Doublet Group distance statistics: 55189

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.001, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.010 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.002, 0.012, 0.021, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.014 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.003, 0.014, 0.026, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.014 std_dev=0.012
O4	A	0, 0.001, 0.017, 0.032, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.016
O4'	A	0, 0.036, 0.143, 0.251, 0.260 max_d=0.260 avg_d=0.143 std_dev=0.108
C2'	A	0, 0.053, 0.189, 0.325, 0.314 max_d=0.314 avg_d=0.189 std_dev=0.136
C4'	A	0, 0.067, 0.258, 0.449, 0.455 max_d=0.455 avg_d=0.258 std_dev=0.191
O2'	A	0, 0.060, 0.275, 0.489, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.275 std_dev=0.215
C3'	A	0, 0.079, 0.301, 0.523, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.301 std_dev=0.222
C3'	B	0, 0.072, 0.317, 0.563, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.317 std_dev=0.245
O2'	B	0, 0.058, 0.370, 0.683, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.370 std_dev=0.312
O3'	B	0, 0.127, 0.461, 0.795, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.461 std_dev=0.334
O3'	A	0, 0.094, 0.431, 0.768, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.431 std_dev=0.337
O5'	A	0, 0.064, 0.405, 0.746, 0.834 max_d=0.834 avg_d=0.405 std_dev=0.341
C5'	A	0, 0.140, 0.483, 0.825, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.483 std_dev=0.342
C2'	B	0, 0.106, 0.485, 0.864, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.485 std_dev=0.379
P	A	0, 0.097, 0.513, 0.928, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.513 std_dev=0.415
OP2	A	0, 0.194, 0.699, 1.203, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.699 std_dev=0.504
OP1	A	0, 0.238, 0.823, 1.408, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.823 std_dev=0.585
C4'	B	0, 0.257, 0.881, 1.505, 1.368 max_d=1.368 avg_d=0.881 std_dev=0.624
C1'	B	0, 0.184, 0.918, 1.652, 1.796 max_d=1.796 avg_d=0.918 std_dev=0.734
O4'	B	0, 0.327, 1.198, 2.068, 2.044 max_d=2.044 avg_d=1.198 std_dev=0.871
C5'	B	0, 0.386, 1.318, 2.251, 2.008 max_d=2.008 avg_d=1.318 std_dev=0.932
N9	B	0, 0.447, 1.623, 2.799, 2.748 max_d=2.748 avg_d=1.623 std_dev=1.176
N3	B	0, 0.477, 1.690, 2.903, 2.790 max_d=2.790 avg_d=1.690 std_dev=1.213
C4	B	0, 0.539, 1.852, 3.165, 2.889 max_d=2.889 avg_d=1.852 std_dev=1.313
C2	B	0, 0.608, 2.260, 3.912, 3.901 max_d=3.901 avg_d=2.260 std_dev=1.652
C8	B	0, 0.691, 2.400, 4.109, 3.849 max_d=3.849 avg_d=2.400 std_dev=1.709
C5	B	0, 0.764, 2.613, 4.462, 4.013 max_d=4.013 avg_d=2.613 std_dev=1.849
O5'	B	0, 0.743, 2.624, 4.504, 4.310 max_d=4.310 avg_d=2.624 std_dev=1.880
P	B	0, 0.401, 2.349, 4.298, 4.771 max_d=4.771 avg_d=2.349 std_dev=1.949
OP2	B	0, 0.308, 2.313, 4.319, 4.890 max_d=4.890 avg_d=2.313 std_dev=2.005
OP1	B	0, 0.312, 2.341, 4.371, 4.950 max_d=4.950 avg_d=2.341 std_dev=2.030
N1	B	0, 0.802, 2.832, 4.861, 4.656 max_d=4.656 avg_d=2.832 std_dev=2.030
N7	B	0, 0.859, 2.951, 5.043, 4.604 max_d=4.604 avg_d=2.951 std_dev=2.092
C6	B	0, 0.891, 3.048, 5.206, 4.695 max_d=4.695 avg_d=3.048 std_dev=2.158
N6	B	0, 1.110, 3.801, 6.492, 5.872 max_d=5.872 avg_d=3.801 std_dev=2.691

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.17	0.25	0.06
C2	0.02	0.00	0.03	0.07	0.01	0.05	0.01	0.13	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.03	0.15	0.14	0.51	0.21
C2'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.02	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.04	0.07	0.25	0.06
