Doublet Group distance statistics: 55184

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.006, 0.012, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C5	A	0, -0.001, 0.006, 0.013, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.006 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.003, 0.017, 0.031, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.016
C4	A	0, -0.001, 0.016, 0.033, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.016 std_dev=0.017
C6	A	0, -0.004, 0.014, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.014 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.002, 0.020, 0.038, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.018
O2	A	0, 0.000, 0.034, 0.068, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.034 std_dev=0.034
O4	A	0, -0.023, 0.054, 0.132, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.054 std_dev=0.077
O4'	B	0, 0.118, 0.305, 0.492, 0.485 max_d=0.485 avg_d=0.305 std_dev=0.187
P	B	0, 0.074, 0.279, 0.484, 0.580 max_d=0.580 avg_d=0.279 std_dev=0.205
O4'	A	0, 0.060, 0.296, 0.532, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.296 std_dev=0.236
O5'	B	0, 0.129, 0.376, 0.622, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.376 std_dev=0.246
C3'	A	0, 0.057, 0.312, 0.568, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.312 std_dev=0.256
C4'	A	0, 0.069, 0.325, 0.582, 0.584 max_d=0.584 avg_d=0.325 std_dev=0.256
C2'	A	0, 0.043, 0.371, 0.699, 0.807 max_d=0.807 avg_d=0.371 std_dev=0.328
C1'	B	0, 0.133, 0.481, 0.829, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.481 std_dev=0.348
O3'	A	0, 0.024, 0.373, 0.723, 0.855 max_d=0.855 avg_d=0.373 std_dev=0.350
O2'	B	0, 0.123, 0.502, 0.882, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.502 std_dev=0.380
C4'	B	0, 0.022, 0.433, 0.844, 1.097 max_d=1.097 avg_d=0.433 std_dev=0.411
C2'	B	0, 0.104, 0.517, 0.930, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.517 std_dev=0.413
OP1	B	0, 0.109, 0.524, 0.940, 1.084 max_d=1.084 avg_d=0.524 std_dev=0.416
C3'	B	0, 0.074, 0.521, 0.967, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.521 std_dev=0.446
OP2	B	0, 0.065, 0.512, 0.959, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.512 std_dev=0.447
C5'	A	0, 0.076, 0.554, 1.032, 1.221 max_d=1.221 avg_d=0.554 std_dev=0.478
O5'	A	0, 0.051, 0.564, 1.078, 1.146 max_d=1.146 avg_d=0.564 std_dev=0.513
O3'	B	0, 0.022, 0.625, 1.227, 1.345 max_d=1.345 avg_d=0.625 std_dev=0.603
O2'	A	0, 0.067, 0.704, 1.342, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.704 std_dev=0.638
P	A	0, -0.079, 0.599, 1.278, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.599 std_dev=0.678
N9	B	0, 0.163, 0.842, 1.522, 1.702 max_d=1.702 avg_d=0.842 std_dev=0.679
C8	B	0, 0.199, 0.949, 1.698, 2.044 max_d=2.044 avg_d=0.949 std_dev=0.749
C5'	B	0, -0.068, 0.763, 1.593, 2.151 max_d=2.151 avg_d=0.763 std_dev=0.830
OP2	A	0, -0.134, 0.873, 1.880, 2.509 max_d=2.509 avg_d=0.873 std_dev=1.007
OP1	A	0, -0.117, 1.005, 2.126, 2.768 max_d=2.768 avg_d=1.005 std_dev=1.121
C4	B	0, 0.096, 1.252, 2.408, 2.848 max_d=2.848 avg_d=1.252 std_dev=1.156
N7	B	0, 0.133, 1.296, 2.459, 3.083 max_d=3.083 avg_d=1.296 std_dev=1.163
N3	B	0, 0.156, 1.516, 2.877, 3.388 max_d=3.388 avg_d=1.516 std_dev=1.361
C5	B	0, 0.046, 1.454, 2.862, 3.535 max_d=3.535 avg_d=1.454 std_dev=1.408
C2	B	0, 0.147, 1.953, 3.759, 4.539 max_d=4.539 avg_d=1.953 std_dev=1.806
C6	B	0, -0.044, 1.853, 3.750, 4.699 max_d=4.699 avg_d=1.853 std_dev=1.897
N1	B	0, 0.055, 2.122, 4.188, 5.170 max_d=5.170 avg_d=2.122 std_dev=2.066
N6	B	0, -0.144, 2.053, 4.250, 5.458 max_d=5.458 avg_d=2.053 std_dev=2.197

