Doublet Group distance statistics: 55179

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.011, 0.022, 0.032, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.022 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.015, 0.027, 0.039, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.027 std_dev=0.012
C6	A	0, 0.019, 0.036, 0.052, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.036 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.021, 0.037, 0.054, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.037 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.021, 0.038, 0.055, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.038 std_dev=0.017
C2	A	0, 0.024, 0.043, 0.063, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.043 std_dev=0.020
O2	A	0, 0.052, 0.094, 0.137, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.094 std_dev=0.043
O4	A	0, 0.071, 0.128, 0.186, 0.161 max_d=0.161 avg_d=0.128 std_dev=0.058
C1'	B	0, 0.271, 0.554, 0.836, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.554 std_dev=0.283
C2'	A	0, 0.256, 0.579, 0.902, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.579 std_dev=0.323
O4'	A	0, 0.304, 0.645, 0.986, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.645 std_dev=0.341
O4'	B	0, 0.388, 0.731, 1.073, 1.012 max_d=1.012 avg_d=0.731 std_dev=0.342
C4'	B	0, 0.283, 0.652, 1.021, 1.009 max_d=1.009 avg_d=0.652 std_dev=0.369
C5'	B	0, 0.431, 0.806, 1.182, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.806 std_dev=0.375
C2'	B	0, 0.216, 0.613, 1.010, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.613 std_dev=0.397
N9	B	0, 0.413, 0.815, 1.217, 1.202 max_d=1.202 avg_d=0.815 std_dev=0.402
C3'	B	0, 0.349, 0.769, 1.189, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.769 std_dev=0.420
C4	B	0, 0.303, 0.747, 1.192, 1.455 max_d=1.455 avg_d=0.747 std_dev=0.445
O5'	B	0, 0.412, 0.876, 1.339, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.876 std_dev=0.463
O2'	B	0, 0.452, 0.919, 1.386, 1.381 max_d=1.381 avg_d=0.919 std_dev=0.467
C6	B	0, 0.663, 1.212, 1.760, 1.567 max_d=1.567 avg_d=1.212 std_dev=0.549
C5	B	0, 0.638, 1.218, 1.798, 1.730 max_d=1.730 avg_d=1.218 std_dev=0.580
O3'	B	0, 0.542, 1.196, 1.851, 1.952 max_d=1.952 avg_d=1.196 std_dev=0.655
P	B	0, 0.337, 0.995, 1.654, 1.766 max_d=1.766 avg_d=0.995 std_dev=0.658
C4'	A	0, 0.596, 1.292, 1.988, 1.913 max_d=1.913 avg_d=1.292 std_dev=0.696
O2'	A	0, 0.420, 1.150, 1.880, 1.728 max_d=1.728 avg_d=1.150 std_dev=0.730
N1	B	0, 0.673, 1.430, 2.187, 2.536 max_d=2.536 avg_d=1.430 std_dev=0.757
C3'	A	0, 0.625, 1.384, 2.143, 1.971 max_d=1.971 avg_d=1.384 std_dev=0.759
O5'	A	0, 0.702, 1.462, 2.221, 2.187 max_d=2.187 avg_d=1.462 std_dev=0.759
N3	B	0, 0.730, 1.537, 2.344, 2.575 max_d=2.575 avg_d=1.537 std_dev=0.807
C5'	A	0, 0.781, 1.596, 2.411, 2.368 max_d=2.368 avg_d=1.596 std_dev=0.815
N6	B	0, 0.888, 1.733, 2.577, 2.477 max_d=2.477 avg_d=1.733 std_dev=0.844
OP1	B	0, 0.937, 1.803, 2.668, 2.851 max_d=2.851 avg_d=1.803 std_dev=0.866
P	A	0, 0.810, 1.691, 2.573, 2.538 max_d=2.538 avg_d=1.691 std_dev=0.881
C2	B	0, 0.946, 1.887, 2.827, 3.062 max_d=3.062 avg_d=1.887 std_dev=0.941
OP2	A	0, 0.838, 1.782, 2.726, 2.494 max_d=2.494 avg_d=1.782 std_dev=0.944
C8	B	0, 0.899, 1.861, 2.824, 2.842 max_d=2.842 avg_d=1.861 std_dev=0.962
N7	B	0, 1.037, 2.121, 3.205, 3.171 max_d=3.171 avg_d=2.121 std_dev=1.084
O3'	A	0, 0.925, 2.184, 3.442, 3.119 max_d=3.119 avg_d=2.184 std_dev=1.258
OP2	B	0, 0.669, 1.982, 3.295, 3.610 max_d=3.610 avg_d=1.982 std_dev=1.313
OP1	A	0, 1.318, 2.739, 4.159, 4.073 max_d=4.073 avg_d=2.739 std_dev=1.421