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.10	0.00	0.12	0.01	0.12	0.08	0.08	0.06	0.01	0.00	0.10	0.01	0.06	0.01	0.21	0.09
C4	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.12	0.00	0.03	0.22	0.35	0.67	0.36
C4'	0.00	0.05	0.01	0.00	0.11	0.00	0.13	0.00	0.13	0.07	0.08	0.03	0.03	0.01	0.11	0.00	0.01	0.18	0.11	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.12	0.00	0.13	0.00	0.25	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.01	0.03	0.22	0.35	0.64	0.36
C5'	0.03	0.13	0.00	0.01	0.23	0.00	0.25	0.00	0.22	0.14	0.18	0.09	0.02	0.02	0.24	0.01	0.00	0.20	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.12	0.00	0.13	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.14	0.00	0.03	0.18	0.22	0.49	0.26
N1	0.01	0.00	0.01	0.08	0.01	0.07	0.01	0.14	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.01	0.02	0.13	0.12	0.43	0.18
N3	0.02	0.00	0.02	0.08	0.00	0.08	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.03	0.19	0.24	0.61	0.29
O2	0.02	0.00	0.05	0.06	0.00	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.05	0.01	0.03	0.13	0.10	0.47	0.17
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.10	0.00	0.03	0.04	0.07	0.05	0.10	0.22	0.05
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.12	0.01	0.15	0.02	0.14	0.08	0.09	0.05	0.03	0.00	0.13	0.01	0.14	0.09	0.22	0.15
O4	0.02	0.01	0.01	0.10	0.00	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.23	0.42	0.71	0.39
O4'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.03	0.07	0.01	0.03	0.00	0.12	0.29	0.09	0.12
O5'	0.07	0.15	0.04	0.06	0.22	0.01	0.22	0.00	0.18	0.13	0.19	0.13	0.05	0.14	0.23	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.17	0.14	0.07	0.01	0.35	0.18	0.35	0.20	0.22	0.12	0.24	0.10	0.10	0.09	0.42	0.29	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.25	0.51	0.25	0.21	0.67	0.11	0.64	0.04	0.49	0.43	0.61	0.47	0.22	0.22	0.71	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.21	0.06	0.09	0.36	0.02	0.36	0.01	0.26	0.18	0.29	0.17	0.05	0.15	0.39	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.25	0.24	0.20	0.40	0.17	0.55	0.19	0.54	0.59	0.39	0.23	0.64	0.66	0.43	0.14	0.17	0.20	0.30	0.39	0.66	0.28
C2	0.43	0.52	0.29	0.19	0.61	0.21	0.78	0.22	0.77	0.80	0.62	0.50	0.89	0.91	0.61	0.26	0.15	0.33	0.51	0.61	0.90	0.54
C2'	0.29	0.28	0.24	0.20	0.43	0.14	0.59	0.17	0.58	0.65	0.42	0.26	0.69	0.72	0.46	0.07	0.09	0.20	0.35	0.50	0.77	0.40
C3'	0.25	0.17	0.23	0.18	0.34	0.08	0.49	0.11	0.46	0.58	0.30	0.16	0.56	0.63	0.40	0.08	0.01	0.15	0.40	0.55	0.79	0.46
C4	0.51	0.74	0.28	0.15	0.75	0.26	0.91	0.32	0.87	0.93	0.76	0.69	0.93	1.04	0.72	0.27	0.16	0.44	0.74	0.82	1.11	0.79
C4'	0.17	0.18	0.20	0.11	0.25	0.05	0.36	0.09	0.34	0.41	0.26	0.16	0.41	0.45	0.28	0.15	0.01	0.04	0.36	0.35	0.65	0.29
C5	0.46	0.56	0.26	0.16	0.60	0.25	0.72	0.30	0.63	0.85	0.54	0.54	0.68	0.88	0.64	0.22	0.17	0.39	0.68	0.76	0.99	0.71
C5'	0.23	0.28	0.29	0.17	0.24	0.16	0.25	0.16	0.24	0.29	0.26	0.27	0.25	0.29	0.24	0.33	0.16	0.17	0.47	0.34	0.66	0.33
C6	0.38	0.36	0.26	0.19	0.46	0.20	0.58	0.23	0.51	0.70	0.38	0.36	0.57	0.73	0.52	0.18	0.16	0.31	0.50	0.60	0.82	0.52
N1	0.37	0.35	0.28	0.20	0.49	0.19	0.64	0.20	0.60	0.70	0.45	0.36	0.70	0.77	0.53	0.21	0.16	0.28	0.43	0.53	0.80	0.45
N3	0.49	0.69	0.29	0.17	0.72	0.24	0.89	0.28	0.89	0.89	0.75	0.65	0.99	1.01	0.69	0.29	0.15	0.40	0.65	0.73	1.03	0.69
O2	0.41	0.53	0.29	0.19	0.61	0.19	0.81	0.21	0.83	0.79	0.67	0.49	0.97	0.91	0.60	0.26	0.15	0.31	0.47	0.56	0.87	0.49
O2'	0.22	0.28	0.20	0.14	0.40	0.08	0.57	0.11	0.58	0.58	0.44	0.23	0.70	0.68	0.40	0.01	0.06	0.11	0.34	0.42	0.74	0.35
