Doublet Group distance statistics: 55193

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.006, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.015, 0.031, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.015 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.000, 0.022, 0.043, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.022 std_dev=0.022
O4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
O2	A	0, 0.000, 0.038, 0.076, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.038 std_dev=0.038
C4'	B	0, 0.000, 0.265, 0.529, 0.529 max_d=0.529 avg_d=0.265 std_dev=0.265
C2'	B	0, 0.000, 0.271, 0.542, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.271 std_dev=0.271
C3'	B	0, 0.000, 0.293, 0.587, 0.587 max_d=0.587 avg_d=0.293 std_dev=0.293
O3'	B	0, 0.000, 0.438, 0.877, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.438 std_dev=0.438
O4'	A	0, 0.000, 0.441, 0.883, 0.883 max_d=0.883 avg_d=0.441 std_dev=0.441
C2'	A	0, 0.000, 0.454, 0.907, 0.907 max_d=0.907 avg_d=0.454 std_dev=0.454
O2'	B	0, 0.000, 0.462, 0.925, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.462 std_dev=0.462
O4'	B	0, 0.000, 0.671, 1.342, 1.342 max_d=1.342 avg_d=0.671 std_dev=0.671
O2'	A	0, 0.000, 0.821, 1.641, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.821 std_dev=0.821
C4'	A	0, 0.000, 0.854, 1.708, 1.708 max_d=1.708 avg_d=0.854 std_dev=0.854
C5'	B	0, 0.000, 0.905, 1.810, 1.810 max_d=1.810 avg_d=0.905 std_dev=0.905
P	A	0, 0.000, 0.907, 1.814, 1.814 max_d=1.814 avg_d=0.907 std_dev=0.907
C5'	A	0, 0.000, 0.953, 1.906, 1.906 max_d=1.906 avg_d=0.953 std_dev=0.953
C3'	A	0, 0.000, 0.994, 1.988, 1.988 max_d=1.988 avg_d=0.994 std_dev=0.994
OP1	A	0, 0.000, 1.034, 2.067, 2.067 max_d=2.067 avg_d=1.034 std_dev=1.034
C1'	B	0, 0.000, 1.071, 2.142, 2.142 max_d=2.142 avg_d=1.071 std_dev=1.071
O5'	A	0, 0.000, 1.083, 2.167, 2.167 max_d=2.167 avg_d=1.083 std_dev=1.083
OP2	A	0, 0.000, 1.203, 2.406, 2.406 max_d=2.406 avg_d=1.203 std_dev=1.203
O5'	B	0, 0.000, 1.273, 2.547, 2.547 max_d=2.547 avg_d=1.273 std_dev=1.273
O3'	A	0, 0.000, 1.608, 3.217, 3.217 max_d=3.217 avg_d=1.608 std_dev=1.608
N9	B	0, 0.000, 2.077, 4.155, 4.155 max_d=4.155 avg_d=2.077 std_dev=2.077
P	B	0, 0.000, 2.149, 4.298, 4.298 max_d=4.298 avg_d=2.149 std_dev=2.149
OP1	B	0, 0.000, 2.262, 4.525, 4.525 max_d=4.525 avg_d=2.262 std_dev=2.262
OP2	B	0, 0.000, 2.444, 4.889, 4.889 max_d=4.889 avg_d=2.444 std_dev=2.444
C8	B	0, 0.000, 2.542, 5.085, 5.085 max_d=5.085 avg_d=2.542 std_dev=2.542
C4	B	0, 0.000, 3.032, 6.065, 6.065 max_d=6.065 avg_d=3.032 std_dev=3.032
N3	B	0, 0.000, 3.404, 6.807, 6.807 max_d=6.807 avg_d=3.404 std_dev=3.404
N7	B	0, 0.000, 3.534, 7.068, 7.068 max_d=7.068 avg_d=3.534 std_dev=3.534
C5	B	0, 0.000, 3.787, 7.575, 7.575 max_d=7.575 avg_d=3.787 std_dev=3.787
C2	B	0, 0.000, 4.431, 8.862, 8.862 max_d=8.862 avg_d=4.431 std_dev=4.431
C6	B	0, 0.000, 4.821, 9.643, 9.643 max_d=9.643 avg_d=4.821 std_dev=4.821
N1	B	0, 0.000, 5.082, 10.164, 10.164 max_d=10.164 avg_d=5.082 std_dev=5.082
N6	B	0, 0.000, 5.661, 11.323, 11.323 max_d=11.323 avg_d=5.661 std_dev=5.661

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.27	0.02	0.00	0.15	0.06	0.35	0.13
C2	0.02	0.00	0.16	0.24	0.00	0.09	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.10	0.00	0.02	0.04	0.09	0.04	0.07
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.17	0.07	0.03	0.13	0.25	0.00	0.00	0.06	0.01	0.23	0.28	0.65	0.36
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.36	0.00	0.34	0.01	0.28	0.21	0.32	0.16	0.00	0.00	0.39	0.01	0.19	0.07	0.12	0.08