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.17	0.02	0.00	0.23	0.64	0.13	0.24
C2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.00	0.05	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.17	0.00	0.09	0.32	0.85	0.26	0.40
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.13	0.16	0.15	0.03	0.03	0.18	0.00	0.02	0.06	0.03	0.53	0.67	0.34	0.39
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.02	0.12	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.09	0.02	0.30	0.47	0.13	0.17
C4	0.02	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.22	0.08	0.00	0.03	0.37	0.80	0.28	0.43
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.05	0.08	0.13	0.01	0.04	0.01	0.01	0.41	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.13	0.13	0.01	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.05	0.00	0.08	0.39	0.68	0.22	0.38
C5'	0.04	0.08	0.16	0.02	0.03	0.01	0.03	0.00	0.03	0.04	0.07	0.11	0.03	0.12	0.02	0.01	0.01	0.32	0.11	0.02
C6	0.01	0.00	0.15	0.12	0.00	0.06	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.27	0.05	0.00	0.10	0.39	0.66	0.19	0.35
N1	0.02	0.00	0.03	0.06	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.11	0.00	0.02	0.34	0.75	0.20	0.35
N3	0.02	0.00	0.03	0.07	0.00	0.05	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.14	0.00	0.06	0.35	0.87	0.29	0.44
O2	0.03	0.00	0.18	0.04	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00	0.27	0.24	0.00	0.15	0.28	0.87	0.27	0.39
O2'	0.02	0.13	0.00	0.01	0.22	0.13	0.30	0.03	0.27	0.12	0.14	0.27	0.00	0.05	0.25	0.08	0.45	0.64	0.27	0.35
O3'	0.17	0.17	0.02	0.01	0.08	0.01	0.05	0.12	0.05	0.11	0.14	0.24	0.05	0.00	0.08	0.11	0.12	0.41	0.04	0.11
O4	0.02	0.00	0.06	0.09	0.00	0.04	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.08	0.00	0.04	0.37	0.79	0.30	0.44
O4'	0.00	0.09	0.03	0.02	0.03	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.06	0.15	0.08	0.11	0.04	0.00	0.05	0.54	0.05	0.14
O5'	0.23	0.32	0.53	0.30	0.37	0.01	0.39	0.01	0.39	0.34	0.35	0.28	0.45	0.12	0.37	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.64	0.85	0.67	0.47	0.80	0.41	0.68	0.32	0.66	0.75	0.87	0.87	0.64	0.41	0.79	0.54	0.02	0.00	0.04	0.01
OP2	0.13	0.26	0.34	0.13	0.28	0.08	0.22	0.11	0.19	0.20	0.29	0.27	0.27	0.04	0.30	0.05	0.01	0.04	0.00	0.02
P	0.24	0.40	0.39	0.17	0.43	0.05	0.38	0.02	0.35	0.35	0.44	0.39	0.35	0.11	0.44	0.14	0.00	0.01	0.02	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.65	0.10	0.16	0.34	0.13	0.29	0.21	0.42	0.12	0.59	0.55	0.38	0.15	0.16	0.14	0.21	0.04	0.24	0.43	0.21	0.20
C2	0.10	0.70	0.13	0.08	0.39	0.17	0.38	0.26	0.53	0.16	0.68	0.57	0.52	0.24	0.20	0.09	0.12	0.10	0.25	0.44	0.16	0.16
C2'	0.38	0.83	0.29	0.10	0.54	0.21	0.47	0.13	0.58	0.25	0.75	0.75	0.53	0.30	0.37	0.45	0.03	0.30	0.40	0.10	0.44	0.26
C3'	0.29	0.89	0.26	0.33	0.54	0.23	0.48	0.34	0.62	0.30	0.81	0.76	0.57	0.35	0.35	0.25	0.32	0.24	0.05	0.32	0.13	0.06
C4	0.14	0.85	0.17	0.03	0.48	0.27	0.47	0.41	0.63	0.18	0.81	0.70	0.62	0.29	0.25	0.20	0.17	0.17	0.25	0.47	0.12	0.14
C4'	0.12	0.65	0.12	0.31	0.29	0.30	0.23	0.41	0.37	0.19	0.58	0.52	0.32	0.14	0.13	0.10	0.38	0.20	0.22	0.42	0.27	0.26
C5	0.13	0.74	0.16	0.03	0.43	0.25	0.40	0.38	0.53	0.16	0.69	0.63	0.51	0.24	0.23	0.20	0.13	0.16	0.26	0.46	0.15	0.16
C5'	0.10	0.54	0.08	0.32	0.23	0.36	0.23	0.49	0.34	0.26	0.50	0.42	0.33	0.23	0.13	0.12	0.39	0.25	0.22	0.35	0.28	0.25
C6	0.11	0.63	0.14	0.08	0.36	0.18	0.32	0.26	0.44	0.14	0.58	0.54	0.41	0.19	0.18	0.11	0.10	0.09	0.25	0.44	0.18	0.17
N1	0.10	0.64	0.13	0.11	0.35	0.15	0.33	0.22	0.45	0.14	0.60	0.53	0.43	0.20	0.18	0.09	0.13	0.07	0.24	0.44	0.18	0.17
N3	0.12	0.80	0.15	0.04	0.45	0.22	0.45	0.34	0.61	0.18	0.77	0.64	0.61	0.28	0.24	0.15	0.14	0.15	0.25	0.46	0.14	0.15
