Doublet Group distance statistics: 55172

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 1, 3, 2, 8, 8, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.007, 0.012, 0.018, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.012 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.022 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.019, 0.031, 0.043, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.018, 0.030, 0.042, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.019, 0.031, 0.044, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.031 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.029 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.034, 0.063, 0.092, 0.130 max_d=0.130 avg_d=0.063 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.077, 0.138, 0.200, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.138 std_dev=0.061
O4'	A	0, 0.068, 0.132, 0.196, 0.291 max_d=0.291 avg_d=0.132 std_dev=0.064
O2'	A	0, 0.098, 0.169, 0.239, 0.342 max_d=0.342 avg_d=0.169 std_dev=0.071
O4	A	0, 0.069, 0.144, 0.220, 0.287 max_d=0.287 avg_d=0.144 std_dev=0.076
C3'	A	0, 0.132, 0.250, 0.368, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.250 std_dev=0.118
C4'	A	0, 0.106, 0.224, 0.341, 0.507 max_d=0.507 avg_d=0.224 std_dev=0.118
C5'	A	0, 0.212, 0.335, 0.458, 0.637 max_d=0.637 avg_d=0.335 std_dev=0.123
O5'	A	0, 0.329, 0.465, 0.601, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.465 std_dev=0.136
O3'	A	0, 0.247, 0.413, 0.580, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.413 std_dev=0.167
P	A	0, 0.278, 0.471, 0.664, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.471 std_dev=0.193
OP1	A	0, 0.360, 0.569, 0.777, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.569 std_dev=0.209
C2'	B	0, 0.464, 0.696, 0.928, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.696 std_dev=0.232
O2'	B	0, 0.505, 0.785, 1.065, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.785 std_dev=0.280
C1'	B	0, 0.537, 0.841, 1.145, 1.724 max_d=1.724 avg_d=0.841 std_dev=0.304
N9	B	0, 0.739, 1.083, 1.427, 2.000 max_d=2.000 avg_d=1.083 std_dev=0.344
O3'	B	0, 0.145, 0.516, 0.888, 2.279 max_d=2.279 avg_d=0.516 std_dev=0.371
OP2	A	0, 0.188, 0.564, 0.939, 1.944 max_d=1.944 avg_d=0.564 std_dev=0.375
C4	B	0, 1.157, 1.564, 1.971, 2.252 max_d=2.252 avg_d=1.564 std_dev=0.407
C3'	B	0, 0.106, 0.573, 1.040, 2.771 max_d=2.771 avg_d=0.573 std_dev=0.467
C8	B	0, 0.826, 1.311, 1.795, 2.897 max_d=2.897 avg_d=1.311 std_dev=0.484
C5	B	0, 1.387, 1.880, 2.372, 2.745 max_d=2.745 avg_d=1.880 std_dev=0.492
N7	B	0, 1.229, 1.785, 2.341, 3.553 max_d=3.553 avg_d=1.785 std_dev=0.556
O4'	B	0, 0.084, 0.741, 1.398, 3.777 max_d=3.777 avg_d=0.741 std_dev=0.657
N3	B	0, 1.165, 1.866, 2.566, 4.286 max_d=4.286 avg_d=1.866 std_dev=0.701
C6	B	0, 1.676, 2.390, 3.103, 4.046 max_d=4.046 avg_d=2.390 std_dev=0.714
C4'	B	0, -0.035, 0.756, 1.547, 4.785 max_d=4.785 avg_d=0.756 std_dev=0.791
N6	B	0, 1.926, 2.795, 3.663, 5.175 max_d=5.175 avg_d=2.795 std_dev=0.868
N1	B	0, 1.647, 2.573, 3.499, 5.459 max_d=5.459 avg_d=2.573 std_dev=0.926
C2	B	0, 1.385, 2.338, 3.291, 5.730 max_d=5.730 avg_d=2.338 std_dev=0.953
C5'	B	0, -0.008, 1.100, 2.207, 6.863 max_d=6.863 avg_d=1.100 std_dev=1.107
O5'	B	0, 0.088, 1.213, 2.337, 6.959 max_d=6.959 avg_d=1.213 std_dev=1.124
P	B	0, 0.221, 1.662, 3.104, 9.073 max_d=9.073 avg_d=1.662 std_dev=1.441
OP2	B	0, 0.312, 1.848, 3.383, 9.740 max_d=9.740 avg_d=1.848 std_dev=1.536
OP1	B	0, 0.417, 2.083, 3.750, 10.434 max_d=10.434 avg_d=2.083 std_dev=1.666

