0.07	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.13	0.10	0.44	0.07	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.04	0.03	0.13	0.24	0.04	0.01	0.08	0.03	0.06	0.01	0.01	0.07	0.13	0.38	0.06	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.24	0.14	0.05	0.06	0.17	0.23	0.22	0.30	0.23	0.19	0.14	0.11	0.07	0.23	0.16	0.38	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.08	0.01	0.11	0.24	0.04	0.03	0.08	0.00	0.07	0.03	0.00	0.04	0.07	0.37	0.04	0.20	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.32	0.08	0.01	0.47	0.05	0.42	0.14	0.34	0.27	0.43	0.21	0.03	0.08	0.49	0.11	0.17	0.46	0.49	0.06
C2	0.16	0.41	0.08	0.01	0.74	0.11	0.65	0.26	0.48	0.35	0.63	0.22	0.06	0.11	0.84	0.19	0.26	0.56	0.71	0.00
C2'	0.05	0.31	0.01	0.13	0.49	0.09	0.42	0.01	0.31	0.22	0.45	0.22	0.04	0.24	0.56	0.01	0.11	0.45	0.42	0.13
C3'	0.10	0.16	0.14	0.28	0.33	0.27	0.27	0.18	0.16	0.07	0.29	0.09	0.10	0.39	0.40	0.18	0.01	0.42	0.24	0.24
C4	0.18	0.34	0.10	0.07	0.77	0.20	0.74	0.37	0.54	0.35	0.56	0.15	0.07	0.04	0.88	0.25	0.38	0.55	0.90	0.10
C4'	0.05	0.11	0.01	0.13	0.24	0.18	0.22	0.10	0.15	0.07	0.19	0.04	0.08	0.22	0.27	0.14	0.06	0.29	0.27	0.14
C5	0.14	0.26	0.09	0.06	0.60	0.16	0.61	0.31	0.47	0.29	0.43	0.09	0.07	0.04	0.64	0.19	0.34	0.54	0.79	0.04
C5'	0.25	0.08	0.12	0.28	0.07	0.40	0.06	0.31	0.01	0.12	0.01	0.14	0.09	0.40	0.11	0.39	0.03	0.22	0.13	0.21
C6	0.10	0.26	0.05	0.01	0.50	0.08	0.49	0.21	0.39	0.25	0.40	0.10	0.06	0.08	0.53	0.12	0.23	0.54	0.62	0.04
N1	0.12	0.34	0.06	0.01	0.57	0.06	0.52	0.19	0.40	0.29	0.50	0.17	0.05	0.11	0.62	0.13	0.20	0.54	0.60	0.05
N3	0.19	0.40	0.09	0.04	0.82	0.17	0.74	0.34	0.54	0.37	0.65	0.20	0.07	0.08	0.95	0.24	0.33	0.57	0.84	0.07
O2	0.16	0.42	0.07	0.01	0.75	0.10	0.65	0.24	0.48	0.35	0.65	0.24	0.06	0.14	0.87	0.18	0.23	0.57	0.70	0.00
O2'	0.09	0.34	0.02	0.09	0.49	0.06	0.41	0.03	0.31	0.25	0.46	0.27	0.00	0.20	0.54	0.04	0.09	0.43	0.39	0.12
O3'	0.11	0.19	0.17	0.34	0.35	0.33	0.26	0.26	0.14	0.07	0.32	0.15	0.13	0.46	0.42	0.20	0.03	0.40	0.14	0.29
O4	0.20	0.33	0.12	0.10	0.79	0.25	0.78	0.44	0.56	0.35	0.54	0.14	0.06	0.01	0.93	0.29	0.45	0.52	1.02	0.18
O4'	0.07	0.16	0.11	0.04	0.28	0.01	0.29	0.09	0.25	0.17	0.22	0.05	0.15	0.04	0.29	0.02	0.15	0.35	0.42	0.05
O5'	0.23	0.34	0.15	0.04	0.38	0.07	0.36	0.08	0.33	0.29	0.36	0.34	0.16	0.01	0.38	0.17	0.31	0.08	0.24	0.02
OP1	0.11	0.18	0.13	0.03	0.24	0.06	0.24	0.08	0.21	0.16	0.21	0.19	0.22	0.01	0.26	0.00	0.32	0.47	0.08	0.11
OP2	0.27	0.38	0.27	0.09	0.48	0.06	0.47	0.07	0.42	0.35	0.43	0.36	0.38	0.02	0.50	0.16	0.50	0.35	0.33	0.16
P	0.18	0.26	0.17	0.05	0.32	0.02	0.32	0.02	0.29	0.24	0.29	0.26	0.23	0.01	0.34	0.10	0.36	0.30	0.18	0.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.06	0.02	0.04	0.04	0.00	0.04	0.07	0.00	0.11	0.52	0.08	0.25
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.00	0.03	0.21	0.90	0.17	0.33
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.12	0.01	0.13	0.06	0.12	0.04	0.08	0.03	0.00	0.02	0.13	0.00	0.14	0.32	0.20	0.15
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.03	0.11	0.04	0.07	0.04	0.00	0.01	0.12	0.01	0.25	0.10	0.07	0.02
C4	0.06	0.00	0.12	0.11	0.00	0.09	0.01	0.14	0.02	0.04	0.00	0.01	0.14	0.12	0.00	0.05	0.22	1.16	0.30	0.32
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.05	0.04	0.01	0.00	0.10	0.00	0.02	0.05	0.10	0.06
C5	0.07	0.00	0.13	0.13	0.01	0.10	0.00	0.15	0.01	0.03	0.00	0.00	0.15	0.14	0.02	0.05	0.21	1.17	0.29	0.33
C5'	0.04	0.08	0.06	0.03	0.14	0.01	0.15	0.00	0.13	0.07	0.10	0.08	0.06	0.01	0.16	0.01	0.00	0.17	0.19	0.02
C6	0.06	0.00	0.12	0.11	0.02	0.09	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.12	0.12	0.03	0.04	0.21	1.01	0.20	0.34
N1	0.02	0.01	0.04	0.04	0.04	0.04	0.03	0.07	0.01	0.00	0.03	0.02	0.04	0.07	0.04	0.02	0.21	0.85	0.13	0.33
N3	0.04	0.00	0.08	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.00	0.03	0.00	0.02	0.08	0.08	0.00	0.03	0.23	1.06	0.24	0.34
O2	0.04	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.05	0.16	0.78	0.15	0.29
O2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.14	0.01	0.15	0.06	0.12	0.04	0.08	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.21	0.32	0.32	0.12
O3'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.12	0.00	0.14	0.01	0.12	0.07	0.08	0.07	0.01	0.00	0.13	0.03	0.24	0.19	0.06	0.02
O4	0.07	0.00	0.13	0.12	0.00	0.10	0.02	0.16	0.03	0.04	0.00	0.03	0.15	0.13	0.00	0.06	0.21	1.20	0.35	0.30
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.00	0.03	0.06	0.00	0.21	0.36	0.09	0.22
O5'	0.11	0.21	0.14	0.25	0.22	0.02	0.21	0.00	0.21	0.21	0.23	0.16	0.21	0.24	0.21	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.52	0.90	0.32	0.10	1.16	0.05	1.17	0.17	1.01	0.85	1.06	0.78	0.32	0.19	1.20	0.36	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.17	0.20	0.07	0.30	0.10	0.29	0.19	0.20	0.13	0.24	0.15	0.32	0.06	0.35	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.33	0.15	0.02	0.32	0.06	0.33	0.02	0.34	0.33	0.34	0.29	0.12	0.02	0.30	0.22	0.01	0.00	0.00	0.00