Doublet Group distance statistics: 55202

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 8, 7, 14, 17, 4, 4, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.018, 0.025, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.025 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.020, 0.032, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.020 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.016, 0.029, 0.041, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.029 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.016, 0.029, 0.042, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.029 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.011, 0.025, 0.039, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.025 std_dev=0.014
O2	A	0, 0.031, 0.059, 0.086, 0.170 max_d=0.170 avg_d=0.059 std_dev=0.028
O4	A	0, 0.038, 0.094, 0.150, 0.288 max_d=0.288 avg_d=0.094 std_dev=0.056
O4'	A	0, 0.061, 0.155, 0.249, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.155 std_dev=0.094
C2'	A	0, 0.087, 0.197, 0.308, 0.817 max_d=0.817 avg_d=0.197 std_dev=0.110
C2'	B	0, 0.276, 0.438, 0.601, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.438 std_dev=0.163
O3'	B	0, 0.161, 0.327, 0.493, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.327 std_dev=0.166
C4'	A	0, 0.095, 0.266, 0.437, 1.177 max_d=1.177 avg_d=0.266 std_dev=0.171
C3'	B	0, 0.120, 0.293, 0.466, 1.334 max_d=1.334 avg_d=0.293 std_dev=0.173
C3'	A	0, 0.100, 0.290, 0.479, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.290 std_dev=0.189
O2'	B	0, 0.397, 0.611, 0.825, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.611 std_dev=0.214
C5'	A	0, 0.228, 0.448, 0.667, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.448 std_dev=0.219
O2'	A	0, 0.015, 0.240, 0.464, 1.844 max_d=1.844 avg_d=0.240 std_dev=0.224
O5'	A	0, 0.231, 0.476, 0.721, 1.704 max_d=1.704 avg_d=0.476 std_dev=0.245
O4'	B	0, 0.308, 0.574, 0.839, 2.196 max_d=2.196 avg_d=0.574 std_dev=0.266
C4'	B	0, 0.135, 0.408, 0.680, 2.118 max_d=2.118 avg_d=0.408 std_dev=0.273
C1'	B	0, 0.325, 0.602, 0.879, 2.330 max_d=2.330 avg_d=0.602 std_dev=0.277
P	A	0, 0.071, 0.388, 0.704, 2.363 max_d=2.363 avg_d=0.388 std_dev=0.317
O3'	A	0, 0.073, 0.401, 0.729, 2.474 max_d=2.474 avg_d=0.401 std_dev=0.328
C5'	B	0, 0.267, 0.615, 0.963, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.615 std_dev=0.348
N9	B	0, 0.482, 0.850, 1.218, 3.166 max_d=3.166 avg_d=0.850 std_dev=0.368
C8	B	0, 0.595, 0.986, 1.376, 3.104 max_d=3.104 avg_d=0.986 std_dev=0.390
OP2	A	0, -0.051, 0.434, 0.918, 3.666 max_d=3.666 avg_d=0.434 std_dev=0.485
OP1	A	0, -0.045, 0.457, 0.960, 3.941 max_d=3.941 avg_d=0.457 std_dev=0.502
N7	B	0, 0.616, 1.188, 1.759, 4.706 max_d=4.706 avg_d=1.188 std_dev=0.571