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.07	0.16	0.06	0.09
C2	0.02	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.07	0.01	0.04	0.13	0.22	0.16	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.00	0.02	0.06	0.01	0.05	0.10	0.08	0.06
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.07	0.03	0.03	0.04	0.01	0.01	0.06	0.01	0.04	0.08	0.09	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.05	0.00	0.05	0.22	0.28	0.30	0.29
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.04	0.06	0.01	0.01	0.08	0.01	0.01	0.11	0.07	0.03
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.01	0.09	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.05	0.24	0.27	0.32	0.30
C5'	0.03	0.06	0.03	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.15	0.08	0.10	0.05	0.02	0.02	0.17	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.05	0.21	0.22	0.25	0.24
N1	0.00	0.01	0.03	0.03	0.01	0.03	0.01	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.02	0.14	0.20	0.15	0.16
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.01	0.04	0.17	0.25	0.23	0.24
O2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.10	0.01	0.06	0.09	0.23	0.11	0.15
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.06	0.08	0.00	0.03	0.09	0.01	0.05	0.10	0.11	0.08
O3'	0.04	0.07	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.10	0.03	0.00	0.05	0.04	0.04	0.10	0.11	0.05
O4	0.02	0.01	0.06	0.06	0.00	0.08	0.01	0.17	0.02	0.02	0.01	0.01	0.09	0.05	0.00	0.06	0.25	0.31	0.35	0.32
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.06	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.18	0.05	0.09
O5'	0.07	0.13	0.05	0.04	0.22	0.01	0.24	0.01	0.21	0.14	0.17	0.09	0.05	0.04	0.25	0.05	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.22	0.10	0.08	0.28	0.11	0.27	0.07	0.22	0.20	0.25	0.23	0.10	0.10	0.31	0.18	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.06	0.16	0.08	0.09	0.30	0.07	0.32	0.08	0.25	0.15	0.23	0.11	0.11	0.11	0.35	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.09	0.18	0.06	0.05	0.29	0.03	0.30	0.01	0.24	0.16	0.24	0.15	0.08	0.05	0.32	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.75	0.25	0.11	0.49	0.16	0.51	0.16	0.60	0.46	0.70	0.65	0.62	0.52	0.35	0.23	0.17	0.13	0.23	0.14	0.49	0.28
C2	0.18	0.60	0.19	0.18	0.38	0.44	0.45	0.50	0.52	0.43	0.57	0.52	0.58	0.51	0.27	0.25	0.32	0.31	0.29	0.49	0.39	0.34
C2'	0.24	0.82	0.27	0.19	0.55	0.09	0.57	0.18	0.67	0.51	0.77	0.72	0.68	0.57	0.40	0.16	0.12	0.13	0.40	0.30	0.67	0.48
C3'	0.24	0.88	0.24	0.25	0.57	0.18	0.60	0.32	0.73	0.46	0.86	0.75	0.74	0.53	0.39	0.15	0.10	0.18	0.52	0.43	0.74	0.58
C4	0.22	0.44	0.19	0.38	0.31	0.70	0.42	0.86	0.48	0.40	0.46	0.37	0.56	0.49	0.25	0.28	0.45	0.51	0.63	0.92	0.54	0.67
C4'	0.20	0.75	0.20	0.17	0.47	0.10	0.48	0.16	0.60	0.33	0.72	0.63	0.61	0.39	0.30	0.17	0.08	0.13	0.31	0.17	0.46	0.32
C5	0.21	0.41	0.20	0.38	0.30	0.66	0.38	0.78	0.42	0.35	0.42	0.36	0.48	0.43	0.23	0.29	0.45	0.46	0.57	0.80	0.46	0.58
C5'	0.15	0.59	0.13	0.13	0.37	0.09	0.38	0.12	0.49	0.22	0.59	0.49	0.50	0.28	0.22	0.16	0.04	0.11	0.20	0.16	0.25	0.17
C6	0.18	0.48	0.20	0.24	0.33	0.46	0.37	0.50	0.42	0.35	0.45	0.43	0.45	0.41	0.25	0.29	0.35	0.30	0.31	0.50	0.28	0.32
N1	0.19	0.60	0.21	0.14	0.39	0.35	0.44	0.38	0.50	0.41	0.56	0.53	0.54	0.48	0.28	0.26	0.28	0.24	0.20	0.35	0.34	0.24
N3	0.19	0.51	0.18	0.29	0.33	0.59	0.43	0.70	0.50	0.42	0.51	0.44	0.58	0.51	0.25	0.27	0.39	0.43	0.47	0.74	0.44	0.52
O2	0.17	0.67	0.20	0.14	0.41	0.38	0.48	0.42	0.57	0.46	0.64	0.57	0.63	0.55	0.29	0.23	0.28	0.27	0.26	0.40	0.46	0.32
