Doublet Group distance statistics: 55139

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 14, 5, 15, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.009, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.006, 0.010, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.008, 0.013, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.002, 0.008, 0.013, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.008 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.006, 0.012, 0.018, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.020, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.016, 0.029, 0.043, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.029 std_dev=0.013
O4	A	0, 0.020, 0.061, 0.102, 0.172 max_d=0.172 avg_d=0.061 std_dev=0.041
C4'	A	0, 0.036, 0.126, 0.216, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.126 std_dev=0.090
O4'	A	0, 0.004, 0.100, 0.195, 0.577 max_d=0.577 avg_d=0.100 std_dev=0.095
C3'	A	0, 0.032, 0.130, 0.228, 0.592 max_d=0.592 avg_d=0.130 std_dev=0.098
C2'	A	0, 0.038, 0.142, 0.247, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.142 std_dev=0.104
C2'	B	0, 0.126, 0.244, 0.361, 0.460 max_d=0.460 avg_d=0.244 std_dev=0.118
O3'	B	0, 0.132, 0.257, 0.381, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.257 std_dev=0.124
C3'	B	0, 0.132, 0.256, 0.381, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.256 std_dev=0.125
P	A	0, 0.137, 0.274, 0.410, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.274 std_dev=0.136
C5'	A	0, 0.088, 0.226, 0.363, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.226 std_dev=0.137
C1'	B	0, 0.141, 0.279, 0.418, 0.618 max_d=0.618 avg_d=0.279 std_dev=0.139
O2'	B	0, 0.111, 0.252, 0.392, 0.649 max_d=0.649 avg_d=0.252 std_dev=0.141
N1	B	0, 0.162, 0.310, 0.457, 0.701 max_d=0.701 avg_d=0.310 std_dev=0.147
OP2	A	0, 0.121, 0.269, 0.416, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.269 std_dev=0.148
C4'	B	0, 0.130, 0.286, 0.441, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.286 std_dev=0.156
O5'	A	0, 0.117, 0.279, 0.440, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.279 std_dev=0.161
O4'	B	0, 0.145, 0.312, 0.479, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.312 std_dev=0.167
C6	B	0, 0.175, 0.343, 0.510, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.343 std_dev=0.167
OP1	A	0, 0.166, 0.344, 0.522, 1.329 max_d=1.329 avg_d=0.344 std_dev=0.178
C5'	B	0, 0.164, 0.345, 0.525, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.345 std_dev=0.180
C2	B	0, 0.171, 0.352, 0.532, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.352 std_dev=0.180
O5'	B	0, 0.168, 0.354, 0.540, 0.984 max_d=0.984 avg_d=0.354 std_dev=0.186
O3'	A	0, -0.002, 0.186, 0.374, 1.349 max_d=1.349 avg_d=0.186 std_dev=0.188
C5	B	0, 0.186, 0.379, 0.572, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.379 std_dev=0.193
C4	B	0, 0.188, 0.383, 0.578, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.383 std_dev=0.195
P	B	0, 0.238, 0.439, 0.640, 1.162 max_d=1.162 avg_d=0.439 std_dev=0.201
N3	B	0, 0.177, 0.380, 0.583, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.380 std_dev=0.203
O2'	A	0, 0.015, 0.224, 0.432, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.224 std_dev=0.208
OP2	B	0, 0.291, 0.503, 0.714, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.503 std_dev=0.212
O2	B	0, 0.175, 0.395, 0.615, 0.947 max_d=0.947 avg_d=0.395 std_dev=0.220
N4	B	0, 0.190, 0.426, 0.662, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.426 std_dev=0.236
OP1	B	0, 0.243, 0.479, 0.716, 1.245 max_d=1.245 avg_d=0.479 std_dev=0.237

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.12	0.01	0.00	0.10	0.10	0.08	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.14	0.01	0.05	0.16	0.14	0.12	0.11
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.08	0.05	0.02	0.03	0.06	0.00	0.03	0.03	0.01	0.15	0.12	0.17	0.14
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.00	0.02	0.19	0.19	0.14	0.15
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.02	0.04	0.00	0.01	0.09	0.05	0.03
C5	0.01	0.00	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.06	0.00	0.03	0.19	0.19	0.15	0.16
C5'	0.04	0.09	0.08	0.01	0.11	0.00	0.11	0.00	0.10	0.08	0.10	0.09	0.04	0.09	0.12	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.06	0.01	0.04	0.17	0.16	0.13	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.10	0.01	0.01	0.15	0.13	0.11	0.10
N3	0.01	0.00	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.12	0.01	0.04	0.18	0.17	0.13	0.14
O2	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.01	0.08	0.15	0.13	0.12	0.10
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.07	0.04	0.11	0.04	0.11	0.04	0.06	0.12	0.00	0.05	0.08	0.02	0.15	0.11	0.20	0.15
O3'	0.12	0.14	0.03	0.00	0.09	0.02	0.06	0.09	0.06	0.10	0.12	0.17	0.05	0.00	0.09	0.08	0.10	0.11	0.12	0.10