C4	B	0, 0.353, 0.957, 1.561, 5.279 max_d=5.279 avg_d=0.957 std_dev=0.604
C5	B	0, 0.489, 1.171, 1.853, 5.869 max_d=5.869 avg_d=1.171 std_dev=0.682
O5'	B	0, 1.411, 2.099, 2.787, 5.133 max_d=5.133 avg_d=2.099 std_dev=0.688
P	B	0, 1.915, 2.709, 3.503, 6.387 max_d=6.387 avg_d=2.709 std_dev=0.794
N3	B	0, 0.090, 0.885, 1.680, 6.823 max_d=6.823 avg_d=0.885 std_dev=0.795
OP1	B	0, 0.216, 1.084, 1.952, 6.432 max_d=6.432 avg_d=1.084 std_dev=0.868
C6	B	0, 0.421, 1.349, 2.277, 7.958 max_d=7.958 avg_d=1.349 std_dev=0.928
C2	B	0, 0.023, 1.047, 2.072, 8.742 max_d=8.742 avg_d=1.047 std_dev=1.025
O6	B	0, 0.513, 1.568, 2.623, 8.937 max_d=8.937 avg_d=1.568 std_dev=1.055
N1	B	0, 0.197, 1.268, 2.339, 9.189 max_d=9.189 avg_d=1.268 std_dev=1.071
OP2	B	0, 3.568, 4.736, 5.903, 6.886 max_d=6.886 avg_d=4.736 std_dev=1.168
N2	B	0, -0.237, 1.022, 2.280, 10.550 max_d=10.550 avg_d=1.022 std_dev=1.259

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.09	0.02	0.01	0.09	0.12	0.15	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.10	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.07	0.01	0.02	0.15	0.16	0.28	0.15
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.06	0.02	0.05	0.11	0.02	0.02	0.05	0.01	0.15	0.14	0.22	0.17
C3'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.10	0.02	0.09	0.07	0.11	0.12	0.04	0.01	0.12	0.01	0.06	0.06	0.10	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.08	0.01	0.03	0.18	0.18	0.36	0.19
C4'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.06	0.04	0.05	0.06	0.10	0.02	0.06	0.01	0.03	0.07	0.04	0.04
C5	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.09	0.01	0.04	0.18	0.19	0.32	0.18
C5'	0.03	0.07	0.06	0.02	0.10	0.01	0.11	0.00	0.10	0.06	0.08	0.07	0.05	0.07	0.11	0.02	0.02	0.08	0.05	0.03
C6	0.02	0.01	0.06	0.09	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.07	0.01	0.03	0.16	0.17	0.25	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.02	0.13	0.15	0.23	0.13
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.05	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.01	0.02	0.17	0.17	0.34	0.18
O2	0.03	0.01	0.11	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.11	0.01	0.03	0.15	0.15	0.27	0.15
O2'	0.02	0.09	0.02	0.04	0.12	0.10	0.12	0.05	0.10	0.07	0.11	0.09	0.00	0.06	0.13	0.07	0.13	0.12	0.25	0.17
O3'	0.09	0.07	0.02	0.01	0.08	0.02	0.09	0.07	0.07	0.05	0.07	0.11	0.06	0.00	0.09	0.06	0.10	0.13	0.11	0.10
O4	0.02	0.01	0.05	0.12	0.01	0.06	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.04	0.18	0.19	0.39	0.20
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.04	0.00	0.08	0.15	0.09	0.08