O2'	0.27	0.96	0.29	0.21	0.64	0.11	0.69	0.26	0.79	0.65	0.90	0.84	0.82	0.73	0.47	0.15	0.13	0.14	0.53	0.49	0.90	0.66
O3'	0.25	1.02	0.25	0.27	0.63	0.20	0.68	0.39	0.84	0.53	1.00	0.84	0.87	0.62	0.43	0.14	0.10	0.19	0.62	0.56	0.92	0.71
O4	0.26	0.45	0.21	0.45	0.33	0.80	0.46	1.02	0.52	0.42	0.50	0.36	0.62	0.51	0.27	0.28	0.49	0.60	0.80	1.15	0.70	0.87
O4'	0.21	0.69	0.23	0.12	0.44	0.14	0.44	0.14	0.54	0.34	0.65	0.60	0.54	0.39	0.30	0.22	0.17	0.13	0.17	0.13	0.35	0.18
O5'	0.13	0.48	0.12	0.12	0.31	0.07	0.32	0.07	0.40	0.19	0.47	0.40	0.41	0.24	0.19	0.17	0.01	0.10	0.15	0.19	0.19	0.15
OP1	0.17	0.26	0.06	0.05	0.13	0.06	0.10	0.22	0.14	0.17	0.21	0.24	0.15	0.16	0.10	0.18	0.03	0.09	0.28	0.57	0.40	0.37
OP2	0.15	0.38	0.24	0.05	0.34	0.09	0.44	0.18	0.48	0.39	0.45	0.31	0.53	0.46	0.29	0.24	0.03	0.04	0.24	0.50	0.34	0.34
P	0.08	0.23	0.07	0.01	0.13	0.03	0.17	0.08	0.21	0.15	0.24	0.19	0.24	0.17	0.06	0.12	0.01	0.06	0.13	0.36	0.20	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.00	0.08	0.10	0.09	0.10
C2	0.03	0.00	0.20	0.15	0.00	0.10	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.20	0.16	0.11	0.29	0.17	0.24
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.06	0.05	0.10	0.11	0.16	0.20	0.08	0.07	0.02	0.00	0.03	0.01	0.11	0.11	0.20	0.17
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.11	0.00	0.12	0.03	0.14	0.13	0.14	0.13	0.14	0.13	0.08	0.02	0.01	0.01	0.06	0.14	0.10	0.06
C4	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.11	0.09	0.13	0.18	0.16	0.17
C4'	0.00	0.10	0.01	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.11	0.07	0.09	0.04	0.09	0.03	0.11	0.02	0.00	0.02	0.07	0.03	0.03
C5	0.02	0.01	0.06	0.12	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.04	0.17	0.17	0.21	0.18
C5'	0.03	0.14	0.05	0.03	0.07	0.01	0.08	0.00	0.09	0.17	0.11	0.13	0.09	0.15	0.07	0.06	0.10	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01
C6	0.02	0.01	0.10	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.11	0.08	0.16	0.21	0.22	0.20
C8	0.01	0.01	0.11	0.13	0.00	0.11	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.22	0.09	0.09	0.25	0.18	0.23	0.18
N1	0.03	0.00	0.16	0.14	0.01	0.07	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.13	0.13	0.27	0.19	0.23
N3	0.04	0.00	0.20	0.13	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.19	0.16	0.11	0.25	0.15	0.21
N6	0.03	0.01	0.08	0.14	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.10	0.06	0.18	0.21	0.25	0.21
N7	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.09	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.08	0.05	0.24	0.18	0.27	0.20
N9	0.01	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.08	0.06	0.01	0.15	0.12	0.15	0.13
O2'	0.01	0.21	0.00	0.02	0.08	0.11	0.10	0.06	0.10	0.22	0.14	0.21	0.11	0.19	0.08	0.00	0.05	0.08	0.08	0.08	0.21	0.14
O3'	0.13	0.20	0.03	0.01	0.11	0.02	0.07	0.10	0.11	0.09	0.16	0.19	0.10	0.08	0.06	0.05	0.00	0.09	0.13	0.28	0.17	0.15
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.09	0.00	0.04	0.02	0.08	0.09	0.13	0.16	0.06	0.05	0.01	0.08	0.09	0.00	0.07	0.09	0.06	0.06
O5'	0.08	0.11	0.11	0.06	0.13	0.02	0.17	0.01	0.16	0.25	0.13	0.11	0.18	0.24	0.15	0.08	0.13	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.29	0.11	0.14	0.18	0.07	0.17	0.07	0.21	0.18	0.27	0.25	0.21	0.18	0.12	0.08	0.28	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.17	0.20	0.10	0.16	0.03	0.21	0.01	0.22	0.23	0.19	0.15	0.25	0.27	0.15	0.21	0.17	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.24	0.17	0.06	0.17	0.03	0.18	0.01	0.20	0.18	0.23	0.21	0.21	0.20	0.13	0.14	0.15	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00