O4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.04	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.03	0.19	0.20	0.15	0.16
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.08	0.02	0.08	0.03	0.00	0.04	0.13	0.05	0.07
O5'	0.10	0.16	0.15	0.03	0.19	0.01	0.19	0.00	0.17	0.15	0.18	0.15	0.15	0.10	0.19	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.10	0.14	0.12	0.07	0.19	0.09	0.19	0.05	0.16	0.13	0.17	0.13	0.11	0.11	0.20	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.12	0.17	0.08	0.14	0.05	0.15	0.06	0.13	0.11	0.13	0.12	0.20	0.12	0.15	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.11	0.14	0.04	0.15	0.03	0.16	0.01	0.13	0.10	0.14	0.10	0.15	0.10	0.16	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.08	0.06	0.05	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.10	0.06	0.09	0.06	0.07	0.08	0.06
C2	0.09	0.09	0.07	0.06	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.08	0.09	0.06	0.06	0.09	0.06
C2'	0.10	0.11	0.11	0.11	0.12	0.07	0.13	0.07	0.13	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.12	0.08	0.11	0.16	0.12	0.14
C3'	0.13	0.13	0.10	0.07	0.10	0.11	0.09	0.09	0.09	0.11	0.12	0.11	0.18	0.19	0.07	0.13	0.08	0.08	0.08	0.06
C4	0.10	0.10	0.09	0.08	0.10	0.08	0.10	0.08	0.10	0.10	0.10	0.10	0.11	0.11	0.12	0.10	0.08	0.08	0.11	0.08
C4'	0.12	0.14	0.10	0.07	0.10	0.10	0.08	0.09	0.08	0.10	0.14	0.11	0.20	0.19	0.07	0.12	0.08	0.09	0.08	0.07
C5	0.09	0.10	0.09	0.08	0.10	0.07	0.09	0.07	0.09	0.09	0.10	0.10	0.11	0.11	0.13	0.10	0.07	0.07	0.10	0.07
C5'	0.08	0.14	0.08	0.03	0.09	0.04	0.07	0.02	0.08	0.07	0.14	0.10	0.21	0.16	0.03	0.06	0.07	0.12	0.10	0.10
C6	0.09	0.09	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.06	0.06	0.08	0.06
N1	0.08	0.09	0.07	0.05	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.10	0.09	0.07	0.09	0.06	0.06	0.08	0.06
N3	0.09	0.10	0.08	0.07	0.09	0.07	0.09	0.08	0.09	0.09	0.10	0.09	0.11	0.09	0.10	0.10	0.07	0.07	0.11	0.07
O2	0.09	0.09	0.07	0.05	0.09	0.07	0.08	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.07	0.09	0.06	0.06	0.09	0.06
O2'	0.23	0.26	0.23	0.20	0.26	0.17	0.26	0.16	0.25	0.25	0.26	0.27	0.25	0.21	0.18	0.20	0.20	0.24	0.19	0.22
O3'	0.16	0.20	0.14	0.12	0.18	0.13	0.15	0.12	0.15	0.16	0.21	0.19	0.24	0.19	0.10	0.15	0.12	0.09	0.10	0.08
O4	0.10	0.11	0.10	0.09	0.11	0.09	0.11	0.09	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.12	0.13	0.11	0.09	0.10	0.14	0.10
O4'	0.15	0.16	0.13	0.13	0.13	0.16	0.12	0.16	0.12	0.14	0.15	0.14	0.19	0.19	0.12	0.17	0.13	0.11	0.13	0.11
O5'	0.07	0.15	0.07	0.03	0.12	0.03	0.08	0.02	0.07	0.08	0.16	0.14	0.21	0.13	0.01	0.05	0.07	0.10	0.10	0.09
OP1	0.02	0.12	0.03	0.02	0.08	0.03	0.07	0.06	0.08	0.04	0.13	0.11	0.18	0.06	0.01	0.02	0.08	0.11	0.15	0.12
OP2	0.05	0.15	0.08	0.03	0.11	0.03	0.09	0.07	0.10	0.06	0.17	0.14	0.22	0.11	0.02	0.03	0.10	0.15	0.15	0.15
P	0.03	0.12	0.04	0.01	0.09	0.01	0.07	0.04	0.07	0.04	0.13	0.11	0.18	0.08	0.00	0.01	0.07	0.10	0.11	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.06	0.03	0.03
C2	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.05	0.09	0.05	0.06
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.04	0.09	0.00	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.04
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.07	0.06	0.10	0.01	0.00	0.00	0.05	0.05	0.06	0.05
C4	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.05	0.01	0.06	0.10	0.07	0.07
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01
C5	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.05	0.02	0.06	0.10	0.08	0.08
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.00	0.06	0.03	0.05	0.06	0.05	0.04	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.02	0.07	0.10	0.07	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.04
N3	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.06	0.10	0.06	0.08
N4	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.07	0.11	0.09	0.09
O2	0.01	0.00	0.09	0.10	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.12	0.02	0.06	0.09	0.06	0.07
O2'	0.02	0.04	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.03	0.07	0.00	0.03	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.05	0.01	0.05	0.01	0.06	0.02	0.08	0.07	0.12	0.03	0.00	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.04	0.01	0.00	0.05	0.07	0.05	0.05
O5'	0.03	0.05	0.03	0.05	0.06	0.01	0.06	0.00	0.07	0.03	0.06	0.07	0.06	0.03	0.06	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.09	0.05	0.05	0.10	0.02	0.10	0.02	0.10	0.07	0.10	0.11	0.09	0.05	0.07	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.03	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.08	0.04	0.07	0.04	0.06	0.09	0.06	0.05	0.09	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.04	0.05	0.07	0.01	0.08	0.01	0.08	0.04	0.08	0.09	0.07	0.04	0.07	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00