O5'	0.09	0.15	0.15	0.06	0.18	0.03	0.18	0.02	0.16	0.13	0.17	0.15	0.13	0.10	0.18	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.12	0.16	0.14	0.06	0.18	0.07	0.19	0.08	0.17	0.15	0.17	0.15	0.12	0.13	0.19	0.15	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.15	0.28	0.22	0.10	0.36	0.04	0.32	0.05	0.25	0.23	0.34	0.27	0.25	0.11	0.39	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.15	0.17	0.07	0.19	0.04	0.18	0.03	0.15	0.13	0.18	0.15	0.17	0.10	0.20	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.32	0.65	0.16	0.17	0.43	0.23	0.37	0.21	0.45	0.20	0.58	0.77	0.59	0.23	0.31	0.12	0.14	0.32	0.28	0.42	0.64	0.44	0.53
C2	0.32	0.85	0.15	0.14	0.55	0.15	0.50	0.21	0.63	0.25	0.78	1.01	0.74	0.32	0.37	0.13	0.14	0.27	0.24	0.60	0.50	0.42	0.46
C2'	0.28	0.57	0.17	0.18	0.38	0.22	0.32	0.24	0.40	0.19	0.51	0.68	0.51	0.22	0.27	0.17	0.17	0.29	0.30	0.37	0.61	0.39	0.46
C3'	0.19	0.42	0.08	0.11	0.26	0.16	0.21	0.20	0.27	0.11	0.37	0.51	0.37	0.12	0.17	0.11	0.09	0.21	0.32	0.25	0.59	0.38	0.38
C4	0.33	0.96	0.16	0.13	0.64	0.13	0.60	0.23	0.74	0.31	0.90	1.12	0.84	0.42	0.43	0.15	0.16	0.21	0.32	0.72	0.41	0.41	0.39
C4'	0.25	0.42	0.12	0.17	0.27	0.24	0.21	0.24	0.25	0.12	0.35	0.50	0.39	0.12	0.20	0.10	0.13	0.28	0.39	0.22	0.65	0.44	0.46
C5	0.33	0.82	0.16	0.13	0.57	0.12	0.52	0.22	0.62	0.28	0.76	0.94	0.75	0.36	0.40	0.14	0.16	0.24	0.27	0.60	0.40	0.34	0.35
C5'	0.23	0.31	0.13	0.18	0.21	0.24	0.15	0.25	0.17	0.11	0.25	0.38	0.30	0.11	0.16	0.13	0.14	0.26	0.45	0.14	0.59	0.48	0.39
C6	0.33	0.71	0.16	0.14	0.49	0.16	0.43	0.19	0.52	0.23	0.65	0.82	0.66	0.28	0.35	0.12	0.14	0.29	0.21	0.49	0.46	0.32	0.39
N1	0.33	0.74	0.16	0.15	0.50	0.17	0.43	0.19	0.53	0.22	0.67	0.88	0.67	0.28	0.34	0.12	0.14	0.29	0.23	0.50	0.53	0.38	0.46
N3	0.33	0.94	0.16	0.13	0.62	0.13	0.58	0.22	0.72	0.29	0.89	1.12	0.81	0.39	0.41	0.14	0.15	0.23	0.29	0.70	0.45	0.42	0.43
O2	0.33	0.86	0.16	0.15	0.56	0.16	0.50	0.21	0.63	0.25	0.80	1.03	0.75	0.32	0.37	0.13	0.15	0.28	0.25	0.61	0.54	0.45	0.49
O2'	0.32	0.61	0.19	0.20	0.42	0.25	0.36	0.25	0.44	0.22	0.55	0.73	0.56	0.25	0.31	0.20	0.18	0.32	0.33	0.41	0.75	0.51	0.58
O3'	0.15	0.32	0.11	0.11	0.19	0.15	0.16	0.20	0.20	0.10	0.28	0.40	0.28	0.11	0.13	0.17	0.09	0.18	0.37	0.19	0.61	0.45	0.39
O4	0.31	1.05	0.16	0.14	0.69	0.15	0.67	0.27	0.83	0.35	1.00	1.24	0.89	0.47	0.44	0.16	0.16	0.16	0.42	0.82	0.42	0.46	0.42
O4'	0.32	0.54	0.18	0.20	0.37	0.27	0.30	0.23	0.36	0.18	0.47	0.65	0.51	0.19	0.28	0.14	0.16	0.34	0.34	0.32	0.67	0.42	0.51
O5'	0.13	0.28	0.04	0.05	0.16	0.09	0.13	0.16	0.16	0.10	0.23	0.35	0.26	0.11	0.10	0.10	0.02	0.11	0.33	0.15	0.45	0.40	0.21
OP1	0.11	0.17	0.12	0.07	0.13	0.10	0.16	0.22	0.16	0.18	0.15	0.21	0.16	0.21	0.11	0.27	0.02	0.06	0.47	0.18	0.42	0.69	0.32
OP2	0.20	0.30	0.13	0.06	0.25	0.06	0.25	0.10	0.27	0.23	0.29	0.33	0.29	0.25	0.22	0.24	0.02	0.15	0.27	0.27	0.36	0.45	0.16
P	0.13	0.22	0.08	0.02	0.15	0.04	0.14	0.13	0.15	0.14	0.19	0.27	0.21	0.15	0.11	0.18	0.01	0.07	0.33	0.15	0.39	0.46	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.11	0.01	0.22	0.03	0.30	0.42	0.18