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.27	0.02	0.00	0.15	0.15	0.07	0.13
C2	0.03	0.00	0.07	0.18	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.16	0.01	0.04	0.07	0.08	0.21	0.08
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.02	0.00	0.07	0.17	0.08	0.01	0.05	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.30	0.30	0.29	0.30
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.33	0.00	0.35	0.00	0.29	0.19	0.26	0.10	0.01	0.00	0.36	0.01	0.12	0.06	0.18	0.12
C4	0.02	0.01	0.02	0.33	0.00	0.16	0.00	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.37	0.11	0.00	0.01	0.20	0.27	0.43	0.25
C4'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.00	0.17	0.08	0.11	0.03	0.23	0.01	0.17	0.00	0.00	0.08	0.06	0.00
C5	0.01	0.01	0.07	0.35	0.00	0.19	0.00	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.31	0.18	0.00	0.03	0.21	0.25	0.40	0.24
C5'	0.05	0.07	0.17	0.00	0.21	0.00	0.24	0.00	0.18	0.07	0.14	0.04	0.04	0.17	0.24	0.01	0.00	0.10	0.02	0.00
C6	0.00	0.01	0.08	0.29	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.12	0.01	0.05	0.11	0.10	0.20	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.19	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.08	0.01	0.01	0.06	0.05	0.12	0.05
N3	0.02	0.00	0.05	0.26	0.00	0.11	0.01	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.06	0.00	0.03	0.13	0.19	0.34	0.17
O2	0.04	0.01	0.13	0.10	0.01	0.03	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.34	0.01	0.08	0.08	0.07	0.16	0.07
O2'	0.01	0.31	0.00	0.01	0.37	0.23	0.31	0.04	0.24	0.21	0.37	0.30	0.00	0.02	0.40	0.18	0.21	0.20	0.37	0.25
O3'	0.27	0.16	0.01	0.00	0.11	0.01	0.18	0.17	0.12	0.08	0.06	0.34	0.02	0.00	0.15	0.18	0.31	0.37	0.37	0.33
O4	0.02	0.01	0.02	0.36	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.01	0.00	0.01	0.40	0.15	0.00	0.01	0.25	0.36	0.52	0.32
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.03	0.08	0.18	0.18	0.01	0.00	0.12	0.15	0.04	0.10
O5'	0.15	0.07	0.30	0.12	0.20	0.00	0.21	0.00	0.11	0.06	0.13	0.08	0.21	0.31	0.25	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.15	0.08	0.30	0.06	0.27	0.08	0.25	0.10	0.10	0.05	0.19	0.07	0.20	0.37	0.36	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.21	0.29	0.18	0.43	0.06	0.40	0.02	0.20	0.12	0.34	0.16	0.37	0.37	0.52	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.08	0.30	0.12	0.25	0.00	0.24	0.00	0.10	0.05	0.17	0.07	0.25	0.33	0.32	0.10	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.09	0.14	0.06	0.09	0.09	0.02	0.18	0.09	0.19	0.21	0.15	0.11	0.25	0.24	0.10	0.18	0.11	0.06	0.16	0.14	0.22	0.18
C2	0.09	0.10	0.07	0.07	0.09	0.03	0.20	0.09	0.21	0.21	0.15	0.06	0.28	0.26	0.11	0.17	0.06	0.06	0.16	0.16	0.25	0.19
C2'	0.09	0.18	0.10	0.26	0.17	0.17	0.28	0.30	0.27	0.34	0.21	0.15	0.35	0.38	0.20	0.10	0.24	0.13	0.40	0.40	0.46	0.42
C3'	0.25	0.31	0.24	0.15	0.24	0.18	0.25	0.11	0.23	0.32	0.25	0.29	0.25	0.32	0.26	0.27	0.13	0.21	0.08	0.09	0.12	0.08
C4	0.07	0.22	0.08	0.02	0.13	0.04	0.21	0.08	0.23	0.22	0.21	0.18	0.27	0.26	0.13	0.16	0.06	0.07	0.13	0.15	0.24	0.17
C4'	0.17	0.19	0.16	0.08	0.13	0.13	0.15	0.08	0.13	0.25	0.14	0.18	0.16	0.24	0.17	0.21	0.05	0.15	0.04	0.09	0.06	0.05
C5	0.05	0.26	0.06	0.03	0.15	0.04	0.20	0.09	0.20	0.23	0.21	0.25	0.23	0.26	0.13	0.12	0.06	0.07	0.14	0.14	0.23	0.17
C5'	0.21	0.26	0.22	0.13	0.20	0.17	0.21	0.11	0.19	0.29	0.22	0.25	0.20	0.28	0.22	0.25	0.12	0.19	0.10	0.13	0.13	0.10
C6	0.03	0.21	0.02	0.07	0.12	0.04	0.18	0.10	0.19	0.22	0.18	0.19	0.22	0.25	0.11	0.12	0.04	0.04	0.16	0.14	0.23	0.19
N1	0.05	0.15	0.04	0.08	0.09	0.02	0.19	0.10	0.20	0.21	0.16	0.12	0.26	0.25	0.11	0.15	0.07	0.02	0.17	0.15	0.24	0.19
