Doublet Group distance statistics: 55130

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.004, 0.008, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.004 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.014, 0.028, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.000, 0.016, 0.032, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N3	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
O2	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O4	A	0, 0.000, 0.046, 0.091, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.046 std_dev=0.046
O4'	A	0, 0.000, 0.084, 0.168, 0.168 max_d=0.168 avg_d=0.084 std_dev=0.084
O2'	A	0, 0.000, 0.092, 0.185, 0.185 max_d=0.185 avg_d=0.092 std_dev=0.092
C2'	A	0, 0.000, 0.102, 0.204, 0.204 max_d=0.204 avg_d=0.102 std_dev=0.102
C4'	A	0, 0.000, 0.149, 0.297, 0.297 max_d=0.297 avg_d=0.149 std_dev=0.149
C3'	A	0, 0.000, 0.155, 0.310, 0.310 max_d=0.310 avg_d=0.155 std_dev=0.155
O3'	A	0, 0.000, 0.182, 0.365, 0.365 max_d=0.365 avg_d=0.182 std_dev=0.182
O3'	B	0, 0.000, 0.183, 0.366, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.183 std_dev=0.183
O5'	A	0, 0.000, 0.200, 0.401, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.200 std_dev=0.200
P	A	0, 0.000, 0.221, 0.442, 0.442 max_d=0.442 avg_d=0.221 std_dev=0.221
C5'	B	0, 0.000, 0.236, 0.472, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.236 std_dev=0.236
OP2	A	0, 0.000, 0.252, 0.503, 0.503 max_d=0.503 avg_d=0.252 std_dev=0.252
OP1	B	0, 0.000, 0.256, 0.512, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.256 std_dev=0.256
C5'	A	0, 0.000, 0.260, 0.520, 0.520 max_d=0.520 avg_d=0.260 std_dev=0.260
C4'	B	0, 0.000, 0.262, 0.523, 0.523 max_d=0.523 avg_d=0.262 std_dev=0.262
C3'	B	0, 0.000, 0.268, 0.536, 0.536 max_d=0.536 avg_d=0.268 std_dev=0.268
O5'	B	0, 0.000, 0.271, 0.541, 0.541 max_d=0.541 avg_d=0.271 std_dev=0.271
P	B	0, 0.000, 0.271, 0.543, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.271 std_dev=0.271
O2'	B	0, 0.000, 0.275, 0.550, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.275 std_dev=0.275
C2'	B	0, 0.000, 0.311, 0.622, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.311 std_dev=0.311
OP2	B	0, 0.000, 0.313, 0.627, 0.627 max_d=0.627 avg_d=0.313 std_dev=0.313
O4'	B	0, 0.000, 0.326, 0.652, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.326 std_dev=0.326
C1'	B	0, 0.000, 0.368, 0.736, 0.736 max_d=0.736 avg_d=0.368 std_dev=0.368
OP1	A	0, 0.000, 0.415, 0.830, 0.830 max_d=0.830 avg_d=0.415 std_dev=0.415
N1	B	0, 0.000, 0.447, 0.894, 0.894 max_d=0.894 avg_d=0.447 std_dev=0.447
C6	B	0, 0.000, 0.472, 0.944, 0.944 max_d=0.944 avg_d=0.472 std_dev=0.472
C2	B	0, 0.000, 0.486, 0.971, 0.971 max_d=0.971 avg_d=0.486 std_dev=0.486
O2	B	0, 0.000, 0.494, 0.989, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.494 std_dev=0.494
C5	B	0, 0.000, 0.524, 1.049, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.524 std_dev=0.524
N3	B	0, 0.000, 0.541, 1.082, 1.082 max_d=1.082 avg_d=0.541 std_dev=0.541
C4	B	0, 0.000, 0.564, 1.129, 1.129 max_d=1.129 avg_d=0.564 std_dev=0.564
O4	B	0, 0.000, 0.611, 1.221, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.611 std_dev=0.611

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.10	0.00
C2	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.09	0.01	0.11	0.01
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.02	0.04	0.00	0.02	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.11	0.01
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.04	0.06	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.06	0.09	0.01
C4	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.13	0.04
C4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.09	0.05	0.01
C5	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.00	0.01	0.06	0.05	0.12	0.03
C5'	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.02	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.02
C6	0.02	0.00	0.04	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01
N1	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.02	0.11	0.01
N3	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.09	0.01	0.12	0.02
O2	0.02	0.01	0.05	0.06	0.02	0.04	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.03	0.01	0.09	0.04	0.10	0.00
O2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.09	0.08	0.01
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.03	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.07	0.00
O4	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.14	0.06
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.07	0.01
O5'	0.06	0.09	0.03	0.01	0.08	0.03	0.06	0.01	0.07	0.08	0.09	0.09	0.04	0.00	0.06	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.05	0.01	0.05	0.06	0.05	0.09	0.05	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.09	0.09	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.11	0.11	0.09	0.13	0.05	0.12	0.01	0.10	0.11	0.12	0.10	0.08	0.07	0.14	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01
P	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00
C2	0.04	0.05	0.03	0.02	0.03	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.04	0.09	0.04	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01
C2'	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
C3'	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03
C4	0.05	0.07	0.04	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.11	0.05	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.03	0.02
C4'	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.04
C5	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.07	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02
C5'	0.04	0.04	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.02	0.04	0.03	0.06	0.02	0.04	0.04	0.05	0.08	0.08	0.10	0.09
C6	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01
N1	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01
N3	0.05	0.07	0.04	0.03	0.04	0.03	0.02	0.02	0.02	0.05	0.05	0.11	0.05	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01
O2	0.04	0.05	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.08	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
O2'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03
O3'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01
O4	0.07	0.11	0.07	0.05	0.09	0.05	0.06	0.04	0.05	0.08	0.10	0.15	0.08	0.04	0.09	0.06	0.04	0.03	0.05	0.04
O4'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01
O5'	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.08	0.06
OP1	0.04	0.08	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.01	0.04	0.07	0.11	0.06	0.00	0.05	0.01	0.05	0.09	0.04	0.06
OP2	0.03	0.04	0.04	0.02	0.07	0.00	0.08	0.01	0.08	0.05	0.06	0.01	0.00	0.00	0.07	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00
P	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
C2	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
C3'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01
C4	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00
C5	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03
C5'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00
C6	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.03
N1	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01
N3	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.03
O2	0.00	0.02	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.05	0.01	0.04	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02
O2'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00
O3'	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.02
O4	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02
O4'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01
O5'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01
OP1	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.00	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00