C2	0.03	0.00	0.07	0.05	0.01	0.08	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.21	0.11	0.34	0.01	0.21	0.60	0.31
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.04	0.06	0.05	0.09	0.07	0.05	0.02	0.00	0.03	0.03	0.24	0.04	0.36	0.44	0.19
C3'	0.02	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.07	0.02	0.06	0.10	0.04	0.08	0.05	0.10	0.05	0.01	0.01	0.01	0.23	0.07	0.37	0.35	0.12
C4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.00	0.04	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.13	0.07	0.33	0.01	0.26	0.66	0.32
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.07	0.10	0.07	0.11	0.08	0.10	0.04	0.07	0.02	0.01	0.02	0.08	0.36	0.23	0.12
C5	0.02	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.09	0.05	0.37	0.01	0.35	0.83	0.43
C5'	0.05	0.13	0.08	0.02	0.14	0.01	0.19	0.00	0.19	0.21	0.16	0.13	0.11	0.23	0.13	0.05	0.06	0.02	0.01	0.22	0.32	0.30	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.12	0.12	0.07	0.38	0.01	0.33	0.84	0.43
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.10	0.01	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.05	0.38	0.02	0.45	0.89	0.50
N1	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.17	0.10	0.37	0.01	0.23	0.72	0.36
N2	0.04	0.01	0.09	0.08	0.01	0.11	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.24	0.13	0.34	0.01	0.26	0.55	0.34
N3	0.03	0.01	0.07	0.05	0.00	0.08	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.20	0.11	0.32	0.01	0.24	0.54	0.28
N7	0.01	0.01	0.05	0.10	0.01	0.10	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.16	0.06	0.04	0.40	0.02	0.48	0.96	0.55
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.01	0.13	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.08	0.02	0.31	0.02	0.30	0.65	0.32
O2'	0.02	0.11	0.00	0.01	0.08	0.07	0.12	0.05	0.12	0.16	0.10	0.14	0.10	0.16	0.08	0.00	0.04	0.06	0.27	0.14	0.37	0.50	0.22
O3'	0.11	0.21	0.03	0.01	0.13	0.02	0.09	0.06	0.12	0.06	0.17	0.24	0.20	0.06	0.08	0.04	0.00	0.09	0.23	0.10	0.41	0.31	0.17
O4'	0.01	0.11	0.03	0.01	0.07	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.13	0.11	0.04	0.02	0.06	0.09	0.00	0.28	0.07	0.28	0.38	0.21
O5'	0.22	0.34	0.24	0.23	0.33	0.02	0.37	0.01	0.38	0.38	0.37	0.34	0.32	0.40	0.31	0.27	0.23	0.28	0.00	0.41	0.02	0.02	0.01
O6	0.03	0.01	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.22	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.14	0.10	0.07	0.41	0.00	0.40	0.93	0.50
OP1	0.30	0.21	0.36	0.37	0.26	0.36	0.35	0.32	0.33	0.45	0.23	0.26	0.24	0.48	0.30	0.37	0.41	0.28	0.02	0.40	0.00	0.01	0.01
OP2	0.42	0.60	0.44	0.35	0.66	0.23	0.83	0.30	0.84	0.89	0.72	0.55	0.54	0.96	0.65	0.50	0.31	0.38	0.02	0.93	0.01	0.00	0.01
P	0.18	0.31	0.19	0.12	0.32	0.12	0.43	0.02	0.43	0.50	0.36	0.34	0.28	0.55	0.32	0.22	0.17	0.21	0.01	0.50	0.01	0.01	0.00