O3'	0.23	0.16	0.23	0.17	0.32	0.04	0.48	0.04	0.45	0.56	0.30	0.14	0.56	0.62	0.37	0.14	0.09	0.12	0.46	0.62	0.87	0.54
O4	0.53	0.93	0.27	0.14	0.84	0.30	1.05	0.38	1.07	0.99	0.96	0.82	1.13	1.16	0.76	0.29	0.16	0.49	0.85	0.93	1.23	0.91
O4'	0.20	0.21	0.21	0.19	0.30	0.15	0.42	0.19	0.41	0.46	0.32	0.17	0.48	0.50	0.33	0.04	0.18	0.13	0.22	0.30	0.52	0.14
O5'	0.09	0.15	0.09	0.09	0.05	0.08	0.12	0.10	0.07	0.27	0.09	0.12	0.12	0.25	0.13	0.06	0.01	0.06	0.35	0.48	0.64	0.35
OP1	0.16	0.32	0.07	0.14	0.27	0.24	0.27	0.39	0.31	0.20	0.33	0.29	0.31	0.23	0.21	0.08	0.00	0.23	0.63	0.47	0.74	0.48
OP2	0.08	0.40	0.13	0.06	0.23	0.19	0.22	0.32	0.30	0.19	0.39	0.33	0.28	0.16	0.13	0.08	0.01	0.10	0.47	0.61	0.71	0.49
P	0.02	0.29	0.04	0.02	0.16	0.06	0.13	0.07	0.19	0.08	0.26	0.25	0.17	0.05	0.06	0.01	0.00	0.03	0.42	0.48	0.63	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.14	0.49	0.19
C2	0.04	0.00	0.16	0.20	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.25	0.05	0.13	0.12	0.58	0.19
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.09	0.01	0.05	0.00	0.08	0.06	0.13	0.16	0.06	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.20	0.19	0.47	0.07
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.12	0.01	0.08	0.00	0.13	0.06	0.17	0.18	0.11	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.32	0.27	0.49	0.17
C4	0.02	0.00	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.13	0.02	0.14	0.13	0.63	0.23
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.06	0.01	0.07	0.07	0.07	0.07	0.09	0.08	0.03	0.03	0.00	0.00	0.01	0.28	0.34	0.15
C5	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.06	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.06	0.10	0.01	0.16	0.25	0.75	0.34
C5'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.11	0.01	0.17	0.00	0.18	0.18	0.14	0.08	0.22	0.21	0.10	0.04	0.05	0.00	0.01	0.21	0.27	0.02
C6	0.02	0.01	0.08	0.13	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.01	0.16	0.27	0.73	0.33
C8	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.04	0.06	0.04	0.20	0.28	0.83	0.42
N1	0.04	0.00	0.13	0.17	0.01	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.11	0.22	0.04	0.15	0.19	0.65	0.25
N3	0.04	0.00	0.16	0.18	0.00	0.07	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.11	0.22	0.05	0.12	0.11	0.55	0.18
N6	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.09	0.01	0.22	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.07	0.14	0.01	0.16	0.36	0.79	0.40
N7	0.00	0.01	0.04	0.02	0.00	0.08	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.19	0.36	0.88	0.46
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.15	0.11	0.64	0.25
O2'	0.01	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.06	0.04	0.08	0.04	0.11	0.11	0.07	0.05	0.02	0.00	0.01	0.04	0.08	0.31	0.38	0.19
O3'	0.00	0.25	0.00	0.01	0.13	0.00	0.10	0.05	0.16	0.06	0.22	0.22	0.14	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.33	0.41	0.44	0.18
O4'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.00	0.09	0.21	0.47	0.26
O5'	0.08	0.13	0.20	0.32	0.14	0.01	0.16	0.01	0.16	0.20	0.15	0.12	0.16	0.19	0.15	0.08	0.33	0.09	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.14	0.12	0.19	0.27	0.13	0.28	0.25	0.21	0.27	0.28	0.19	0.11	0.36	0.36	0.11	0.31	0.41	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.49	0.58	0.47	0.49	0.63	0.34	0.75	0.27	0.73	0.83	0.65	0.55	0.79	0.88	0.64	0.38	0.44	0.47	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.19	0.19	0.07	0.17	0.23	0.15	0.34	0.02	0.33	0.42	0.25	0.18	0.40	0.46	0.25	0.19	0.18	0.26	0.01	0.00	0.00	0.00