C4	0.02	0.00	0.05	0.36	0.00	0.17	0.01	0.20	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.12	0.00	0.02	0.15	0.22	0.24	0.23
C4'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.17	0.00	0.19	0.01	0.17	0.11	0.13	0.05	0.25	0.01	0.18	0.00	0.00	0.04	0.17	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.34	0.01	0.19	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00	0.26	0.16	0.00	0.06	0.12	0.20	0.18	0.20
C5'	0.04	0.10	0.17	0.01	0.20	0.01	0.22	0.00	0.17	0.09	0.15	0.05	0.05	0.19	0.23	0.02	0.00	0.04	0.15	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.28	0.00	0.17	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.22	0.10	0.00	0.08	0.04	0.12	0.03	0.08
N1	0.02	0.00	0.03	0.21	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.06	0.00	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01
N3	0.02	0.00	0.13	0.32	0.00	0.13	0.01	0.15	0.01	0.00	0.00	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.11	0.16	0.12	0.16
O2	0.03	0.00	0.25	0.16	0.01	0.05	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.23	0.01	0.05	0.02	0.06	0.10	0.03
O2'	0.02	0.14	0.00	0.00	0.26	0.25	0.26	0.05	0.22	0.15	0.21	0.03	0.00	0.02	0.28	0.19	0.12	0.14	0.73	0.31
O3'	0.27	0.10	0.00	0.00	0.12	0.01	0.16	0.19	0.10	0.06	0.01	0.23	0.02	0.00	0.16	0.18	0.35	0.34	0.15	0.30
O4	0.02	0.00	0.06	0.39	0.00	0.18	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.01	0.28	0.16	0.00	0.02	0.19	0.26	0.36	0.28
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.02	0.08	0.02	0.01	0.05	0.19	0.18	0.02	0.00	0.14	0.03	0.21	0.04
O5'	0.15	0.04	0.23	0.19	0.15	0.00	0.12	0.00	0.04	0.01	0.11	0.02	0.12	0.35	0.19	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00
OP1	0.06	0.09	0.28	0.07	0.22	0.04	0.20	0.04	0.12	0.06	0.16	0.06	0.14	0.34	0.26	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.35	0.04	0.65	0.12	0.24	0.17	0.18	0.15	0.03	0.14	0.12	0.10	0.73	0.15	0.36	0.21	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.13	0.07	0.36	0.08	0.23	0.01	0.20	0.01	0.08	0.01	0.16	0.03	0.31	0.30	0.28	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.46	1.37	0.06	0.10	0.81	0.10	0.61	0.61	0.84	0.07	1.19	1.24	0.71	0.19	0.45	0.06	0.06	0.22	0.73	0.88	0.75	0.88
C2	0.63	2.05	0.09	0.12	1.32	0.13	1.23	0.55	1.56	0.53	1.93	1.78	1.49	0.78	0.83	0.11	0.17	0.34	0.59	0.63	0.43	0.60
C2'	0.61	1.37	0.25	0.12	0.84	0.11	0.62	0.39	0.82	0.13	1.17	1.27	0.67	0.21	0.53	0.20	0.19	0.36	0.54	0.76	0.56	0.75
C3'	0.22	0.74	0.16	0.23	0.31	0.08	0.08	0.46	0.23	0.29	0.54	0.68	0.07	0.27	0.07	0.23	0.24	0.12	0.69	0.92	0.70	0.88
C4	0.72	2.32	0.11	0.12	1.59	0.14	1.57	0.44	1.91	0.87	2.24	2.02	1.89	1.17	1.07	0.13	0.24	0.39	0.39	0.31	0.03	0.22
C4'	0.24	0.66	0.10	0.19	0.27	0.01	0.03	0.43	0.16	0.33	0.45	0.63	0.00	0.31	0.06	0.17	0.18	0.16	0.71	0.96	0.76	0.93
C5	0.68	1.86	0.10	0.12	1.33	0.15	1.25	0.45	1.50	0.69	1.76	1.70	1.44	0.90	0.91	0.10	0.23	0.35	0.40	0.33	0.03	0.24
C5'	0.12	0.24	0.15	0.19	0.02	0.04	0.27	0.28	0.21	0.49	0.03	0.27	0.37	0.54	0.14	0.17	0.16	0.11	0.60	0.84	0.56	0.77
C6	0.58	1.55	0.08	0.13	1.05	0.15	0.92	0.54	1.13	0.39	1.41	1.42	1.04	0.56	0.68	0.08	0.17	0.29	0.54	0.53	0.25	0.48
N1	0.56	1.68	0.07	0.12	1.08	0.13	0.93	0.58	1.19	0.34	1.53	1.50	1.10	0.52	0.66	0.09	0.14	0.29	0.63	0.68	0.48	0.66
N3	0.69	2.32	0.11	0.12	1.54	0.14	1.51	0.50	1.87	0.76	2.24	1.99	1.84	1.06	1.00	0.13	0.22	0.38	0.48	0.46	0.19	0.40
O2	0.61	2.09	0.09	0.12	1.31	0.12	1.21	0.57	1.57	0.48	1.98	1.79	1.50	0.74	0.80	0.11	0.16	0.33	0.64	0.73	0.57	0.71
O2'	0.52	1.47	0.21	0.02	0.82	0.06	0.55	0.67	0.80	0.03	1.24	1.33	0.62	0.07	0.44	0.24	0.16	0.20	0.85	1.17	0.95	1.15