N3	0.08	0.13	0.08	0.04	0.10	0.04	0.20	0.08	0.22	0.21	0.17	0.09	0.29	0.26	0.12	0.18	0.03	0.07	0.14	0.16	0.25	0.18
O2	0.11	0.05	0.08	0.08	0.09	0.04	0.20	0.10	0.21	0.21	0.14	0.03	0.29	0.26	0.12	0.19	0.09	0.08	0.17	0.17	0.26	0.20
O2'	0.09	0.35	0.08	0.21	0.33	0.08	0.51	0.23	0.57	0.46	0.48	0.25	0.69	0.57	0.29	0.21	0.14	0.09	0.41	0.42	0.57	0.46
O3'	0.16	0.23	0.16	0.19	0.11	0.23	0.17	0.23	0.13	0.32	0.16	0.19	0.18	0.31	0.19	0.14	0.23	0.19	0.22	0.32	0.25	0.24
O4	0.10	0.27	0.09	0.02	0.16	0.05	0.23	0.08	0.26	0.22	0.26	0.21	0.29	0.26	0.14	0.17	0.09	0.10	0.11	0.16	0.24	0.16
O4'	0.11	0.14	0.09	0.05	0.08	0.07	0.13	0.03	0.14	0.19	0.13	0.11	0.18	0.19	0.11	0.18	0.07	0.10	0.06	0.02	0.09	0.06
O5'	0.06	0.31	0.08	0.03	0.13	0.03	0.13	0.09	0.14	0.23	0.23	0.27	0.15	0.22	0.10	0.12	0.01	0.02	0.07	0.03	0.06	0.06
OP1	0.03	0.43	0.05	0.01	0.25	0.10	0.29	0.13	0.36	0.28	0.41	0.36	0.39	0.33	0.15	0.05	0.02	0.05	0.06	0.10	0.22	0.09
OP2	0.15	0.58	0.19	0.03	0.37	0.12	0.36	0.28	0.43	0.28	0.52	0.53	0.42	0.33	0.23	0.18	0.02	0.05	0.22	0.28	0.14	0.22
P	0.06	0.38	0.08	0.01	0.22	0.07	0.23	0.14	0.27	0.26	0.34	0.34	0.28	0.27	0.14	0.07	0.00	0.02	0.05	0.03	0.09	0.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.16	0.08
C2	0.02	0.00	0.13	0.16	0.01	0.07	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.21	0.02	0.12	0.32	0.15	0.13
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.06	0.03	0.02	0.00	0.04	0.08	0.09	0.13	0.02	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.11	0.05
C3'	0.02	0.16	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.09	0.18	0.12	0.15	0.10	0.15	0.08	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.09	0.01	0.05	0.22	0.15	0.09
C4'	0.00	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.08	0.05	0.06	0.05	0.07	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.23	0.14	0.08
C5'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.05	0.08	0.07	0.08	0.06	0.07	0.02	0.06	0.02	0.01	0.00	0.12	0.09	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.12	0.01	0.07	0.29	0.12	0.10
C8	0.01	0.01	0.08	0.18	0.00	0.08	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.20	0.02	0.13	0.09	0.17	0.11
N1	0.02	0.00	0.09	0.12	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.16	0.02	0.10	0.33	0.13	0.12
N3	0.02	0.00	0.13	0.15	0.00	0.06	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.19	0.02	0.10	0.26	0.16	0.11
N6	0.02	0.00	0.02	0.10	0.01	0.05	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.07	0.30	0.11	0.08
N7	0.01	0.01	0.05	0.15	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.19	0.02	0.10	0.15	0.15	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.08	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.07	0.01	0.04	0.12	0.16	0.08
O2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.08	0.07	0.06	0.06	0.09	0.05	0.13	0.15	0.07	0.04	0.03	0.00	0.03	0.05	0.03	0.10	0.10	0.03
O3'	0.00	0.21	0.00	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.12	0.20	0.16	0.19	0.13	0.19	0.07	0.03	0.00	0.01	0.07	0.13	0.10	0.07
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.03	0.17	0.08
O5'	0.03	0.12	0.03	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.07	0.13	0.10	0.10	0.07	0.10	0.04	0.03	0.07	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.32	0.06	0.07	0.22	0.07	0.23	0.12	0.29	0.09	0.33	0.26	0.30	0.15	0.12	0.10	0.13	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	0.15	0.11	0.06	0.15	0.10	0.14	0.09	0.12	0.17	0.13	0.16	0.11	0.15	0.16	0.10	0.10	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.13	0.05	0.04	0.09	0.02	0.08	0.01	0.10	0.11	0.12	0.11	0.08	0.09	0.08	0.03	0.07	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00