O2	0.10	0.70	0.13	0.10	0.38	0.15	0.39	0.23	0.53	0.17	0.69	0.56	0.54	0.25	0.20	0.08	0.12	0.09	0.25	0.43	0.17	0.16
O2'	0.62	1.13	0.46	0.20	0.80	0.35	0.71	0.21	0.83	0.47	1.03	1.03	0.77	0.52	0.61	0.66	0.07	0.52	0.49	0.04	0.52	0.34
O3'	0.38	1.05	0.34	0.44	0.65	0.34	0.63	0.49	0.79	0.47	0.99	0.88	0.76	0.53	0.47	0.27	0.38	0.34	0.09	0.40	0.03	0.17
O4	0.16	0.93	0.17	0.05	0.53	0.30	0.51	0.49	0.70	0.19	0.89	0.76	0.69	0.31	0.28	0.24	0.20	0.21	0.24	0.49	0.09	0.13
O4'	0.16	0.51	0.17	0.32	0.21	0.33	0.15	0.41	0.26	0.24	0.44	0.41	0.21	0.18	0.15	0.07	0.38	0.24	0.30	0.57	0.34	0.37
O5'	0.51	1.08	0.59	0.20	0.80	0.10	0.74	0.19	0.86	0.47	1.01	1.00	0.82	0.57	0.58	0.71	0.03	0.28	0.30	0.36	0.28	0.22
OP1	0.09	0.35	0.11	0.14	0.23	0.35	0.45	0.59	0.44	0.63	0.36	0.29	0.58	0.68	0.28	0.34	0.01	0.29	0.73	1.01	1.01	0.90
OP2	0.12	0.65	0.21	0.04	0.55	0.39	0.71	0.64	0.80	0.59	0.76	0.52	0.89	0.74	0.41	0.19	0.02	0.23	0.09	0.33	0.28	0.18
P	0.10	0.50	0.23	0.01	0.36	0.20	0.46	0.33	0.51	0.46	0.51	0.44	0.58	0.53	0.27	0.32	0.00	0.09	0.34	0.45	0.46	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.01	0.04	0.32	0.33	0.05
C2	0.04	0.00	0.16	0.11	0.01	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.31	0.16	0.03	0.20	0.13	0.79	0.25
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.08	0.03	0.04	0.01	0.07	0.08	0.12	0.16	0.04	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.21	0.20	0.38	0.12
C3'	0.02	0.11	0.00	0.00	0.10	0.01	0.16	0.01	0.14	0.25	0.11	0.11	0.18	0.24	0.13	0.01	0.01	0.02	0.33	0.06	0.35	0.22
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.01	0.23	0.05	0.79	0.31
C4'	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.05	0.12	0.03	0.06	0.08	0.12	0.04	0.10	0.03	0.01	0.01	0.38	0.05	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.13	0.15	0.01	0.34	0.29	1.05	0.53
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.08	0.12	0.05	0.05	0.12	0.14	0.04	0.10	0.07	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.14	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.13	0.02	0.35	0.30	1.12	0.55
C8	0.01	0.01	0.08	0.25	0.01	0.12	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.04	0.27	0.01	0.36	0.34	0.96	0.55
N1	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.10	0.02	0.28	0.14	0.99	0.41
N3	0.04	0.01	0.16	0.11	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.16	0.03	0.16	0.20	0.66	0.18
N6	0.01	0.01	0.04	0.18	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.16	0.19	0.03	0.42	0.49	1.30	0.69
N7	0.00	0.01	0.05	0.24	0.00	0.12	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.05	0.28	0.01	0.42	0.49	1.18	0.68
N9	0.01	0.01	0.02	0.13	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.10	0.01	0.20	0.03	0.68	0.28
O2'	0.02	0.31	0.00	0.01	0.17	0.10	0.13	0.10	0.19	0.04	0.27	0.29	0.16	0.05	0.06	0.00	0.09	0.07	0.13	0.42	0.20	0.05
O3'	0.04	0.16	0.03	0.01	0.07	0.03	0.15	0.07	0.13	0.27	0.10	0.16	0.19	0.28	0.10	0.09	0.00	0.02	0.35	0.15	0.30	0.19
O4'	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00	0.13	0.40	0.15	0.14
O5'	0.04	0.20	0.21	0.33	0.23	0.01	0.34	0.00	0.35	0.36	0.28	0.16	0.42	0.42	0.20	0.13	0.35	0.13	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.32	0.13	0.20	0.06	0.05	0.38	0.29	0.12	0.30	0.34	0.14	0.20	0.49	0.49	0.03	0.42	0.15	0.40	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.79	0.38	0.35	0.79	0.05	1.05	0.15	1.12	0.96	0.99	0.66	1.30	1.18	0.68	0.20	0.30	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.25	0.12	0.22	0.31	0.11	0.53	0.01	0.55	0.55	0.41	0.18	0.69	0.68	0.28	0.05	0.19	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00