O3'	0.23	0.80	0.21	0.31	0.32	0.05	0.06	0.44	0.22	0.34	0.57	0.73	0.04	0.32	0.07	0.27	0.34	0.17	0.78	1.13	0.81	1.02
O4	0.75	2.60	0.13	0.11	1.78	0.14	1.84	0.38	2.24	1.08	2.58	2.20	2.25	1.43	1.21	0.14	0.26	0.41	0.30	0.17	0.22	0.07
O4'	0.33	1.01	0.04	0.19	0.54	0.10	0.33	0.60	0.51	0.13	0.82	0.93	0.37	0.05	0.25	0.16	0.16	0.18	0.79	0.95	0.82	0.94
O5'	0.44	0.50	0.09	0.08	0.30	0.34	0.11	0.05	0.15	0.06	0.33	0.53	0.03	0.10	0.22	0.03	0.01	0.43	0.19	0.37	0.01	0.24
OP1	0.10	0.57	0.19	0.06	0.58	0.18	0.79	0.16	0.85	0.69	0.74	0.44	0.97	0.86	0.48	0.08	0.01	0.02	0.03	0.27	0.13	0.11
OP2	0.09	0.13	0.20	0.05	0.18	0.10	0.33	0.00	0.35	0.31	0.26	0.06	0.44	0.40	0.15	0.12	0.00	0.11	0.08	0.20	0.26	0.05
P	0.13	0.08	0.10	0.02	0.15	0.17	0.31	0.03	0.33	0.33	0.21	0.01	0.42	0.41	0.13	0.06	0.00	0.15	0.10	0.23	0.19	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.09	0.16	0.33	0.13
C2	0.02	0.00	0.26	0.19	0.01	0.05	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.09	0.12	0.32	0.66	0.16	0.12
C2'	0.00	0.26	0.00	0.00	0.13	0.01	0.06	0.07	0.11	0.13	0.20	0.26	0.07	0.07	0.00	0.00	0.01	0.02	0.15	0.22	0.82	0.46
C3'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.19	0.00	0.25	0.01	0.26	0.22	0.23	0.16	0.28	0.26	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.44	0.19
C4	0.01	0.01	0.13	0.19	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.03	0.06	0.35	0.62	0.18	0.12
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.06	0.17	0.00	0.05	0.09	0.16	0.07	0.22	0.01	0.00	0.02	0.02	0.10	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.25	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.06	0.02	0.48	0.82	0.09	0.26
C5'	0.00	0.00	0.07	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.14	0.26	0.06	0.02	0.19	0.26	0.12	0.13	0.13	0.01	0.00	0.02	0.14	0.02
C6	0.01	0.00	0.11	0.26	0.00	0.06	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.20	0.05	0.05	0.49	0.90	0.06	0.29
C8	0.00	0.01	0.13	0.22	0.00	0.17	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.33	0.10	0.09	0.50	0.70	0.12	0.24
N1	0.01	0.00	0.20	0.23	0.00	0.00	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.02	0.09	0.41	0.81	0.10	0.22
N3	0.02	0.00	0.26	0.16	0.00	0.05	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.12	0.12	0.26	0.53	0.21	0.06
N6	0.01	0.00	0.07	0.28	0.00	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.26	0.10	0.02	0.56	1.03	0.01	0.37
N7	0.00	0.01	0.07	0.26	0.00	0.16	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.13	0.05	0.56	0.90	0.03	0.34
N9	0.00	0.01	0.00	0.16	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.02	0.01	0.33	0.49	0.22	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.01	0.11	0.22	0.23	0.13	0.20	0.33	0.08	0.07	0.26	0.34	0.17	0.00	0.01	0.15	0.08	0.27	0.79	0.42
O3'	0.17	0.09	0.01	0.00	0.03	0.01	0.06	0.13	0.05	0.10	0.02	0.12	0.10	0.13	0.02	0.01	0.00	0.08	0.10	0.09	0.32	0.03
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.06	0.00	0.02	0.01	0.05	0.09	0.09	0.12	0.02	0.05	0.01	0.15	0.08	0.00	0.12	0.17	0.04	0.02
O5'	0.09	0.32	0.15	0.02	0.35	0.02	0.48	0.00	0.49	0.50	0.41	0.26	0.56	0.56	0.33	0.08	0.10	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.16	0.66	0.22	0.02	0.62	0.02	0.82	0.02	0.90	0.70	0.81	0.53	1.03	0.90	0.49	0.27	0.09	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.16	0.82	0.44	0.18	0.10	0.09	0.14	0.06	0.12	0.10	0.21	0.01	0.03	0.22	0.79	0.32	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.12	0.46	0.19	0.12	0.07	0.26	0.02	0.29	0.24	0.22	0.06	0.37	0.34	0.07	0.42	0.03	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00